RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476635.5

PRKCI-202, Transcript of protein kinase C iota, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PRKCI, Length 3,650 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCI-202ENST00000476635 APRTP07741 180 aa6.53□□□□□ -1.36
PRKCI-202ENST00000476635 COL6A2P12110 1019 aa6.53□□□□□ -1.36
PRKCI-202ENST00000476635 HDCP19113 662 aa6.53□□□□□ -1.36
PRKCI-202ENST00000476635 OR1E1P30953 314 aa6.53□□□□□ -1.36
PRKCI-202ENST00000476635 LEPRP48357 1165 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
PRKCI-202ENST00000476635 SERPINH1P50454 418 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
PRKCI-202ENST00000476635 SLC10A7Q0GE19 358 aa6.53□□□□□ -1.36
PRKCI-202ENST00000476635 TMC7Q7Z402 723 aa6.53□□□□□ -1.36
PRKCI-202ENST00000476635 CELF5Q8N6W0 485 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
PRKCI-202ENST00000476635 CKAP2Q8WWK9 683 aa6.53□□□□□ -1.36
PRKCI-202ENST00000476635 CERS2Q96G23 380 aa6.53□□□□□ -1.36
PRKCI-202ENST00000476635 ABHD8Q96I13 439 aa6.53□□□□□ -1.36
PRKCI-202ENST00000476635 C9orf72Q96LT7 481 aa6.53□□□□□ -1.36
PRKCI-202ENST00000476635 RPRD1AQ96P16 312 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
PRKCI-202ENST00000476635 RBBP8Q99708 897 aa6.53□□□□□ -1.36
PRKCI-202ENST00000476635 TRABDQ9H4I3 376 aa6.53□□□□□ -1.36
PRKCI-202ENST00000476635 UBA2Q9UBT2 640 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
PRKCI-202ENST00000476635 ZNF559-ZNF177A0A0A6YYI6 481 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
PRKCI-202ENST00000476635 LOC107983988A0A1B0GUW6 1196 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
PRKCI-202ENST00000476635 EXOC1LA0A1B0GW35 172 aa6.53□□□□□ -1.36
PRKCI-202ENST00000476635 HEATR9A2RTY3 570 aa6.53□□□□□ -1.36
PRKCI-202ENST00000476635 ZBBXA8MT70 800 aa6.53□□□□□ -1.36
PRKCI-202ENST00000476635 BIRC5O15392 142 aa6.53□□□□□ -1.36
PRKCI-202ENST00000476635 INSIG1O15503 277 aa6.53□□□□□ -1.36
PRKCI-202ENST00000476635 LDB2O43679 373 aa6.53□□□□□ -1.36
PRKCI-202ENST00000476635 JCHAINP01591 159 aa6.53□□□□□ -1.36
PRKCI-202ENST00000476635 ASLP04424 464 aa6.53□□□□□ -1.36
PRKCI-202ENST00000476635 RHOCP08134 193 aa6.53□□□□□ -1.36
PRKCI-202ENST00000476635 OGNP20774 298 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
PRKCI-202ENST00000476635 CRHR1P34998 444 aa6.53□□□□□ -1.36
PRKCI-202ENST00000476635 ACVRL1P37023 503 aa6.53□□□□□ -1.36
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PRKCI-202ENST00000476635 PDE1BQ01064 536 aa6.53□□□□□ -1.36
PRKCI-202ENST00000476635 ZNF177Q13360 481 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
PRKCI-202ENST00000476635 LONRF1Q17RB8 773 aa6.53□□□□□ -1.36
PRKCI-202ENST00000476635 RWDD4Q6NW29 188 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
PRKCI-202ENST00000476635 ANKRD54Q6NXT1 300 aa6.53□□□□□ -1.36
PRKCI-202ENST00000476635 LRRC6Q86X45 466 aa6.53□□□□□ -1.36
PRKCI-202ENST00000476635 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
PRKCI-202ENST00000476635 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP6.53□□□□□ -1.36
PRKCI-202ENST00000476635 OSCP1Q8WVF1 389 aa6.53□□□□□ -1.36
PRKCI-202ENST00000476635 APOPT1Q96IL0 206 aa6.53□□□□□ -1.36
PRKCI-202ENST00000476635 MCCC1Q96RQ3 725 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
PRKCI-202ENST00000476635 GPR22Q99680 433 aa6.53□□□□□ -1.36
PRKCI-202ENST00000476635 EPN3Q9H201 632 aa6.53□□□□□ -1.36
PRKCI-202ENST00000476635 NLE1Q9NVX2 485 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
PRKCI-202ENST00000476635 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP6.53□□□□□ -1.36
PRKCI-202ENST00000476635 EPS15L1Q9UBC2 864 aa6.53□□□□□ -1.36
PRKCI-202ENST00000476635 HAO1Q9UJM8 370 aa6.53□□□□□ -1.36
PRKCI-202ENST00000476635 ANKRD6Q9Y2G4 727 aa6.53□□□□□ -1.36
PRKCI-202ENST00000476635 TRBV5-4A0A0C4DH59 114 aa6.52□□□□□ -1.37
PRKCI-202ENST00000476635 ARNTLO00327 626 aa6.52□□□□□ -1.37
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PRKCI-202ENST00000476635 NDST3O95803 873 aa6.52□□□□□ -1.37
PRKCI-202ENST00000476635 CPP00450 1065 aa6.52□□□□□ -1.37
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PRKCI-202ENST00000476635 MAGOHP61326 146 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
PRKCI-202ENST00000476635 ADAM15Q13444 863 aa6.52□□□□□ -1.37
PRKCI-202ENST00000476635 LLGL1Q15334 1064 aa6.52□□□□□ -1.37
PRKCI-202ENST00000476635 EML3Q32P44 896 aa6.52□□□□□ -1.37
PRKCI-202ENST00000476635 TSTD2Q5T7W7 516 aa6.52□□□□□ -1.37
PRKCI-202ENST00000476635 PACS1Q6VY07 963 aa6.52□□□□□ -1.37
PRKCI-202ENST00000476635 ARL14EPQ8N8R7 260 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
PRKCI-202ENST00000476635 LRIG1Q96JA1 1093 aa6.52□□□□□ -1.37
PRKCI-202ENST00000476635 MRGPRX3Q96LB0 322 aa6.52□□□□□ -1.37
PRKCI-202ENST00000476635 MAGEB18Q96M61 343 aa6.52□□□□□ -1.37
PRKCI-202ENST00000476635 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa6.52□□□□□ -1.37
PRKCI-202ENST00000476635 FAM167BQ9BTA0 163 aa6.52□□□□□ -1.37
PRKCI-202ENST00000476635 ZBED2Q9BTP6 218 aa6.52□□□□□ -1.37
PRKCI-202ENST00000476635 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
PRKCI-202ENST00000476635 LATS2Q9NRM7 1088 aa6.52□□□□□ -1.37
PRKCI-202ENST00000476635 TDP1Q9NUW8 608 aa6.52□□□□□ -1.37
PRKCI-202ENST00000476635 BFARQ9NZS9 450 aa6.52□□□□□ -1.37
PRKCI-202ENST00000476635 HACD3Q9P035 362 aa6.52□□□□□ -1.37
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PRKCI-202ENST00000476635 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa6.52□□□□□ -1.37
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PRKCI-202ENST00000476635 ANHXE9PGG2 379 aa6.52□□□□□ -1.37
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PRKCI-202ENST00000476635 C2CD2LO14523 706 aa6.52□□□□□ -1.37
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PRKCI-202ENST00000476635 EPCAMP16422 314 aa6.52□□□□□ -1.37
PRKCI-202ENST00000476635 WNT3AP56704 352 aa6.52□□□□□ -1.37
PRKCI-202ENST00000476635 TAF1AQ15573 450 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
PRKCI-202ENST00000476635 LRIT3Q3SXY7 679 aa6.52□□□□□ -1.37
PRKCI-202ENST00000476635 KBTBD12Q3ZCT8 623 aa6.52□□□□□ -1.37
PRKCI-202ENST00000476635 TXNDC8Q6A555 127 aa6.52□□□□□ -1.37
PRKCI-202ENST00000476635 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
PRKCI-202ENST00000476635 OTOP3Q7RTS5 596 aa6.52□□□□□ -1.37
PRKCI-202ENST00000476635 PIGWQ7Z7B1 504 aa6.52□□□□□ -1.37
PRKCI-202ENST00000476635 ADGRD2Q7Z7M1 963 aa6.52□□□□□ -1.37
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