RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473542.1

BBX-223, Transcript of BBX, HMG-box containing, human

TSL 3

Gene BBX, Length 581 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BBX-223	ENST00000473542	C17orf102	A2RUQ5	167 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BBX-223	ENST00000473542	WDR91	A4D1P6	747 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BBX-223	ENST00000473542	FAM157A	C9JC47	383 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BBX-223	ENST00000473542	KIR2DS3	K7RE56	304 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BBX-223	ENST00000473542	EBAG9	O00559	213 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BBX-223	ENST00000473542	TGFB1I1	O43294	461 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BBX-223	ENST00000473542	TIPRL	O75663	272 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BBX-223	ENST00000473542	TMCC1	O94876	653 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BBX-223	ENST00000473542	CBX6	O95503	412 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BBX-223	ENST00000473542	HEXA	P06865	529 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BBX-223	ENST00000473542	HOXB5	P09067	269 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BBX-223	ENST00000473542	IRF1	P10914	325 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BBX-223	ENST00000473542	PTGER1	P34995	402 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BBX-223	ENST00000473542	SLC16A2	P36021	539 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BBX-223	ENST00000473542	MLH1	P40692	756 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BBX-223	ENST00000473542	RGS2	P41220	211 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BBX-223	ENST00000473542	CTCF	P49711	727 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
BBX-223	ENST00000473542	ARSF	P54793	590 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BBX-223	ENST00000473542	DCTN2	Q13561	401 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
BBX-223	ENST00000473542	ALG10	Q5BKT4	473 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BBX-223	ENST00000473542	ALG10B	Q5I7T1	473 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BBX-223	ENST00000473542	FAM205BP	Q63HN1	556 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BBX-223	ENST00000473542	CDC73	Q6P1J9	531 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BBX-223	ENST00000473542	KLHL24	Q6TFL4	600 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BBX-223	ENST00000473542	ZNF782	Q6ZMW2	699 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
BBX-223	ENST00000473542	KDELC2	Q7Z4H8	507 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BBX-223	ENST00000473542	DDIAS	Q8IXT1	998 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BBX-223	ENST00000473542	ADGRF4	Q8IZF3	695 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BBX-223	ENST00000473542	OR4N2	Q8NGD1	307 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BBX-223	ENST00000473542	RSRC1	Q96IZ7	334 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
BBX-223	ENST00000473542	BARD1	Q99728	777 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
BBX-223	ENST00000473542	H2AFJ	Q9BTM1	129 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BBX-223	ENST00000473542	ITPA	Q9BY32	194 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BBX-223	ENST00000473542	CCDC68	Q9H2F9	335 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BBX-223	ENST00000473542	SLC32A1	Q9H598	525 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BBX-223	ENST00000473542	ZNF304	Q9HCX3	659 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BBX-223	ENST00000473542	C20orf141	Q9NUB4	165 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BBX-223	ENST00000473542	SLC45A1	Q9Y2W3	748 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BBX-223	ENST00000473542	PCDHGB5	Q9Y5G0	923 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BBX-223	ENST00000473542	PIAS3	Q9Y6X2	628 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BBX-223	ENST00000473542	RUSC2	Q8N2Y8	1516 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BBX-223	ENST00000473542	KAT6A	Q92794	2004 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BBX-223	ENST00000473542	TARSL2	A2RTX5	802 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
BBX-223	ENST00000473542	CBY3	A6NI87	242 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BBX-223	ENST00000473542	GTPBP1	O00178	669 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
BBX-223	ENST00000473542	LDLRAD4	O15165	306 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BBX-223	ENST00000473542	DOK2	O60496	412 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BBX-223	ENST00000473542	CNOT3	O75175	753 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
BBX-223	ENST00000473542	TACC1	O75410	805 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BBX-223	ENST00000473542	MLYCD	O95822	493 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BBX-223	ENST00000473542	ALOX12	P18054	663 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BBX-223	ENST00000473542	KLRC2	P26717	231 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BBX-223	ENST00000473542	GPR12	P47775	334 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BBX-223	ENST00000473542	GHRHR	Q02643	423 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BBX-223	ENST00000473542	PMPCA	Q10713	525 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BBX-223	ENST00000473542	PKP1	Q13835	747 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BBX-223	ENST00000473542	TAF11	Q15544	211 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BBX-223	ENST00000473542	ME3	Q16798	604 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BBX-223	ENST00000473542	TMEM119	Q4V9L6	283 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BBX-223	ENST00000473542	TXNDC8	Q6A555	127 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BBX-223	ENST00000473542	MIS18BP1	Q6P0N0	1132 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BBX-223	ENST00000473542	ZNF66	Q6ZN08	573 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BBX-223	ENST00000473542	SLC46A3	Q7Z3Q1	461 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BBX-223	ENST00000473542	CCDC25	Q86WR0	208 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BBX-223	ENST00000473542	GDPD5	Q8WTR4	605 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BBX-223	ENST00000473542	IGFBPL1	Q8WX77	278 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BBX-223	ENST00000473542	USP6NL	Q92738	828 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BBX-223	ENST00000473542	NSUN4	Q96CB9	384 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
BBX-223	ENST00000473542	PIP5K1A	Q99755	562 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BBX-223	ENST00000473542	SH2D3A	Q9BRG2	576 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BBX-223	ENST00000473542	WDR83	Q9BRX9	315 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
BBX-223	ENST00000473542	STRA6	Q9BX79	667 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BBX-223	ENST00000473542	CXorf56	Q9H5V9	222 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BBX-223	ENST00000473542	SYNC	Q9H7C4	482 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BBX-223	ENST00000473542	SPAG4	Q9NPE6	437 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BBX-223	ENST00000473542	SNTG1	Q9NSN8	517 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BBX-223	ENST00000473542	HCFC1R1	Q9NWW0	138 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BBX-223	ENST00000473542	ZNF70	Q9UC06	446 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
BBX-223	ENST00000473542	LIMA1	Q9UHB6	759 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
BBX-223	ENST00000473542	SLCO3A1	Q9UIG8	710 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BBX-223	ENST00000473542	A4GNT	Q9UNA3	340 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BBX-223	ENST00000473542	GPR34	Q9UPC5	381 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BBX-223	ENST00000473542	RABGAP1	Q9Y3P9	1069 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BBX-223	ENST00000473542	SLC4A4	Q9Y6R1	1079 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BBX-223	ENST00000473542	TRBV5-3	A0A0A0MS03	114 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BBX-223	ENST00000473542		A0A1W2PRG0	241 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BBX-223	ENST00000473542	MANSC4	A6NHS7	340 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
BBX-223	ENST00000473542	RHOD	O00212	210 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BBX-223	ENST00000473542	PPP6C	O00743	305 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BBX-223	ENST00000473542	GFPT2	O94808	682 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BBX-223	ENST00000473542	SPARC	P09486	303 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BBX-223	ENST00000473542	MYZAP	P0CAP1	466 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BBX-223	ENST00000473542	CTSA	P10619	480 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BBX-223	ENST00000473542	UNG	P13051	313 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
BBX-223	ENST00000473542	CD72	P21854	359 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BBX-223	ENST00000473542	ATP5F1	P24539	256 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
BBX-223	ENST00000473542	POU1F1	P28069	291 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BBX-223	ENST00000473542	TM4SF1	P30408	202 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BBX-223	ENST00000473542	ICAM3	P32942	547 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BBX-223	ENST00000473542	CIITA	P33076	1130 aa		4.93	□□□□□ -1.62

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