RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473406.5

RABGGTB-209, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTB, Length 721 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-209ENST00000473406 BPIFB3P59826 476 aa6.29□□□□□ -1.4
RABGGTB-209ENST00000473406 YWHAZP63104 245 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
RABGGTB-209ENST00000473406 OLIG2Q13516 323 aa6.29□□□□□ -1.4
RABGGTB-209ENST00000473406 BMPR2Q13873 1038 aa6.29□□□□□ -1.4
RABGGTB-209ENST00000473406 FGFBP1Q14512 234 aa6.29□□□□□ -1.4
RABGGTB-209ENST00000473406 SLMAPQ14BN4 828 aa6.29□□□□□ -1.4
RABGGTB-209ENST00000473406 VEPH1Q14D04 833 aa6.29□□□□□ -1.4
RABGGTB-209ENST00000473406 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
RABGGTB-209ENST00000473406 RPE65Q16518 533 aa6.29□□□□□ -1.4
RABGGTB-209ENST00000473406 BEAN1Q3B7T3 259 aa6.29□□□□□ -1.4
RABGGTB-209ENST00000473406 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
RABGGTB-209ENST00000473406 GLRX5Q86SX6 157 aa6.29□□□□□ -1.4
RABGGTB-209ENST00000473406 SFTPA1Q8IWL2 248 aa6.29□□□□□ -1.4
RABGGTB-209ENST00000473406 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
RABGGTB-209ENST00000473406 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
RABGGTB-209ENST00000473406 FUBP1Q96AE4 644 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
RABGGTB-209ENST00000473406 PGBD1Q96JS3 809 aa6.29□□□□□ -1.4
RABGGTB-209ENST00000473406 SPAG5Q96R06 1193 aa6.29□□□□□ -1.4
RABGGTB-209ENST00000473406 ADAM2Q99965 735 aa6.29□□□□□ -1.4
RABGGTB-209ENST00000473406 NAA11Q9BSU3 229 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
RABGGTB-209ENST00000473406 KIFC3Q9BVG8 833 aa6.29□□□□□ -1.4
RABGGTB-209ENST00000473406 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa6.29□□□□□ -1.4
RABGGTB-209ENST00000473406 DNAI2Q9GZS0 605 aa6.29□□□□□ -1.4
RABGGTB-209ENST00000473406 OSGEPL1Q9H4B0 414 aa6.29□□□□□ -1.4
RABGGTB-209ENST00000473406 PLK3Q9H4B4 646 aa6.29□□□□□ -1.4
RABGGTB-209ENST00000473406 COPS7BQ9H9Q2 264 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
RABGGTB-209ENST00000473406 ARHGEF38Q9NXL2 777 aa6.29□□□□□ -1.4
RABGGTB-209ENST00000473406 PLK2Q9NYY3 685 aa6.29□□□□□ -1.4
RABGGTB-209ENST00000473406 SH3BP4Q9P0V3 963 aa6.29□□□□□ -1.4
RABGGTB-209ENST00000473406 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa6.29□□□□□ -1.4
RABGGTB-209ENST00000473406 DTX4Q9Y2E6 619 aa6.29□□□□□ -1.4
RABGGTB-209ENST00000473406 BTBD3Q9Y2F9 522 aa6.29□□□□□ -1.4
RABGGTB-209ENST00000473406 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP6.29□□□□□ -1.4
RABGGTB-209ENST00000473406 VWC2LB2RUY7 222 aa6.28□□□□□ -1.4
RABGGTB-209ENST00000473406 QSOX1O00391 747 aa6.28□□□□□ -1.4
RABGGTB-209ENST00000473406 ADAMDEC1O15204 470 aa6.28□□□□□ -1.4
RABGGTB-209ENST00000473406 WDR46O15213 610 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
RABGGTB-209ENST00000473406 LPXNO60711 386 aa6.28□□□□□ -1.4
RABGGTB-209ENST00000473406 DIAPH2O60879 1101 aa6.28□□□□□ -1.4
RABGGTB-209ENST00000473406 SLC25A12O75746 678 aa6.28□□□□□ -1.4
RABGGTB-209ENST00000473406 NDUFA10O95299 355 aa6.28□□□□□ -1.4
RABGGTB-209ENST00000473406 CHRM2P08172 466 aa6.28□□□□□ -1.4
RABGGTB-209ENST00000473406 ADH4P08319 380 aa6.28□□□□□ -1.4
RABGGTB-209ENST00000473406 THEGLP0DJG4 465 aa6.28□□□□□ -1.4
RABGGTB-209ENST00000473406 FDPSP14324 419 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
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RABGGTB-209ENST00000473406 PON1P27169 355 aa6.28□□□□□ -1.4
RABGGTB-209ENST00000473406 PNLIPRP2P54317 469 aa6.28□□□□□ -1.4
RABGGTB-209ENST00000473406 LINC00310P59036 64 aa6.28□□□□□ -1.4
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RABGGTB-209ENST00000473406 PPP2R5BQ15173 497 aa6.28□□□□□ -1.4
RABGGTB-209ENST00000473406 HIST2H2ACQ16777 129 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
RABGGTB-209ENST00000473406 ARL13AQ5H913 290 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
RABGGTB-209ENST00000473406 SPDYAQ5MJ70 313 aa6.28□□□□□ -1.4
RABGGTB-209ENST00000473406 VWA1Q6PCB0 445 aa6.28□□□□□ -1.4
RABGGTB-209ENST00000473406 ABHD11Q8NFV4 315 aa6.28□□□□□ -1.4
RABGGTB-209ENST00000473406 MOSPD2Q8NHP6 518 aa6.28□□□□□ -1.4
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RABGGTB-209ENST00000473406 GDPD5Q8WTR4 605 aa6.28□□□□□ -1.4
RABGGTB-209ENST00000473406 SGCDQ92629 289 aa6.28□□□□□ -1.4
RABGGTB-209ENST00000473406 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP6.28□□□□□ -1.4
RABGGTB-209ENST00000473406 TBC1D31Q96DN5 1066 aa6.28□□□□□ -1.4
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RABGGTB-209ENST00000473406 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
RABGGTB-209ENST00000473406 PBKQ96KB5 322 aa6.28□□□□□ -1.4
RABGGTB-209ENST00000473406 TRIM2Q9C040 744 aa6.28□□□□□ -1.4
RABGGTB-209ENST00000473406 HRH4Q9H3N8 390 aa6.28□□□□□ -1.4
RABGGTB-209ENST00000473406 PDZD7Q9H5P4 517 aa6.28□□□□□ -1.4
RABGGTB-209ENST00000473406 Q9N2J8 555 aa6.28□□□□□ -1.4
RABGGTB-209ENST00000473406 SETD4Q9NVD3 440 aa6.28□□□□□ -1.4
RABGGTB-209ENST00000473406 ASNSD1Q9NWL6 643 aa6.28□□□□□ -1.4
RABGGTB-209ENST00000473406 NLKQ9UBE8 527 aa6.28□□□□□ -1.4
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RABGGTB-209ENST00000473406 TUBE1Q9UJT0 475 aa6.28□□□□□ -1.4
RABGGTB-209ENST00000473406 CLDN16Q9Y5I7 305 aa6.28□□□□□ -1.4
RABGGTB-209ENST00000473406 POMT1Q9Y6A1 747 aa6.28□□□□□ -1.4
RABGGTB-209ENST00000473406 A0A0U1RQK1 487 aa6.27□□□□□ -1.41
RABGGTB-209ENST00000473406 TCRBV21S2A2A0A5A6 115 aa6.27□□□□□ -1.41
RABGGTB-209ENST00000473406 ZNF320A2RRD8 509 aa6.27□□□□□ -1.41
RABGGTB-209ENST00000473406 NPEPPSL1A6NEC2 478 aa6.27□□□□□ -1.41
RABGGTB-209ENST00000473406 A6NL46 340 aa6.27□□□□□ -1.41
RABGGTB-209ENST00000473406 H0YAE9 185 aa6.27□□□□□ -1.41
RABGGTB-209ENST00000473406 HCRTR2O43614 444 aa6.27□□□□□ -1.41
RABGGTB-209ENST00000473406 FMO6PO60774 539 aa6.27□□□□□ -1.41
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RABGGTB-209ENST00000473406 AVILO75366 819 aa6.27□□□□□ -1.41
RABGGTB-209ENST00000473406 HLA-DQA2P01906 255 aa6.27□□□□□ -1.41
RABGGTB-209ENST00000473406 MT-ND3P03897 115 aa6.27□□□□□ -1.41
RABGGTB-209ENST00000473406 HOXB5P09067 269 aa6.27□□□□□ -1.41
RABGGTB-209ENST00000473406 FCGR2AP12318 317 aa6.27□□□□□ -1.41
RABGGTB-209ENST00000473406 ENGP17813 658 aa6.27□□□□□ -1.41
RABGGTB-209ENST00000473406 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
RABGGTB-209ENST00000473406 EDN2P20800 178 aa6.27□□□□□ -1.41
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RABGGTB-209ENST00000473406 VPS41P49754 854 aa6.27□□□□□ -1.41
RABGGTB-209ENST00000473406 ALDH3A2P51648 485 aa6.27□□□□□ -1.41
RABGGTB-209ENST00000473406 GALCP54803 685 aa6.27□□□□□ -1.41
RABGGTB-209ENST00000473406 DMWDQ09019 674 aa6.27□□□□□ -1.41
RABGGTB-209ENST00000473406 AP1B1Q10567 949 aa6.27□□□□□ -1.41
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