RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000446688.5

TNS1-209, Transcript of tensin 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TNS1, Length 4,292 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS1-209ENST00000446688 RGS18Q9NS28 235 aa10.11□□□□□ -0.79
TNS1-209ENST00000446688 TAS2R13Q9NYV9 303 aa10.11□□□□□ -0.79
TNS1-209ENST00000446688 MGAT4DA6NG13 374 aa10.1□□□□□ -0.79
TNS1-209ENST00000446688 TMEM114B3SHH9 223 aa10.1□□□□□ -0.79
TNS1-209ENST00000446688 UBDO15205 165 aa10.1□□□□□ -0.79
TNS1-209ENST00000446688 PMM2O15305 246 aa10.1□□□□□ -0.79
TNS1-209ENST00000446688 PHGDHO43175 533 aaKnown RBP10.1□□□□□ -0.79
TNS1-209ENST00000446688 FGFR1P11362 822 aa10.1□□□□□ -0.79
TNS1-209ENST00000446688 RPL14P50914 215 aaKnown RBP10.1□□□□□ -0.79
TNS1-209ENST00000446688 ZNF143P52747 638 aaPredicted RBP10.1□□□□□ -0.79
TNS1-209ENST00000446688 PLK1P53350 603 aa10.1□□□□□ -0.79
TNS1-209ENST00000446688 BCL2L1Q07817 233 aa10.1□□□□□ -0.79
TNS1-209ENST00000446688 TRAF2Q12933 501 aa10.1□□□□□ -0.79
TNS1-209ENST00000446688 TJAP1Q5JTD0 557 aa10.1□□□□□ -0.79
TNS1-209ENST00000446688 RHBDF2Q6PJF5 856 aa10.1□□□□□ -0.79
TNS1-209ENST00000446688 RD3Q7Z3Z2 195 aa10.1□□□□□ -0.79
TNS1-209ENST00000446688 TRMT11Q7Z4G4 463 aaKnown RBP10.1□□□□□ -0.79
TNS1-209ENST00000446688 ZCCHC7Q8N3Z6 543 aaKnown RBP10.1□□□□□ -0.79
TNS1-209ENST00000446688 C12orf65Q9H3J6 166 aaKnown RBP10.1□□□□□ -0.79
TNS1-209ENST00000446688 PRDM12Q9H4Q4 367 aa10.1□□□□□ -0.79
TNS1-209ENST00000446688 MRPL17Q9NRX2 175 aaKnown RBP10.1□□□□□ -0.79
TNS1-209ENST00000446688 FAM105AQ9NUU6 356 aa10.1□□□□□ -0.79
TNS1-209ENST00000446688 SCN3BQ9NY72 215 aa10.1□□□□□ -0.79
TNS1-209ENST00000446688 CDV3Q9UKY7 258 aaKnown RBP10.1□□□□□ -0.79
TNS1-209ENST00000446688 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa10.1□□□□□ -0.79
TNS1-209ENST00000446688 ELNP15502 786 aa10.1□□□□□ -0.79
TNS1-209ENST00000446688 ZNF23P17027 643 aa10.1□□□□□ -0.79
TNS1-209ENST00000446688 ABCG1P45844 678 aa10.1□□□□□ -0.79
TNS1-209ENST00000446688 CDK18Q07002 472 aa10.1□□□□□ -0.79
TNS1-209ENST00000446688 KLF10Q13118 480 aa10.1□□□□□ -0.79
TNS1-209ENST00000446688 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP10.1□□□□□ -0.79
TNS1-209ENST00000446688 HECTD3Q5T447 861 aa10.1□□□□□ -0.79
TNS1-209ENST00000446688 RAP1GAP2Q684P5 730 aa10.1□□□□□ -0.79
TNS1-209ENST00000446688 FAM183BPQ6ZVS7 135 aa10.1□□□□□ -0.79
TNS1-209ENST00000446688 ADGRG6Q86SQ4 1221 aa10.1□□□□□ -0.79
TNS1-209ENST00000446688 SYTL1Q8IYJ3 562 aa10.1□□□□□ -0.79
TNS1-209ENST00000446688 FNIP1Q8TF40 1166 aa10.1□□□□□ -0.79
TNS1-209ENST00000446688 SEMA4DQ92854 862 aa10.1□□□□□ -0.79
TNS1-209ENST00000446688 TMEM159Q96B96 161 aa10.1□□□□□ -0.79
TNS1-209ENST00000446688 EBNA1BP2Q99848 306 aaKnown RBP10.1□□□□□ -0.79
TNS1-209ENST00000446688 THG1LQ9NWX6 298 aaKnown RBP10.1□□□□□ -0.79
TNS1-209ENST00000446688 DNAJC28Q9NX36 388 aa10.1□□□□□ -0.79
TNS1-209ENST00000446688 CDH9Q9ULB4 789 aa10.1□□□□□ -0.79
TNS1-209ENST00000446688 POMPQ9Y244 141 aa10.1□□□□□ -0.79
TNS1-209ENST00000446688 HACD1B0YJ81 288 aa10.1□□□□□ -0.79
TNS1-209ENST00000446688 HDAC3O15379 428 aa10.1□□□□□ -0.79
TNS1-209ENST00000446688 BUD23O43709 281 aaKnown RBP10.1□□□□□ -0.79
TNS1-209ENST00000446688 PEX1O43933 1283 aa10.1□□□□□ -0.79
TNS1-209ENST00000446688 SIN3BO75182 1162 aa10.1□□□□□ -0.79
TNS1-209ENST00000446688 ZMPSTE24O75844 475 aa10.1□□□□□ -0.79
TNS1-209ENST00000446688 ZNF12P17014 697 aa10.1□□□□□ -0.79
TNS1-209ENST00000446688 GRK3P35626 688 aa10.1□□□□□ -0.79
TNS1-209ENST00000446688 ZNF135P52742 658 aaPredicted RBP10.1□□□□□ -0.79
TNS1-209ENST00000446688 MTA1Q13330 715 aa10.1□□□□□ -0.79
TNS1-209ENST00000446688 ITGADQ13349 1161 aa10.1□□□□□ -0.79
TNS1-209ENST00000446688 TP53BP2Q13625 1128 aa10.1□□□□□ -0.79
TNS1-209ENST00000446688 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP10.1□□□□□ -0.794e-8■■■■□ 23.6
TNS1-209ENST00000446688 NEPROQ6NW34 567 aa10.1□□□□□ -0.79
TNS1-209ENST00000446688 PDSS2Q86YH6 399 aa10.1□□□□□ -0.79
TNS1-209ENST00000446688 P3H2Q8IVL5 708 aa10.1□□□□□ -0.79
TNS1-209ENST00000446688 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP10.1□□□□□ -0.79
TNS1-209ENST00000446688 DEFB118Q96PH6 123 aa10.1□□□□□ -0.79
TNS1-209ENST00000446688 SLC25A23Q9BV35 468 aa10.1□□□□□ -0.79
TNS1-209ENST00000446688 C2orf49Q9BVC5 232 aaPredicted RBP10.1□□□□□ -0.79
TNS1-209ENST00000446688 POLR1EQ9GZS1 481 aaKnown RBP10.1□□□□□ -0.79
TNS1-209ENST00000446688 PPM1HQ9ULR3 514 aa10.1□□□□□ -0.79
TNS1-209ENST00000446688 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa10.1□□□□□ -0.79
TNS1-209ENST00000446688 ASB3Q9Y575 518 aa10.1□□□□□ -0.79
TNS1-209ENST00000446688 NR2E3Q9Y5X4 410 aa10.1□□□□□ -0.79
TNS1-209ENST00000446688 TPP1O14773 563 aa10.1□□□□□ -0.79
TNS1-209ENST00000446688 IGSF6O95976 241 aa10.1□□□□□ -0.79
TNS1-209ENST00000446688 BRCC3P46736 316 aa10.1□□□□□ -0.79
TNS1-209ENST00000446688 NR1D2Q14995 579 aa10.1□□□□□ -0.79
TNS1-209ENST00000446688 SPANXN3Q5MJ09 141 aa10.1□□□□□ -0.79
TNS1-209ENST00000446688 SDHAF4Q5VUM1 108 aa10.1□□□□□ -0.79
TNS1-209ENST00000446688 HORMAD1Q86X24 394 aa10.1□□□□□ -0.79
TNS1-209ENST00000446688 NLGN2Q8NFZ4 835 aa10.1□□□□□ -0.79
TNS1-209ENST00000446688 PLEKHG4BQ96PX9 1271 aa10.1□□□□□ -0.79
TNS1-209ENST00000446688 SLC4A5Q9BY07 1137 aa10.1□□□□□ -0.79
TNS1-209ENST00000446688 SEMA6AQ9H2E6 1030 aa10.1□□□□□ -0.79
TNS1-209ENST00000446688 EPB41L4BQ9H329 900 aa10.1□□□□□ -0.79
TNS1-209ENST00000446688 EURLQ9NYK6 297 aa10.1□□□□□ -0.79
TNS1-209ENST00000446688 ADAM28Q9UKQ2 775 aa10.1□□□□□ -0.79
TNS1-209ENST00000446688 DYRK1BQ9Y463 629 aa10.1□□□□□ -0.79
TNS1-209ENST00000446688 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP10.09□□□□□ -0.79
TNS1-209ENST00000446688 IFRD1O00458 451 aaPredicted RBP10.09□□□□□ -0.79
TNS1-209ENST00000446688 MRASO14807 208 aa10.09□□□□□ -0.79
TNS1-209ENST00000446688 ACADMP11310 421 aa10.09□□□□□ -0.79
TNS1-209ENST00000446688 S100A1P23297 94 aa10.09□□□□□ -0.79
TNS1-209ENST00000446688 CLK1P49759 484 aaKnown RBP10.09□□□□□ -0.79
TNS1-209ENST00000446688 NAA20P61599 178 aa10.09□□□□□ -0.79
TNS1-209ENST00000446688 PLCL1Q15111 1095 aa10.09□□□□□ -0.79
TNS1-209ENST00000446688 NEDD8Q15843 81 aa10.09□□□□□ -0.79
TNS1-209ENST00000446688 ZNF618Q5T7W0 954 aa10.09□□□□□ -0.79
TNS1-209ENST00000446688 ARMC12Q5T9G4 340 aa10.09□□□□□ -0.79
TNS1-209ENST00000446688 NPNTQ6UXI9 565 aa10.09□□□□□ -0.79
TNS1-209ENST00000446688 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa10.09□□□□□ -0.79
TNS1-209ENST00000446688 GLT6D1Q7Z4J2 308 aa10.09□□□□□ -0.79
TNS1-209ENST00000446688 ERI1Q8IV48 349 aaKnown RBP10.09□□□□□ -0.79
TNS1-209ENST00000446688 OSCP1Q8WVF1 389 aa10.09□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.7 ms