RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000441222.7

USP46-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 46, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP46, Length 7,954 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP46-201ENST00000441222 ATP5C1P36542 298 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
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USP46-201ENST00000441222 HSF2Q03933 536 aa6.74□□□□□ -1.33
USP46-201ENST00000441222 SWI5Q1ZZU3 235 aa6.74□□□□□ -1.33
USP46-201ENST00000441222 ULK3Q6PHR2 472 aa6.74□□□□□ -1.33
USP46-201ENST00000441222 TSPAN14Q8NG11 270 aa6.74□□□□□ -1.33
USP46-201ENST00000441222 PIWIL2Q8TC59 973 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
USP46-201ENST00000441222 PTCD2Q8WV60 388 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
USP46-201ENST00000441222 BTBD9Q96Q07 612 aa6.74□□□□□ -1.33
USP46-201ENST00000441222 MRPL57Q9BQC6 102 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
USP46-201ENST00000441222 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
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USP46-201ENST00000441222 OR10H1Q9Y4A9 318 aa6.74□□□□□ -1.33
USP46-201ENST00000441222 ACTL7BQ9Y614 415 aa6.74□□□□□ -1.33
USP46-201ENST00000441222 FAM86C2PA6NEL3 165 aa6.74□□□□□ -1.33
USP46-201ENST00000441222 SAGE2PA6NJ88 616 aa6.74□□□□□ -1.33
USP46-201ENST00000441222 SIN3BO75182 1162 aa6.74□□□□□ -1.33
USP46-201ENST00000441222 GATBO75879 557 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
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USP46-201ENST00000441222 TTI2Q6NXR4 508 aa6.74□□□□□ -1.33
USP46-201ENST00000441222 SLC27A1Q6PCB7 646 aa6.74□□□□□ -1.33
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USP46-201ENST00000441222 ZSCAN2Q7Z7L9 614 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
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USP46-201ENST00000441222 TAAR1Q96RJ0 339 aa6.74□□□□□ -1.33
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USP46-201ENST00000441222 LRIG2O94898 1065 aa6.74□□□□□ -1.33
USP46-201ENST00000441222 CSF1RP07333 972 aa6.74□□□□□ -1.33
USP46-201ENST00000441222 CHKAP35790 457 aa6.74□□□□□ -1.33
USP46-201ENST00000441222 DDI2Q5TDH0 399 aa6.74□□□□□ -1.33
USP46-201ENST00000441222 TMC8Q8IU68 726 aa6.74□□□□□ -1.33
USP46-201ENST00000441222 REXO1L1PQ8IX06 675 aa6.74□□□□□ -1.33
USP46-201ENST00000441222 MEIOBQ8N635 442 aa6.74□□□□□ -1.33
USP46-201ENST00000441222 DGCR6LQ9BY27 220 aa6.74□□□□□ -1.33
USP46-201ENST00000441222 CRISPLD1Q9H336 500 aa6.74□□□□□ -1.33
USP46-201ENST00000441222 IDH3BO43837 385 aa6.74□□□□□ -1.33
USP46-201ENST00000441222 VAPBO95292 243 aa6.74□□□□□ -1.33
USP46-201ENST00000441222 LTFP02788 710 aa6.74□□□□□ -1.33
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USP46-201ENST00000441222 LTA4HP09960 611 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
USP46-201ENST00000441222 EPORP19235 508 aa6.74□□□□□ -1.33
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USP46-201ENST00000441222 PCID2Q5JVF3 399 aa6.74□□□□□ -1.33
USP46-201ENST00000441222 ATXN7L2Q5T6C5 722 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
USP46-201ENST00000441222 FAM46CQ5VWP2 391 aa6.74□□□□□ -1.33
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USP46-201ENST00000441222 FAM83AQ86UY5 434 aa6.74□□□□□ -1.33
USP46-201ENST00000441222 ADGRG2Q8IZP9 1017 aa6.74□□□□□ -1.33
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USP46-201ENST00000441222 UROC1Q96N76 676 aa6.74□□□□□ -1.33
USP46-201ENST00000441222 POPDC2Q9HBU9 364 aa6.74□□□□□ -1.33
USP46-201ENST00000441222 MORF4L1Q9UBU8 362 aa6.74□□□□□ -1.33
USP46-201ENST00000441222 HMGXB4Q9UGU5 601 aa6.74□□□□□ -1.33
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USP46-201ENST00000441222 PFDN2Q9UHV9 154 aa6.74□□□□□ -1.33
USP46-201ENST00000441222 GGA2Q9UJY4 613 aa6.74□□□□□ -1.33
USP46-201ENST00000441222 C15orf41Q9Y2V0 281 aa6.74□□□□□ -1.33
USP46-201ENST00000441222 GPC6Q9Y625 555 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
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USP46-201ENST00000441222 NDST1P52848 882 aa6.74□□□□□ -1.33
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USP46-201ENST00000441222 ZNF34Q8IZ26 560 aa6.74□□□□□ -1.33
USP46-201ENST00000441222 NEK7Q8TDX7 302 aa6.74□□□□□ -1.33
USP46-201ENST00000441222 RFT1Q96AA3 541 aa6.74□□□□□ -1.33
USP46-201ENST00000441222 CPB2Q96IY4 423 aa6.74□□□□□ -1.33
USP46-201ENST00000441222 DCUN1D5Q9BTE7 237 aa6.74□□□□□ -1.33
USP46-201ENST00000441222 CDADC1Q9BWV3 514 aa6.74□□□□□ -1.33
USP46-201ENST00000441222 EHD4Q9H223 541 aa6.74□□□□□ -1.33
USP46-201ENST00000441222 MUC13Q9H3R2 512 aa6.74□□□□□ -1.33
USP46-201ENST00000441222 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa6.74□□□□□ -1.33
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