RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000435535.1

RPS3AP54-201, Transcript of ribosomal protein S3a pseudogene 54, humanhuman

BASIC

Gene RPS3AP54, Length 734 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3AP54-201ENST00000435535 TPP1O14773 563 aa4.73□□□□□ -1.65
RPS3AP54-201ENST00000435535 SYN3O14994 580 aa4.73□□□□□ -1.65
RPS3AP54-201ENST00000435535 SPTLC2O15270 562 aa4.73□□□□□ -1.65
RPS3AP54-201ENST00000435535 GPR42O15529 346 aa4.73□□□□□ -1.65
RPS3AP54-201ENST00000435535 HCRTO43612 131 aa4.73□□□□□ -1.65
RPS3AP54-201ENST00000435535 VNN2O95498 520 aa4.73□□□□□ -1.65
RPS3AP54-201ENST00000435535 PIGRP01833 764 aa4.73□□□□□ -1.65
RPS3AP54-201ENST00000435535 ITGB3P05106 788 aa4.73□□□□□ -1.65
RPS3AP54-201ENST00000435535 RHOP08100 348 aa4.73□□□□□ -1.65
RPS3AP54-201ENST00000435535 KRT19P08727 400 aa4.73□□□□□ -1.65
RPS3AP54-201ENST00000435535 ODC1P11926 461 aa4.73□□□□□ -1.65
RPS3AP54-201ENST00000435535 MYL4P12829 197 aa4.73□□□□□ -1.65
RPS3AP54-201ENST00000435535 KCNE1P15382 129 aa4.73□□□□□ -1.65
RPS3AP54-201ENST00000435535 MALP21145 153 aa4.73□□□□□ -1.65
RPS3AP54-201ENST00000435535 ELF1P32519 619 aa4.73□□□□□ -1.65
RPS3AP54-201ENST00000435535 RPS19P39019 145 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
RPS3AP54-201ENST00000435535 CCR2P41597 374 aa4.73□□□□□ -1.65
RPS3AP54-201ENST00000435535 ME1P48163 572 aa4.73□□□□□ -1.65
RPS3AP54-201ENST00000435535 CYP2J2P51589 502 aa4.73□□□□□ -1.65
RPS3AP54-201ENST00000435535 AGFG1P52594 562 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
RPS3AP54-201ENST00000435535 NKX6-1P78426 367 aaPredicted RBP4.73□□□□□ -1.65
RPS3AP54-201ENST00000435535 TWF1Q12792 350 aa4.73□□□□□ -1.65
RPS3AP54-201ENST00000435535 TCF15Q12870 199 aa4.73□□□□□ -1.65
RPS3AP54-201ENST00000435535 BFSP1Q12934 665 aa4.73□□□□□ -1.65
RPS3AP54-201ENST00000435535 PLD1Q13393 1074 aa4.73□□□□□ -1.65
RPS3AP54-201ENST00000435535 TDGQ13569 410 aa4.73□□□□□ -1.65
RPS3AP54-201ENST00000435535 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP4.73□□□□□ -1.65
RPS3AP54-201ENST00000435535 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa4.73□□□□□ -1.65
RPS3AP54-201ENST00000435535 MAP9Q49MG5 647 aa4.73□□□□□ -1.65
RPS3AP54-201ENST00000435535 XKR4Q5GH76 650 aa4.73□□□□□ -1.65
RPS3AP54-201ENST00000435535 STXBP5Q5T5C0 1151 aa4.73□□□□□ -1.65
RPS3AP54-201ENST00000435535 C9orf57Q5W0N0 161 aa4.73□□□□□ -1.65
RPS3AP54-201ENST00000435535 TCTN3Q6NUS6 607 aa4.73□□□□□ -1.65
RPS3AP54-201ENST00000435535 ARMCX5Q6P1M9 558 aa4.73□□□□□ -1.65
RPS3AP54-201ENST00000435535 PDXDC1Q6P996 788 aa4.73□□□□□ -1.65
RPS3AP54-201ENST00000435535 DCLRE1AQ6PJP8 1040 aa4.73□□□□□ -1.65
RPS3AP54-201ENST00000435535 SHC4Q6S5L8 630 aa4.73□□□□□ -1.65
RPS3AP54-201ENST00000435535 NPNTQ6UXI9 565 aa4.73□□□□□ -1.65
RPS3AP54-201ENST00000435535 ALKAL1Q6UXT8 129 aa4.73□□□□□ -1.65
RPS3AP54-201ENST00000435535 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa4.73□□□□□ -1.65
RPS3AP54-201ENST00000435535 LIMS2Q7Z4I7 341 aa4.73□□□□□ -1.65
RPS3AP54-201ENST00000435535 XYLT1Q86Y38 959 aa4.73□□□□□ -1.65
RPS3AP54-201ENST00000435535 NELFCDQ8IXH7 590 aa4.73□□□□□ -1.65
RPS3AP54-201ENST00000435535 UBALD2Q8IYN6 164 aa4.73□□□□□ -1.65
RPS3AP54-201ENST00000435535 FUKQ8N0W3 1084 aa4.73□□□□□ -1.65
RPS3AP54-201ENST00000435535 LINC00301Q8NCQ3 95 aa4.73□□□□□ -1.65
RPS3AP54-201ENST00000435535 BEST2Q8NFU1 509 aa4.73□□□□□ -1.65
RPS3AP54-201ENST00000435535 OR10T2Q8NGX3 314 aa4.73□□□□□ -1.65
RPS3AP54-201ENST00000435535 DNAJC19Q96DA6 116 aa4.73□□□□□ -1.65
RPS3AP54-201ENST00000435535 BORCS6Q96GS4 357 aa4.73□□□□□ -1.65
RPS3AP54-201ENST00000435535 SEPT5Q99719 369 aaPredicted RBP4.73□□□□□ -1.65
RPS3AP54-201ENST00000435535 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
RPS3AP54-201ENST00000435535 CBWD1Q9BRT8 395 aa4.73□□□□□ -1.65
RPS3AP54-201ENST00000435535 RPP25Q9BUL9 199 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
RPS3AP54-201ENST00000435535 SSBP3Q9BWW4 388 aaPredicted RBP4.73□□□□□ -1.65
RPS3AP54-201ENST00000435535 B3GNT5Q9BYG0 378 aa4.73□□□□□ -1.65
RPS3AP54-201ENST00000435535 TBC1D17Q9HA65 648 aa4.73□□□□□ -1.65
RPS3AP54-201ENST00000435535 ARHGEF3Q9NR81 526 aa4.73□□□□□ -1.65
RPS3AP54-201ENST00000435535 PANK4Q9NVE7 773 aa4.73□□□□□ -1.65
RPS3AP54-201ENST00000435535 RBAKQ9NYW8 714 aaPredicted RBP4.73□□□□□ -1.65
RPS3AP54-201ENST00000435535 PLA2G3Q9NZ20 509 aa4.73□□□□□ -1.65
RPS3AP54-201ENST00000435535 MOCS1Q9NZB8 636 aa4.73□□□□□ -1.65
RPS3AP54-201ENST00000435535 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
RPS3AP54-201ENST00000435535 SLC23A1Q9UHI7 598 aa4.73□□□□□ -1.65
RPS3AP54-201ENST00000435535 POLHQ9Y253 713 aa4.73□□□□□ -1.65
RPS3AP54-201ENST00000435535 RUVBL1Q9Y265 456 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
RPS3AP54-201ENST00000435535 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
RPS3AP54-201ENST00000435535 TNRC6BQ9UPQ9 1833 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
RPS3AP54-201ENST00000435535 ADAMTS9Q9P2N4 1935 aa4.73□□□□□ -1.65
RPS3AP54-201ENST00000435535 OTOGLQ3ZCN5 2332 aa4.73□□□□□ -1.65
RPS3AP54-201ENST00000435535 EP300Q09472 2414 aaPredicted RBP4.72□□□□□ -1.65
RPS3AP54-201ENST00000435535 CEP250Q9BV73 2442 aa4.72□□□□□ -1.65
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZNF292O60281 2723 aa4.72□□□□□ -1.65
RPS3AP54-201ENST00000435535 A0A0B4J269 797 aa4.72□□□□□ -1.65
RPS3AP54-201ENST00000435535 MTMR11A4FU01 709 aa4.72□□□□□ -1.65
RPS3AP54-201ENST00000435535 H7C4K7 107 aa4.72□□□□□ -1.65
RPS3AP54-201ENST00000435535 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
RPS3AP54-201ENST00000435535 FOXS1O43638 330 aa4.72□□□□□ -1.65
RPS3AP54-201ENST00000435535 PI15O43692 258 aa4.72□□□□□ -1.65
RPS3AP54-201ENST00000435535 YEATS4O95619 227 aa4.72□□□□□ -1.65
RPS3AP54-201ENST00000435535 ADRB2P07550 413 aa4.72□□□□□ -1.65
RPS3AP54-201ENST00000435535 DCNP07585 359 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
RPS3AP54-201ENST00000435535 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP4.72□□□□□ -1.65
RPS3AP54-201ENST00000435535 SBK3P0C264 359 aa4.72□□□□□ -1.65
RPS3AP54-201ENST00000435535 TMEM191BP0C7N4 346 aa4.72□□□□□ -1.65
RPS3AP54-201ENST00000435535 RAP2AP10114 183 aa4.72□□□□□ -1.65
RPS3AP54-201ENST00000435535 LAMP2P13473 410 aa4.72□□□□□ -1.65
RPS3AP54-201ENST00000435535 GAP43P17677 238 aa4.72□□□□□ -1.65
RPS3AP54-201ENST00000435535 CD72P21854 359 aa4.72□□□□□ -1.65
RPS3AP54-201ENST00000435535 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
RPS3AP54-201ENST00000435535 LRPAP1P30533 357 aa4.72□□□□□ -1.65
RPS3AP54-201ENST00000435535 HOXA9P31269 272 aa4.72□□□□□ -1.65
RPS3AP54-201ENST00000435535 RPL9P32969 192 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
RPS3AP54-201ENST00000435535 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
RPS3AP54-201ENST00000435535 GTF2BQ00403 316 aa4.72□□□□□ -1.65
RPS3AP54-201ENST00000435535 FOXL1Q12952 345 aa4.72□□□□□ -1.65
RPS3AP54-201ENST00000435535 UBXN2BQ14CS0 331 aa4.72□□□□□ -1.65
RPS3AP54-201ENST00000435535 SLC39A14Q15043 492 aa4.72□□□□□ -1.65
RPS3AP54-201ENST00000435535 TEAD2Q15562 447 aa4.72□□□□□ -1.65
RPS3AP54-201ENST00000435535 CSRP2Q16527 193 aa4.72□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.8 ms