RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428026.6

PTPRU-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRU, Length 5,550 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-204ENST00000428026 SERPINA6P08185 405 aa14.64□□□□□ -0.07
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PTPRU-204ENST00000428026 GPSM1Q86YR5 675 aa14.63□□□□□ -0.07
PTPRU-204ENST00000428026 C10orf107Q8IVU9 208 aa14.63□□□□□ -0.07
PTPRU-204ENST00000428026 CAMKK1Q8N5S9 505 aa14.63□□□□□ -0.07
PTPRU-204ENST00000428026 PTCD3Q96EY7 689 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
PTPRU-204ENST00000428026 GALNT8Q9NY28 637 aa14.63□□□□□ -0.07
PTPRU-204ENST00000428026 IKZF3Q9UKT9 509 aa14.63□□□□□ -0.07
PTPRU-204ENST00000428026 TPD52L2O43399 206 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
PTPRU-204ENST00000428026 RAMP2O60895 175 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRU-204ENST00000428026 NADKO95544 446 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
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