RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000427220.5

TTLL3-210, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TTLL3, Length 3,233 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL3-210ENST00000427220 ANPEPP15144 967 aa19.89■□□□□ 0.78
TTLL3-210ENST00000427220 TBX4P57082 545 aa19.89■□□□□ 0.78
TTLL3-210ENST00000427220 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP19.89■□□□□ 0.786e-14■■■■■ 38.6
TTLL3-210ENST00000427220 TRIP10Q15642 601 aa19.89■□□□□ 0.78
TTLL3-210ENST00000427220 PKN3Q6P5Z2 889 aa19.89■□□□□ 0.78
TTLL3-210ENST00000427220 TIFABQ6ZNK6 161 aa19.89■□□□□ 0.78
TTLL3-210ENST00000427220 SH3RF2Q8TEC5 729 aa19.89■□□□□ 0.78
TTLL3-210ENST00000427220 NPAS2Q99743 824 aa19.89■□□□□ 0.78
TTLL3-210ENST00000427220 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa19.89■□□□□ 0.78
TTLL3-210ENST00000427220 CDH19Q9H159 772 aa19.89■□□□□ 0.78
TTLL3-210ENST00000427220 POMKQ9H5K3 350 aa19.89■□□□□ 0.78
TTLL3-210ENST00000427220 GIMAP2Q9UG22 337 aa19.89■□□□□ 0.78
TTLL3-210ENST00000427220 DPPA5A6NC42 116 aa19.89■□□□□ 0.77
TTLL3-210ENST00000427220 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP19.89■□□□□ 0.77
TTLL3-210ENST00000427220 NCF1BA6NI72 391 aaPredicted RBP19.89■□□□□ 0.77
TTLL3-210ENST00000427220 NCF1CA8MVU1 366 aaPredicted RBP19.89■□□□□ 0.77
TTLL3-210ENST00000427220 NCAM2O15394 837 aa19.89■□□□□ 0.77
TTLL3-210ENST00000427220 MAFKO60675 156 aa19.89■□□□□ 0.77
TTLL3-210ENST00000427220 TM7SF2O76062 418 aa19.89■□□□□ 0.77
TTLL3-210ENST00000427220 NCF1P14598 390 aaPredicted RBP19.89■□□□□ 0.77
TTLL3-210ENST00000427220 GRK2P25098 689 aa19.89■□□□□ 0.77
TTLL3-210ENST00000427220 ACVRL1P37023 503 aa19.89■□□□□ 0.77
TTLL3-210ENST00000427220 COG7P83436 770 aa19.89■□□□□ 0.77
TTLL3-210ENST00000427220 LSM12Q3MHD2 195 aaKnown RBP19.89■□□□□ 0.77
TTLL3-210ENST00000427220 NEPROQ6NW34 567 aa19.89■□□□□ 0.77
TTLL3-210ENST00000427220 HDAC10Q969S8 669 aa19.89■□□□□ 0.77
TTLL3-210ENST00000427220 CATSPERBQ9H7T0 1116 aa19.89■□□□□ 0.77
TTLL3-210ENST00000427220 FBXO5Q9UKT4 447 aa19.89■□□□□ 0.77
TTLL3-210ENST00000427220 A0A0U1RQF3 1178 aa19.89■□□□□ 0.77
TTLL3-210ENST00000427220 CCDC166P0CW27 439 aa19.89■□□□□ 0.77
TTLL3-210ENST00000427220 NPY2RP49146 381 aa19.89■□□□□ 0.77
TTLL3-210ENST00000427220 DLG1Q12959 904 aa19.89■□□□□ 0.77
TTLL3-210ENST00000427220 SEL1L3Q68CR1 1132 aa19.89■□□□□ 0.77
TTLL3-210ENST00000427220 SUPV3L1Q8IYB8 786 aaKnown RBP eCLIP19.89■□□□□ 0.77
TTLL3-210ENST00000427220 HEXDCQ8WVB3 486 aa19.89■□□□□ 0.77
TTLL3-210ENST00000427220 RCN3Q96D15 328 aa19.89■□□□□ 0.77
TTLL3-210ENST00000427220 ABCC13Q9NSE7 274 aa19.89■□□□□ 0.77
TTLL3-210ENST00000427220 CDY1Q9Y6F8 540 aa19.89■□□□□ 0.77
TTLL3-210ENST00000427220 COX4I1P13073 169 aa19.88■□□□□ 0.77
TTLL3-210ENST00000427220 TFEBP19484 476 aa19.88■□□□□ 0.77
TTLL3-210ENST00000427220 RAB41Q5JT25 222 aa19.88■□□□□ 0.77
TTLL3-210ENST00000427220 PIK3R6Q5UE93 754 aa19.88■□□□□ 0.77
TTLL3-210ENST00000427220 CLEC6AQ6EIG7 209 aa19.88■□□□□ 0.77
TTLL3-210ENST00000427220 ACMSDQ8TDX5 336 aa19.88■□□□□ 0.77
TTLL3-210ENST00000427220 CDRT15Q96T59 188 aa19.88■□□□□ 0.77
TTLL3-210ENST00000427220 SLC9A7Q96T83 725 aa19.88■□□□□ 0.77
TTLL3-210ENST00000427220 ADA2Q9NZK5 511 aa19.88■□□□□ 0.77
TTLL3-210ENST00000427220 UXTQ9UBK9 157 aaPredicted RBP19.88■□□□□ 0.77
TTLL3-210ENST00000427220 DLX3O60479 287 aa19.88■□□□□ 0.77
TTLL3-210ENST00000427220 SLC35E2BP0CK96 405 aa19.88■□□□□ 0.77
TTLL3-210ENST00000427220 KLF10Q13118 480 aa19.88■□□□□ 0.77
TTLL3-210ENST00000427220 PCID2Q5JVF3 399 aa19.88■□□□□ 0.77
TTLL3-210ENST00000427220 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP19.88■□□□□ 0.77
TTLL3-210ENST00000427220 DCBLD1Q8N8Z6 715 aa19.88■□□□□ 0.77
TTLL3-210ENST00000427220 ALG9Q9H6U8 611 aa19.88■□□□□ 0.77
TTLL3-210ENST00000427220 AAR2Q9Y312 384 aaKnown RBP19.88■□□□□ 0.77
TTLL3-210ENST00000427220 MYO7AQ13402 2215 aa19.88■□□□□ 0.77
TTLL3-210ENST00000427220 A0A088AWK7 358 aa19.87■□□□□ 0.77
TTLL3-210ENST00000427220 KLHL2O95198 593 aa19.87■□□□□ 0.77
TTLL3-210ENST00000427220 TAF10Q12962 218 aa19.87■□□□□ 0.77
TTLL3-210ENST00000427220 DUSP4Q13115 394 aa19.87■□□□□ 0.77
TTLL3-210ENST00000427220 CCDC153Q494R4 210 aa19.87■□□□□ 0.77
TTLL3-210ENST00000427220 KCTD11Q693B1 232 aa19.87■□□□□ 0.77
TTLL3-210ENST00000427220 SAPCD2Q86UD0 394 aa19.87■□□□□ 0.77
TTLL3-210ENST00000427220 DDX51Q8N8A6 666 aaKnown RBP eCLIP19.87■□□□□ 0.77
TTLL3-210ENST00000427220 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP19.87■□□□□ 0.77
TTLL3-210ENST00000427220 GPAMQ9HCL2 828 aa19.87■□□□□ 0.77
TTLL3-210ENST00000427220 SARS2Q9NP81 518 aaKnown RBP19.87■□□□□ 0.77
TTLL3-210ENST00000427220 HNRNPCL1O60812 293 aaKnown RBP19.87■□□□□ 0.77
TTLL3-210ENST00000427220 KCNA5P22460 613 aa19.87■□□□□ 0.77
TTLL3-210ENST00000427220 RPL9P32969 192 aaKnown RBP19.87■□□□□ 0.77
TTLL3-210ENST00000427220 AP2B1P63010 937 aa19.87■□□□□ 0.77
TTLL3-210ENST00000427220 TUBB3Q13509 450 aa19.87■□□□□ 0.77
TTLL3-210ENST00000427220 DNAL1Q4LDG9 190 aa19.87■□□□□ 0.77
TTLL3-210ENST00000427220 MARC1Q5VT66 337 aa19.87■□□□□ 0.77
TTLL3-210ENST00000427220 IGSF8Q969P0 613 aa19.87■□□□□ 0.77
TTLL3-210ENST00000427220 MYEOVQ96EZ4 313 aa19.87■□□□□ 0.77
TTLL3-210ENST00000427220 CCSER2Q9H7U1 834 aa19.87■□□□□ 0.77
TTLL3-210ENST00000427220 SMPD4Q9NXE4 827 aa19.87■□□□□ 0.77
TTLL3-210ENST00000427220 ANKRD12Q6UB98 2062 aa19.87■□□□□ 0.77
TTLL3-210ENST00000427220 ZNF487B1APH4 448 aa19.87■□□□□ 0.77
TTLL3-210ENST00000427220 WFS1O76024 890 aa19.87■□□□□ 0.77
TTLL3-210ENST00000427220 ANXA9O76027 345 aa19.87■□□□□ 0.77
TTLL3-210ENST00000427220 OR1E1P30953 314 aa19.87■□□□□ 0.77
TTLL3-210ENST00000427220 ARSDP51689 593 aa19.87■□□□□ 0.77
TTLL3-210ENST00000427220 KCNQ1P51787 676 aa19.87■□□□□ 0.77
TTLL3-210ENST00000427220 RNF220Q5VTB9 566 aa19.87■□□□□ 0.77
TTLL3-210ENST00000427220 LRRC8EQ6NSJ5 796 aa19.87■□□□□ 0.77
TTLL3-210ENST00000427220 LIMS2Q7Z4I7 341 aa19.87■□□□□ 0.77
TTLL3-210ENST00000427220 SOCS4Q8WXH5 440 aa19.87■□□□□ 0.77
TTLL3-210ENST00000427220 MTSS1O43312 755 aa19.86■□□□□ 0.77
TTLL3-210ENST00000427220 TOMM70O94826 608 aa19.86■□□□□ 0.77
TTLL3-210ENST00000427220 SUPT7LO94864 414 aa19.86■□□□□ 0.77
TTLL3-210ENST00000427220 SKIP12755 728 aa19.86■□□□□ 0.77
TTLL3-210ENST00000427220 SP100P23497 879 aaPredicted RBP19.86■□□□□ 0.77
TTLL3-210ENST00000427220 FKBP1BP68106 108 aa19.86■□□□□ 0.77
TTLL3-210ENST00000427220 MRPS22P82650 360 aaKnown RBP19.86■□□□□ 0.77
TTLL3-210ENST00000427220 ART3Q13508 389 aa19.86■□□□□ 0.77
TTLL3-210ENST00000427220 EFHBQ8N7U6 833 aa19.86■□□□□ 0.77
TTLL3-210ENST00000427220 ESAMQ96AP7 390 aa19.86■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 162 ms