RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000425695.5

HTATSF1-202, Transcript of HIV-1 Tat specific factor 1, humanhuman

TSL 3

Gene HTATSF1, Length 885 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTATSF1-202ENST00000425695 SPA17Q15506 151 aa25.4■■□□□ 1.66
HTATSF1-202ENST00000425695 ERN2Q76MJ5 926 aaKnown RBP25.4■■□□□ 1.66
HTATSF1-202ENST00000425695 CCDC170Q8IYT3 715 aa25.4■■□□□ 1.66
HTATSF1-202ENST00000425695 SPC24Q8NBT2 197 aa25.4■■□□□ 1.66
HTATSF1-202ENST00000425695 TSC1Q92574 1164 aa25.4■■□□□ 1.66
HTATSF1-202ENST00000425695 PPP1R16AQ96I34 528 aa25.4■■□□□ 1.66
HTATSF1-202ENST00000425695 EXOC2Q96KP1 924 aa25.4■■□□□ 1.66
HTATSF1-202ENST00000425695 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa25.4■■□□□ 1.66
HTATSF1-202ENST00000425695 EBF2Q9HAK2 575 aa25.4■■□□□ 1.66
HTATSF1-202ENST00000425695 SP110Q9HB58 689 aa25.4■■□□□ 1.66
HTATSF1-202ENST00000425695 PDFQ9HBH1 243 aa25.4■■□□□ 1.66
HTATSF1-202ENST00000425695 TM9SF3Q9HD45 589 aa25.4■■□□□ 1.66
HTATSF1-202ENST00000425695 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa25.4■■□□□ 1.66
HTATSF1-202ENST00000425695 SOWAHDA6NJG2 315 aa25.39■■□□□ 1.66
HTATSF1-202ENST00000425695 MTA2O94776 668 aa25.39■■□□□ 1.66
HTATSF1-202ENST00000425695 IGSF6O95976 241 aa25.39■■□□□ 1.66
HTATSF1-202ENST00000425695 SYPP08247 313 aa25.39■■□□□ 1.66
HTATSF1-202ENST00000425695 CYLC1P35663 651 aaPredicted RBP25.39■■□□□ 1.66
HTATSF1-202ENST00000425695 ARHGAP25P42331 645 aa25.39■■□□□ 1.66
HTATSF1-202ENST00000425695 NOP2P46087 812 aaKnown RBP25.39■■□□□ 1.66
HTATSF1-202ENST00000425695 CCR5P51681 352 aa25.39■■□□□ 1.66
HTATSF1-202ENST00000425695 ARSEP51690 589 aa25.39■■□□□ 1.66
HTATSF1-202ENST00000425695 ORAI3Q9BRQ5 295 aa25.39■■□□□ 1.66
HTATSF1-202ENST00000425695 LHX3Q9UBR4 397 aa25.39■■□□□ 1.66
HTATSF1-202ENST00000425695 IPO11Q9UI26 975 aaKnown RBP25.39■■□□□ 1.66
HTATSF1-202ENST00000425695 DOCK9Q9BZ29 2069 aa25.39■■□□□ 1.65
HTATSF1-202ENST00000425695 CACNA1EQ15878 2313 aa25.38■■□□□ 1.65
HTATSF1-202ENST00000425695 KNL1Q8NG31 2342 aa25.38■■□□□ 1.65
HTATSF1-202ENST00000425695 A0A1B0GVT2 93 aa25.38■■□□□ 1.65
HTATSF1-202ENST00000425695 A0A1W2PPC4 97 aa25.38■■□□□ 1.65
HTATSF1-202ENST00000425695 INSIG1O15503 277 aa25.38■■□□□ 1.65
HTATSF1-202ENST00000425695 PALMO75781 387 aa25.38■■□□□ 1.65
HTATSF1-202ENST00000425695 LCA5LO95447 670 aa25.38■■□□□ 1.65
HTATSF1-202ENST00000425695 UGT2B4P06133 528 aa25.38■■□□□ 1.65
HTATSF1-202ENST00000425695 KRT7P08729 469 aa25.38■■□□□ 1.65
HTATSF1-202ENST00000425695 CCDC15Q0P6D6 951 aa25.38■■□□□ 1.65
HTATSF1-202ENST00000425695 DPYSL3Q14195 570 aa25.38■■□□□ 1.65
HTATSF1-202ENST00000425695 LAYNQ6UX15 382 aa25.38■■□□□ 1.65
HTATSF1-202ENST00000425695 DGLUCYQ7Z3D6 616 aa25.38■■□□□ 1.65
HTATSF1-202ENST00000425695 TMTC1Q8IUR5 882 aa25.38■■□□□ 1.65
HTATSF1-202ENST00000425695 FAM71BQ8TC56 605 aa25.38■■□□□ 1.65
HTATSF1-202ENST00000425695 HDAC8Q9BY41 377 aa25.38■■□□□ 1.65
HTATSF1-202ENST00000425695 KDM4CQ9H3R0 1056 aa25.38■■□□□ 1.65
HTATSF1-202ENST00000425695 HYOU1Q9Y4L1 999 aa25.38■■□□□ 1.65
HTATSF1-202ENST00000425695 EPN1Q9Y6I3 576 aaPredicted RBP25.38■■□□□ 1.65
HTATSF1-202ENST00000425695 PCDH15Q96QU1 1955 aa25.37■■□□□ 1.65
HTATSF1-202ENST00000425695 PLXNA2O75051 1894 aa25.37■■□□□ 1.65
HTATSF1-202ENST00000425695 TNNT1P13805 278 aa25.37■■□□□ 1.65
HTATSF1-202ENST00000425695 ITGB7P26010 798 aa25.37■■□□□ 1.65
HTATSF1-202ENST00000425695 AFF3P51826 1226 aaKnown RBP25.37■■□□□ 1.65
HTATSF1-202ENST00000425695 RAD51Q06609 339 aa25.37■■□□□ 1.65
HTATSF1-202ENST00000425695 GRIK2Q13002 908 aa25.37■■□□□ 1.65
HTATSF1-202ENST00000425695 FBXL19Q6PCT2 694 aa25.37■■□□□ 1.65
HTATSF1-202ENST00000425695 PRPF39Q86UA1 669 aaKnown RBP25.37■■□□□ 1.65
HTATSF1-202ENST00000425695 MINDY1Q8N5J2 469 aa25.37■■□□□ 1.65
HTATSF1-202ENST00000425695 KLK6Q92876 244 aa25.37■■□□□ 1.65
HTATSF1-202ENST00000425695 SLC6A18Q96N87 628 aa25.37■■□□□ 1.65
HTATSF1-202ENST00000425695 KLHL32Q96NJ5 620 aa25.37■■□□□ 1.65
HTATSF1-202ENST00000425695 RCOR3Q9P2K3 495 aaPredicted RBP25.37■■□□□ 1.65
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HTATSF1-202ENST00000425695 NEK3P51956 506 aa25.36■■□□□ 1.65
HTATSF1-202ENST00000425695 IL10RBQ08334 325 aa25.36■■□□□ 1.65
HTATSF1-202ENST00000425695 PDK2Q15119 407 aa25.36■■□□□ 1.65
HTATSF1-202ENST00000425695 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa25.36■■□□□ 1.65
HTATSF1-202ENST00000425695 GDPD4Q6W3E5 623 aa25.36■■□□□ 1.65
HTATSF1-202ENST00000425695 PARS2Q7L3T8 475 aaKnown RBP25.36■■□□□ 1.65
HTATSF1-202ENST00000425695 RAPGEF5Q92565 580 aa25.36■■□□□ 1.65
HTATSF1-202ENST00000425695 VOPP1Q96AW1 172 aa25.36■■□□□ 1.65
HTATSF1-202ENST00000425695 LRIG1Q96JA1 1093 aa25.36■■□□□ 1.65
HTATSF1-202ENST00000425695 AASDHPPTQ9NRN7 309 aa25.36■■□□□ 1.65
HTATSF1-202ENST00000425695 DCHS1Q96JQ0 3298 aa25.36■■□□□ 1.65
HTATSF1-202ENST00000425695 ASCC3Q8N3C0 2202 aaKnown RBP25.35■■□□□ 1.65
HTATSF1-202ENST00000425695 C16orf96A6NNT2 1141 aa25.35■■□□□ 1.65
HTATSF1-202ENST00000425695 C10orf142B7Z368 130 aa25.35■■□□□ 1.65
HTATSF1-202ENST00000425695 WNT9AO14904 365 aa25.35■■□□□ 1.65
HTATSF1-202ENST00000425695 NDUFA10O95299 355 aa25.35■■□□□ 1.65
HTATSF1-202ENST00000425695 ADRB3P13945 408 aa25.35■■□□□ 1.65
HTATSF1-202ENST00000425695 KCNA4P22459 653 aa25.35■■□□□ 1.65
HTATSF1-202ENST00000425695 BNC1Q01954 994 aa25.35■■□□□ 1.65
HTATSF1-202ENST00000425695 TCEAL1Q15170 157 aa25.35■■□□□ 1.65
HTATSF1-202ENST00000425695 TEAD4Q15561 434 aa25.35■■□□□ 1.65
HTATSF1-202ENST00000425695 ZNF805Q5CZA5 627 aa25.35■■□□□ 1.65
HTATSF1-202ENST00000425695 ADAT2Q7Z6V5 191 aaKnown RBP25.35■■□□□ 1.65
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HTATSF1-202ENST00000425695 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP25.35■■□□□ 1.65
HTATSF1-202ENST00000425695 PCDH19Q8TAB3 1148 aa25.35■■□□□ 1.65
HTATSF1-202ENST00000425695 SERAC1Q96JX3 654 aa25.35■■□□□ 1.65
HTATSF1-202ENST00000425695 CINPQ9BW66 212 aaPredicted RBP25.35■■□□□ 1.65
HTATSF1-202ENST00000425695 PREBQ9HCU5 417 aa25.35■■□□□ 1.65
HTATSF1-202ENST00000425695 A0A1W2PQU0 124 aa25.34■■□□□ 1.65
HTATSF1-202ENST00000425695 TM4SF5O14894 197 aa25.34■■□□□ 1.65
HTATSF1-202ENST00000425695 FECHP22830 423 aa25.34■■□□□ 1.65
HTATSF1-202ENST00000425695 KDELR1P24390 212 aa25.34■■□□□ 1.65
HTATSF1-202ENST00000425695 CDC25BP30305 580 aa25.34■■□□□ 1.65
HTATSF1-202ENST00000425695 SERPINB6P35237 376 aa25.34■■□□□ 1.65
HTATSF1-202ENST00000425695 RGRP47804 291 aa25.34■■□□□ 1.65
HTATSF1-202ENST00000425695 RACK1P63244 317 aaKnown RBP25.34■■□□□ 1.65
HTATSF1-202ENST00000425695 RAD9BQ6WBX8 426 aa25.34■■□□□ 1.65
HTATSF1-202ENST00000425695 TRIM69Q86WT6 500 aa25.34■■□□□ 1.65
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