RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000421004.3

SCAMP1-AS1-201, SCAMP1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SCAMP1-AS1, Length 1,479 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KLF15Q9UIH9 416 aa13.42□□□□□ -0.26
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DNAJC12Q9UKB3 198 aa13.42□□□□□ -0.26
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SATB2Q9UPW6 733 aa13.42□□□□□ -0.26
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FCF1Q9Y324 198 aaKnown RBP13.42□□□□□ -0.26
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CSNK1G3Q9Y6M4 447 aa13.42□□□□□ -0.26
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 EME2A4GXA9 379 aaPredicted RBP13.41□□□□□ -0.26
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP13.41□□□□□ -0.26
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FPGTO14772 594 aa13.41□□□□□ -0.26
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 AQP9O43315 295 aa13.41□□□□□ -0.26
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SRGAP2O75044 1071 aa13.41□□□□□ -0.26
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CDH5P33151 784 aaPredicted RBP13.41□□□□□ -0.26
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FLT3P36888 993 aa13.41□□□□□ -0.26
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GABRB2P47870 512 aa13.41□□□□□ -0.26
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DNA2P51530 1060 aa13.41□□□□□ -0.26
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GNA12Q03113 381 aa13.41□□□□□ -0.26
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TPRG1LQ5T0D9 272 aa13.41□□□□□ -0.26
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GUSBP11Q6P575 273 aa13.41□□□□□ -0.26
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 EFL1Q7Z2Z2 1120 aaKnown RBP13.41□□□□□ -0.26
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FAM71AQ8IYT1 594 aa13.41□□□□□ -0.26
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TMEM35BQ8NCS4 154 aa13.41□□□□□ -0.26
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DENND6BQ8NEG7 585 aa13.41□□□□□ -0.26
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GRAMD1AQ96CP6 724 aa13.41□□□□□ -0.26
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LENG8Q96PV6 779 aaPredicted RBP13.41□□□□□ -0.26
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HAPLN3Q96S86 360 aa13.41□□□□□ -0.26
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DPH1Q9BZG8 443 aa13.41□□□□□ -0.26
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZYG11BQ9C0D3 744 aa13.41□□□□□ -0.26
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PDCL3Q9H2J4 239 aa13.41□□□□□ -0.26
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZDHHC6Q9H6R6 413 aa13.41□□□□□ -0.26
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 IPO11Q9UI26 975 aaKnown RBP13.41□□□□□ -0.26
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SALL4Q9UJQ4 1053 aa13.41□□□□□ -0.26
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 COL6A6A6NMZ7 2263 aa13.4□□□□□ -0.26
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CHD5Q8TDI0 1954 aa13.4□□□□□ -0.26
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 A0A1W2PNU3 283 aaPredicted RBP13.4□□□□□ -0.26
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CPED1A4D0V7 1026 aa13.4□□□□□ -0.26
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SPINT1O43278 529 aa13.4□□□□□ -0.26
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TSPAN6O43657 245 aa13.4□□□□□ -0.26
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 JUNDP17535 347 aa13.4□□□□□ -0.26
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RBMS1P29558 406 aaKnown RBP13.4□□□□□ -0.26
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ABL2P42684 1182 aa13.4□□□□□ -0.26
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP13.4□□□□□ -0.26
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PFN3P60673 137 aa13.4□□□□□ -0.26
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SGCGQ13326 291 aa13.4□□□□□ -0.26
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DEFB133Q30KQ1 61 aa13.4□□□□□ -0.26
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RBM44Q6ZP01 1051 aaKnown RBP13.4□□□□□ -0.26
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 BNIPLQ7Z465 357 aa13.4□□□□□ -0.26
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 XYLT1Q86Y38 959 aa13.4□□□□□ -0.26
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 IRF2BP1Q8IU81 584 aa13.4□□□□□ -0.26
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DRC7Q8IY82 874 aa13.4□□□□□ -0.26
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LMX1AQ8TE12 382 aa13.4□□□□□ -0.26
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RAB7BQ96AH8 199 aa13.4□□□□□ -0.26
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 C18orf8Q96DM3 657 aa13.4□□□□□ -0.26
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ATXN7L3BQ96GX2 97 aa13.4□□□□□ -0.26
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 C1QTNF2Q9BXJ5 285 aa13.4□□□□□ -0.26
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TM6SF2Q9BZW4 377 aa13.4□□□□□ -0.26
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ENTPD2Q9Y5L3 495 aa13.4□□□□□ -0.26
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ACTL7AQ9Y615 435 aa13.4□□□□□ -0.26
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 IGLON5A6NGN9 336 aa13.39□□□□□ -0.27
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 C16orf96A6NNT2 1141 aa13.39□□□□□ -0.27
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 J3QKU1 62 aa13.39□□□□□ -0.27
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TPP1O14773 563 aa13.39□□□□□ -0.27
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP13.39□□□□□ -0.27
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TCEA3O75764 348 aa13.39□□□□□ -0.27
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CD160O95971 181 aa13.39□□□□□ -0.27
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 BPIFB4P59827 614 aa13.39□□□□□ -0.27
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SKOR1P84550 965 aa13.39□□□□□ -0.27
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 VAC14Q08AM6 782 aa13.39□□□□□ -0.27
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 EIF2B5Q13144 721 aaKnown RBP13.39□□□□□ -0.27
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP13.39□□□□□ -0.27
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NR0B2Q15466 257 aa13.39□□□□□ -0.27
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TRNP1Q6NT89 227 aa13.39□□□□□ -0.27
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CRTC1Q6UUV9 634 aa13.39□□□□□ -0.27
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FAM131BQ86XD5 332 aa13.39□□□□□ -0.27
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RBFAQ8N0V3 343 aa13.39□□□□□ -0.27
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OR6K2Q8NGY2 324 aa13.39□□□□□ -0.27
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TPCN2Q8NHX9 752 aa13.39□□□□□ -0.27
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SNRNP27Q8WVK2 155 aaKnown RBP13.39□□□□□ -0.27
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 BTN2A2Q8WVV5 523 aa13.39□□□□□ -0.27
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ASB12Q8WXK4 309 aa13.39□□□□□ -0.27
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TTC9Q92623 222 aa13.39□□□□□ -0.27
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ISG20Q96AZ6 181 aaKnown RBP13.39□□□□□ -0.27
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CFAP57Q96MR6 1250 aa13.39□□□□□ -0.27
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SLC46A1Q96NT5 459 aa13.39□□□□□ -0.27
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PHF12Q96QT6 1004 aa13.39□□□□□ -0.27
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 IL12RB2Q99665 862 aa13.39□□□□□ -0.27
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SEMA4CQ9C0C4 833 aa13.39□□□□□ -0.27
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PPARGC1AQ9UBK2 798 aaKnown RBP13.39□□□□□ -0.27
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 APOBEC3BQ9UH17 382 aaKnown RBP13.39□□□□□ -0.27
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GGT7Q9UJ14 662 aa13.39□□□□□ -0.27
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ITM2BQ9Y287 266 aa13.39□□□□□ -0.27
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PCDHGA8Q9Y5G5 932 aa13.39□□□□□ -0.27
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CXorf51AA0A1B0GTR3 108 aa13.38□□□□□ -0.27
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FAM170AA1A519 330 aa13.38□□□□□ -0.27
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GOLGA8SH3BPF8 625 aa13.38□□□□□ -0.27
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NEMP1O14524 444 aa13.38□□□□□ -0.27
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CYP11B1P15538 503 aa13.38□□□□□ -0.27
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GKP32189 559 aa13.38□□□□□ -0.27
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ACVRL1P37023 503 aa13.38□□□□□ -0.27
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ETFBP38117 255 aa13.38□□□□□ -0.27
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MAN2A1Q16706 1144 aa13.38□□□□□ -0.27
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 C2CD6Q53TS8 623 aa13.38□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.4 ms