RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411710.1

LIMS1-AS1-201, LIMS1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene LIMS1-AS1, Length 477 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 PRR11Q96HE9 360 aaPredicted RBP3.99□□□□□ -1.77
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 CCDC34Q96HJ3 373 aa3.99□□□□□ -1.77
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 CFAP57Q96MR6 1250 aa3.99□□□□□ -1.77
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 DGAT2Q96PD7 388 aa3.99□□□□□ -1.77
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 CITED2Q99967 270 aaPredicted RBP3.99□□□□□ -1.77
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 TCF25Q9BQ70 676 aa3.99□□□□□ -1.77
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 SRSF8Q9BRL6 282 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 THUMPD3Q9BV44 507 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 HEMGNQ9BXL5 484 aa3.99□□□□□ -1.77
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 MRPL1Q9BYD6 325 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP3.99□□□□□ -1.77
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 FBRSL1Q9HCM7 1045 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 GCM1Q9NP62 436 aa3.99□□□□□ -1.77
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 MBNL1Q9NR56 388 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 OSGIN1Q9UJX0 560 aa3.99□□□□□ -1.77
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 MKLN1Q9UL63 735 aa3.99□□□□□ -1.77
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 LIPT1Q9Y234 373 aa3.99□□□□□ -1.77
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 SESN1Q9Y6P5 492 aa3.99□□□□□ -1.77
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 ADGRL2O95490 1459 aa3.98□□□□□ -1.77
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa3.98□□□□□ -1.77
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 LOC102723996A0A087X1L8 192 aa3.98□□□□□ -1.77
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 TEX13CA0A0J9YWL9 993 aa3.98□□□□□ -1.77
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 A0A1W2PR77 199 aa3.98□□□□□ -1.77
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 A0A1W2PRG0 241 aa3.98□□□□□ -1.77
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 A0A1W2PS29 197 aa3.98□□□□□ -1.77
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 ARHGAP10A1A4S6 786 aa3.98□□□□□ -1.77
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 PLOD2O00469 737 aa3.98□□□□□ -1.77
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 CPLX1O14810 134 aa3.98□□□□□ -1.77
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 SPRY2O43597 315 aa3.98□□□□□ -1.77
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 B3GALNT1O75752 331 aa3.98□□□□□ -1.77
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 VNN1O95497 513 aa3.98□□□□□ -1.77
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 OLFM2O95897 454 aa3.98□□□□□ -1.77
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 RB1P06400 928 aa3.98□□□□□ -1.77
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 CD19P15391 556 aa3.98□□□□□ -1.77
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 ITGALP20701 1170 aa3.98□□□□□ -1.77
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 AGAP20933 346 aa3.98□□□□□ -1.77
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 MMP8P22894 467 aa3.98□□□□□ -1.77
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 GJC1P36383 396 aa3.98□□□□□ -1.77
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 CLK3P49761 638 aaKnown RBP3.98□□□□□ -1.77
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP3.98□□□□□ -1.77
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 SRSF3P84103 164 aaKnown RBP3.98□□□□□ -1.77
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP3.98□□□□□ -1.77
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 TUBB3Q13509 450 aa3.98□□□□□ -1.77
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 GRAPQ13588 217 aa3.98□□□□□ -1.77
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 DYRK1AQ13627 763 aa3.98□□□□□ -1.77
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 TUBB2AQ13885 445 aa3.98□□□□□ -1.77
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 HLXQ14774 488 aaPredicted RBP3.98□□□□□ -1.77
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 PTPN14Q15678 1187 aa3.98□□□□□ -1.77
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 GSTA3Q16772 222 aa3.98□□□□□ -1.77
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 MEP1BQ16820 701 aa3.98□□□□□ -1.77
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 RBM20Q5T481 1227 aaKnown RBP3.98□□□□□ -1.77
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 PMS2CLQ68D20 193 aa3.98□□□□□ -1.77
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 RAB12Q6IQ22 244 aa3.98□□□□□ -1.77
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 GALNT17Q6IS24 598 aa3.98□□□□□ -1.77
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 HMBOX1Q6NT76 420 aa3.98□□□□□ -1.77
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 FAM111BQ6SJ93 734 aa3.98□□□□□ -1.77
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 CFAP77Q6ZQR2 320 aa3.98□□□□□ -1.77
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 LRRC55Q6ZSA7 311 aa3.98□□□□□ -1.77
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 SLC46A3Q7Z3Q1 461 aa3.98□□□□□ -1.77
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 KRT27Q7Z3Y8 459 aa3.98□□□□□ -1.77
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 MINDY1Q8N5J2 469 aa3.98□□□□□ -1.77
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 SPC24Q8NBT2 197 aa3.98□□□□□ -1.77
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 SETD9Q8NE22 299 aa3.98□□□□□ -1.77
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 KIF18AQ8NI77 898 aa3.98□□□□□ -1.77
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 OSCP1Q8WVF1 389 aa3.98□□□□□ -1.77
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 ST8SIA2Q92186 375 aa3.98□□□□□ -1.77
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 KRT35Q92764 455 aa3.98□□□□□ -1.77
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 EXOC4Q96A65 974 aa3.98□□□□□ -1.77
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP3.98□□□□□ -1.77
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 SIPA1Q96FS4 1042 aa3.98□□□□□ -1.77
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 KIRREL1Q96J84 757 aa3.98□□□□□ -1.77
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 RAB3IPQ96QF0 476 aaPredicted RBP3.98□□□□□ -1.77
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 OR2A14Q96R47 310 aa3.98□□□□□ -1.77
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 TUBB2BQ9BVA1 445 aa3.98□□□□□ -1.77
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 FAM129AQ9BZQ8 928 aa3.98□□□□□ -1.77
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 AMBRA1Q9C0C7 1298 aa3.98□□□□□ -1.77
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 DEF6Q9H4E7 631 aa3.98□□□□□ -1.77
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 PDZD7Q9H5P4 517 aa3.98□□□□□ -1.77
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 CDCP1Q9H5V8 836 aa3.98□□□□□ -1.77
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP3.98□□□□□ -1.77
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP3.98□□□□□ -1.77
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 SAP30LQ9HAJ7 183 aa3.98□□□□□ -1.77
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 CYP4F11Q9HBI6 524 aa3.98□□□□□ -1.77
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 SIRT3Q9NTG7 399 aaPredicted RBP3.98□□□□□ -1.77
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 C20orf141Q9NUB4 165 aa3.98□□□□□ -1.77
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 CHCHD3Q9NX63 227 aaKnown RBP3.98□□□□□ -1.77
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 CPSF2Q9P2I0 782 aaKnown RBP3.98□□□□□ -1.77
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 PEMTQ9UBM1 199 aa3.98□□□□□ -1.77
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 NKX1-2Q9UD57 310 aaPredicted RBP3.98□□□□□ -1.77
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 XPO7Q9UIA9 1087 aaKnown RBP3.98□□□□□ -1.77
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 SERTAD3Q9UJW9 196 aa3.98□□□□□ -1.77
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 ANAPC5Q9UJX4 755 aa3.98□□□□□ -1.77
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 NENFQ9UMX5 172 aa3.98□□□□□ -1.77
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 ZDHHC9Q9Y397 364 aa3.98□□□□□ -1.77
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 MTF2Q9Y483 593 aaPredicted RBP3.98□□□□□ -1.77
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 METP08581 1390 aa3.98□□□□□ -1.77
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP3.98□□□□□ -1.77
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 ATP10DQ9P241 1426 aa3.97□□□□□ -1.77
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 PRAMEF33A0A0G2JMD5 474 aa3.97□□□□□ -1.77
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 C3orf70A6NLC5 250 aaPredicted RBP3.97□□□□□ -1.77
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 102.8 ms