RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000393537.4

ANKRD39-201, Transcript of ankyrin repeat domain 39, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ANKRD39, Length 976 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39-201ENST00000393537 NDST2P52849 883 aa20.56■□□□□ 0.88
ANKRD39-201ENST00000393537 TRIM14Q14142 442 aa20.56■□□□□ 0.88
ANKRD39-201ENST00000393537 PIGHQ14442 188 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
ANKRD39-201ENST00000393537 MYLK3Q32MK0 819 aa20.56■□□□□ 0.88
ANKRD39-201ENST00000393537 INO80DQ53TQ3 878 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
ANKRD39-201ENST00000393537 PRAMEF14Q5SWL7 426 aa20.56■□□□□ 0.88
ANKRD39-201ENST00000393537 NEK5Q6P3R8 708 aa20.56■□□□□ 0.88
ANKRD39-201ENST00000393537 FBXL19Q6PCT2 694 aa20.56■□□□□ 0.88
ANKRD39-201ENST00000393537 PARS2Q7L3T8 475 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
ANKRD39-201ENST00000393537 HORMAD1Q86X24 394 aa20.56■□□□□ 0.88
ANKRD39-201ENST00000393537 KLK6Q92876 244 aa20.56■□□□□ 0.88
ANKRD39-201ENST00000393537 ARHGEF26Q96DR7 871 aa20.56■□□□□ 0.88
ANKRD39-201ENST00000393537 LRIG1Q96JA1 1093 aa20.56■□□□□ 0.88
ANKRD39-201ENST00000393537 BTBD6Q96KE9 485 aa20.56■□□□□ 0.88
ANKRD39-201ENST00000393537 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa20.56■□□□□ 0.88
ANKRD39-201ENST00000393537 SLC39A8Q9C0K1 460 aa20.56■□□□□ 0.88
ANKRD39-201ENST00000393537 ANAPC7Q9UJX3 599 aa20.56■□□□□ 0.88
ANKRD39-201ENST00000393537 TRPM6Q9BX84 2022 aa20.56■□□□□ 0.88
ANKRD39-201ENST00000393537 SLC31A1O15431 190 aa20.55■□□□□ 0.88
ANKRD39-201ENST00000393537 POP4O95707 220 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
ANKRD39-201ENST00000393537 IGSF6O95976 241 aa20.55■□□□□ 0.88
ANKRD39-201ENST00000393537 UGT2B4P06133 528 aa20.55■□□□□ 0.88
ANKRD39-201ENST00000393537 TCF4P15884 667 aa20.55■□□□□ 0.88
ANKRD39-201ENST00000393537 PRLRP16471 622 aa20.55■□□□□ 0.88
ANKRD39-201ENST00000393537 ERCC2P18074 760 aa20.55■□□□□ 0.88
ANKRD39-201ENST00000393537 RHOAP61586 193 aa20.55■□□□□ 0.88
ANKRD39-201ENST00000393537 IL9RQ01113 521 aa20.55■□□□□ 0.88
ANKRD39-201ENST00000393537 TRIP6Q15654 476 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
ANKRD39-201ENST00000393537 SMTNL2Q2TAL5 461 aa20.55■□□□□ 0.88
ANKRD39-201ENST00000393537 MFSD2AQ8NA29 543 aa20.55■□□□□ 0.88
ANKRD39-201ENST00000393537 OR8K1Q8NGG5 319 aa20.55■□□□□ 0.88
ANKRD39-201ENST00000393537 ZWILCHQ9H900 591 aa20.55■□□□□ 0.88
ANKRD39-201ENST00000393537 CWC15Q9P013 229 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
ANKRD39-201ENST00000393537 UBA2Q9UBT2 640 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
ANKRD39-201ENST00000393537 IP6K2Q9UHH9 426 aa20.55■□□□□ 0.88
ANKRD39-201ENST00000393537 PCOLCE2Q9UKZ9 415 aa20.55■□□□□ 0.88
ANKRD39-201ENST00000393537 NENFQ9UMX5 172 aa20.55■□□□□ 0.88
ANKRD39-201ENST00000393537 CA5BQ9Y2D0 317 aa20.55■□□□□ 0.88
ANKRD39-201ENST00000393537 ARHGAP42A6NI28 874 aa20.54■□□□□ 0.88
ANKRD39-201ENST00000393537 PRAMEF26H0Y7S4 382 aa20.54■□□□□ 0.88
ANKRD39-201ENST00000393537 J3KR12 359 aa20.54■□□□□ 0.88
ANKRD39-201ENST00000393537 TLR4O00206 839 aa20.54■□□□□ 0.88
ANKRD39-201ENST00000393537 FLRT2O43155 660 aa20.54■□□□□ 0.88
ANKRD39-201ENST00000393537 DFNA5O60443 496 aa20.54■□□□□ 0.88
ANKRD39-201ENST00000393537 PAPOLAP51003 745 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
ANKRD39-201ENST00000393537 ZNF135P52742 658 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
ANKRD39-201ENST00000393537 NXPH1P58417 271 aa20.54■□□□□ 0.88
ANKRD39-201ENST00000393537 SHC2P98077 582 aa20.54■□□□□ 0.88
ANKRD39-201ENST00000393537 STAT4Q14765 748 aa20.54■□□□□ 0.88
ANKRD39-201ENST00000393537 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
ANKRD39-201ENST00000393537 ZNF284Q2VY69 593 aa20.54■□□□□ 0.88
ANKRD39-201ENST00000393537 BOLA3Q53S33 107 aa20.54■□□□□ 0.88
ANKRD39-201ENST00000393537 ZNF805Q5CZA5 627 aa20.54■□□□□ 0.88
ANKRD39-201ENST00000393537 SEL1L3Q68CR1 1132 aa20.54■□□□□ 0.88
ANKRD39-201ENST00000393537 DBX2Q6ZNG2 339 aa20.54■□□□□ 0.88
ANKRD39-201ENST00000393537 VSTM4Q8IW00 320 aa20.54■□□□□ 0.88
ANKRD39-201ENST00000393537 NPWQ8N729 165 aa20.54■□□□□ 0.88
ANKRD39-201ENST00000393537 HSPH1Q92598 858 aa20.54■□□□□ 0.88
ANKRD39-201ENST00000393537 VOPP1Q96AW1 172 aa20.54■□□□□ 0.88
ANKRD39-201ENST00000393537 CNTNAP3BQ96NU0 1288 aa20.54■□□□□ 0.88
ANKRD39-201ENST00000393537 ELF4Q99607 663 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
ANKRD39-201ENST00000393537 DNAJC7Q99615 494 aa20.54■□□□□ 0.88
ANKRD39-201ENST00000393537 MYOCQ99972 504 aa20.54■□□□□ 0.88
ANKRD39-201ENST00000393537 OSBPL1AQ9BXW6 950 aa20.54■□□□□ 0.88
ANKRD39-201ENST00000393537 CNTNAP3Q9BZ76 1288 aa20.54■□□□□ 0.88
ANKRD39-201ENST00000393537 PDFQ9HBH1 243 aa20.54■□□□□ 0.88
ANKRD39-201ENST00000393537 GDF3Q9NR23 364 aa20.54■□□□□ 0.88
ANKRD39-201ENST00000393537 LHX3Q9UBR4 397 aa20.54■□□□□ 0.88
ANKRD39-201ENST00000393537 ZFR2Q9UPR6 939 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
ANKRD39-201ENST00000393537 FADS3Q9Y5Q0 445 aa20.54■□□□□ 0.88
ANKRD39-201ENST00000393537 A0A1B0GTQ1 180 aa20.53■□□□□ 0.88
ANKRD39-201ENST00000393537 C16orf96A6NNT2 1141 aa20.53■□□□□ 0.88
ANKRD39-201ENST00000393537 H3BRJ5 948 aa20.53■□□□□ 0.88
ANKRD39-201ENST00000393537 PRAMEF11O60813 436 aa20.53■□□□□ 0.88
ANKRD39-201ENST00000393537 CBFA2T3O75081 653 aa20.53■□□□□ 0.88
ANKRD39-201ENST00000393537 TPM1P09493 284 aa20.53■□□□□ 0.88
ANKRD39-201ENST00000393537 HCAR3P49019 387 aa20.53■□□□□ 0.88
ANKRD39-201ENST00000393537 RAD51Q06609 339 aa20.53■□□□□ 0.88
ANKRD39-201ENST00000393537 DPYSQ14117 519 aa20.53■□□□□ 0.88
ANKRD39-201ENST00000393537 CYTH1Q15438 398 aa20.53■□□□□ 0.88
ANKRD39-201ENST00000393537 DPYSL2Q16555 572 aa20.53■□□□□ 0.88
ANKRD39-201ENST00000393537 AFMIDQ63HM1 303 aa20.53■□□□□ 0.88
ANKRD39-201ENST00000393537 ARHGAP12Q8IWW6 846 aa20.53■□□□□ 0.88
ANKRD39-201ENST00000393537 NIPA2Q8N8Q9 360 aa20.53■□□□□ 0.88
ANKRD39-201ENST00000393537 RHBDD1Q8TEB9 315 aa20.53■□□□□ 0.88
ANKRD39-201ENST00000393537 EXOC2Q96KP1 924 aa20.53■□□□□ 0.88
ANKRD39-201ENST00000393537 KLHL32Q96NJ5 620 aa20.53■□□□□ 0.88
ANKRD39-201ENST00000393537 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP20.53■□□□□ 0.88
ANKRD39-201ENST00000393537 ZNHIT6Q9NWK9 470 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
ANKRD39-201ENST00000393537 BTBD3Q9Y2F9 522 aa20.53■□□□□ 0.88
ANKRD39-201ENST00000393537 MYO1FO00160 1098 aa20.52■□□□□ 0.88
ANKRD39-201ENST00000393537 DFFAO00273 331 aa20.52■□□□□ 0.88
ANKRD39-201ENST00000393537 PCDHGA12O60330 932 aa20.52■□□□□ 0.88
ANKRD39-201ENST00000393537 TOP3BO95985 862 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
ANKRD39-201ENST00000393537 RARAP10276 462 aa20.52■□□□□ 0.88
ANKRD39-201ENST00000393537 ARL4AP40617 200 aa20.52■□□□□ 0.88
ANKRD39-201ENST00000393537 ABL2P42684 1182 aa20.52■□□□□ 0.88
ANKRD39-201ENST00000393537 SLC18A3Q16572 532 aa20.52■□□□□ 0.88
ANKRD39-201ENST00000393537 TMEM259Q4ZIN3 620 aa20.52■□□□□ 0.88
ANKRD39-201ENST00000393537 TXNRD3NBQ6F5E7 133 aa20.52■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.9 ms