RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000379615.3

PGGT1B-202, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PGGT1B, Length 903 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-202ENST00000379615 LEFTY1O75610 366 aa15.62■□□□□ 0.09
PGGT1B-202ENST00000379615 CTNNA2P26232 953 aa15.62■□□□□ 0.09
PGGT1B-202ENST00000379615 ACSL1P33121 698 aa15.62■□□□□ 0.09
PGGT1B-202ENST00000379615 CTNNA1P35221 906 aaKnown RBP15.62■□□□□ 0.09
PGGT1B-202ENST00000379615 HOXD12P35452 270 aa15.62■□□□□ 0.09
PGGT1B-202ENST00000379615 GARSP41250 739 aaKnown RBP15.62■□□□□ 0.09
PGGT1B-202ENST00000379615 MAPK8P45983 427 aa15.62■□□□□ 0.09
PGGT1B-202ENST00000379615 CSNK1DP48730 415 aa15.62■□□□□ 0.09
PGGT1B-202ENST00000379615 RWDD2BP57060 319 aa15.62■□□□□ 0.09
PGGT1B-202ENST00000379615 COPS2P61201 443 aa15.62■□□□□ 0.09
PGGT1B-202ENST00000379615 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP15.62■□□□□ 0.09
PGGT1B-202ENST00000379615 ZNF235Q14590 738 aa15.62■□□□□ 0.09
PGGT1B-202ENST00000379615 LBRQ14739 615 aaKnown RBP15.62■□□□□ 0.09
PGGT1B-202ENST00000379615 TFDP3Q5H9I0 405 aa15.62■□□□□ 0.09
PGGT1B-202ENST00000379615 SLC9A4Q6AI14 798 aa15.62■□□□□ 0.09
PGGT1B-202ENST00000379615 SPOCD1Q6ZMY3 1216 aa15.62■□□□□ 0.09
PGGT1B-202ENST00000379615 ZNF662Q6ZS27 426 aa15.62■□□□□ 0.09
PGGT1B-202ENST00000379615 CCDC50Q8IVM0 306 aa15.62■□□□□ 0.09
PGGT1B-202ENST00000379615 AADATQ8N5Z0 425 aa15.62■□□□□ 0.09
PGGT1B-202ENST00000379615 UBL4BQ8N7F7 174 aa15.62■□□□□ 0.09
PGGT1B-202ENST00000379615 GRIN3AQ8TCU5 1115 aa15.62■□□□□ 0.09
PGGT1B-202ENST00000379615 FATE1Q969F0 183 aa15.62■□□□□ 0.09
PGGT1B-202ENST00000379615 HSPA12BQ96MM6 686 aa15.62■□□□□ 0.09
PGGT1B-202ENST00000379615 TSGA13Q96PP4 275 aa15.62■□□□□ 0.09
PGGT1B-202ENST00000379615 HDAC8Q9BY41 377 aa15.62■□□□□ 0.09
PGGT1B-202ENST00000379615 BRD8Q9H0E9 1235 aa15.62■□□□□ 0.09
PGGT1B-202ENST00000379615 CD93Q9NPY3 652 aa15.62■□□□□ 0.09
PGGT1B-202ENST00000379615 VPS45Q9NRW7 570 aa15.62■□□□□ 0.09
PGGT1B-202ENST00000379615 SARDHQ9UL12 918 aa15.62■□□□□ 0.09
PGGT1B-202ENST00000379615 GUCA1BQ9UMX6 200 aa15.62■□□□□ 0.09
PGGT1B-202ENST00000379615 WASF2Q9Y6W5 498 aa15.62■□□□□ 0.09
PGGT1B-202ENST00000379615 MEI4A8MW99 385 aa15.61■□□□□ 0.09
PGGT1B-202ENST00000379615 MFSD11O43934 449 aa15.61■□□□□ 0.09
PGGT1B-202ENST00000379615 NEBLO76041 1014 aa15.61■□□□□ 0.09
PGGT1B-202ENST00000379615 CTSLP07711 333 aa15.61■□□□□ 0.09
PGGT1B-202ENST00000379615 GNSP15586 552 aa15.61■□□□□ 0.09
PGGT1B-202ENST00000379615 CCNCP24863 283 aa15.61■□□□□ 0.09
PGGT1B-202ENST00000379615 ITGB7P26010 798 aa15.61■□□□□ 0.09
PGGT1B-202ENST00000379615 CDKN2BP42772 138 aa15.61■□□□□ 0.09
PGGT1B-202ENST00000379615 PTGER3P43115 390 aa15.61■□□□□ 0.09
PGGT1B-202ENST00000379615 NR2C2P49116 596 aa15.61■□□□□ 0.09
PGGT1B-202ENST00000379615 CCZ1BP86790 482 aa15.61■□□□□ 0.09
PGGT1B-202ENST00000379615 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP15.61■□□□□ 0.09
PGGT1B-202ENST00000379615 PDK1Q15118 436 aa15.61■□□□□ 0.09
PGGT1B-202ENST00000379615 TAZQ16635 292 aa15.61■□□□□ 0.09
PGGT1B-202ENST00000379615 ZNF805Q5CZA5 627 aa15.61■□□□□ 0.09
PGGT1B-202ENST00000379615 ATXN7L2Q5T6C5 722 aaPredicted RBP15.61■□□□□ 0.09
PGGT1B-202ENST00000379615 MARC1Q5VT66 337 aa15.61■□□□□ 0.09
PGGT1B-202ENST00000379615 FBXL19Q6PCT2 694 aa15.61■□□□□ 0.09
PGGT1B-202ENST00000379615 MFSD7Q6UXD7 560 aa15.61■□□□□ 0.09
PGGT1B-202ENST00000379615 ARHGAP36Q6ZRI8 547 aa15.61■□□□□ 0.09
PGGT1B-202ENST00000379615 ERN2Q76MJ5 926 aaKnown RBP15.61■□□□□ 0.09
PGGT1B-202ENST00000379615 ARMCX6Q7L4S7 300 aa15.61■□□□□ 0.09
PGGT1B-202ENST00000379615 SYT12Q8IV01 421 aa15.61■□□□□ 0.09
PGGT1B-202ENST00000379615 TP53INP2Q8IXH6 220 aa15.61■□□□□ 0.09
PGGT1B-202ENST00000379615 DEFB119Q8N690 84 aa15.61■□□□□ 0.09
PGGT1B-202ENST00000379615 NETO2Q8NC67 525 aa15.61■□□□□ 0.09
PGGT1B-202ENST00000379615 CCNYQ8ND76 341 aa15.61■□□□□ 0.09
PGGT1B-202ENST00000379615 OR2T34Q8NGX1 318 aa15.61■□□□□ 0.09
PGGT1B-202ENST00000379615 OR14C36Q8NHC7 312 aa15.61■□□□□ 0.09
PGGT1B-202ENST00000379615 PIGKQ92643 395 aa15.61■□□□□ 0.09
PGGT1B-202ENST00000379615 PSKH2Q96QS6 385 aa15.61■□□□□ 0.09
PGGT1B-202ENST00000379615 TUBGCP5Q96RT8 1024 aa15.61■□□□□ 0.09
PGGT1B-202ENST00000379615 CPEB1Q9BZB8 566 aaKnown RBP15.61■□□□□ 0.09
PGGT1B-202ENST00000379615 ARRDC1-AS1Q9H2J1 176 aa15.61■□□□□ 0.09
PGGT1B-202ENST00000379615 LHX3Q9UBR4 397 aa15.61■□□□□ 0.09
PGGT1B-202ENST00000379615 TRIM10Q9UDY6 481 aa15.61■□□□□ 0.09
PGGT1B-202ENST00000379615 SUSD2Q9UGT4 822 aa15.61■□□□□ 0.09
PGGT1B-202ENST00000379615 HEY1Q9Y5J3 304 aa15.61■□□□□ 0.09
PGGT1B-202ENST00000379615 ZNF292O60281 2723 aa15.61■□□□□ 0.09
PGGT1B-202ENST00000379615 RALGAPA1Q6GYQ0 2036 aa15.61■□□□□ 0.09
PGGT1B-202ENST00000379615 PI4KAP42356 2102 aa15.61■□□□□ 0.09
PGGT1B-202ENST00000379615 DMDP11532 3685 aa15.61■□□□□ 0.09
PGGT1B-202ENST00000379615 MED19A0JLT2 244 aaPredicted RBP15.6■□□□□ 0.09
PGGT1B-202ENST00000379615 FAM47DPA6NHR8 397 aa15.6■□□□□ 0.09
PGGT1B-202ENST00000379615 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP15.6■□□□□ 0.09
PGGT1B-202ENST00000379615 MATN3O15232 486 aa15.6■□□□□ 0.09
PGGT1B-202ENST00000379615 DRD3P35462 400 aa15.6■□□□□ 0.09
PGGT1B-202ENST00000379615 MPLP40238 635 aa15.6■□□□□ 0.09
PGGT1B-202ENST00000379615 NEK3P51956 506 aa15.6■□□□□ 0.09
PGGT1B-202ENST00000379615 GBE1Q04446 702 aa15.6■□□□□ 0.09
PGGT1B-202ENST00000379615 CNTN1Q12860 1018 aa15.6■□□□□ 0.09
PGGT1B-202ENST00000379615 HNRNPDQ14103 355 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
PGGT1B-202ENST00000379615 PPP2R5EQ16537 467 aa15.6■□□□□ 0.09
PGGT1B-202ENST00000379615 POM121L1PQ3SYA9 428 aa15.6■□□□□ 0.09
PGGT1B-202ENST00000379615 CFAP58Q5T655 872 aa15.6■□□□□ 0.09
PGGT1B-202ENST00000379615 GDPD4Q6W3E5 623 aa15.6■□□□□ 0.09
PGGT1B-202ENST00000379615 NT5DC3Q86UY8 548 aa15.6■□□□□ 0.09
PGGT1B-202ENST00000379615 RGL4Q8IZJ4 473 aa15.6■□□□□ 0.09
PGGT1B-202ENST00000379615 PLD5Q8N7P1 536 aa15.6■□□□□ 0.09
PGGT1B-202ENST00000379615 OR6K2Q8NGY2 324 aa15.6■□□□□ 0.09
PGGT1B-202ENST00000379615 CEP76Q8TAP6 659 aa15.6■□□□□ 0.09
PGGT1B-202ENST00000379615 HCAR2Q8TDS4 363 aa15.6■□□□□ 0.09
PGGT1B-202ENST00000379615 KRT35Q92764 455 aa15.6■□□□□ 0.09
PGGT1B-202ENST00000379615 FAM131CQ96AQ9 280 aa15.6■□□□□ 0.09
PGGT1B-202ENST00000379615 ZNF641Q96N77 438 aaPredicted RBP15.6■□□□□ 0.09
PGGT1B-202ENST00000379615 ALS2CR12Q96Q35 445 aa15.6■□□□□ 0.09
PGGT1B-202ENST00000379615 DTLQ9NZJ0 730 aa15.6■□□□□ 0.09
PGGT1B-202ENST00000379615 SERGEFQ9UGK8 458 aa15.6■□□□□ 0.09
PGGT1B-202ENST00000379615 EVLQ9UI08 416 aaPredicted RBP15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.3 ms