RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368547.3

ECHS1-201, Transcript of enoyl-CoA hydratase, short chain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ECHS1, Length 1,617 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHS1-201ENST00000368547 NT5MQ9NPB1 228 aa30.03■■■□□ 2.4
ECHS1-201ENST00000368547 LHX3Q9UBR4 397 aa30.03■■■□□ 2.4
ECHS1-201ENST00000368547 NEU2Q9Y3R4 380 aa30.03■■■□□ 2.4
ECHS1-201ENST00000368547 TECTAO75443 2155 aa30.02■■■□□ 2.4
ECHS1-201ENST00000368547 NTSR1P30989 418 aa30.02■■■□□ 2.4
ECHS1-201ENST00000368547 PTK6Q13882 451 aa30.02■■■□□ 2.4
ECHS1-201ENST00000368547 TEX44Q53QW1 395 aa30.02■■■□□ 2.4
ECHS1-201ENST00000368547 Q6ZVU0 165 aa30.02■■■□□ 2.4
ECHS1-201ENST00000368547 TRMT11Q7Z4G4 463 aaKnown RBP30.02■■■□□ 2.4
ECHS1-201ENST00000368547 PGBD5Q8N414 524 aa30.02■■■□□ 2.4
ECHS1-201ENST00000368547 CNTD1Q8N815 330 aa30.02■■■□□ 2.4
ECHS1-201ENST00000368547 TXNDC5Q8NBS9 432 aaKnown RBP30.02■■■□□ 2.4
ECHS1-201ENST00000368547 ISG20Q96AZ6 181 aaKnown RBP30.02■■■□□ 2.4
ECHS1-201ENST00000368547 EXOC2Q96KP1 924 aa30.02■■■□□ 2.4
ECHS1-201ENST00000368547 AGAP3Q96P47 875 aa30.02■■■□□ 2.4
ECHS1-201ENST00000368547 TM6SF2Q9BZW4 377 aa30.02■■■□□ 2.4
ECHS1-201ENST00000368547 MUSKO15146 869 aa30.01■■■□□ 2.39
ECHS1-201ENST00000368547 ZNF189O75820 626 aaPredicted RBP30.01■■■□□ 2.39
ECHS1-201ENST00000368547 STIP1P31948 543 aaKnown RBP30.01■■■□□ 2.39
ECHS1-201ENST00000368547 PPP1R7Q15435 360 aa30.01■■■□□ 2.39
ECHS1-201ENST00000368547 HNRNPA1L2Q32P51 320 aaKnown RBP30.01■■■□□ 2.39
ECHS1-201ENST00000368547 PCDH20Q8N6Y1 951 aaKnown RBP30.01■■■□□ 2.39
ECHS1-201ENST00000368547 CCHCR1Q8TD31 782 aa30.01■■■□□ 2.39
ECHS1-201ENST00000368547 FAM129AQ9BZQ8 928 aa30.01■■■□□ 2.39
ECHS1-201ENST00000368547 SIT1Q9Y3P8 196 aa30.01■■■□□ 2.39
ECHS1-201ENST00000368547 TTLL3Q9Y4R7 772 aa30.01■■■□□ 2.39
ECHS1-201ENST00000368547 BNIP3LO60238 219 aa30■■■□□ 2.39
ECHS1-201ENST00000368547 STK10O94804 968 aaKnown RBP30■■■□□ 2.39
ECHS1-201ENST00000368547 HLA-DQB2P05538 268 aa30■■■□□ 2.39
ECHS1-201ENST00000368547 EPHX1P07099 455 aa30■■■□□ 2.39
ECHS1-201ENST00000368547 SDE2Q6IQ49 451 aa30■■■□□ 2.39
ECHS1-201ENST00000368547 PKN3Q6P5Z2 889 aa30■■■□□ 2.39
ECHS1-201ENST00000368547 GSTA5Q7RTV2 222 aa30■■■□□ 2.39
ECHS1-201ENST00000368547 ZNF567Q8N184 647 aa30■■■□□ 2.39
ECHS1-201ENST00000368547 VAT1Q99536 393 aa30■■■□□ 2.39
ECHS1-201ENST00000368547 TTC28Q96AY4 2481 aa30■■■□□ 2.39
ECHS1-201ENST00000368547 ESYT3A0FGR9 886 aa30■■■□□ 2.39
ECHS1-201ENST00000368547 ADAM23O75077 832 aa30■■■□□ 2.39
ECHS1-201ENST00000368547 CARSP49589 748 aaKnown RBP30■■■□□ 2.39
ECHS1-201ENST00000368547 MAXP61244 160 aa30■■■□□ 2.39
ECHS1-201ENST00000368547 PTPRN2Q92932 1015 aa30■■■□□ 2.39
ECHS1-201ENST00000368547 TEKT5Q96M29 485 aa30■■■□□ 2.39
ECHS1-201ENST00000368547 KLHL8Q9P2G9 620 aaPredicted RBP30■■■□□ 2.39
ECHS1-201ENST00000368547 EDDM13A0A1B0GTR0 161 aa29.99■■■□□ 2.39
ECHS1-201ENST00000368547 TMEM221A6NGB7 291 aa29.99■■■□□ 2.39
ECHS1-201ENST00000368547 M0R296 226 aa29.99■■■□□ 2.39
ECHS1-201ENST00000368547 IFNB1P01574 187 aa29.99■■■□□ 2.39
ECHS1-201ENST00000368547 RGRP47804 291 aa29.99■■■□□ 2.39
ECHS1-201ENST00000368547 HSF5Q4G112 596 aaPredicted RBP29.99■■■□□ 2.39
ECHS1-201ENST00000368547 BEND6Q5SZJ8 279 aaPredicted RBP29.99■■■□□ 2.39
ECHS1-201ENST00000368547 ATXN7L2Q5T6C5 722 aaPredicted RBP29.99■■■□□ 2.39
ECHS1-201ENST00000368547 CWF19L1Q69YN2 538 aaKnown RBP29.99■■■□□ 2.39
ECHS1-201ENST00000368547 PID1Q7Z2X4 250 aa29.99■■■□□ 2.39
ECHS1-201ENST00000368547 CCDC89Q8N998 374 aa29.99■■■□□ 2.39
ECHS1-201ENST00000368547 CCDC110Q8TBZ0 833 aa29.99■■■□□ 2.39
ECHS1-201ENST00000368547 CLDN23Q96B33 292 aa29.99■■■□□ 2.39
ECHS1-201ENST00000368547 RTP4Q96DX8 246 aa29.99■■■□□ 2.39
ECHS1-201ENST00000368547 GABRG3Q99928 467 aa29.99■■■□□ 2.39
ECHS1-201ENST00000368547 HINFPQ9BQA5 517 aa29.99■■■□□ 2.39
ECHS1-201ENST00000368547 MGME1Q9BQP7 344 aa29.99■■■□□ 2.39
ECHS1-201ENST00000368547 SUN2Q9UH99 717 aa29.99■■■□□ 2.39
ECHS1-201ENST00000368547 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa29.99■■■□□ 2.39
ECHS1-201ENST00000368547 CKAP5Q14008 2032 aa29.99■■■□□ 2.39
ECHS1-201ENST00000368547 C5orf60A6NFR6 353 aa29.98■■■□□ 2.39
ECHS1-201ENST00000368547 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP29.98■■■□□ 2.39
ECHS1-201ENST00000368547 MYBL2P10244 700 aa29.98■■■□□ 2.39
ECHS1-201ENST00000368547 HSPA9P38646 679 aaKnown RBP29.98■■■□□ 2.39
ECHS1-201ENST00000368547 ITKQ08881 620 aa29.98■■■□□ 2.39
ECHS1-201ENST00000368547 KCTD19Q17RG1 926 aaPredicted RBP29.98■■■□□ 2.39
ECHS1-201ENST00000368547 ANKRD20A2Q5SQ80 823 aa29.98■■■□□ 2.39
ECHS1-201ENST00000368547 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa29.98■■■□□ 2.39
ECHS1-201ENST00000368547 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa29.98■■■□□ 2.39
ECHS1-201ENST00000368547 EMBQ6PCB8 327 aa29.98■■■□□ 2.39
ECHS1-201ENST00000368547 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP29.98■■■□□ 2.39
ECHS1-201ENST00000368547 OR2AP1Q8NGE2 309 aa29.98■■■□□ 2.39
ECHS1-201ENST00000368547 OR2A12Q8NGT7 310 aa29.98■■■□□ 2.39
ECHS1-201ENST00000368547 AENQ8WTP8 325 aaKnown RBP29.98■■■□□ 2.39
ECHS1-201ENST00000368547 IFT81Q8WYA0 676 aa29.98■■■□□ 2.39
ECHS1-201ENST00000368547 ERLEC1Q96DZ1 483 aa29.98■■■□□ 2.39
ECHS1-201ENST00000368547 HAUS2Q9NVX0 235 aa29.98■■■□□ 2.39
ECHS1-201ENST00000368547 TRHDEQ9UKU6 1024 aa29.98■■■□□ 2.39
ECHS1-201ENST00000368547 SNRPD1P62314 119 aaKnown RBP29.97■■■□□ 2.39
ECHS1-201ENST00000368547 GAS6Q14393 721 aa29.97■■■□□ 2.39
ECHS1-201ENST00000368547 CARD16Q5EG05 197 aa29.97■■■□□ 2.39
ECHS1-201ENST00000368547 PRUNE1Q86TP1 453 aa29.97■■■□□ 2.39
ECHS1-201ENST00000368547 GLIS1Q8NBF1 620 aa29.97■■■□□ 2.39
ECHS1-201ENST00000368547 SPATA13Q96N96 652 aa29.97■■■□□ 2.39
ECHS1-201ENST00000368547 POLR1EQ9GZS1 481 aaKnown RBP29.97■■■□□ 2.39
ECHS1-201ENST00000368547 MMP17Q9ULZ9 603 aa29.97■■■□□ 2.39
ECHS1-201ENST00000368547 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP29.96■■■□□ 2.39
ECHS1-201ENST00000368547 SIN3BO75182 1162 aa29.96■■■□□ 2.39
ECHS1-201ENST00000368547 GCATO75600 419 aa29.96■■■□□ 2.39
ECHS1-201ENST00000368547 GJB3O75712 270 aa29.96■■■□□ 2.39
ECHS1-201ENST00000368547 IGSF6O95976 241 aa29.96■■■□□ 2.39
ECHS1-201ENST00000368547 GSRP00390 522 aa29.96■■■□□ 2.39
ECHS1-201ENST00000368547 DCNP07585 359 aaKnown RBP29.96■■■□□ 2.39
ECHS1-201ENST00000368547 HOXB2P14652 356 aa29.96■■■□□ 2.39
ECHS1-201ENST00000368547 ETS1P14921 441 aa29.96■■■□□ 2.39
ECHS1-201ENST00000368547 RECQLP46063 649 aaPredicted RBP29.96■■■□□ 2.39
ECHS1-201ENST00000368547 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP29.96■■■□□ 2.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20 ms