RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000365280.1

RNU6-407P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 407, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-407P, Length 104 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-407P-201ENST00000365280 CNPY2Q9Y2B0 182 aa2.01□□□□□ -2.09
RNU6-407P-201ENST00000365280 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa2.01□□□□□ -2.09
RNU6-407P-201ENST00000365280 OBSCNQ5VST9 7968 aa2□□□□□ -2.09
RNU6-407P-201ENST00000365280 A0A0A0MQY5 61 aa2□□□□□ -2.09
RNU6-407P-201ENST00000365280 GOLGA6L10A0A0M3HER8 536 aa2□□□□□ -2.09
RNU6-407P-201ENST00000365280 IFRD1O00458 451 aaPredicted RBP2□□□□□ -2.09
RNU6-407P-201ENST00000365280 WNT9BO14905 357 aa2□□□□□ -2.09
RNU6-407P-201ENST00000365280 LIASO43766 372 aa2□□□□□ -2.09
RNU6-407P-201ENST00000365280 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP2□□□□□ -2.09
RNU6-407P-201ENST00000365280 SERPINC1P01008 464 aa2□□□□□ -2.09
RNU6-407P-201ENST00000365280 PRSS2P07478 247 aa2□□□□□ -2.09
RNU6-407P-201ENST00000365280 CHRM4P08173 479 aa2□□□□□ -2.09
RNU6-407P-201ENST00000365280 FCGR1AP12314 374 aa2□□□□□ -2.09
RNU6-407P-201ENST00000365280 DAOP14920 347 aa2□□□□□ -2.09
RNU6-407P-201ENST00000365280 CTPS1P17812 591 aa2□□□□□ -2.09
RNU6-407P-201ENST00000365280 RFC1P35251 1148 aaPredicted RBP2□□□□□ -2.09
RNU6-407P-201ENST00000365280 HNF1BP35680 557 aa2□□□□□ -2.09
RNU6-407P-201ENST00000365280 DPP6P42658 865 aa2□□□□□ -2.09
RNU6-407P-201ENST00000365280 GPD2P43304 727 aa2□□□□□ -2.09
RNU6-407P-201ENST00000365280 ART1P52961 327 aa2□□□□□ -2.09
RNU6-407P-201ENST00000365280 GAS1P54826 345 aa2□□□□□ -2.09
RNU6-407P-201ENST00000365280 DSCR9P59020 149 aa2□□□□□ -2.09
RNU6-407P-201ENST00000365280 HILS1P60008 231 aa2□□□□□ -2.09
RNU6-407P-201ENST00000365280 KIF5AQ12840 1032 aa2□□□□□ -2.09
RNU6-407P-201ENST00000365280 TRAF1Q13077 416 aa2□□□□□ -2.09
RNU6-407P-201ENST00000365280 IL13RA2Q14627 380 aa2□□□□□ -2.09
RNU6-407P-201ENST00000365280 HLFQ16534 295 aa2□□□□□ -2.09
RNU6-407P-201ENST00000365280 TIGD6Q17RP2 521 aa2□□□□□ -2.09
RNU6-407P-201ENST00000365280 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP2□□□□□ -2.09
RNU6-407P-201ENST00000365280 INO80DQ53TQ3 878 aaPredicted RBP2□□□□□ -2.09
RNU6-407P-201ENST00000365280 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa2□□□□□ -2.09
RNU6-407P-201ENST00000365280 ANKRD45Q5TZF3 282 aa2□□□□□ -2.09
RNU6-407P-201ENST00000365280 FBXL22Q6P050 247 aa2□□□□□ -2.09
RNU6-407P-201ENST00000365280 KLHL24Q6TFL4 600 aa2□□□□□ -2.09
RNU6-407P-201ENST00000365280 BBS12Q6ZW61 710 aa2□□□□□ -2.09
RNU6-407P-201ENST00000365280 MON1BQ7L1V2 547 aa2□□□□□ -2.09
RNU6-407P-201ENST00000365280 PALB2Q86YC2 1186 aa2□□□□□ -2.09
RNU6-407P-201ENST00000365280 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP2□□□□□ -2.09
RNU6-407P-201ENST00000365280 OR14A16Q8NHC5 309 aa2□□□□□ -2.09
RNU6-407P-201ENST00000365280 CEP76Q8TAP6 659 aa2□□□□□ -2.09
RNU6-407P-201ENST00000365280 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP2□□□□□ -2.09
RNU6-407P-201ENST00000365280 RAB40AQ8WXH6 277 aa2□□□□□ -2.09
RNU6-407P-201ENST00000365280 CCT6BQ92526 530 aa2□□□□□ -2.09
RNU6-407P-201ENST00000365280 TWNKQ96RR1 684 aa2□□□□□ -2.09
RNU6-407P-201ENST00000365280 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa2□□□□□ -2.09
RNU6-407P-201ENST00000365280 C6orf106Q9H6K1 298 aaPredicted RBP2□□□□□ -2.09
RNU6-407P-201ENST00000365280 ANKRD10Q9NXR5 420 aa2□□□□□ -2.09
RNU6-407P-201ENST00000365280 CDH22Q9UJ99 828 aa2□□□□□ -2.09
RNU6-407P-201ENST00000365280 DNAJC16Q9Y2G8 782 aa2□□□□□ -2.09
RNU6-407P-201ENST00000365280 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP2□□□□□ -2.09
RNU6-407P-201ENST00000365280 INSL5Q9Y5Q6 135 aa2□□□□□ -2.09
RNU6-407P-201ENST00000365280 PTGDR2Q9Y5Y4 395 aa2□□□□□ -2.09
RNU6-407P-201ENST00000365280 TCF20Q9UGU0 1960 aaKnown RBP1.99□□□□□ -2.09
RNU6-407P-201ENST00000365280 A0A0U1RQJ8 604 aa1.99□□□□□ -2.09
RNU6-407P-201ENST00000365280 C17orf113A0A1B0GUU1 675 aa1.99□□□□□ -2.09
RNU6-407P-201ENST00000365280 A0A1B0GUV1 79 aa1.99□□□□□ -2.09
RNU6-407P-201ENST00000365280 A0A1B0GVT2 93 aa1.99□□□□□ -2.09
RNU6-407P-201ENST00000365280 VWA3AA6NCI4 1184 aa1.99□□□□□ -2.09
RNU6-407P-201ENST00000365280 BTBD18B2RXH4 712 aa1.99□□□□□ -2.09
RNU6-407P-201ENST00000365280 CHL1O00533 1208 aa1.99□□□□□ -2.09
RNU6-407P-201ENST00000365280 SLC16A5O15375 505 aa1.99□□□□□ -2.09
RNU6-407P-201ENST00000365280 KRT38O76015 456 aa1.99□□□□□ -2.09
RNU6-407P-201ENST00000365280 GAGE7O76087 117 aa1.99□□□□□ -2.09
RNU6-407P-201ENST00000365280 ADAP00813 363 aa1.99□□□□□ -2.09
RNU6-407P-201ENST00000365280 IL1AP01583 271 aa1.99□□□□□ -2.09
RNU6-407P-201ENST00000365280 GAGE12FP0CL80 117 aa1.99□□□□□ -2.09
RNU6-407P-201ENST00000365280 GAGE12GP0CL81 117 aa1.99□□□□□ -2.09
RNU6-407P-201ENST00000365280 GAGE12IP0CL82 117 aa1.99□□□□□ -2.09
RNU6-407P-201ENST00000365280 HSD3B1P14060 373 aa1.99□□□□□ -2.09
RNU6-407P-201ENST00000365280 PTPN2P17706 415 aa1.99□□□□□ -2.09
RNU6-407P-201ENST00000365280 CHATP28329 748 aa1.99□□□□□ -2.09
RNU6-407P-201ENST00000365280 TNFRSF8P28908 595 aa1.99□□□□□ -2.09
RNU6-407P-201ENST00000365280 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP1.99□□□□□ -2.09
RNU6-407P-201ENST00000365280 TRAPPC10P48553 1259 aa1.99□□□□□ -2.09
RNU6-407P-201ENST00000365280 POU3F1Q03052 451 aaPredicted RBP1.99□□□□□ -2.09
RNU6-407P-201ENST00000365280 SLC18A2Q05940 514 aa1.99□□□□□ -2.09
RNU6-407P-201ENST00000365280 POU5F1BQ06416 359 aa1.99□□□□□ -2.09
RNU6-407P-201ENST00000365280 GAGE1Q13065 139 aa1.99□□□□□ -2.09
RNU6-407P-201ENST00000365280 GAGE4Q13068 117 aa1.99□□□□□ -2.09
RNU6-407P-201ENST00000365280 PPFIA1Q13136 1202 aa1.99□□□□□ -2.09
RNU6-407P-201ENST00000365280 HNF4GQ14541 408 aa1.99□□□□□ -2.09
RNU6-407P-201ENST00000365280 ME3Q16798 604 aa1.99□□□□□ -2.09
RNU6-407P-201ENST00000365280 LRRC24Q50LG9 513 aa1.99□□□□□ -2.09
RNU6-407P-201ENST00000365280 C10orf62Q5T681 223 aaPredicted RBP1.99□□□□□ -2.09
RNU6-407P-201ENST00000365280 IL20RBQ6UXL0 311 aa1.99□□□□□ -2.09
RNU6-407P-201ENST00000365280 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa1.99□□□□□ -2.09
RNU6-407P-201ENST00000365280 C2CD5Q86YS7 1000 aa1.99□□□□□ -2.09
RNU6-407P-201ENST00000365280 DENND6AQ8IWF6 608 aa1.99□□□□□ -2.09
RNU6-407P-201ENST00000365280 SFTPA2Q8IWL1 248 aa1.99□□□□□ -2.09
RNU6-407P-201ENST00000365280 LINS1Q8NG48 757 aa1.99□□□□□ -2.09
RNU6-407P-201ENST00000365280 CEP70Q8NHQ1 597 aa1.99□□□□□ -2.09
RNU6-407P-201ENST00000365280 CSGALNACT1Q8TDX6 532 aa1.99□□□□□ -2.09
RNU6-407P-201ENST00000365280 AFG1LQ8WV93 481 aa1.99□□□□□ -2.09
RNU6-407P-201ENST00000365280 NUDCD2Q8WVJ2 157 aa1.99□□□□□ -2.09
RNU6-407P-201ENST00000365280 NEUROG1Q92886 237 aa1.99□□□□□ -2.09
RNU6-407P-201ENST00000365280 RNF183Q96D59 192 aa1.99□□□□□ -2.09
RNU6-407P-201ENST00000365280 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP1.99□□□□□ -2.09
RNU6-407P-201ENST00000365280 APOLD1Q96LR9 279 aa1.99□□□□□ -2.09
RNU6-407P-201ENST00000365280 CD180Q99467 661 aa1.99□□□□□ -2.09
RNU6-407P-201ENST00000365280 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP1.99□□□□□ -2.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35 ms