RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361219.10

SERBP1-201, Transcript of SERPINE1 mRNA binding protein 1, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SERBP1, Length 2,103 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERBP1-201ENST00000361219 PDZD8Q8NEN9 1154 aa20.32■□□□□ 0.84
SERBP1-201ENST00000361219 OR6Y1Q8NGX8 325 aa20.32■□□□□ 0.84
SERBP1-201ENST00000361219 PIWIL2Q8TC59 973 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
SERBP1-201ENST00000361219 OVCA2Q8WZ82 227 aa20.32■□□□□ 0.84
SERBP1-201ENST00000361219 UTP4Q969X6 686 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
SERBP1-201ENST00000361219 TADA1Q96BN2 335 aa20.32■□□□□ 0.84
SERBP1-201ENST00000361219 MYEOVQ96EZ4 313 aa20.32■□□□□ 0.84
SERBP1-201ENST00000361219 RANBP9Q96S59 729 aa20.32■□□□□ 0.84
SERBP1-201ENST00000361219 CWH43Q9H720 699 aa20.32■□□□□ 0.84
SERBP1-201ENST00000361219 MARCOQ9UEW3 520 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
SERBP1-201ENST00000361219 SLC2A6Q9UGQ3 507 aa20.32■□□□□ 0.84
SERBP1-201ENST00000361219 COL4A6Q14031 1691 aa20.31■□□□□ 0.84
SERBP1-201ENST00000361219 FCHO1O14526 889 aa20.31■□□□□ 0.84
SERBP1-201ENST00000361219 ATP5BP06576 529 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
SERBP1-201ENST00000361219 KITP10721 976 aa20.31■□□□□ 0.84
SERBP1-201ENST00000361219 RALBP11234 206 aa20.31■□□□□ 0.84
SERBP1-201ENST00000361219 RPL17P18621 184 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
SERBP1-201ENST00000361219 ATP5C1P36542 298 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
SERBP1-201ENST00000361219 POLD2P49005 469 aa20.31■□□□□ 0.84
SERBP1-201ENST00000361219 KCNQ1P51787 676 aa20.31■□□□□ 0.84
SERBP1-201ENST00000361219 AQP5P55064 265 aa20.31■□□□□ 0.84
SERBP1-201ENST00000361219 DSC2Q02487 901 aa20.31■□□□□ 0.84
SERBP1-201ENST00000361219 ITKQ08881 620 aa20.31■□□□□ 0.84
SERBP1-201ENST00000361219 CNGA3Q16281 694 aa20.31■□□□□ 0.84
SERBP1-201ENST00000361219 LCA5Q86VQ0 697 aa20.31■□□□□ 0.84
SERBP1-201ENST00000361219 IGSF21Q96ID5 467 aa20.31■□□□□ 0.84
SERBP1-201ENST00000361219 STK38LQ9Y2H1 464 aa20.31■□□□□ 0.84
SERBP1-201ENST00000361219 HEATR9A2RTY3 570 aa20.3■□□□□ 0.84
SERBP1-201ENST00000361219 F5H5T6 163 aa20.3■□□□□ 0.84
SERBP1-201ENST00000361219 UPP2O95045 317 aa20.3■□□□□ 0.84
SERBP1-201ENST00000361219 SERPINH1P50454 418 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
SERBP1-201ENST00000361219 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa20.3■□□□□ 0.84
SERBP1-201ENST00000361219 WDR75Q8IWA0 830 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
SERBP1-201ENST00000361219 DENND6AQ8IWF6 608 aa20.3■□□□□ 0.84
SERBP1-201ENST00000361219 PTCD3Q96EY7 689 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
SERBP1-201ENST00000361219 PRR11Q96HE9 360 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
SERBP1-201ENST00000361219 FAM167BQ9BTA0 163 aa20.3■□□□□ 0.84
SERBP1-201ENST00000361219 NOD2Q9HC29 1040 aa20.3■□□□□ 0.84
SERBP1-201ENST00000361219 LYPLA1O75608 230 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
SERBP1-201ENST00000361219 PTPN4P29074 926 aa20.3■□□□□ 0.84
SERBP1-201ENST00000361219 HTRA3P83110 453 aa20.3■□□□□ 0.84
SERBP1-201ENST00000361219 MSLNQ13421 630 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
SERBP1-201ENST00000361219 SEPT6Q14141 434 aa20.3■□□□□ 0.84
SERBP1-201ENST00000361219 IHHQ14623 411 aa20.3■□□□□ 0.84
SERBP1-201ENST00000361219 USP10Q14694 798 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
SERBP1-201ENST00000361219 KLHDC10Q6PID8 442 aa20.3■□□□□ 0.84
SERBP1-201ENST00000361219 TTC7BQ86TV6 843 aa20.3■□□□□ 0.84
SERBP1-201ENST00000361219 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
SERBP1-201ENST00000361219 TNS4Q8IZW8 715 aa20.3■□□□□ 0.84
SERBP1-201ENST00000361219 PGBD5Q8N414 524 aa20.3■□□□□ 0.84
SERBP1-201ENST00000361219 SLC25A41Q8N5S1 370 aa20.3■□□□□ 0.84
SERBP1-201ENST00000361219 C2CD4AQ8NCU7 369 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
SERBP1-201ENST00000361219 ARRDC2Q8TBH0 407 aa20.3■□□□□ 0.84
SERBP1-201ENST00000361219 MAGEC3Q8TD91 643 aa20.3■□□□□ 0.84
SERBP1-201ENST00000361219 SORT1Q99523 831 aa20.3■□□□□ 0.84
SERBP1-201ENST00000361219 NMUR2Q9GZQ4 415 aa20.3■□□□□ 0.84
SERBP1-201ENST00000361219 RNF208Q9H0X6 261 aa20.3■□□□□ 0.84
SERBP1-201ENST00000361219 RETREG1Q9H6L5 497 aa20.3■□□□□ 0.84
SERBP1-201ENST00000361219 NMRAL1Q9HBL8 299 aa20.3■□□□□ 0.84
SERBP1-201ENST00000361219 ARL8BQ9NVJ2 186 aa20.3■□□□□ 0.84
SERBP1-201ENST00000361219 AFF4Q9UHB7 1163 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
SERBP1-201ENST00000361219 BAIAP2L1Q9UHR4 511 aa20.3■□□□□ 0.84
SERBP1-201ENST00000361219 DNAJC16Q9Y2G8 782 aa20.3■□□□□ 0.84
SERBP1-201ENST00000361219 G3V2L1 256 aa20.29■□□□□ 0.84
SERBP1-201ENST00000361219 ACSL4O60488 711 aa20.29■□□□□ 0.84
SERBP1-201ENST00000361219 PRAMEF11O60813 436 aa20.29■□□□□ 0.84
SERBP1-201ENST00000361219 APOA4P06727 396 aa20.29■□□□□ 0.84
SERBP1-201ENST00000361219 DNAJB1P25685 340 aa20.29■□□□□ 0.84
SERBP1-201ENST00000361219 ACVRL1P37023 503 aa20.29■□□□□ 0.84
SERBP1-201ENST00000361219 HARS2P49590 506 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
SERBP1-201ENST00000361219 MPP1Q00013 466 aa20.29■□□□□ 0.84
SERBP1-201ENST00000361219 CTBP1Q13363 440 aa20.29■□□□□ 0.84
SERBP1-201ENST00000361219 THOC5Q13769 683 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
SERBP1-201ENST00000361219 LBRQ14739 615 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
SERBP1-201ENST00000361219 LGI2Q8N0V4 545 aa20.29■□□□□ 0.84
SERBP1-201ENST00000361219 NSL1Q96IY1 281 aa20.29■□□□□ 0.84
SERBP1-201ENST00000361219 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
SERBP1-201ENST00000361219 TOX2Q96NM4 488 aa20.29■□□□□ 0.84
SERBP1-201ENST00000361219 TBC1D10AQ9BXI6 508 aa20.29■□□□□ 0.84
SERBP1-201ENST00000361219 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa20.29■□□□□ 0.84
SERBP1-201ENST00000361219 TLE6Q9H808 572 aa20.29■□□□□ 0.84
SERBP1-201ENST00000361219 HSFX1Q9UBD0 423 aa20.29■□□□□ 0.84
SERBP1-201ENST00000361219 MID2Q9UJV3 735 aa20.29■□□□□ 0.84
SERBP1-201ENST00000361219 TLK1Q9UKI8 766 aa20.29■□□□□ 0.84
SERBP1-201ENST00000361219 ZNF840PA6NDX5 716 aa20.29■□□□□ 0.84
SERBP1-201ENST00000361219 CHUKO15111 745 aa20.29■□□□□ 0.84
SERBP1-201ENST00000361219 PAPSS2O95340 614 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
SERBP1-201ENST00000361219 CCL5P13501 91 aa20.29■□□□□ 0.84
SERBP1-201ENST00000361219 SLC6A4P31645 630 aa20.29■□□□□ 0.84
SERBP1-201ENST00000361219 SLC1A2P43004 574 aa20.29■□□□□ 0.84
SERBP1-201ENST00000361219 ITGA9Q13797 1035 aa20.29■□□□□ 0.84
SERBP1-201ENST00000361219 TMCO4Q5TGY1 634 aa20.29■□□□□ 0.84
SERBP1-201ENST00000361219 RAPH1Q70E73 1250 aa20.29■□□□□ 0.84
SERBP1-201ENST00000361219 PPP4R1Q8TF05 950 aa20.29■□□□□ 0.84
SERBP1-201ENST00000361219 CLSTN3Q9BQT9 956 aa20.29■□□□□ 0.84
SERBP1-201ENST00000361219 STN1Q9H668 368 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
SERBP1-201ENST00000361219 SLC35E2BP0CK96 405 aa20.28■□□□□ 0.84
SERBP1-201ENST00000361219 COL6A2P12110 1019 aa20.28■□□□□ 0.84
SERBP1-201ENST00000361219 ABCE1P61221 599 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
SERBP1-201ENST00000361219 TLE2Q04725 743 aa20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.4 ms