RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000353258.7

GDE1-201, Transcript of glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GDE1, Length 2,958 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1-201ENST00000353258 RAP2CQ9Y3L5 183 aa17.02■□□□□ 0.31
GDE1-201ENST00000353258 HES2Q9Y543 173 aa17.02■□□□□ 0.31
GDE1-201ENST00000353258 TRIM64A6NGJ6 449 aa17.01■□□□□ 0.31
GDE1-201ENST00000353258 ZNF839A8K0R7 811 aa17.01■□□□□ 0.31
GDE1-201ENST00000353258 DLGAP1O14490 977 aa17.01■□□□□ 0.31
GDE1-201ENST00000353258 PRPSAP2O60256 369 aa17.01■□□□□ 0.31
GDE1-201ENST00000353258 NOL3O60936 208 aaKnown RBP17.01■□□□□ 0.31
GDE1-201ENST00000353258 PIGNO95427 931 aa17.01■□□□□ 0.31
GDE1-201ENST00000353258 ITGB3P05106 788 aa17.01■□□□□ 0.31
GDE1-201ENST00000353258 CYP2C9P11712 490 aa17.01■□□□□ 0.31
GDE1-201ENST00000353258 DLG2Q15700 870 aa17.01■□□□□ 0.31
GDE1-201ENST00000353258 FAM102AQ5T9C2 384 aaPredicted RBP17.01■□□□□ 0.31
GDE1-201ENST00000353258 CES3Q6UWW8 571 aa17.01■□□□□ 0.31
GDE1-201ENST00000353258 KCTD8Q6ZWB6 473 aa17.01■□□□□ 0.31
GDE1-201ENST00000353258 PCDH19Q8TAB3 1148 aa17.01■□□□□ 0.31
GDE1-201ENST00000353258 SREK1Q8WXA9 508 aaKnown RBP17.01■□□□□ 0.31
GDE1-201ENST00000353258 C2orf40Q9H1Z8 148 aa17.01■□□□□ 0.31
GDE1-201ENST00000353258 DHX35Q9H5Z1 703 aaKnown RBP17.01■□□□□ 0.31
GDE1-201ENST00000353258 PTPRHQ9HD43 1115 aa17.01■□□□□ 0.31
GDE1-201ENST00000353258 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa17.01■□□□□ 0.31
GDE1-201ENST00000353258 SIX4Q9UIU6 781 aa17.01■□□□□ 0.31
GDE1-201ENST00000353258 SLC30A1Q9Y6M5 507 aa17.01■□□□□ 0.31
GDE1-201ENST00000353258 A0A0G2JMZ2 1700 aa17.01■□□□□ 0.31
GDE1-201ENST00000353258 TCRBV3S1A0A5B6 114 aa17.01■□□□□ 0.31
GDE1-201ENST00000353258 PRORSD1PA6NEY8 169 aa17.01■□□□□ 0.31
GDE1-201ENST00000353258 TFEBP19484 476 aa17.01■□□□□ 0.31
GDE1-201ENST00000353258 TGM2P21980 687 aa17.01■□□□□ 0.31
GDE1-201ENST00000353258 PAX3P23760 479 aa17.01■□□□□ 0.31
GDE1-201ENST00000353258 ADSLP30566 484 aaPredicted RBP17.01■□□□□ 0.31
GDE1-201ENST00000353258 GRIA3P42263 894 aa17.01■□□□□ 0.31
GDE1-201ENST00000353258 NME5P56597 212 aa17.01■□□□□ 0.31
GDE1-201ENST00000353258 PDK2Q15119 407 aa17.01■□□□□ 0.31
GDE1-201ENST00000353258 ZNF667Q5HYK9 610 aa17.01■□□□□ 0.31
GDE1-201ENST00000353258 TTC30AQ86WT1 665 aa17.01■□□□□ 0.31
GDE1-201ENST00000353258 C1orf127Q8N9H9 656 aa17.01■□□□□ 0.31
GDE1-201ENST00000353258 EFHD1Q9BUP0 239 aa17.01■□□□□ 0.31
GDE1-201ENST00000353258 TDRD1Q9BXT4 1180 aaKnown RBP17.01■□□□□ 0.31
GDE1-201ENST00000353258 MUC3BQ9H195 1237 aa17.01■□□□□ 0.31
GDE1-201ENST00000353258 GBA3Q9H227 469 aa17.01■□□□□ 0.31
GDE1-201ENST00000353258 FZD8Q9H461 694 aa17.01■□□□□ 0.31
GDE1-201ENST00000353258 LRRC37A2A6NM11 1700 aa17.01■□□□□ 0.31
GDE1-201ENST00000353258 MGAT1P26572 445 aa17.01■□□□□ 0.31
GDE1-201ENST00000353258 ABCG1P45844 678 aa17.01■□□□□ 0.31
GDE1-201ENST00000353258 MLLT10P55197 1068 aa17.01■□□□□ 0.31
GDE1-201ENST00000353258 MBTD1Q05BQ5 628 aa17.01■□□□□ 0.31
GDE1-201ENST00000353258 GRM1Q13255 1194 aa17.01■□□□□ 0.31
GDE1-201ENST00000353258 ARL13AQ5H913 290 aaPredicted RBP17.01■□□□□ 0.31
GDE1-201ENST00000353258 ARMCX6Q7L4S7 300 aa17.01■□□□□ 0.31
GDE1-201ENST00000353258 CHST15Q7LFX5 561 aaPredicted RBP17.01■□□□□ 0.31
GDE1-201ENST00000353258 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa17.01■□□□□ 0.31
GDE1-201ENST00000353258 ERO1BQ86YB8 467 aa17.01■□□□□ 0.31
GDE1-201ENST00000353258 ANKFN1Q8N957 763 aa17.01■□□□□ 0.31
GDE1-201ENST00000353258 OLFM1Q99784 485 aa17.01■□□□□ 0.31
GDE1-201ENST00000353258 ADPGKQ9BRR6 497 aa17.01■□□□□ 0.31
GDE1-201ENST00000353258 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP17.01■□□□□ 0.31
GDE1-201ENST00000353258 B3GNT3Q9Y2A9 372 aa17.01■□□□□ 0.31
GDE1-201ENST00000353258 A0A087WZ62 844 aa17■□□□□ 0.31
GDE1-201ENST00000353258 LACTBL1A8MY62 500 aa17■□□□□ 0.31
GDE1-201ENST00000353258 KPNA4O00629 521 aaPredicted RBP17■□□□□ 0.31
GDE1-201ENST00000353258 PAPSS1O43252 624 aaPredicted RBP17■□□□□ 0.31
GDE1-201ENST00000353258 TFE3P19532 575 aaPredicted RBP17■□□□□ 0.31
GDE1-201ENST00000353258 CCNA2P20248 432 aa17■□□□□ 0.31
GDE1-201ENST00000353258 GP5P40197 560 aa17■□□□□ 0.31
GDE1-201ENST00000353258 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP17■□□□□ 0.31
GDE1-201ENST00000353258 SURF1Q15526 300 aa17■□□□□ 0.31
GDE1-201ENST00000353258 KCNJ8Q15842 424 aa17■□□□□ 0.31
GDE1-201ENST00000353258 GLRA4Q5JXX5 417 aa17■□□□□ 0.31
GDE1-201ENST00000353258 TRNP1Q6NT89 227 aa17■□□□□ 0.31
GDE1-201ENST00000353258 SCYL2Q6P3W7 929 aa17■□□□□ 0.31
GDE1-201ENST00000353258 ILDR2Q71H61 639 aa17■□□□□ 0.31
GDE1-201ENST00000353258 FBXL20Q96IG2 436 aa17■□□□□ 0.31
GDE1-201ENST00000353258 CCDC138Q96M89 665 aa17■□□□□ 0.31
GDE1-201ENST00000353258 TCF12Q99081 682 aa17■□□□□ 0.31
GDE1-201ENST00000353258 CGREF1Q99674 301 aa17■□□□□ 0.31
GDE1-201ENST00000353258 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP17■□□□□ 0.31
GDE1-201ENST00000353258 DRC3Q9H069 523 aa17■□□□□ 0.31
GDE1-201ENST00000353258 CAB39LQ9H9S4 337 aa17■□□□□ 0.31
GDE1-201ENST00000353258 ZDHHC2Q9UIJ5 367 aa17■□□□□ 0.31
GDE1-201ENST00000353258 HEATR9A2RTY3 570 aa17■□□□□ 0.31
GDE1-201ENST00000353258 VTNP04004 478 aa17■□□□□ 0.31
GDE1-201ENST00000353258 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP17■□□□□ 0.311e-6■■■□□ 15
GDE1-201ENST00000353258 RCVRNP35243 200 aa17■□□□□ 0.31
GDE1-201ENST00000353258 GARSP41250 739 aaKnown RBP17■□□□□ 0.31
GDE1-201ENST00000353258 OXA1LQ15070 435 aa17■□□□□ 0.31
GDE1-201ENST00000353258 CLPPQ16740 277 aaPredicted RBP17■□□□□ 0.31
GDE1-201ENST00000353258 LDLRAP1Q5SW96 308 aa17■□□□□ 0.31
GDE1-201ENST00000353258 JADE1Q6IE81 842 aa17■□□□□ 0.31
GDE1-201ENST00000353258 OFCC1Q8IZS5 231 aa17■□□□□ 0.31
GDE1-201ENST00000353258 HPS1Q92902 700 aa17■□□□□ 0.31
GDE1-201ENST00000353258 TOP1MTQ969P6 601 aa17■□□□□ 0.31
GDE1-201ENST00000353258 PBXIP1Q96AQ6 731 aa17■□□□□ 0.31
GDE1-201ENST00000353258 PGLYRP2Q96PD5 576 aa17■□□□□ 0.31
GDE1-201ENST00000353258 UNC93B1Q9H1C4 597 aa17■□□□□ 0.31
GDE1-201ENST00000353258 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa17■□□□□ 0.31
GDE1-201ENST00000353258 VPS51Q9UID3 782 aa17■□□□□ 0.31
GDE1-201ENST00000353258 CPQQ9Y646 472 aa17■□□□□ 0.31
GDE1-201ENST00000353258 B4GALT4O60513 344 aa16.99■□□□□ 0.31
GDE1-201ENST00000353258 SLC25A27O95847 323 aa16.99■□□□□ 0.31
GDE1-201ENST00000353258 BCL10O95999 233 aa16.99■□□□□ 0.31
GDE1-201ENST00000353258 CYP2C8P10632 490 aa16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.2 ms