RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000325599.12

SHQ1-201, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SHQ1, Length 2,879 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-201ENST00000325599 TCF7L2Q9NQB0 619 aa16.59■□□□□ 0.25
SHQ1-201ENST00000325599 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa16.58■□□□□ 0.25
SHQ1-201ENST00000325599 TMEM114B3SHH9 223 aa16.58■□□□□ 0.25
SHQ1-201ENST00000325599 IRAK2O43187 625 aa16.58■□□□□ 0.25
SHQ1-201ENST00000325599 PIGNO95427 931 aa16.58■□□□□ 0.25
SHQ1-201ENST00000325599 JUNP05412 331 aaKnown RBP16.58■□□□□ 0.25
SHQ1-201ENST00000325599 OR4Q2P0C623 313 aa16.58■□□□□ 0.25
SHQ1-201ENST00000325599 RGS2P41220 211 aa16.58■□□□□ 0.25
SHQ1-201ENST00000325599 EIF4EBP2Q13542 120 aaPredicted RBP16.58■□□□□ 0.25
SHQ1-201ENST00000325599 PPM1LQ5SGD2 360 aa16.58■□□□□ 0.25
SHQ1-201ENST00000325599 TMCO4Q5TGY1 634 aa16.58■□□□□ 0.25
SHQ1-201ENST00000325599 CST9Q5W186 159 aa16.58■□□□□ 0.25
SHQ1-201ENST00000325599 ZNF280DQ6N043 979 aa16.58■□□□□ 0.25
SHQ1-201ENST00000325599 FCRL2Q96LA5 508 aaPredicted RBP16.58■□□□□ 0.25
SHQ1-201ENST00000325599 TSGA13Q96PP4 275 aa16.58■□□□□ 0.25
SHQ1-201ENST00000325599 GLOD4Q9HC38 313 aa16.58■□□□□ 0.25
SHQ1-201ENST00000325599 S100A14Q9HCY8 104 aa16.58■□□□□ 0.25
SHQ1-201ENST00000325599 CHST12Q9NRB3 414 aa16.58■□□□□ 0.25
SHQ1-201ENST00000325599 ZDHHC2Q9UIJ5 367 aa16.58■□□□□ 0.25
SHQ1-201ENST00000325599 PHF24Q9UPV7 400 aa16.58■□□□□ 0.25
SHQ1-201ENST00000325599 CCNT2O60583 730 aaKnown RBP16.58■□□□□ 0.24
SHQ1-201ENST00000325599 AKR1A1P14550 325 aa16.58■□□□□ 0.24
SHQ1-201ENST00000325599 CCNCP24863 283 aa16.58■□□□□ 0.24
SHQ1-201ENST00000325599 CTGFP29279 349 aa16.58■□□□□ 0.24
SHQ1-201ENST00000325599 DLG1Q12959 904 aa16.58■□□□□ 0.24
SHQ1-201ENST00000325599 LBRQ14739 615 aaKnown RBP16.58■□□□□ 0.24
SHQ1-201ENST00000325599 CNGA3Q16281 694 aa16.58■□□□□ 0.24
SHQ1-201ENST00000325599 PCID2Q5JVF3 399 aa16.58■□□□□ 0.24
SHQ1-201ENST00000325599 IRGCQ6NXR0 463 aa16.58■□□□□ 0.24
SHQ1-201ENST00000325599 ZYG11AQ6WRX3 759 aa16.58■□□□□ 0.24
SHQ1-201ENST00000325599 C14orf80Q86SX3 495 aa16.58■□□□□ 0.24
SHQ1-201ENST00000325599 LINC00523Q86TU6 105 aa16.58■□□□□ 0.24
SHQ1-201ENST00000325599 ACTRT2Q8TDY3 377 aa16.58■□□□□ 0.24
SHQ1-201ENST00000325599 DTNBP1Q96EV8 351 aa16.58■□□□□ 0.24
SHQ1-201ENST00000325599 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP16.58■□□□□ 0.24
SHQ1-201ENST00000325599 NUF2Q9BZD4 464 aa16.58■□□□□ 0.24
SHQ1-201ENST00000325599 ARHGEF38Q9NXL2 777 aa16.58■□□□□ 0.24
SHQ1-201ENST00000325599 MATN2O00339 956 aa16.57■□□□□ 0.24
SHQ1-201ENST00000325599 AURKAO14965 403 aa16.57■□□□□ 0.24
SHQ1-201ENST00000325599 HLA-DQB2P05538 268 aa16.57■□□□□ 0.24
SHQ1-201ENST00000325599 GLDCP23378 1020 aa16.57■□□□□ 0.24
SHQ1-201ENST00000325599 THPOP40225 353 aa16.57■□□□□ 0.24
SHQ1-201ENST00000325599 COG7P83436 770 aa16.57■□□□□ 0.24
SHQ1-201ENST00000325599 TBL3Q12788 808 aaKnown RBP16.57■□□□□ 0.24
SHQ1-201ENST00000325599 METTL23Q86XA0 190 aa16.57■□□□□ 0.24
SHQ1-201ENST00000325599 NXNL1Q96CM4 212 aa16.57■□□□□ 0.24
SHQ1-201ENST00000325599 GPAMQ9HCL2 828 aa16.57■□□□□ 0.24
SHQ1-201ENST00000325599 POMPQ9Y244 141 aa16.57■□□□□ 0.24
SHQ1-201ENST00000325599 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa16.57■□□□□ 0.24
SHQ1-201ENST00000325599 AAR2Q9Y312 384 aaKnown RBP16.57■□□□□ 0.24
SHQ1-201ENST00000325599 PTPRDP23468 1912 aa16.57■□□□□ 0.24
SHQ1-201ENST00000325599 ARCN1P48444 511 aaKnown RBP16.57■□□□□ 0.24
SHQ1-201ENST00000325599 SLC5A3P53794 718 aa16.57■□□□□ 0.24
SHQ1-201ENST00000325599 HUNKP57058 714 aa16.57■□□□□ 0.24
SHQ1-201ENST00000325599 LSM12Q3MHD2 195 aaKnown RBP16.57■□□□□ 0.24
SHQ1-201ENST00000325599 LIPMQ5VYY2 423 aa16.57■□□□□ 0.24
SHQ1-201ENST00000325599 BTBD8Q5XKL5 378 aa16.57■□□□□ 0.24
SHQ1-201ENST00000325599 TMEM198Q66K66 360 aa16.57■□□□□ 0.24
SHQ1-201ENST00000325599 OVOS1Q6IE37 1185 aa16.57■□□□□ 0.24
SHQ1-201ENST00000325599 SGF29Q96ES7 293 aa16.57■□□□□ 0.24
SHQ1-201ENST00000325599 FCRL5Q96RD9 977 aa16.57■□□□□ 0.24
SHQ1-201ENST00000325599 IL12RB2Q99665 862 aa16.57■□□□□ 0.24
SHQ1-201ENST00000325599 DRC3Q9H069 523 aa16.57■□□□□ 0.24
SHQ1-201ENST00000325599 VCXQ9H320 206 aa16.57■□□□□ 0.24
SHQ1-201ENST00000325599 NMUR1Q9HB89 426 aa16.57■□□□□ 0.24
SHQ1-201ENST00000325599 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP16.57■□□□□ 0.24
SHQ1-201ENST00000325599 XPR1Q9UBH6 696 aa16.57■□□□□ 0.24
SHQ1-201ENST00000325599 NLRC5Q86WI3 1866 aa16.57■□□□□ 0.24
SHQ1-201ENST00000325599 GRID2O43424 1007 aa16.56■□□□□ 0.24
SHQ1-201ENST00000325599 BUD23O43709 281 aaKnown RBP16.56■□□□□ 0.24
SHQ1-201ENST00000325599 DLX3O60479 287 aa16.56■□□□□ 0.24
SHQ1-201ENST00000325599 PFDN1O60925 122 aa16.56■□□□□ 0.24
SHQ1-201ENST00000325599 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP16.56■□□□□ 0.24
SHQ1-201ENST00000325599 TFEBP19484 476 aa16.56■□□□□ 0.24
SHQ1-201ENST00000325599 GSTT1P30711 240 aa16.56■□□□□ 0.24
SHQ1-201ENST00000325599 GRIK1P39086 918 aa16.56■□□□□ 0.24
SHQ1-201ENST00000325599 ZNF135P52742 658 aaPredicted RBP16.56■□□□□ 0.24
SHQ1-201ENST00000325599 BTKQ06187 659 aa16.56■□□□□ 0.24
SHQ1-201ENST00000325599 PCSK7Q16549 785 aa16.56■□□□□ 0.24
SHQ1-201ENST00000325599 SDHAF4Q5VUM1 108 aa16.56■□□□□ 0.24
SHQ1-201ENST00000325599 TMC7Q7Z402 723 aa16.56■□□□□ 0.24
SHQ1-201ENST00000325599 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP16.56■□□□□ 0.24
SHQ1-201ENST00000325599 SCD5Q86SK9 330 aa16.56■□□□□ 0.24
SHQ1-201ENST00000325599 SERINC5Q86VE9 423 aa16.56■□□□□ 0.24
SHQ1-201ENST00000325599 LSMEM2Q8N112 164 aa16.56■□□□□ 0.24
SHQ1-201ENST00000325599 MARK4Q96L34 752 aa16.56■□□□□ 0.24
SHQ1-201ENST00000325599 DDX50Q9BQ39 737 aaKnown RBP16.56■□□□□ 0.24
SHQ1-201ENST00000325599 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP16.56■□□□□ 0.24
SHQ1-201ENST00000325599 AIM2O14862 343 aa16.56■□□□□ 0.24
SHQ1-201ENST00000325599 IGHA2P01877 340 aa16.56■□□□□ 0.24
SHQ1-201ENST00000325599 UBTFL6P0CB48 400 aaPredicted RBP16.56■□□□□ 0.24
SHQ1-201ENST00000325599 SLC1A2P43004 574 aa16.56■□□□□ 0.24
SHQ1-201ENST00000325599 RPL14P50914 215 aaKnown RBP16.56■□□□□ 0.24
SHQ1-201ENST00000325599 MGAT3Q09327 533 aa16.56■□□□□ 0.24
SHQ1-201ENST00000325599 SLC12A1Q13621 1099 aa16.56■□□□□ 0.24
SHQ1-201ENST00000325599 ZRSR2Q15696 482 aaKnown RBP16.56■□□□□ 0.24
SHQ1-201ENST00000325599 GPR162Q16538 588 aa16.56■□□□□ 0.24
SHQ1-201ENST00000325599 FSCBQ5H9T9 825 aa16.56■□□□□ 0.24
SHQ1-201ENST00000325599 LPCAT4Q643R3 524 aa16.56■□□□□ 0.24
SHQ1-201ENST00000325599 OR52E8Q6IFG1 317 aa16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.9 ms