RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000285199.11

USP43-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 43, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP43, Length 4,169 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43-201ENST00000285199 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP15.88■□□□□ 0.13
USP43-201ENST00000285199 ANAPC2Q9UJX6 822 aa15.88■□□□□ 0.13
USP43-201ENST00000285199 KNL1Q8NG31 2342 aa15.88■□□□□ 0.13
USP43-201ENST00000285199 KCPQ6ZWJ8 1503 aa15.88■□□□□ 0.13
USP43-201ENST00000285199 KPNA4O00629 521 aaPredicted RBP15.87■□□□□ 0.13
USP43-201ENST00000285199 DHX15O43143 795 aaKnown RBP15.87■□□□□ 0.13
USP43-201ENST00000285199 UGT1A6P19224 532 aa15.87■□□□□ 0.13
USP43-201ENST00000285199 STT3AP46977 705 aa15.87■□□□□ 0.13
USP43-201ENST00000285199 TMEM132BQ14DG7 1078 aa15.87■□□□□ 0.13
USP43-201ENST00000285199 DRICH1Q6PGQ1 229 aaPredicted RBP15.87■□□□□ 0.13
USP43-201ENST00000285199 FNIP1Q8TF40 1166 aa15.87■□□□□ 0.13
USP43-201ENST00000285199 RIC8BQ9NVN3 520 aa15.87■□□□□ 0.13
USP43-201ENST00000285199 C19orf81C9J6K1 198 aa15.87■□□□□ 0.13
USP43-201ENST00000285199 CD4P01730 458 aa15.87■□□□□ 0.13
USP43-201ENST00000285199 ZNF37AP17032 561 aaPredicted RBP15.87■□□□□ 0.13
USP43-201ENST00000285199 NPY2RP49146 381 aa15.87■□□□□ 0.13
USP43-201ENST00000285199 TMEM214Q6NUQ4 689 aaKnown RBP15.87■□□□□ 0.13
USP43-201ENST00000285199 NOTUMQ6P988 496 aa15.87■□□□□ 0.13
USP43-201ENST00000285199 ABRAXAS1Q6UWZ7 409 aa15.87■□□□□ 0.13
USP43-201ENST00000285199 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP15.87■□□□□ 0.13
USP43-201ENST00000285199 FSTL5Q8N475 847 aaPredicted RBP15.87■□□□□ 0.13
USP43-201ENST00000285199 DRAXINQ8NBI3 349 aaPredicted RBP15.87■□□□□ 0.13
USP43-201ENST00000285199 CANT1Q8WVQ1 401 aa15.87■□□□□ 0.13
USP43-201ENST00000285199 LZICQ8WZA0 190 aa15.87■□□□□ 0.13
USP43-201ENST00000285199 PPM1MQ96MI6 270 aa15.87■□□□□ 0.13
USP43-201ENST00000285199 ZNF670Q9BS34 389 aa15.87■□□□□ 0.13
USP43-201ENST00000285199 SOX17Q9H6I2 414 aaPredicted RBP15.87■□□□□ 0.13
USP43-201ENST00000285199 CPA4Q9UI42 421 aa15.87■□□□□ 0.13
USP43-201ENST00000285199 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa15.87■□□□□ 0.13
USP43-201ENST00000285199 MOXD2PA6NHM9 499 aa15.87■□□□□ 0.13
USP43-201ENST00000285199 GPR25O00155 361 aa15.87■□□□□ 0.13
USP43-201ENST00000285199 PLA2G6O60733 806 aa15.87■□□□□ 0.13
USP43-201ENST00000285199 TSC22D2O75157 780 aa15.87■□□□□ 0.13
USP43-201ENST00000285199 METTL6Q8TCB7 284 aa15.87■□□□□ 0.13
USP43-201ENST00000285199 UTP15Q8TED0 518 aaKnown RBP15.87■□□□□ 0.13
USP43-201ENST00000285199 BTBD9Q96Q07 612 aa15.87■□□□□ 0.13
USP43-201ENST00000285199 TRIM17Q9Y577 477 aa15.87■□□□□ 0.13
USP43-201ENST00000285199 SLC30A1Q9Y6M5 507 aa15.87■□□□□ 0.13
USP43-201ENST00000285199 A0A088AWK7 358 aa15.87■□□□□ 0.13
USP43-201ENST00000285199 H3BRB1 525 aa15.87■□□□□ 0.13
USP43-201ENST00000285199 TSHRP16473 764 aa15.87■□□□□ 0.13
USP43-201ENST00000285199 PGS1Q32NB8 556 aa15.87■□□□□ 0.13
USP43-201ENST00000285199 MRNIPQ6NTE8 343 aa15.87■□□□□ 0.13
USP43-201ENST00000285199 CENPLQ8N0S6 344 aaPredicted RBP15.87■□□□□ 0.13
USP43-201ENST00000285199 PLD6Q8N2A8 252 aaKnown RBP15.87■□□□□ 0.13
USP43-201ENST00000285199 FBXO39Q8N4B4 442 aa15.87■□□□□ 0.13
USP43-201ENST00000285199 REPS2Q8NFH8 660 aa15.87■□□□□ 0.13
USP43-201ENST00000285199 MTFMTQ96DP5 389 aaKnown RBP15.87■□□□□ 0.13
USP43-201ENST00000285199 CCDC126Q96EE4 140 aa15.87■□□□□ 0.13
USP43-201ENST00000285199 ALG2Q9H553 416 aa15.87■□□□□ 0.13
USP43-201ENST00000285199 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP15.87■□□□□ 0.13
USP43-201ENST00000285199 ATAD3AQ9NVI7 634 aa15.87■□□□□ 0.13
USP43-201ENST00000285199 SOAT2O75908 522 aa15.86■□□□□ 0.13
USP43-201ENST00000285199 CABYRO75952 493 aa15.86■□□□□ 0.13
USP43-201ENST00000285199 LYPLA2O95372 231 aa15.86■□□□□ 0.13
USP43-201ENST00000285199 CPB1P15086 417 aa15.86■□□□□ 0.13
USP43-201ENST00000285199 ATP5F1P24539 256 aaPredicted RBP15.86■□□□□ 0.13
USP43-201ENST00000285199 CYP4F2P78329 520 aa15.86■□□□□ 0.13
USP43-201ENST00000285199 CYP4F3Q08477 520 aa15.86■□□□□ 0.13
USP43-201ENST00000285199 SV2CQ496J9 727 aa15.86■□□□□ 0.13
USP43-201ENST00000285199 KIAA1841Q6NSI8 718 aa15.86■□□□□ 0.13
USP43-201ENST00000285199 ATG14Q6ZNE5 492 aa15.86■□□□□ 0.13
USP43-201ENST00000285199 ASIC4Q96FT7 647 aa15.86■□□□□ 0.13
USP43-201ENST00000285199 RAD21L1Q9H4I0 556 aa15.86■□□□□ 0.13
USP43-201ENST00000285199 CATSPERBQ9H7T0 1116 aa15.86■□□□□ 0.13
USP43-201ENST00000285199 TMEM161AQ9NX61 479 aa15.86■□□□□ 0.13
USP43-201ENST00000285199 DTLQ9NZJ0 730 aa15.86■□□□□ 0.13
USP43-201ENST00000285199 CITO14578 2027 aa15.86■□□□□ 0.13
USP43-201ENST00000285199 HCRTO43612 131 aa15.86■□□□□ 0.13
USP43-201ENST00000285199 RECQL4O94761 1208 aa15.86■□□□□ 0.13
USP43-201ENST00000285199 DBTP11182 482 aaKnown RBP15.86■□□□□ 0.13
USP43-201ENST00000285199 NMBRP28336 390 aa15.86■□□□□ 0.13
USP43-201ENST00000285199 FMO4P31512 558 aa15.86■□□□□ 0.13
USP43-201ENST00000285199 RAB10P61026 200 aa15.86■□□□□ 0.13
USP43-201ENST00000285199 FAM98BQ52LJ0 330 aaKnown RBP15.86■□□□□ 0.13
USP43-201ENST00000285199 TMEM63BQ5T3F8 832 aa15.86■□□□□ 0.13
USP43-201ENST00000285199 DEPDC1Q5TB30 811 aa15.86■□□□□ 0.13
USP43-201ENST00000285199 OR52E8Q6IFG1 317 aa15.86■□□□□ 0.13
USP43-201ENST00000285199 ABHD15Q6UXT9 468 aa15.86■□□□□ 0.13
USP43-201ENST00000285199 CROCCP3Q8IVE0 287 aa15.86■□□□□ 0.13
USP43-201ENST00000285199 ZNF567Q8N184 647 aa15.86■□□□□ 0.13
USP43-201ENST00000285199 ACTRT2Q8TDY3 377 aa15.86■□□□□ 0.13
USP43-201ENST00000285199 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP15.86■□□□□ 0.13
USP43-201ENST00000285199 SNX8Q9Y5X2 465 aa15.86■□□□□ 0.13
USP43-201ENST00000285199 A0A1W2PPW3 197 aa15.86■□□□□ 0.13
USP43-201ENST00000285199 LSM1O15116 133 aaKnown RBP15.86■□□□□ 0.13
USP43-201ENST00000285199 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP15.86■□□□□ 0.13
USP43-201ENST00000285199 RFPL1O75677 317 aa15.86■□□□□ 0.13
USP43-201ENST00000285199 CUZD1Q86UP6 607 aa15.86■□□□□ 0.13
USP43-201ENST00000285199 NT5DC4Q86YG4 428 aa15.86■□□□□ 0.13
USP43-201ENST00000285199 CDYL2Q8N8U2 506 aa15.86■□□□□ 0.13
USP43-201ENST00000285199 POC5Q8NA72 575 aa15.86■□□□□ 0.13
USP43-201ENST00000285199 OR7A2PQ8NGA2 310 aa15.86■□□□□ 0.13
USP43-201ENST00000285199 HEMK1Q9Y5R4 338 aaPredicted RBP15.86■□□□□ 0.13
USP43-201ENST00000285199 URB1O60287 2271 aaKnown RBP15.85■□□□□ 0.13
USP43-201ENST00000285199 A8MX80 341 aa15.85■□□□□ 0.13
USP43-201ENST00000285199 TAF4O00268 1085 aa15.85■□□□□ 0.13
USP43-201ENST00000285199 BTN3A1O00481 513 aa15.85■□□□□ 0.13
USP43-201ENST00000285199 PSMD3O43242 534 aa15.85■□□□□ 0.13
USP43-201ENST00000285199 PIK3CGP48736 1102 aa15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.6 ms