RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000270792.9

SH3BGRL3-201, Transcript of SH3 domain binding glutamate rich protein like 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BGRL3, Length 1,661 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CAND1Q86VP6 1230 aaKnown RBP20.68■□□□□ 0.9
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SH3BGRL3-201ENST00000270792 FEM1AQ9BSK4 669 aa20.68■□□□□ 0.9
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SH3BGRL3-201ENST00000270792 LEKR1Q6ZMV7 388 aa20.67■□□□□ 0.9
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CNTD1Q8N815 330 aa20.67■□□□□ 0.9
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SH3BGRL3-201ENST00000270792 PEX11BO96011 259 aa20.66■□□□□ 0.9
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SH3BGRL3-201ENST00000270792 HNRNPDQ14103 355 aaKnown RBP20.66■□□□□ 0.9
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SH3BGRL3-201ENST00000270792 ADIPOR2Q86V24 386 aa20.66■□□□□ 0.9
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SH3BGRL3-201ENST00000270792 ATP13A1Q9HD20 1204 aa20.66■□□□□ 0.9
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SH3BGRL3-201ENST00000270792 KAT7O95251 611 aa20.65■□□□□ 0.9
SH3BGRL3-201ENST00000270792 AP2A1O95782 977 aa20.65■□□□□ 0.9
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SH3BGRL3-201ENST00000270792 AGBL2Q5U5Z8 902 aa20.65■□□□□ 0.9
SH3BGRL3-201ENST00000270792 PALM2Q8IXS6 379 aa20.65■□□□□ 0.9
SH3BGRL3-201ENST00000270792 DDX51Q8N8A6 666 aaKnown RBP eCLIP20.65■□□□□ 0.9
SH3BGRL3-201ENST00000270792 TERB1Q8NA31 727 aa20.65■□□□□ 0.9
SH3BGRL3-201ENST00000270792 NSMCE1Q8WV22 266 aa20.65■□□□□ 0.9
SH3BGRL3-201ENST00000270792 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP20.65■□□□□ 0.9
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ATP6V1G3Q96LB4 118 aa20.65■□□□□ 0.9
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SH3BGRL3-201ENST00000270792 ARHGEF3Q9NR81 526 aa20.65■□□□□ 0.9
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