RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628018.2

CAPNS1-215, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,509 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-215ENST00000628018 GPX6P59796 221 aa25.28■■□□□ 1.64
CAPNS1-215ENST00000628018 MPP3Q13368 585 aa25.28■■□□□ 1.64
CAPNS1-215ENST00000628018 ADGRE1Q14246 886 aa25.28■■□□□ 1.64
CAPNS1-215ENST00000628018 COL19A1Q14993 1142 aa25.28■■□□□ 1.64
CAPNS1-215ENST00000628018 CYTH1Q15438 398 aa25.28■■□□□ 1.64
CAPNS1-215ENST00000628018 NAPEPLDQ6IQ20 393 aa25.28■■□□□ 1.64
CAPNS1-215ENST00000628018 LINC00523Q86TU6 105 aa25.28■■□□□ 1.64
CAPNS1-215ENST00000628018 ATP11CQ8NB49 1132 aa25.28■■□□□ 1.64
CAPNS1-215ENST00000628018 OR52K1Q8NGK4 314 aa25.28■■□□□ 1.64
CAPNS1-215ENST00000628018 TADA1Q96BN2 335 aa25.28■■□□□ 1.64
CAPNS1-215ENST00000628018 MGME1Q9BQP7 344 aa25.28■■□□□ 1.64
CAPNS1-215ENST00000628018 HAUS2Q9NVX0 235 aa25.28■■□□□ 1.64
CAPNS1-215ENST00000628018 DUS2Q9NX74 493 aaKnown RBP25.28■■□□□ 1.64
CAPNS1-215ENST00000628018 CLDND1Q9NY35 253 aa25.28■■□□□ 1.64
CAPNS1-215ENST00000628018 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP25.28■■□□□ 1.64
CAPNS1-215ENST00000628018 OPA1O60313 960 aa25.27■■□□□ 1.64
CAPNS1-215ENST00000628018 TYRP14679 529 aa25.27■■□□□ 1.64
CAPNS1-215ENST00000628018 ADRA1AP35348 466 aa25.27■■□□□ 1.64
CAPNS1-215ENST00000628018 LTBRP36941 435 aa25.27■■□□□ 1.64
CAPNS1-215ENST00000628018 DSC2Q02487 901 aa25.27■■□□□ 1.64
CAPNS1-215ENST00000628018 IFFO1Q0D2I5 559 aa25.27■■□□□ 1.64
CAPNS1-215ENST00000628018 EML3Q32P44 896 aa25.27■■□□□ 1.64
CAPNS1-215ENST00000628018 INO80DQ53TQ3 878 aaPredicted RBP25.27■■□□□ 1.64
CAPNS1-215ENST00000628018 CEP85LQ5SZL2 805 aa25.27■■□□□ 1.64
CAPNS1-215ENST00000628018 KDELC1Q6UW63 502 aa25.27■■□□□ 1.64
CAPNS1-215ENST00000628018 PALM2Q8IXS6 379 aa25.27■■□□□ 1.64
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF557Q8N988 423 aaPredicted RBP25.27■■□□□ 1.64
CAPNS1-215ENST00000628018 ACDQ96AP0 544 aa25.27■■□□□ 1.64
CAPNS1-215ENST00000628018 C2orf49Q9BVC5 232 aaPredicted RBP25.27■■□□□ 1.64
CAPNS1-215ENST00000628018 CINPQ9BW66 212 aaPredicted RBP25.27■■□□□ 1.64
CAPNS1-215ENST00000628018 MED4Q9NPJ6 270 aa25.27■■□□□ 1.64
CAPNS1-215ENST00000628018 VPS45Q9NRW7 570 aa25.27■■□□□ 1.64
CAPNS1-215ENST00000628018 HEPACAM2A8MVW5 462 aa25.27■■□□□ 1.64
CAPNS1-215ENST00000628018 HLA-FP30511 346 aa25.27■■□□□ 1.64
CAPNS1-215ENST00000628018 IHHQ14623 411 aa25.27■■□□□ 1.64
CAPNS1-215ENST00000628018 PLEKHG6Q3KR16 790 aa25.27■■□□□ 1.64
CAPNS1-215ENST00000628018 MPP5Q8N3R9 675 aa25.27■■□□□ 1.64
CAPNS1-215ENST00000628018 IPMKQ8NFU5 416 aa25.27■■□□□ 1.64
CAPNS1-215ENST00000628018 MRGPRX2Q96LB1 330 aa25.27■■□□□ 1.64
CAPNS1-215ENST00000628018 EBNA1BP2Q99848 306 aaKnown RBP25.27■■□□□ 1.64
CAPNS1-215ENST00000628018 TMEM109Q9BVC6 243 aa25.27■■□□□ 1.64
CAPNS1-215ENST00000628018 INTS6Q9UL03 887 aaKnown RBP25.27■■□□□ 1.64
CAPNS1-215ENST00000628018 MYOFQ9NZM1 2061 aa25.27■■□□□ 1.64
CAPNS1-215ENST00000628018 A0A087WUV0 522 aaPredicted RBP25.26■■□□□ 1.63
CAPNS1-215ENST00000628018 SDR42E2A6NKP2 422 aa25.26■■□□□ 1.63
CAPNS1-215ENST00000628018 AP3B1O00203 1094 aa25.26■■□□□ 1.63
CAPNS1-215ENST00000628018 SSTR1P30872 391 aa25.26■■□□□ 1.63
CAPNS1-215ENST00000628018 CD86P42081 329 aa25.26■■□□□ 1.63
CAPNS1-215ENST00000628018 SESN2P58004 480 aaPredicted RBP25.26■■□□□ 1.63
CAPNS1-215ENST00000628018 SKOR1P84550 965 aa25.26■■□□□ 1.63
CAPNS1-215ENST00000628018 DHCR24Q15392 516 aa25.26■■□□□ 1.63
CAPNS1-215ENST00000628018 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP25.26■■□□□ 1.63
CAPNS1-215ENST00000628018 LINGO4Q6UY18 593 aa25.26■■□□□ 1.63
CAPNS1-215ENST00000628018 MSLNLQ96KJ4 702 aa25.26■■□□□ 1.63
CAPNS1-215ENST00000628018 RIPOR3Q96MK2 946 aa25.26■■□□□ 1.63
CAPNS1-215ENST00000628018 MYADMQ96S97 322 aa25.26■■□□□ 1.63
CAPNS1-215ENST00000628018 SEMA3CQ99985 751 aa25.26■■□□□ 1.63
CAPNS1-215ENST00000628018 TBL1YQ9BQ87 522 aa25.26■■□□□ 1.63
CAPNS1-215ENST00000628018 VPS37BQ9H9H4 285 aa25.26■■□□□ 1.63
CAPNS1-215ENST00000628018 ABCB8Q9NUT2 735 aa25.26■■□□□ 1.63
CAPNS1-215ENST00000628018 PIH1D1Q9NWS0 290 aaKnown RBP25.26■■□□□ 1.63
CAPNS1-215ENST00000628018 CXorf51AA0A1B0GTR3 108 aa25.25■■□□□ 1.63
CAPNS1-215ENST00000628018 H3BQF6 201 aa25.25■■□□□ 1.63
CAPNS1-215ENST00000628018 PMPCBO75439 489 aa25.25■■□□□ 1.63
CAPNS1-215ENST00000628018 CPP00450 1065 aa25.25■■□□□ 1.63
CAPNS1-215ENST00000628018 MGAT1P26572 445 aa25.25■■□□□ 1.63
CAPNS1-215ENST00000628018 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP25.25■■□□□ 1.63
CAPNS1-215ENST00000628018 CDH17Q12864 832 aa25.25■■□□□ 1.63
CAPNS1-215ENST00000628018 PITRM1Q5JRX3 1037 aa25.25■■□□□ 1.63
CAPNS1-215ENST00000628018 RETSATQ6NUM9 610 aa25.25■■□□□ 1.63
CAPNS1-215ENST00000628018 C3orf62Q6ZUJ4 267 aa25.25■■□□□ 1.63
CAPNS1-215ENST00000628018 ASIC4Q96FT7 647 aa25.25■■□□□ 1.63
CAPNS1-215ENST00000628018 APOL2Q9BQE5 337 aa25.25■■□□□ 1.63
CAPNS1-215ENST00000628018 SLC2A11Q9BYW1 496 aa25.25■■□□□ 1.63
CAPNS1-215ENST00000628018 KIF26AQ9ULI4 1882 aaPredicted RBP25.24■■□□□ 1.63
CAPNS1-215ENST00000628018 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP25.24■■□□□ 1.63
CAPNS1-215ENST00000628018 TMCC1O94876 653 aa25.24■■□□□ 1.63
CAPNS1-215ENST00000628018 AGTP01019 485 aa25.24■■□□□ 1.63
CAPNS1-215ENST00000628018 CYP17A1P05093 508 aa25.24■■□□□ 1.63
CAPNS1-215ENST00000628018 CR2P20023 1033 aa25.24■■□□□ 1.63
CAPNS1-215ENST00000628018 PHBP35232 272 aa25.24■■□□□ 1.63
CAPNS1-215ENST00000628018 WNT3AP56704 352 aa25.24■■□□□ 1.63
CAPNS1-215ENST00000628018 STAT4Q14765 748 aa25.24■■□□□ 1.63
CAPNS1-215ENST00000628018 HSP90B2PQ58FF3 399 aa25.24■■□□□ 1.63
CAPNS1-215ENST00000628018 TRIM68Q6AZZ1 485 aa25.24■■□□□ 1.63
CAPNS1-215ENST00000628018 TANGO2Q6ICL3 276 aa25.24■■□□□ 1.63
CAPNS1-215ENST00000628018 RANBP10Q6VN20 620 aa25.24■■□□□ 1.63
CAPNS1-215ENST00000628018 CAPN12Q6ZSI9 719 aa25.24■■□□□ 1.63
CAPNS1-215ENST00000628018 DNAAF3Q8N9W5 541 aa25.24■■□□□ 1.63
CAPNS1-215ENST00000628018 E2F7Q96AV8 911 aa25.24■■□□□ 1.63
CAPNS1-215ENST00000628018 FICDQ9BVA6 458 aa25.24■■□□□ 1.63
CAPNS1-215ENST00000628018 ROPN1BQ9BZX4 212 aaPredicted RBP25.24■■□□□ 1.63
CAPNS1-215ENST00000628018 ROPN1Q9HAT0 212 aaPredicted RBP25.24■■□□□ 1.63
CAPNS1-215ENST00000628018 ZFP14Q9HCL3 533 aa25.24■■□□□ 1.63
CAPNS1-215ENST00000628018 ZC3H7BQ9UGR2 993 aaKnown RBP25.24■■□□□ 1.63
CAPNS1-215ENST00000628018 DENND4AQ7Z401 1863 aa25.24■■□□□ 1.63
CAPNS1-215ENST00000628018 SPAG6O75602 509 aa25.23■■□□□ 1.63
CAPNS1-215ENST00000628018 GJB3O75712 270 aa25.23■■□□□ 1.63
CAPNS1-215ENST00000628018 TCEA3O75764 348 aa25.23■■□□□ 1.63
CAPNS1-215ENST00000628018 MTHFRP42898 656 aa25.23■■□□□ 1.63
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