RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583289.5

PTPRM-215, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, human

TSL 5

Gene PTPRM, Length 792 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPRM-215	ENST00000583289	MCL1	Q07820	350 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PTPRM-215	ENST00000583289	ZNF844	Q08AG5	666 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PTPRM-215	ENST00000583289	TRPC3	Q13507	836 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PTPRM-215	ENST00000583289	CUL2	Q13617	745 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PTPRM-215	ENST00000583289	PIGH	Q14442	188 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
PTPRM-215	ENST00000583289	EMC2	Q15006	297 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PTPRM-215	ENST00000583289	PLCB4	Q15147	1175 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PTPRM-215	ENST00000583289	PCBP1	Q15365	356 aa	Known RBP eCLIP	4.74	□□□□□ -1.65
PTPRM-215	ENST00000583289	PPP1R7	Q15435	360 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PTPRM-215	ENST00000583289	SEPT7	Q16181	437 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
PTPRM-215	ENST00000583289	PTGIS	Q16647	500 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PTPRM-215	ENST00000583289	MAPK6	Q16659	721 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PTPRM-215	ENST00000583289	KRT71	Q3SY84	523 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PTPRM-215	ENST00000583289	FAM153C	Q494X1	144 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PTPRM-215	ENST00000583289	TTMP	Q5BVD1	217 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PTPRM-215	ENST00000583289	C1orf220	Q5T0J3	134 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PTPRM-215	ENST00000583289	GKAP1	Q5VSY0	366 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
PTPRM-215	ENST00000583289	DRICH1	Q6PGQ1	229 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
PTPRM-215	ENST00000583289	SLC30A10	Q6XR72	485 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PTPRM-215	ENST00000583289	ZNF365	Q70YC5	407 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PTPRM-215	ENST00000583289	FASTKD5	Q7L8L6	764 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
PTPRM-215	ENST00000583289	GDF7	Q7Z4P5	450 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PTPRM-215	ENST00000583289	CPLX4	Q7Z7G2	160 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PTPRM-215	ENST00000583289	PCGF5	Q86SE9	256 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PTPRM-215	ENST00000583289	CBWD2	Q8IUF1	395 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PTPRM-215	ENST00000583289	PLXDC1	Q8IUK5	500 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PTPRM-215	ENST00000583289	WDR49	Q8IV35	697 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PTPRM-215	ENST00000583289	CCDC50	Q8IVM0	306 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PTPRM-215	ENST00000583289	ARHGEF19	Q8IW93	802 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PTPRM-215	ENST00000583289	KATNAL2	Q8IYT4	538 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PTPRM-215	ENST00000583289	RIBC1	Q8N443	379 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
PTPRM-215	ENST00000583289	PRELID2	Q8N945	189 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PTPRM-215	ENST00000583289	TMEM35B	Q8NCS4	154 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PTPRM-215	ENST00000583289	EXD1	Q8NHP7	514 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PTPRM-215	ENST00000583289	ART4	Q93070	314 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PTPRM-215	ENST00000583289	MFSD3	Q96ES6	412 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PTPRM-215	ENST00000583289	SNF8	Q96H20	258 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PTPRM-215	ENST00000583289	TTC25	Q96NG3	672 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PTPRM-215	ENST00000583289	SCLT1	Q96NL6	688 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PTPRM-215	ENST00000583289	SERPINB12	Q96P63	405 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PTPRM-215	ENST00000583289	CCT8L2	Q96SF2	557 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PTPRM-215	ENST00000583289	CGRRF1	Q99675	332 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PTPRM-215	ENST00000583289	FAM213A	Q9BRX8	229 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PTPRM-215	ENST00000583289	MSTO1	Q9BUK6	570 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PTPRM-215	ENST00000583289	TXLNGY	Q9BZA5	131 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PTPRM-215	ENST00000583289	NSRP1	Q9H0G5	558 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
PTPRM-215	ENST00000583289	POLR3F	Q9H1D9	316 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
PTPRM-215	ENST00000583289	CENPH	Q9H3R5	247 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PTPRM-215	ENST00000583289	TOR3A	Q9H497	397 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PTPRM-215	ENST00000583289	MROH8	Q9H579	483 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PTPRM-215	ENST00000583289	ACTR5	Q9H9F9	607 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
PTPRM-215	ENST00000583289	IFT122	Q9HBG6	1241 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PTPRM-215	ENST00000583289	POLD4	Q9HCU8	107 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PTPRM-215	ENST00000583289	A1CF	Q9NQ94	594 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
PTPRM-215	ENST00000583289	RBAK	Q9NYW8	714 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
PTPRM-215	ENST00000583289	EHD2	Q9NZN4	543 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PTPRM-215	ENST00000583289	FAM153A	Q9UHL3	310 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PTPRM-215	ENST00000583289	AJAP1	Q9UKB5	411 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
PTPRM-215	ENST00000583289	KIAA1257	Q9ULG3	409 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PTPRM-215	ENST00000583289	COG5	Q9UP83	839 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PTPRM-215	ENST00000583289	DRG1	Q9Y295	367 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
PTPRM-215	ENST00000583289	ATP8A1	Q9Y2Q0	1164 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PTPRM-215	ENST00000583289	AFG3L2	Q9Y4W6	797 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PTPRM-215	ENST00000583289	NFS1	Q9Y697	457 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PTPRM-215	ENST00000583289	FER1L6	Q2WGJ9	1857 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PTPRM-215	ENST00000583289	DOCK1	Q14185	1865 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PTPRM-215	ENST00000583289	GOLGA8IP	A6NC78	632 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PTPRM-215	ENST00000583289	LRRIQ4	A6NIV6	560 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PTPRM-215	ENST00000583289	GOLGA8J	A6NMD2	632 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PTPRM-215	ENST00000583289	AHRR	A9YTQ3	701 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PTPRM-215	ENST00000583289	RASGRF2	O14827	1237 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PTPRM-215	ENST00000583289	OGT	O15294	1046 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PTPRM-215	ENST00000583289	MAGEB2	O15479	319 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PTPRM-215	ENST00000583289	TRAPPC3	O43617	180 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PTPRM-215	ENST00000583289	PRAMEF4	O60810	478 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PTPRM-215	ENST00000583289	ZNF189	O75820	626 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
PTPRM-215	ENST00000583289	TOMM70	O94826	608 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PTPRM-215	ENST00000583289	FKBP9	O95302	570 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PTPRM-215	ENST00000583289	HLA-DRA	P01903	254 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PTPRM-215	ENST00000583289	TNNC2	P02585	160 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PTPRM-215	ENST00000583289	ADRB2	P07550	413 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PTPRM-215	ENST00000583289	ECHS1	P30084	290 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PTPRM-215	ENST00000583289	ATIC	P31939	592 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PTPRM-215	ENST00000583289	APOBEC3A	P31941	199 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
PTPRM-215	ENST00000583289	PTPN7	P35236	360 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PTPRM-215	ENST00000583289	ADCYAP1R1	P41586	468 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PTPRM-215	ENST00000583289	PIK3CA	P42336	1068 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PTPRM-215	ENST00000583289	PTK6	Q13882	451 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PTPRM-215	ENST00000583289	STAT4	Q14765	748 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PTPRM-215	ENST00000583289	UGCG	Q16739	394 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PTPRM-215	ENST00000583289	HADH	Q16836	314 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
PTPRM-215	ENST00000583289	C19orf54	Q5BKX5	351 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PTPRM-215	ENST00000583289	ZNF484	Q5JVG2	852 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PTPRM-215	ENST00000583289	PLA2G4F	Q68DD2	849 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PTPRM-215	ENST00000583289	KCTD16	Q68DU8	428 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PTPRM-215	ENST00000583289	PLEKHA7	Q6IQ23	1121 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PTPRM-215	ENST00000583289	METTL7B	Q6UX53	244 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PTPRM-215	ENST00000583289	FKBP9P1	Q75LS8	142 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PTPRM-215	ENST00000583289	GPRIN1	Q7Z2K8	1008 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PTPRM-215	ENST00000583289	SLC47A2	Q86VL8	602 aa		4.73	□□□□□ -1.65

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