RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578334.5

TSPOAP1-AS1-202, TSPOAP1, SUPT4H1 and RNF43 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TSPOAP1-AS1, Length 956 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 JOSD2Q8TAC2 188 aa28.77■■■□□ 2.2
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 GPT2Q8TD30 523 aa28.77■■■□□ 2.2
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 NXPE2Q96DL1 559 aa28.77■■■□□ 2.2
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 TM6SF2Q9BZW4 377 aa28.77■■■□□ 2.2
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 LMBRD1Q9NUN5 540 aa28.77■■■□□ 2.2
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 KLHL11Q9NVR0 708 aa28.77■■■□□ 2.2
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 TDRD6O60522 2096 aaKnown RBP28.77■■■□□ 2.2
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TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 ITGB7P26010 798 aa28.76■■■□□ 2.19
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 ETFBP38117 255 aa28.76■■■□□ 2.19
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 STAT1P42224 750 aa28.76■■■□□ 2.19
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP28.76■■■□□ 2.19
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP28.76■■■□□ 2.19
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 HS1BP3Q53T59 392 aa28.76■■■□□ 2.19
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TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 ZDHHC6Q9H6R6 413 aa28.76■■■□□ 2.19
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 NDFIP2Q9NV92 336 aa28.76■■■□□ 2.19
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TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 TRIM38O00635 465 aa28.75■■■□□ 2.19
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TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 DGKAP23743 735 aa28.75■■■□□ 2.19
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 L1CAMP32004 1257 aa28.75■■■□□ 2.19
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 MAPKAPK2P49137 400 aa28.75■■■□□ 2.19
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 NRG1Q02297 640 aaPredicted RBP28.75■■■□□ 2.19
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 PROX2Q3B8N5 592 aa28.75■■■□□ 2.19
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 TMEM259Q4ZIN3 620 aa28.75■■■□□ 2.19
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TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 SLC25A45Q8N413 288 aa28.75■■■□□ 2.19
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 RYBPQ8N488 228 aaPredicted RBP28.75■■■□□ 2.19
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP28.75■■■□□ 2.19
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 OSBPL2Q9H1P3 480 aa28.75■■■□□ 2.19
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 SCUBE2Q9NQ36 999 aa28.75■■■□□ 2.19
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 FANCLQ9NW38 375 aa28.75■■■□□ 2.19
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 HECAQ9UBI9 543 aaPredicted RBP28.75■■■□□ 2.19
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TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 PTPN9P43378 593 aa28.74■■■□□ 2.19
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TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 FAM72DQ6L9T8 149 aa28.74■■■□□ 2.19
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 KIAA1161Q6NSJ0 714 aa28.74■■■□□ 2.19
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TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 SIK3Q9Y2K2 1263 aa28.74■■■□□ 2.19
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TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 KRT3P12035 628 aa28.73■■■□□ 2.19
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 UNGP13051 313 aaPredicted RBP28.73■■■□□ 2.19
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TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 MAGEB5Q9BZ81 275 aa28.73■■■□□ 2.19
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 TMEM248Q9NWD8 314 aa28.73■■■□□ 2.19
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TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 CHD5Q8TDI0 1954 aa28.73■■■□□ 2.19
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TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 POLD3Q15054 466 aaPredicted RBP28.72■■■□□ 2.19
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 SYCP1Q15431 976 aa28.72■■■□□ 2.19
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TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 Q6ZSR6 202 aa28.72■■■□□ 2.19
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 SLC22A18ASQ8N1D0 253 aa28.72■■■□□ 2.19
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 CCDC185Q8N715 623 aa28.72■■■□□ 2.19
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 OR4C6Q8NH72 309 aa28.72■■■□□ 2.19
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 LRIG1Q96JA1 1093 aa28.72■■■□□ 2.19
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 DCBLD2Q96PD2 775 aa28.72■■■□□ 2.19
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 RETREG1Q9H6L5 497 aa28.72■■■□□ 2.19
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 AK5Q9Y6K8 562 aa28.72■■■□□ 2.19
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 CXorf51AA0A1B0GTR3 108 aa28.71■■■□□ 2.19
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 RAMP2O60895 175 aa28.71■■■□□ 2.19
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 PIAS2O75928 621 aa28.71■■■□□ 2.19
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 PAK4O96013 591 aaPredicted RBP28.71■■■□□ 2.19
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 GKP32189 559 aa28.71■■■□□ 2.19
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