RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577498.1

IFT20-204, Transcript of intraflagellar transport 20, humanhuman

TSL 4

Gene IFT20, Length 557 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT20-204ENST00000577498 ASB16Q96NS5 453 aa15.38■□□□□ 0.05
IFT20-204ENST00000577498 MGME1Q9BQP7 344 aa15.38■□□□□ 0.05
IFT20-204ENST00000577498 SLC2A11Q9BYW1 496 aa15.38■□□□□ 0.05
IFT20-204ENST00000577498 BFARQ9NZS9 450 aa15.38■□□□□ 0.05
IFT20-204ENST00000577498 CHD7Q9P2D1 2997 aa15.38■□□□□ 0.05
IFT20-204ENST00000577498 C2orf16Q68DN1 1984 aa15.37■□□□□ 0.05
IFT20-204ENST00000577498 MAGEB16A2A368 324 aa15.37■□□□□ 0.05
IFT20-204ENST00000577498 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP15.37■□□□□ 0.05
IFT20-204ENST00000577498 LINC01565O15544 149 aa15.37■□□□□ 0.05
IFT20-204ENST00000577498 PGAM1P18669 254 aa15.37■□□□□ 0.05
IFT20-204ENST00000577498 MGAT1P26572 445 aa15.37■□□□□ 0.05
IFT20-204ENST00000577498 ARF5P84085 180 aa15.37■□□□□ 0.05
IFT20-204ENST00000577498 SLC20A2Q08357 652 aa15.37■□□□□ 0.05
IFT20-204ENST00000577498 NIPAL4Q0D2K0 466 aa15.37■□□□□ 0.05
IFT20-204ENST00000577498 LMAN2Q12907 356 aa15.37■□□□□ 0.05
IFT20-204ENST00000577498 DMC1Q14565 340 aa15.37■□□□□ 0.05
IFT20-204ENST00000577498 RASA2Q15283 850 aa15.37■□□□□ 0.05
IFT20-204ENST00000577498 KLHL38Q2WGJ6 581 aa15.37■□□□□ 0.05
IFT20-204ENST00000577498 RALGPS1Q5JS13 557 aa15.37■□□□□ 0.05
IFT20-204ENST00000577498 FAM78AQ5JUQ0 283 aa15.37■□□□□ 0.05
IFT20-204ENST00000577498 ATAT1Q5SQI0 421 aa15.37■□□□□ 0.05
IFT20-204ENST00000577498 STEAP4Q687X5 459 aa15.37■□□□□ 0.05
IFT20-204ENST00000577498 RETSATQ6NUM9 610 aa15.37■□□□□ 0.05
IFT20-204ENST00000577498 RANBP10Q6VN20 620 aa15.37■□□□□ 0.05
IFT20-204ENST00000577498 CYS1Q717R9 158 aa15.37■□□□□ 0.05
IFT20-204ENST00000577498 TMEM25Q86YD3 366 aa15.37■□□□□ 0.05
IFT20-204ENST00000577498 TDRPQ86YL5 185 aa15.37■□□□□ 0.05
IFT20-204ENST00000577498 RIBC1Q8N443 379 aaPredicted RBP15.37■□□□□ 0.05
IFT20-204ENST00000577498 DNAAF3Q8N9W5 541 aa15.37■□□□□ 0.05
IFT20-204ENST00000577498 IPMKQ8NFU5 416 aa15.37■□□□□ 0.05
IFT20-204ENST00000577498 OR52K1Q8NGK4 314 aa15.37■□□□□ 0.05
IFT20-204ENST00000577498 UHMK1Q8TAS1 419 aaKnown RBP15.37■□□□□ 0.05
IFT20-204ENST00000577498 E2F7Q96AV8 911 aa15.37■□□□□ 0.05
IFT20-204ENST00000577498 LMLNQ96KR4 655 aa15.37■□□□□ 0.05
IFT20-204ENST00000577498 MRGPRX2Q96LB1 330 aa15.37■□□□□ 0.05
IFT20-204ENST00000577498 ATP6V1G3Q96LB4 118 aa15.37■□□□□ 0.05
IFT20-204ENST00000577498 FICDQ9BVA6 458 aa15.37■□□□□ 0.05
IFT20-204ENST00000577498 BBS2Q9BXC9 721 aa15.37■□□□□ 0.05
IFT20-204ENST00000577498 IL22Q9GZX6 179 aa15.37■□□□□ 0.05
IFT20-204ENST00000577498 STMN4Q9H169 189 aaPredicted RBP15.37■□□□□ 0.05
IFT20-204ENST00000577498 ACSS3Q9H6R3 686 aa15.37■□□□□ 0.05
IFT20-204ENST00000577498 ARNT2Q9HBZ2 717 aa15.37■□□□□ 0.05
IFT20-204ENST00000577498 SLC24A2Q9UI40 661 aa15.37■□□□□ 0.05
IFT20-204ENST00000577498 VPS51Q9UID3 782 aa15.37■□□□□ 0.05
IFT20-204ENST00000577498 CDH7Q9ULB5 785 aa15.37■□□□□ 0.05
IFT20-204ENST00000577498 MAD1L1Q9Y6D9 718 aa15.37■□□□□ 0.05
IFT20-204ENST00000577498 EXOC1LA0A1B0GW35 172 aa15.36■□□□□ 0.05
IFT20-204ENST00000577498 RNF40O75150 1001 aa15.36■□□□□ 0.05
IFT20-204ENST00000577498 PMPCBO75439 489 aa15.36■□□□□ 0.05
IFT20-204ENST00000577498 MT-CYBP00156 380 aaPredicted RBP15.36■□□□□ 0.05
IFT20-204ENST00000577498 MMP2P08253 660 aa15.36■□□□□ 0.05
IFT20-204ENST00000577498 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP15.36■□□□□ 0.05
IFT20-204ENST00000577498 GLDCP23378 1020 aa15.36■□□□□ 0.05
IFT20-204ENST00000577498 SSTR1P30872 391 aa15.36■□□□□ 0.05
IFT20-204ENST00000577498 CD86P42081 329 aa15.36■□□□□ 0.05
IFT20-204ENST00000577498 WNT3AP56704 352 aa15.36■□□□□ 0.05
IFT20-204ENST00000577498 SESN2P58004 480 aaPredicted RBP15.36■□□□□ 0.05
IFT20-204ENST00000577498 SKOR1P84550 965 aa15.36■□□□□ 0.05
IFT20-204ENST00000577498 DSC2Q02487 901 aa15.36■□□□□ 0.05
IFT20-204ENST00000577498 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP15.36■□□□□ 0.05
IFT20-204ENST00000577498 FRG1Q14331 258 aaKnown RBP15.36■□□□□ 0.05
IFT20-204ENST00000577498 CYTH1Q15438 398 aa15.36■□□□□ 0.05
IFT20-204ENST00000577498 PLEKHG6Q3KR16 790 aa15.36■□□□□ 0.05
IFT20-204ENST00000577498 CES5AQ6NT32 575 aa15.36■□□□□ 0.05
IFT20-204ENST00000577498 ZNF449Q6P9G9 518 aa15.36■□□□□ 0.05
IFT20-204ENST00000577498 LEKR1Q6ZMV7 388 aa15.36■□□□□ 0.05
IFT20-204ENST00000577498 GET4Q7L5D6 327 aaPredicted RBP15.36■□□□□ 0.05
IFT20-204ENST00000577498 ADGRG2Q8IZP9 1017 aa15.36■□□□□ 0.05
IFT20-204ENST00000577498 GSDMBQ8TAX9 411 aa15.36■□□□□ 0.05
IFT20-204ENST00000577498 BPIFB1Q8TDL5 484 aa15.36■□□□□ 0.05
IFT20-204ENST00000577498 PTCD2Q8WV60 388 aaKnown RBP15.36■□□□□ 0.05
IFT20-204ENST00000577498 OSCP1Q8WVF1 389 aa15.36■□□□□ 0.05
IFT20-204ENST00000577498 BHMTQ93088 406 aa15.36■□□□□ 0.05
IFT20-204ENST00000577498 ARL8AQ96BM9 186 aa15.36■□□□□ 0.05
IFT20-204ENST00000577498 CFAP36Q96G28 342 aa15.36■□□□□ 0.05
IFT20-204ENST00000577498 CYTH2Q99418 400 aa15.36■□□□□ 0.05
IFT20-204ENST00000577498 SEMA3CQ99985 751 aa15.36■□□□□ 0.05
IFT20-204ENST00000577498 FSD1LQ9BXM9 530 aa15.36■□□□□ 0.05
IFT20-204ENST00000577498 LINC00597Q9H2U6 94 aa15.36■□□□□ 0.05
IFT20-204ENST00000577498 SYBUQ9NX95 663 aa15.36■□□□□ 0.05
IFT20-204ENST00000577498 UBP1Q9NZI7 540 aa15.36■□□□□ 0.05
IFT20-204ENST00000577498 CLEC1BQ9P126 229 aa15.36■□□□□ 0.05
IFT20-204ENST00000577498 SAMD15Q9P1V8 674 aa15.36■□□□□ 0.05
IFT20-204ENST00000577498 LGALS13Q9UHV8 139 aa15.36■□□□□ 0.05
IFT20-204ENST00000577498 RABGEF1Q9UJ41 708 aa15.36■□□□□ 0.05
IFT20-204ENST00000577498 WNT6Q9Y6F9 365 aa15.36■□□□□ 0.05
IFT20-204ENST00000577498 TCRBV9S1A1TA0A576 114 aa15.35■□□□□ 0.05
IFT20-204ENST00000577498 MUSKO15146 869 aa15.35■□□□□ 0.05
IFT20-204ENST00000577498 RGS16O15492 202 aaPredicted RBP15.35■□□□□ 0.05
IFT20-204ENST00000577498 SNAP91O60641 907 aa15.35■□□□□ 0.05
IFT20-204ENST00000577498 CDH16O75309 829 aa15.35■□□□□ 0.05
IFT20-204ENST00000577498 USP12O75317 370 aa15.35■□□□□ 0.05
IFT20-204ENST00000577498 TMCC1O94876 653 aa15.35■□□□□ 0.05
IFT20-204ENST00000577498 EPOP01588 193 aa15.35■□□□□ 0.05
IFT20-204ENST00000577498 TYRP14679 529 aa15.35■□□□□ 0.05
IFT20-204ENST00000577498 CR2P20023 1033 aa15.35■□□□□ 0.05
IFT20-204ENST00000577498 MTHFRP42898 656 aa15.35■□□□□ 0.05
IFT20-204ENST00000577498 MAXP61244 160 aa15.35■□□□□ 0.05
IFT20-204ENST00000577498 MTM1Q13496 603 aa15.35■□□□□ 0.05
IFT20-204ENST00000577498 COL19A1Q14993 1142 aa15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 89.3 ms