RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000564630.5

CCNDBP1-205, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 5

Gene CCNDBP1, Length 2,079 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-205ENST00000564630 H3BNX3 289 aa20.63■□□□□ 0.89
CCNDBP1-205ENST00000564630 I6L893 689 aaPredicted RBP20.63■□□□□ 0.89
CCNDBP1-205ENST00000564630 NCAM2O15394 837 aa20.63■□□□□ 0.89
CCNDBP1-205ENST00000564630 SIN3BO75182 1162 aa20.63■□□□□ 0.89
CCNDBP1-205ENST00000564630 USP12O75317 370 aa20.63■□□□□ 0.89
CCNDBP1-205ENST00000564630 CTSHP09668 335 aa20.63■□□□□ 0.89
CCNDBP1-205ENST00000564630 RALBP11234 206 aa20.63■□□□□ 0.89
CCNDBP1-205ENST00000564630 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP20.63■□□□□ 0.89
CCNDBP1-205ENST00000564630 SPRP35270 261 aaPredicted RBP20.63■□□□□ 0.89
CCNDBP1-205ENST00000564630 THPOP40225 353 aa20.63■□□□□ 0.89
CCNDBP1-205ENST00000564630 RPL5P46777 297 aaKnown RBP20.63■□□□□ 0.89
CCNDBP1-205ENST00000564630 HCAR3P49019 387 aa20.63■□□□□ 0.89
CCNDBP1-205ENST00000564630 SERPINB8P50452 374 aa20.63■□□□□ 0.89
CCNDBP1-205ENST00000564630 ABCE1P61221 599 aaKnown RBP20.63■□□□□ 0.89
CCNDBP1-205ENST00000564630 FRG1Q14331 258 aaKnown RBP20.63■□□□□ 0.89
CCNDBP1-205ENST00000564630 CMC1Q7Z7K0 106 aa20.63■□□□□ 0.89
CCNDBP1-205ENST00000564630 TMEM135Q86UB9 458 aa20.63■□□□□ 0.89
CCNDBP1-205ENST00000564630 SLC25A41Q8N5S1 370 aa20.63■□□□□ 0.89
CCNDBP1-205ENST00000564630 PYDC1Q8WXC3 89 aa20.63■□□□□ 0.89
CCNDBP1-205ENST00000564630 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa20.63■□□□□ 0.89
CCNDBP1-205ENST00000564630 CASS4Q9NQ75 786 aa20.63■□□□□ 0.89
CCNDBP1-205ENST00000564630 IRAK4Q9NWZ3 460 aa20.63■□□□□ 0.89
CCNDBP1-205ENST00000564630 BFARQ9NZS9 450 aa20.63■□□□□ 0.89
CCNDBP1-205ENST00000564630 FBXW11Q9UKB1 542 aa20.63■□□□□ 0.89
CCNDBP1-205ENST00000564630 POMPQ9Y244 141 aa20.63■□□□□ 0.89
CCNDBP1-205ENST00000564630 NUP205Q92621 2012 aa20.62■□□□□ 0.89
CCNDBP1-205ENST00000564630 AMHP03971 560 aa20.62■□□□□ 0.89
CCNDBP1-205ENST00000564630 CKBP12277 381 aa20.62■□□□□ 0.89
CCNDBP1-205ENST00000564630 PEX2P28328 305 aa20.62■□□□□ 0.89
CCNDBP1-205ENST00000564630 ARRB2P32121 409 aa20.62■□□□□ 0.89
CCNDBP1-205ENST00000564630 GMPRP36959 345 aa20.62■□□□□ 0.89
CCNDBP1-205ENST00000564630 HARS2P49590 506 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
CCNDBP1-205ENST00000564630 IDH3AP50213 366 aa20.62■□□□□ 0.89
CCNDBP1-205ENST00000564630 RABGGTBP53611 331 aa20.62■□□□□ 0.89
CCNDBP1-205ENST00000564630 LIMK2P53671 638 aa20.62■□□□□ 0.89
CCNDBP1-205ENST00000564630 SLC25A3Q00325 362 aa20.62■□□□□ 0.89
CCNDBP1-205ENST00000564630 DLG1Q12959 904 aa20.62■□□□□ 0.89
CCNDBP1-205ENST00000564630 MMEL1Q495T6 779 aa20.62■□□□□ 0.89
CCNDBP1-205ENST00000564630 ARMC3Q5W041 872 aa20.62■□□□□ 0.89
CCNDBP1-205ENST00000564630 KCTD11Q693B1 232 aa20.62■□□□□ 0.89
CCNDBP1-205ENST00000564630 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
CCNDBP1-205ENST00000564630 BORAQ6PGQ7 559 aa20.62■□□□□ 0.89
CCNDBP1-205ENST00000564630 STRA8Q7Z7C7 330 aa20.62■□□□□ 0.89
CCNDBP1-205ENST00000564630 OCEL1Q9H607 264 aa20.62■□□□□ 0.89
CCNDBP1-205ENST00000564630 ZNF358Q9NW07 568 aa20.62■□□□□ 0.89
CCNDBP1-205ENST00000564630 ARHGAP42A6NI28 874 aa20.62■□□□□ 0.89
CCNDBP1-205ENST00000564630 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP20.62■□□□□ 0.89
CCNDBP1-205ENST00000564630 CPA3P15088 417 aa20.62■□□□□ 0.89
CCNDBP1-205ENST00000564630 CSF2RAP15509 400 aa20.62■□□□□ 0.89
CCNDBP1-205ENST00000564630 MTTPP55157 894 aa20.62■□□□□ 0.89
CCNDBP1-205ENST00000564630 NPWQ8N729 165 aa20.62■□□□□ 0.89
CCNDBP1-205ENST00000564630 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
CCNDBP1-205ENST00000564630 ZFP42Q96MM3 310 aa20.62■□□□□ 0.89
CCNDBP1-205ENST00000564630 SMOQ99835 787 aa20.62■□□□□ 0.89
CCNDBP1-205ENST00000564630 GBA3Q9H227 469 aa20.62■□□□□ 0.89
CCNDBP1-205ENST00000564630 ZCWPW2A0A1B0GU75 182 aa20.61■□□□□ 0.89
CCNDBP1-205ENST00000564630 E2F8A0AVK6 867 aa20.61■□□□□ 0.89
CCNDBP1-205ENST00000564630 ERI2A8K979 691 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
CCNDBP1-205ENST00000564630 MEI4A8MW99 385 aa20.61■□□□□ 0.89
CCNDBP1-205ENST00000564630 ZNF195O14628 629 aa20.61■□□□□ 0.89
CCNDBP1-205ENST00000564630 CAPNS1P04632 268 aa20.61■□□□□ 0.89
CCNDBP1-205ENST00000564630 PYGLP06737 847 aa20.61■□□□□ 0.89
CCNDBP1-205ENST00000564630 BFSP2Q13515 415 aa20.61■□□□□ 0.89
CCNDBP1-205ENST00000564630 GPRIN1Q7Z2K8 1008 aa20.61■□□□□ 0.89
CCNDBP1-205ENST00000564630 FBXW8Q8N3Y1 598 aa20.61■□□□□ 0.89
CCNDBP1-205ENST00000564630 DNAAF3Q8N9W5 541 aa20.61■□□□□ 0.89
CCNDBP1-205ENST00000564630 SLC26A7Q8TE54 656 aa20.61■□□□□ 0.89
CCNDBP1-205ENST00000564630 HDAC11Q96DB2 347 aa20.61■□□□□ 0.89
CCNDBP1-205ENST00000564630 PGAP3Q96FM1 320 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
CCNDBP1-205ENST00000564630 SENP8Q96LD8 212 aa20.61■□□□□ 0.89
CCNDBP1-205ENST00000564630 BRD8Q9H0E9 1235 aa20.61■□□□□ 0.89
CCNDBP1-205ENST00000564630 RBM38Q9H0Z9 239 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
CCNDBP1-205ENST00000564630 CNGB3Q9NQW8 809 aa20.61■□□□□ 0.89
CCNDBP1-205ENST00000564630 C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 394 aa20.6■□□□□ 0.89
CCNDBP1-205ENST00000564630 NCAM1P13591 858 aa20.6■□□□□ 0.89
CCNDBP1-205ENST00000564630 CD68P34810 354 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
CCNDBP1-205ENST00000564630 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
CCNDBP1-205ENST00000564630 LPCAT4Q643R3 524 aa20.6■□□□□ 0.89
CCNDBP1-205ENST00000564630 FSTL4Q6MZW2 842 aa20.6■□□□□ 0.89
CCNDBP1-205ENST00000564630 ARPINQ7Z6K5 226 aa20.6■□□□□ 0.89
CCNDBP1-205ENST00000564630 FAM35AQ86V20 835 aa20.6■□□□□ 0.89
CCNDBP1-205ENST00000564630 PLD6Q8N2A8 252 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
CCNDBP1-205ENST00000564630 ICA1LQ8NDH6 482 aa20.6■□□□□ 0.89
CCNDBP1-205ENST00000564630 ATXN7L3BQ96GX2 97 aa20.6■□□□□ 0.89
CCNDBP1-205ENST00000564630 KCNK16Q96T55 309 aa20.6■□□□□ 0.89
CCNDBP1-205ENST00000564630 AGAP2Q99490 1192 aa20.6■□□□□ 0.89
CCNDBP1-205ENST00000564630 MLPHQ9BV36 600 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
CCNDBP1-205ENST00000564630 RAB26Q9ULW5 256 aa20.6■□□□□ 0.89
CCNDBP1-205ENST00000564630 PADI4Q9UM07 663 aa20.6■□□□□ 0.89
CCNDBP1-205ENST00000564630 PITPNM1O00562 1244 aa20.6■□□□□ 0.89
CCNDBP1-205ENST00000564630 VILLO15195 856 aa20.6■□□□□ 0.89
CCNDBP1-205ENST00000564630 MTSS1O43312 755 aa20.6■□□□□ 0.89
CCNDBP1-205ENST00000564630 MPOP05164 745 aa20.6■□□□□ 0.89
CCNDBP1-205ENST00000564630 ITGAXP20702 1163 aa20.6■□□□□ 0.89
CCNDBP1-205ENST00000564630 NUMBP49757 651 aa20.6■□□□□ 0.89
CCNDBP1-205ENST00000564630 FOLH1Q04609 750 aa20.6■□□□□ 0.89
CCNDBP1-205ENST00000564630 TBL3Q12788 808 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
CCNDBP1-205ENST00000564630 ARL13BQ3SXY8 428 aa20.6■□□□□ 0.89
CCNDBP1-205ENST00000564630 RAB41Q5JT25 222 aa20.6■□□□□ 0.89
CCNDBP1-205ENST00000564630 CHRDL2Q6WN34 429 aa20.6■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.1 ms