RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000564580.5

RRN3P2-202, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor pseudogene 2, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene RRN3P2, Length 2,132 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3P2-202ENST00000564580 OR8D1Q8WZ84 308 aa11.61□□□□□ -0.55
RRN3P2-202ENST00000564580 ZNF419Q96HQ0 510 aaPredicted RBP11.61□□□□□ -0.55
RRN3P2-202ENST00000564580 ZNF599Q96NL3 588 aa11.61□□□□□ -0.55
RRN3P2-202ENST00000564580 OLFM3Q96PB7 478 aa11.61□□□□□ -0.55
RRN3P2-202ENST00000564580 TSGA13Q96PP4 275 aa11.61□□□□□ -0.55
RRN3P2-202ENST00000564580 OSBPL8Q9BZF1 889 aa11.61□□□□□ -0.55
RRN3P2-202ENST00000564580 USP36Q9P275 1121 aaKnown RBP11.61□□□□□ -0.55
RRN3P2-202ENST00000564580 EFR3BQ9Y2G0 817 aa11.61□□□□□ -0.55
RRN3P2-202ENST00000564580 NUP205Q92621 2012 aa11.61□□□□□ -0.55
RRN3P2-202ENST00000564580 CHD5Q8TDI0 1954 aa11.61□□□□□ -0.55
RRN3P2-202ENST00000564580 SDK1Q7Z5N4 2213 aa11.61□□□□□ -0.55
RRN3P2-202ENST00000564580 MUSKO15146 869 aa11.6□□□□□ -0.55
RRN3P2-202ENST00000564580 ALOX15BO15296 676 aa11.6□□□□□ -0.55
RRN3P2-202ENST00000564580 MID1O15344 667 aa11.6□□□□□ -0.55
RRN3P2-202ENST00000564580 ZNF217O75362 1048 aa11.6□□□□□ -0.55
RRN3P2-202ENST00000564580 PECAM1P16284 738 aaPredicted RBP11.6□□□□□ -0.55
RRN3P2-202ENST00000564580 CHRNA3P32297 505 aa11.6□□□□□ -0.55
RRN3P2-202ENST00000564580 SLC8A1P32418 973 aa11.6□□□□□ -0.55
RRN3P2-202ENST00000564580 CNR2P34972 360 aa11.6□□□□□ -0.55
RRN3P2-202ENST00000564580 PTPN7P35236 360 aa11.6□□□□□ -0.55
RRN3P2-202ENST00000564580 RECQLP46063 649 aaPredicted RBP11.6□□□□□ -0.55
RRN3P2-202ENST00000564580 NR2C2P49116 596 aa11.6□□□□□ -0.55
RRN3P2-202ENST00000564580 CCNHP51946 323 aaPredicted RBP11.6□□□□□ -0.55
RRN3P2-202ENST00000564580 RHOAP61586 193 aa11.6□□□□□ -0.55
RRN3P2-202ENST00000564580 RFTN1Q14699 578 aaPredicted RBP11.6□□□□□ -0.55
RRN3P2-202ENST00000564580 ZC3H14Q6PJT7 736 aaKnown RBP11.6□□□□□ -0.55
RRN3P2-202ENST00000564580 BBS12Q6ZW61 710 aa11.6□□□□□ -0.55
RRN3P2-202ENST00000564580 DSG4Q86SJ6 1040 aa11.6□□□□□ -0.55
RRN3P2-202ENST00000564580 CCNYQ8ND76 341 aa11.6□□□□□ -0.55
RRN3P2-202ENST00000564580 GAB3Q8WWW8 586 aa11.6□□□□□ -0.55
RRN3P2-202ENST00000564580 EXOC2Q96KP1 924 aa11.6□□□□□ -0.55
RRN3P2-202ENST00000564580 CCDC114Q96M63 670 aa11.6□□□□□ -0.55
RRN3P2-202ENST00000564580 TLR10Q9BXR5 811 aa11.6□□□□□ -0.55
RRN3P2-202ENST00000564580 LHX3Q9UBR4 397 aa11.6□□□□□ -0.55
RRN3P2-202ENST00000564580 SERGEFQ9UGK8 458 aa11.6□□□□□ -0.55
RRN3P2-202ENST00000564580 CYP8B1Q9UNU6 501 aa11.6□□□□□ -0.55
RRN3P2-202ENST00000564580 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP11.6□□□□□ -0.55
RRN3P2-202ENST00000564580 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP11.6□□□□□ -0.55
RRN3P2-202ENST00000564580 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP11.6□□□□□ -0.55
RRN3P2-202ENST00000564580 WASF2Q9Y6W5 498 aa11.6□□□□□ -0.55
RRN3P2-202ENST00000564580 LEFTY1O75610 366 aa11.6□□□□□ -0.55
RRN3P2-202ENST00000564580 GSRP00390 522 aa11.6□□□□□ -0.55
RRN3P2-202ENST00000564580 IGLV3-19P01714 112 aa11.6□□□□□ -0.55
RRN3P2-202ENST00000564580 DNTTP04053 509 aa11.6□□□□□ -0.55
RRN3P2-202ENST00000564580 ACADMP11310 421 aa11.6□□□□□ -0.55
RRN3P2-202ENST00000564580 CCNCP24863 283 aa11.6□□□□□ -0.55
RRN3P2-202ENST00000564580 GKP32189 559 aa11.6□□□□□ -0.55
RRN3P2-202ENST00000564580 NBL1P41271 181 aa11.6□□□□□ -0.55
RRN3P2-202ENST00000564580 PSMD8P48556 350 aa11.6□□□□□ -0.55
RRN3P2-202ENST00000564580 SNRPD1P62314 119 aaKnown RBP11.6□□□□□ -0.55
RRN3P2-202ENST00000564580 LBRQ14739 615 aaKnown RBP11.6□□□□□ -0.55
RRN3P2-202ENST00000564580 RPS6KA1Q15418 735 aa11.6□□□□□ -0.55
RRN3P2-202ENST00000564580 MYLK3Q32MK0 819 aa11.6□□□□□ -0.55
RRN3P2-202ENST00000564580 POM121L1PQ3SYA9 428 aa11.6□□□□□ -0.55
RRN3P2-202ENST00000564580 ARSIQ5FYB1 569 aa11.6□□□□□ -0.55
RRN3P2-202ENST00000564580 TMCO4Q5TGY1 634 aa11.6□□□□□ -0.55
RRN3P2-202ENST00000564580 AADATQ8N5Z0 425 aa11.6□□□□□ -0.55
RRN3P2-202ENST00000564580 TMIEQ8NEW7 156 aa11.6□□□□□ -0.55
RRN3P2-202ENST00000564580 GRIN3AQ8TCU5 1115 aa11.6□□□□□ -0.55
RRN3P2-202ENST00000564580 PSKH2Q96QS6 385 aa11.6□□□□□ -0.55
RRN3P2-202ENST00000564580 HEPHQ9BQS7 1158 aa11.6□□□□□ -0.55
RRN3P2-202ENST00000564580 PABPC3Q9H361 631 aaKnown RBP11.6□□□□□ -0.55
RRN3P2-202ENST00000564580 MBD1Q9UIS9 605 aaPredicted RBP11.6□□□□□ -0.55
RRN3P2-202ENST00000564580 DNAH14Q0VDD8 3507 aa11.6□□□□□ -0.55
RRN3P2-202ENST00000564580 PIEZO1Q92508 2521 aa11.59□□□□□ -0.55
RRN3P2-202ENST00000564580 CKAP5Q14008 2032 aa11.59□□□□□ -0.55
RRN3P2-202ENST00000564580 IGHV1OR15-9A0A0B4J2B8 117 aa11.59□□□□□ -0.55
RRN3P2-202ENST00000564580 KRIT1O00522 736 aa11.59□□□□□ -0.55
RRN3P2-202ENST00000564580 MATN3O15232 486 aa11.59□□□□□ -0.55
RRN3P2-202ENST00000564580 POP4O95707 220 aaKnown RBP11.59□□□□□ -0.55
RRN3P2-202ENST00000564580 C5AR1P21730 350 aa11.59□□□□□ -0.55
RRN3P2-202ENST00000564580 TGM2P21980 687 aa11.59□□□□□ -0.55
RRN3P2-202ENST00000564580 RGRP47804 291 aa11.59□□□□□ -0.55
RRN3P2-202ENST00000564580 NHLH1Q02575 133 aa11.59□□□□□ -0.55
RRN3P2-202ENST00000564580 PPIDQ08752 370 aaKnown RBP11.59□□□□□ -0.55
RRN3P2-202ENST00000564580 HNRNPDQ14103 355 aaKnown RBP11.59□□□□□ -0.55
RRN3P2-202ENST00000564580 PDK1Q15118 436 aa11.59□□□□□ -0.55
RRN3P2-202ENST00000564580 MARC1Q5VT66 337 aa11.59□□□□□ -0.55
RRN3P2-202ENST00000564580 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa11.59□□□□□ -0.55
RRN3P2-202ENST00000564580 PGBD5Q8N414 524 aa11.59□□□□□ -0.55
RRN3P2-202ENST00000564580 RYBPQ8N488 228 aaPredicted RBP11.59□□□□□ -0.55
RRN3P2-202ENST00000564580 PIP4K2CQ8TBX8 421 aa11.59□□□□□ -0.55
RRN3P2-202ENST00000564580 P3H4Q92791 437 aa11.59□□□□□ -0.55
RRN3P2-202ENST00000564580 FATE1Q969F0 183 aa11.59□□□□□ -0.55
RRN3P2-202ENST00000564580 HDAC11Q96DB2 347 aa11.59□□□□□ -0.55
RRN3P2-202ENST00000564580 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa11.59□□□□□ -0.55
RRN3P2-202ENST00000564580 FBXL12Q9NXK8 326 aa11.59□□□□□ -0.55
RRN3P2-202ENST00000564580 SEPT3Q9UH03 358 aa11.59□□□□□ -0.55
RRN3P2-202ENST00000564580 IL36AQ9UHA7 158 aa11.59□□□□□ -0.55
RRN3P2-202ENST00000564580 SCML1Q9UN30 329 aa11.59□□□□□ -0.55
RRN3P2-202ENST00000564580 ZNF292O60281 2723 aa11.59□□□□□ -0.55
RRN3P2-202ENST00000564580 APOC4-APOC2K7ER74 178 aa11.59□□□□□ -0.55
RRN3P2-202ENST00000564580 KCNK1O00180 336 aa11.59□□□□□ -0.55
RRN3P2-202ENST00000564580 PLK4O00444 970 aa11.59□□□□□ -0.55
RRN3P2-202ENST00000564580 GJB3O75712 270 aa11.59□□□□□ -0.55
RRN3P2-202ENST00000564580 ADH1BP00325 375 aa11.59□□□□□ -0.55
RRN3P2-202ENST00000564580 APOC2P02655 101 aa11.59□□□□□ -0.55
RRN3P2-202ENST00000564580 PRNPP04156 253 aa11.59□□□□□ -0.55
RRN3P2-202ENST00000564580 CCNB1P14635 433 aa11.59□□□□□ -0.55
RRN3P2-202ENST00000564580 BCKDHBP21953 392 aa11.59□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.8 ms