RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561685.1

RRN3-204, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor, humanhuman

TSL 5

Gene RRN3, Length 615 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3-204ENST00000561685 HEXIM1O94992 359 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
RRN3-204ENST00000561685 PPM1AP35813 382 aa3.55□□□□□ -1.84
RRN3-204ENST00000561685 PDLIM4P50479 330 aa3.55□□□□□ -1.84
RRN3-204ENST00000561685 CLCN5P51795 746 aa3.55□□□□□ -1.84
RRN3-204ENST00000561685 TUBA1BP68363 451 aa3.55□□□□□ -1.84
RRN3-204ENST00000561685 POU5F1BQ06416 359 aa3.55□□□□□ -1.84
RRN3-204ENST00000561685 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
RRN3-204ENST00000561685 KIF19Q2TAC6 998 aa3.55□□□□□ -1.84
RRN3-204ENST00000561685 TTC22Q5TAA0 569 aa3.55□□□□□ -1.84
RRN3-204ENST00000561685 NCAPH2Q6IBW4 605 aa3.55□□□□□ -1.84
RRN3-204ENST00000561685 WBP2NLQ6ICG8 309 aa3.55□□□□□ -1.84
RRN3-204ENST00000561685 DGAT2L7PQ6IED9 249 aa3.55□□□□□ -1.84
RRN3-204ENST00000561685 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP3.55□□□□□ -1.84
RRN3-204ENST00000561685 SRLQ86TD4 932 aa3.55□□□□□ -1.84
RRN3-204ENST00000561685 SERPINA11Q86U17 422 aa3.55□□□□□ -1.84
RRN3-204ENST00000561685 ZNF329Q86UD4 541 aa3.55□□□□□ -1.84
RRN3-204ENST00000561685 FAM186BQ8IYM0 893 aa3.55□□□□□ -1.84
RRN3-204ENST00000561685 TCP11L2Q8N4U5 519 aa3.55□□□□□ -1.84
RRN3-204ENST00000561685 STYXQ8WUJ0 223 aa3.55□□□□□ -1.84
RRN3-204ENST00000561685 KATNAL1Q9BW62 490 aa3.55□□□□□ -1.84
RRN3-204ENST00000561685 CADM1Q9BY67 442 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
RRN3-204ENST00000561685 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP3.55□□□□□ -1.84
RRN3-204ENST00000561685 DDX31Q9H8H2 851 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
RRN3-204ENST00000561685 CHST12Q9NRB3 414 aa3.55□□□□□ -1.84
RRN3-204ENST00000561685 NDUFAF4Q9P032 175 aa3.55□□□□□ -1.84
RRN3-204ENST00000561685 SEL1LQ9UBV2 794 aa3.55□□□□□ -1.84
RRN3-204ENST00000561685 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
RRN3-204ENST00000561685 CPS1P31327 1500 aa3.54□□□□□ -1.84
RRN3-204ENST00000561685 WDR7Q9Y4E6 1490 aa3.54□□□□□ -1.84
RRN3-204ENST00000561685 IGHV4-28A0A0C4DH34 117 aa3.54□□□□□ -1.84
RRN3-204ENST00000561685 SRRM3A6NNA2 597 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
RRN3-204ENST00000561685 EYA2O00167 538 aa3.54□□□□□ -1.84
RRN3-204ENST00000561685 HSPB6O14558 160 aa3.54□□□□□ -1.84
RRN3-204ENST00000561685 ACTL6BO94805 426 aa3.54□□□□□ -1.84
RRN3-204ENST00000561685 FCGR2AP12318 317 aa3.54□□□□□ -1.84
RRN3-204ENST00000561685 EEF1A2Q05639 463 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
RRN3-204ENST00000561685 RPS6KA2Q15349 733 aa3.54□□□□□ -1.84
RRN3-204ENST00000561685 ZNF672Q499Z4 452 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
RRN3-204ENST00000561685 SYTL3Q4VX76 610 aa3.54□□□□□ -1.84
RRN3-204ENST00000561685 TMEM268Q5VZI3 342 aa3.54□□□□□ -1.84
RRN3-204ENST00000561685 IL31Q6EBC2 164 aa3.54□□□□□ -1.84
RRN3-204ENST00000561685 KIAA1324Q6UXG2 1013 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
RRN3-204ENST00000561685 MON1BQ7L1V2 547 aa3.54□□□□□ -1.84
RRN3-204ENST00000561685 GALNT7Q86SF2 657 aa3.54□□□□□ -1.84
RRN3-204ENST00000561685 WDR5BQ86VZ2 330 aa3.54□□□□□ -1.84
RRN3-204ENST00000561685 TMC8Q8IU68 726 aa3.54□□□□□ -1.84
RRN3-204ENST00000561685 SCN4BQ8IWT1 228 aa3.54□□□□□ -1.84
RRN3-204ENST00000561685 VPS52Q8N1B4 723 aa3.54□□□□□ -1.84
RRN3-204ENST00000561685 PTGR2Q8N8N7 351 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
RRN3-204ENST00000561685 TEX45Q8NA69 505 aa3.54□□□□□ -1.84
RRN3-204ENST00000561685 ARRDC3Q96B67 414 aa3.54□□□□□ -1.84
RRN3-204ENST00000561685 TEFMQ96QE5 360 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
RRN3-204ENST00000561685 FIZ1Q96SL8 496 aa3.54□□□□□ -1.84
RRN3-204ENST00000561685 BRD8Q9H0E9 1235 aa3.54□□□□□ -1.84
RRN3-204ENST00000561685 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
RRN3-204ENST00000561685 NLRC4Q9NPP4 1024 aa3.54□□□□□ -1.84
RRN3-204ENST00000561685 FNIP2Q9P278 1114 aa3.54□□□□□ -1.84
RRN3-204ENST00000561685 CDH22Q9UJ99 828 aa3.54□□□□□ -1.84
RRN3-204ENST00000561685 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP3.53□□□□□ -1.84
RRN3-204ENST00000561685 A0A087WYN8 130 aa3.53□□□□□ -1.84
RRN3-204ENST00000561685 ERVV-2B6SEH9 535 aa3.53□□□□□ -1.84
RRN3-204ENST00000561685 SYT5O00445 386 aa3.53□□□□□ -1.84
RRN3-204ENST00000561685 SERPINI2O75830 405 aa3.53□□□□□ -1.84
RRN3-204ENST00000561685 TNFRSF6BO95407 300 aa3.53□□□□□ -1.84
RRN3-204ENST00000561685 DDAH2O95865 285 aa3.53□□□□□ -1.84
RRN3-204ENST00000561685 SNRNP70P08621 437 aaKnown RBP3.53□□□□□ -1.84
RRN3-204ENST00000561685 ZNF12P17014 697 aa3.53□□□□□ -1.84
RRN3-204ENST00000561685 SERPINA4P29622 427 aa3.53□□□□□ -1.84
RRN3-204ENST00000561685 RFC1P35251 1148 aaPredicted RBP3.53□□□□□ -1.84
RRN3-204ENST00000561685 THPOP40225 353 aa3.53□□□□□ -1.84
RRN3-204ENST00000561685 RPS6KA3P51812 740 aa3.53□□□□□ -1.84
RRN3-204ENST00000561685 NEK3P51956 506 aa3.53□□□□□ -1.84
RRN3-204ENST00000561685 AP2B1P63010 937 aa3.53□□□□□ -1.84
RRN3-204ENST00000561685 DCTN1Q14203 1278 aa3.53□□□□□ -1.84
RRN3-204ENST00000561685 SLC39A14Q15043 492 aa3.53□□□□□ -1.84
RRN3-204ENST00000561685 ZNF718Q3SXZ3 478 aa3.53□□□□□ -1.84
RRN3-204ENST00000561685 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa3.53□□□□□ -1.84
RRN3-204ENST00000561685 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP3.53□□□□□ -1.84
RRN3-204ENST00000561685 KLHL17Q6TDP4 642 aa3.53□□□□□ -1.84
RRN3-204ENST00000561685 PATL1Q86TB9 770 aaKnown RBP3.53□□□□□ -1.84
RRN3-204ENST00000561685 SLC44A2Q8IWA5 706 aaPredicted RBP3.53□□□□□ -1.84
RRN3-204ENST00000561685 MIGA1Q8NAN2 632 aa3.53□□□□□ -1.84
RRN3-204ENST00000561685 ZNF527Q8NB42 609 aa3.53□□□□□ -1.84
RRN3-204ENST00000561685 TMED6Q8WW62 240 aa3.53□□□□□ -1.84
RRN3-204ENST00000561685 KCNJ9Q92806 393 aa3.53□□□□□ -1.84
RRN3-204ENST00000561685 IGSF21Q96ID5 467 aa3.53□□□□□ -1.84
RRN3-204ENST00000561685 SLC25A33Q9BSK2 321 aa3.53□□□□□ -1.84
RRN3-204ENST00000561685 RETREG1Q9H6L5 497 aa3.53□□□□□ -1.84
RRN3-204ENST00000561685 ARNT2Q9HBZ2 717 aa3.53□□□□□ -1.84
RRN3-204ENST00000561685 OBP2BQ9NPH6 170 aa3.53□□□□□ -1.84
RRN3-204ENST00000561685 PRDM8Q9NQV8 689 aa3.53□□□□□ -1.84
RRN3-204ENST00000561685 AGO1Q9UL18 857 aaKnown RBP3.53□□□□□ -1.84
RRN3-204ENST00000561685 DAPP1Q9UN19 280 aa3.53□□□□□ -1.84
RRN3-204ENST00000561685 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP3.53□□□□□ -1.84
RRN3-204ENST00000561685 UACAQ9BZF9 1416 aa3.53□□□□□ -1.85
RRN3-204ENST00000561685 WDR81Q562E7 1941 aa3.52□□□□□ -1.85
RRN3-204ENST00000561685 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa3.52□□□□□ -1.85
RRN3-204ENST00000561685 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa3.52□□□□□ -1.85
RRN3-204ENST00000561685 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa3.52□□□□□ -1.85
RRN3-204ENST00000561685 ITM2AO43736 263 aa3.52□□□□□ -1.85
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