RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556591.1

CFAP54-208, Transcript of cilia and flagella associated protein 54, human

TSL 5

Gene CFAP54, Length 802 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CFAP54-208	ENST00000556591	ALKBH4	Q9NXW9	302 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CFAP54-208	ENST00000556591	FBXO40	Q9UH90	709 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CFAP54-208	ENST00000556591	HSF4	Q9ULV5	492 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CFAP54-208	ENST00000556591	CLDN16	Q9Y5I7	305 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CFAP54-208	ENST00000556591	LOC102724159	A0A0B4J2E5	919 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CFAP54-208	ENST00000556591	NCAM2	O15394	837 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CFAP54-208	ENST00000556591	SLC25A17	O43808	307 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CFAP54-208	ENST00000556591	CLDN7	O95471	211 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CFAP54-208	ENST00000556591	CHRM4	P08173	479 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CFAP54-208	ENST00000556591	ARSB	P15848	533 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CFAP54-208	ENST00000556591	YWHAQ	P27348	245 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CFAP54-208	ENST00000556591	PMS2	P54278	862 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CFAP54-208	ENST00000556591	KHDRBS1	Q07666	443 aa	Known RBP eCLIP	4.9	□□□□□ -1.63
CFAP54-208	ENST00000556591	PWP2	Q15269	919 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CFAP54-208	ENST00000556591	C9orf47	Q6ZRZ4	202 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CFAP54-208	ENST00000556591	ZDHHC23	Q8IYP9	409 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CFAP54-208	ENST00000556591	OIT3	Q8WWZ8	545 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CFAP54-208	ENST00000556591	RAB40A	Q8WXH6	277 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CFAP54-208	ENST00000556591	USP13	Q92995	863 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CFAP54-208	ENST00000556591	GPR63	Q9BZJ6	419 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CFAP54-208	ENST00000556591	LHPP	Q9H008	270 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CFAP54-208	ENST00000556591	PLAC1	Q9HBJ0	212 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CFAP54-208	ENST00000556591	WDR6	Q9NNW5	1121 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CFAP54-208	ENST00000556591	KRCC1	Q9NPI7	259 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CFAP54-208	ENST00000556591	CNPY2	Q9Y2B0	182 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CFAP54-208	ENST00000556591		A0A1B0GVT2	93 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CFAP54-208	ENST00000556591	CEP104	O60308	925 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CFAP54-208	ENST00000556591	OAZ2	O95190	189 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CFAP54-208	ENST00000556591	LCAT	P04180	440 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CFAP54-208	ENST00000556591	ALPL	P05186	524 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CFAP54-208	ENST00000556591	ENO3	P13929	434 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CFAP54-208	ENST00000556591	HOXA11	P31270	313 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CFAP54-208	ENST00000556591	PGM1	P36871	562 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CFAP54-208	ENST00000556591	RFX2	P48378	723 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CFAP54-208	ENST00000556591	ARSF	P54793	590 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CFAP54-208	ENST00000556591	CDH12	P55289	794 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CFAP54-208	ENST00000556591	TLE2	Q04725	743 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CFAP54-208	ENST00000556591	FHL1	Q13642	323 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CFAP54-208	ENST00000556591	NFIL3	Q16649	462 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CFAP54-208	ENST00000556591	RETSAT	Q6NUM9	610 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CFAP54-208	ENST00000556591	FAM83H	Q6ZRV2	1179 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CFAP54-208	ENST00000556591		Q6ZSV7	163 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CFAP54-208	ENST00000556591	ZNF367	Q7RTV3	350 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CFAP54-208	ENST00000556591	ADGRG6	Q86SQ4	1221 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CFAP54-208	ENST00000556591	BICD2	Q8TD16	824 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CFAP54-208	ENST00000556591	APOLD1	Q96LR9	279 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CFAP54-208	ENST00000556591	EYA3	Q99504	573 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CFAP54-208	ENST00000556591	WAC	Q9BTA9	647 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CFAP54-208	ENST00000556591	TTYH1	Q9H313	450 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CFAP54-208	ENST00000556591	EPHX3	Q9H6B9	360 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CFAP54-208	ENST00000556591	ENTPD7	Q9NQZ7	604 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CFAP54-208	ENST00000556591	NCKIPSD	Q9NZQ3	722 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CFAP54-208	ENST00000556591	LRRFIP2	Q9Y608	721 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CFAP54-208	ENST00000556591	RGS14	O43566	566 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CFAP54-208	ENST00000556591	LDB2	O43679	373 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CFAP54-208	ENST00000556591	MYZAP	P0CAP1	466 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CFAP54-208	ENST00000556591	ARRB2	P32121	409 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CFAP54-208	ENST00000556591	ENTPD1	P49961	510 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CFAP54-208	ENST00000556591	FOXG1	P55316	489 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CFAP54-208	ENST00000556591	SLC18A2	Q05940	514 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CFAP54-208	ENST00000556591	ATG9B	Q674R7	924 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CFAP54-208	ENST00000556591	IL20RB	Q6UXL0	311 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CFAP54-208	ENST00000556591	MOB3C	Q70IA8	216 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CFAP54-208	ENST00000556591	PRSS45	Q7RTY3	260 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CFAP54-208	ENST00000556591	MON1A	Q86VX9	555 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CFAP54-208	ENST00000556591	CHD1L	Q86WJ1	897 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CFAP54-208	ENST00000556591	TMC8	Q8IU68	726 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CFAP54-208	ENST00000556591	CADM3	Q8N126	398 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CFAP54-208	ENST00000556591	CPXM2	Q8N436	756 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CFAP54-208	ENST00000556591	RFWD2	Q8NHY2	731 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CFAP54-208	ENST00000556591	GDPD5	Q8WTR4	605 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CFAP54-208	ENST00000556591	HVCN1	Q96D96	273 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CFAP54-208	ENST00000556591	ELP4	Q96EB1	424 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CFAP54-208	ENST00000556591	NPFFR1	Q9GZQ6	430 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CFAP54-208	ENST00000556591	MVB12B	Q9H7P6	319 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CFAP54-208	ENST00000556591	MRPL44	Q9H9J2	332 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CFAP54-208	ENST00000556591	PTGDR2	Q9Y5Y4	395 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CFAP54-208	ENST00000556591		A0A096LPK6	155 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CFAP54-208	ENST00000556591	C17orf113	A0A1B0GUU1	675 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CFAP54-208	ENST00000556591	PABPN1L	A6NDY0	278 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CFAP54-208	ENST00000556591	INAFM1	C9JVW0	142 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CFAP54-208	ENST00000556591	INSIG1	O15503	277 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CFAP54-208	ENST00000556591	KIF1C	O43896	1103 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CFAP54-208	ENST00000556591	SNHG28	P0DPA3	235 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CFAP54-208	ENST00000556591	CDC25A	P30304	524 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CFAP54-208	ENST00000556591	THPO	P40225	353 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CFAP54-208	ENST00000556591	HTR6	P50406	440 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CFAP54-208	ENST00000556591	PGGT1B	P53609	377 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CFAP54-208	ENST00000556591	ZP1	P60852	638 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CFAP54-208	ENST00000556591	GPS2	Q13227	327 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CFAP54-208	ENST00000556591	TRPC3	Q13507	836 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CFAP54-208	ENST00000556591	ZNF284	Q2VY69	593 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CFAP54-208	ENST00000556591	FNBP1L	Q5T0N5	605 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CFAP54-208	ENST00000556591	SLC22A25	Q6T423	547 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CFAP54-208	ENST00000556591	C17orf99	Q6UX52	265 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CFAP54-208	ENST00000556591	LRRC8D	Q7L1W4	858 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CFAP54-208	ENST00000556591	TMTC1	Q8IUR5	882 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CFAP54-208	ENST00000556591	RBFA	Q8N0V3	343 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CFAP54-208	ENST00000556591	C9orf106	Q8NAJ2	232 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CFAP54-208	ENST00000556591	SLC35F5	Q8WV83	523 aa		4.87	□□□□□ -1.63

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