RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552009.1

GNPTAB-209, Transcript of N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase subunits alpha and beta, humanhuman

TSL 3

Gene GNPTAB, Length 601 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPTAB-209ENST00000552009 TTC30AQ86WT1 665 aa7.31□□□□□ -1.24
GNPTAB-209ENST00000552009 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa7.31□□□□□ -1.24
GNPTAB-209ENST00000552009 GPD1LQ8N335 351 aa7.31□□□□□ -1.24
GNPTAB-209ENST00000552009 C2orf15Q8WU43 125 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
GNPTAB-209ENST00000552009 DHX58Q96C10 678 aa7.31□□□□□ -1.24
GNPTAB-209ENST00000552009 HVCN1Q96D96 273 aa7.31□□□□□ -1.24
GNPTAB-209ENST00000552009 HPDLQ96IR7 371 aa7.31□□□□□ -1.24
GNPTAB-209ENST00000552009 MMS19Q96T76 1030 aa7.31□□□□□ -1.24
GNPTAB-209ENST00000552009 P2RY13Q9BPV8 354 aa7.31□□□□□ -1.24
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GNPTAB-209ENST00000552009 TPSD1Q9BZJ3 242 aa7.31□□□□□ -1.24
GNPTAB-209ENST00000552009 BLZF1Q9H2G9 400 aa7.31□□□□□ -1.24
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GNPTAB-209ENST00000552009 INTS13Q9NVM9 706 aa7.31□□□□□ -1.24
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GNPTAB-209ENST00000552009 HSFX1Q9UBD0 423 aa7.31□□□□□ -1.24
GNPTAB-209ENST00000552009 RALYQ9UKM9 306 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
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GNPTAB-209ENST00000552009 TCHHQ07283 1943 aa7.31□□□□□ -1.24
GNPTAB-209ENST00000552009 OBSL1O75147 1896 aa7.3□□□□□ -1.24
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GNPTAB-209ENST00000552009 CLDN5O00501 218 aa7.3□□□□□ -1.24
GNPTAB-209ENST00000552009 TRDMT1O14717 391 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
GNPTAB-209ENST00000552009 GABRDO14764 452 aa7.3□□□□□ -1.24
GNPTAB-209ENST00000552009 SLC30A4O14863 429 aa7.3□□□□□ -1.24
GNPTAB-209ENST00000552009 TGFB1I1O43294 461 aa7.3□□□□□ -1.24
GNPTAB-209ENST00000552009 CLSTN1O94985 981 aa7.3□□□□□ -1.24
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GNPTAB-209ENST00000552009 PAPSS2O95340 614 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
GNPTAB-209ENST00000552009 CSH1P0DML2 217 aa7.3□□□□□ -1.24
GNPTAB-209ENST00000552009 CSH2P0DML3 217 aa7.3□□□□□ -1.24
GNPTAB-209ENST00000552009 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP7.3□□□□□ -1.24
GNPTAB-209ENST00000552009 BCKDHBP21953 392 aa7.3□□□□□ -1.24
GNPTAB-209ENST00000552009 SCP2P22307 547 aa7.3□□□□□ -1.24
GNPTAB-209ENST00000552009 APEX1P27695 318 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
GNPTAB-209ENST00000552009 PNPLA4P41247 253 aa7.3□□□□□ -1.24
GNPTAB-209ENST00000552009 IFNAR2P48551 515 aa7.3□□□□□ -1.24
GNPTAB-209ENST00000552009 RPL10AP62906 217 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
GNPTAB-209ENST00000552009 ASIC1P78348 528 aa7.3□□□□□ -1.24
GNPTAB-209ENST00000552009 SERINC3Q13530 473 aa7.3□□□□□ -1.24
GNPTAB-209ENST00000552009 SLC39A14Q15043 492 aa7.3□□□□□ -1.24
GNPTAB-209ENST00000552009 STK38Q15208 465 aa7.3□□□□□ -1.24
GNPTAB-209ENST00000552009 CSRP2Q16527 193 aa7.3□□□□□ -1.24
GNPTAB-209ENST00000552009 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
GNPTAB-209ENST00000552009 TBR1Q16650 682 aa7.3□□□□□ -1.24
GNPTAB-209ENST00000552009 C2orf27AQ580R0 203 aa7.3□□□□□ -1.24
GNPTAB-209ENST00000552009 SHC4Q6S5L8 630 aa7.3□□□□□ -1.24
GNPTAB-209ENST00000552009 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa7.3□□□□□ -1.24
GNPTAB-209ENST00000552009 CPA6Q8N4T0 437 aa7.3□□□□□ -1.24
GNPTAB-209ENST00000552009 CCDC33Q8N5R6 958 aa7.3□□□□□ -1.24
GNPTAB-209ENST00000552009 LRRC52Q8N7C0 313 aa7.3□□□□□ -1.24
GNPTAB-209ENST00000552009 FRMD1Q8N878 549 aa7.3□□□□□ -1.24
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GNPTAB-209ENST00000552009 OSCP1Q8WVF1 389 aa7.3□□□□□ -1.24
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GNPTAB-209ENST00000552009 PCED1BQ96HM7 432 aa7.3□□□□□ -1.24
GNPTAB-209ENST00000552009 DNAJC7Q99615 494 aa7.3□□□□□ -1.24
GNPTAB-209ENST00000552009 RTKNQ9BST9 563 aa7.3□□□□□ -1.24
GNPTAB-209ENST00000552009 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa7.3□□□□□ -1.24
GNPTAB-209ENST00000552009 ECT2Q9H8V3 914 aa7.3□□□□□ -1.24
GNPTAB-209ENST00000552009 AURKAIP1Q9NWT8 199 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
GNPTAB-209ENST00000552009 PLA2G3Q9NZ20 509 aa7.3□□□□□ -1.24
GNPTAB-209ENST00000552009 GCNT4Q9P109 453 aa7.3□□□□□ -1.24
GNPTAB-209ENST00000552009 SEL1LQ9UBV2 794 aa7.3□□□□□ -1.24
GNPTAB-209ENST00000552009 ITGA11Q9UKX5 1188 aa7.3□□□□□ -1.24
GNPTAB-209ENST00000552009 B3GALT1Q9Y5Z6 326 aa7.3□□□□□ -1.24
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GNPTAB-209ENST00000552009 TNNC2P02585 160 aa7.29□□□□□ -1.24
GNPTAB-209ENST00000552009 HDCP19113 662 aa7.29□□□□□ -1.24
GNPTAB-209ENST00000552009 PDCP20941 246 aa7.29□□□□□ -1.24
GNPTAB-209ENST00000552009 PAX3P23760 479 aa7.29□□□□□ -1.24
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GNPTAB-209ENST00000552009 MYL6P60660 151 aa7.29□□□□□ -1.24
GNPTAB-209ENST00000552009 KDSRQ06136 332 aa7.29□□□□□ -1.24
GNPTAB-209ENST00000552009 DMC1Q14565 340 aa7.29□□□□□ -1.24
GNPTAB-209ENST00000552009 KCNB1Q14721 858 aa7.29□□□□□ -1.24
GNPTAB-209ENST00000552009 PDGFRLQ15198 375 aa7.29□□□□□ -1.24
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GNPTAB-209ENST00000552009 LSM12Q3MHD2 195 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
GNPTAB-209ENST00000552009 TRIM61Q5EBN2 209 aa7.29□□□□□ -1.24
GNPTAB-209ENST00000552009 EMC10Q5UCC4 262 aa7.29□□□□□ -1.24
GNPTAB-209ENST00000552009 ANO7Q6IWH7 933 aa7.29□□□□□ -1.24
GNPTAB-209ENST00000552009 FAM171BQ6P995 826 aa7.29□□□□□ -1.24
GNPTAB-209ENST00000552009 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa7.29□□□□□ -1.24
GNPTAB-209ENST00000552009 Q6ZSN1 163 aa7.29□□□□□ -1.24
GNPTAB-209ENST00000552009 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa7.29□□□□□ -1.24
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