RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551525.5

PTPRB-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,291 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-210ENST00000551525 A0A0J9YVX5 310 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRB-210ENST00000551525 USP27XA6NNY8 438 aa6.39□□□□□ -1.39
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PTPRB-210ENST00000551525 C2CD2LO14523 706 aa6.39□□□□□ -1.39
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PTPRB-210ENST00000551525 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
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PTPRB-210ENST00000551525 CAV1Q03135 178 aa6.39□□□□□ -1.39
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PTPRB-210ENST00000551525 GNSP15586 552 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRB-210ENST00000551525 HAAOP46952 286 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRB-210ENST00000551525 GCLMP48507 274 aa6.38□□□□□ -1.39
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PTPRB-210ENST00000551525 ARF5P84085 180 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRB-210ENST00000551525 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP6.38□□□□□ -1.39
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PTPRB-210ENST00000551525 MESDQ14696 234 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRB-210ENST00000551525 FUT11Q495W5 492 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRB-210ENST00000551525 AKIRIN2Q53H80 203 aa6.38□□□□□ -1.39
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PTPRB-210ENST00000551525 SLC24A5Q71RS6 500 aa6.38□□□□□ -1.39
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PTPRB-210ENST00000551525 NDUFA8P51970 172 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRB-210ENST00000551525 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP6.38□□□□□ -1.39
PTPRB-210ENST00000551525 XIAPP98170 497 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRB-210ENST00000551525 ALDH6A1Q02252 535 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
PTPRB-210ENST00000551525 SGCGQ13326 291 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRB-210ENST00000551525 TRIP13Q15645 432 aaPredicted RBP6.38□□□□□ -1.39
PTPRB-210ENST00000551525 TAB1Q15750 504 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRB-210ENST00000551525 ZNF792Q3KQV3 632 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRB-210ENST00000551525 HEATR6Q6AI08 1181 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
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