RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550857.5

PTPRB-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,839 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-209ENST00000550857 ESRRAP11474 423 aaPredicted RBP8.16□□□□□ -1.1
PTPRB-209ENST00000550857 CDK4P11802 303 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRB-209ENST00000550857 CCNG1P51959 295 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRB-209ENST00000550857 ZNF783Q6ZMS7 281 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRB-209ENST00000550857 SRLQ86TD4 932 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRB-209ENST00000550857 KRT73Q86Y46 540 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRB-209ENST00000550857 MCOLN2Q8IZK6 566 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRB-209ENST00000550857 CYP4X1Q8N118 509 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRB-209ENST00000550857 DEFB123Q8N688 67 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRB-209ENST00000550857 ATAD1Q8NBU5 361 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRB-209ENST00000550857 TTLQ8NG68 377 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRB-209ENST00000550857 ETNPPLQ8TBG4 499 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRB-209ENST00000550857 ZSWIM1Q9BR11 485 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRB-209ENST00000550857 KCNN2Q9H2S1 579 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRB-209ENST00000550857 TMCC3Q9ULS5 477 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRB-209ENST00000550857 SCN11AQ9UI33 1791 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRB-209ENST00000550857 TOMM20Q15388 145 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRB-209ENST00000550857 E2F4Q16254 413 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRB-209ENST00000550857 PCID2Q5JVF3 399 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRB-209ENST00000550857 C17orf64Q86WR6 236 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRB-209ENST00000550857 PTCD2Q8WV60 388 aaKnown RBP8.16□□□□□ -1.1
PTPRB-209ENST00000550857 ANKRD7Q92527 254 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRB-209ENST00000550857 NAT6Q93015 286 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRB-209ENST00000550857 FAM83DQ9H4H8 585 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRB-209ENST00000550857 GMIPQ9P107 970 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRB-209ENST00000550857 NEU2Q9Y3R4 380 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRB-209ENST00000550857 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP8.15□□□□□ -1.1
PTPRB-209ENST00000550857 AKAP8O43823 692 aaKnown RBP8.15□□□□□ -1.1
PTPRB-209ENST00000550857 PCNAP12004 261 aa8.15□□□□□ -1.1
PTPRB-209ENST00000550857 NUP107P57740 925 aa8.15□□□□□ -1.1
PTPRB-209ENST00000550857 ATP6V0D1P61421 351 aa8.15□□□□□ -1.1
PTPRB-209ENST00000550857 CDK18Q07002 472 aa8.15□□□□□ -1.1
PTPRB-209ENST00000550857 LRRC74AQ0VAA2 488 aa8.15□□□□□ -1.1
PTPRB-209ENST00000550857 GRIK5Q16478 980 aa8.15□□□□□ -1.1
PTPRB-209ENST00000550857 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP8.15□□□□□ -1.1
PTPRB-209ENST00000550857 CHSY3Q70JA7 882 aa8.15□□□□□ -1.1
PTPRB-209ENST00000550857 R3HCC1LQ7Z5L2 792 aaKnown RBP8.15□□□□□ -1.1
PTPRB-209ENST00000550857 LUZP2Q86TE4 346 aa8.15□□□□□ -1.1
PTPRB-209ENST00000550857 FAM228AQ86W67 206 aa8.15□□□□□ -1.1
PTPRB-209ENST00000550857 PIGKQ92643 395 aa8.15□□□□□ -1.1
PTPRB-209ENST00000550857 PCDH9Q9HC56 1237 aa8.15□□□□□ -1.1
PTPRB-209ENST00000550857 GKN1Q9NS71 199 aa8.15□□□□□ -1.1
PTPRB-209ENST00000550857 MTRRQ9UBK8 725 aa8.15□□□□□ -1.1
PTPRB-209ENST00000550857 RIPK3Q9Y572 518 aa8.15□□□□□ -1.1
PTPRB-209ENST00000550857 GSNP06396 782 aa8.15□□□□□ -1.1
PTPRB-209ENST00000550857 ENO2P09104 434 aaPredicted RBP8.15□□□□□ -1.1
PTPRB-209ENST00000550857 GSTM1P09488 218 aa8.15□□□□□ -1.1
PTPRB-209ENST00000550857 PTPN7P35236 360 aa8.15□□□□□ -1.1
PTPRB-209ENST00000550857 CHI3L1P36222 383 aaPredicted RBP8.15□□□□□ -1.1
PTPRB-209ENST00000550857 CARSP49589 748 aaKnown RBP8.15□□□□□ -1.1
PTPRB-209ENST00000550857 GPR15P49685 360 aa8.15□□□□□ -1.1
PTPRB-209ENST00000550857 ZNF132P52740 706 aa8.15□□□□□ -1.1
PTPRB-209ENST00000550857 SLC5A3P53794 718 aa8.15□□□□□ -1.1
PTPRB-209ENST00000550857 GSTM4Q03013 218 aa8.15□□□□□ -1.1
PTPRB-209ENST00000550857 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP8.15□□□□□ -1.1
PTPRB-209ENST00000550857 ZC3H12BQ5HYM0 836 aaKnown RBP8.15□□□□□ -1.1
PTPRB-209ENST00000550857 POTEHQ6S545 545 aa8.15□□□□□ -1.1
PTPRB-209ENST00000550857 POLNQ7Z5Q5 900 aa8.15□□□□□ -1.1
PTPRB-209ENST00000550857 RPAINQ86UA6 219 aa8.15□□□□□ -1.1
PTPRB-209ENST00000550857 ZNF513Q8N8E2 541 aaPredicted RBP8.15□□□□□ -1.1
PTPRB-209ENST00000550857 IL31RAQ8NI17 732 aa8.15□□□□□ -1.1
PTPRB-209ENST00000550857 SPDL1Q96EA4 605 aa8.15□□□□□ -1.1
PTPRB-209ENST00000550857 AP1M1Q9BXS5 423 aa8.15□□□□□ -1.1
PTPRB-209ENST00000550857 DPEP2Q9H4A9 486 aa8.15□□□□□ -1.1
PTPRB-209ENST00000550857 ARL15Q9NXU5 204 aa8.15□□□□□ -1.1
PTPRB-209ENST00000550857 SNX6Q9UNH7 406 aa8.15□□□□□ -1.1
PTPRB-209ENST00000550857 F8VZ95 297 aa8.15□□□□□ -1.1
PTPRB-209ENST00000550857 IPO13O94829 963 aaKnown RBP8.15□□□□□ -1.1
PTPRB-209ENST00000550857 ACSL3O95573 720 aa8.15□□□□□ -1.1
PTPRB-209ENST00000550857 FDPSP14324 419 aaKnown RBP8.15□□□□□ -1.1
PTPRB-209ENST00000550857 ATP5A1P25705 553 aaKnown RBP8.15□□□□□ -1.1
PTPRB-209ENST00000550857 SPAM1P38567 509 aa8.15□□□□□ -1.1
PTPRB-209ENST00000550857 CLCN5P51795 746 aa8.15□□□□□ -1.1
PTPRB-209ENST00000550857 HNRNPKP61978 463 aaKnown RBP eCLIP8.15□□□□□ -1.1
PTPRB-209ENST00000550857 DNAJC3Q13217 504 aa8.15□□□□□ -1.1
PTPRB-209ENST00000550857 MSLNQ13421 630 aaPredicted RBP8.15□□□□□ -1.1
PTPRB-209ENST00000550857 SLC25A52Q3SY17 297 aa8.15□□□□□ -1.1
PTPRB-209ENST00000550857 TCHHL1Q5QJ38 904 aaPredicted RBP8.15□□□□□ -1.1
PTPRB-209ENST00000550857 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa8.15□□□□□ -1.1
PTPRB-209ENST00000550857 CYP2W1Q8TAV3 490 aa8.15□□□□□ -1.1
PTPRB-209ENST00000550857 AP2M1Q96CW1 435 aa8.15□□□□□ -1.1
PTPRB-209ENST00000550857 SGSM3Q96HU1 749 aa8.15□□□□□ -1.1
PTPRB-209ENST00000550857 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP8.15□□□□□ -1.1
PTPRB-209ENST00000550857 ZFYVE1Q9HBF4 777 aa8.15□□□□□ -1.1
PTPRB-209ENST00000550857 CORO1CQ9ULV4 474 aaPredicted RBP8.15□□□□□ -1.1
PTPRB-209ENST00000550857 CAPN7Q9Y6W3 813 aa8.15□□□□□ -1.1
PTPRB-209ENST00000550857 C1orf232A0A0U1RR37 186 aa8.15□□□□□ -1.11
PTPRB-209ENST00000550857 C5orf60A6NFR6 353 aa8.15□□□□□ -1.11
PTPRB-209ENST00000550857 TMEM150CB9EJG8 249 aa8.15□□□□□ -1.11
PTPRB-209ENST00000550857 MATN2O00339 956 aa8.15□□□□□ -1.11
PTPRB-209ENST00000550857 FOXN1O15353 648 aa8.15□□□□□ -1.11
PTPRB-209ENST00000550857 ATP9AO75110 1047 aa8.15□□□□□ -1.11
PTPRB-209ENST00000550857 ZNF30P17039 623 aa8.15□□□□□ -1.11
PTPRB-209ENST00000550857 HOXB6P17509 224 aaKnown RBP8.15□□□□□ -1.11
PTPRB-209ENST00000550857 IGFALSP35858 605 aa8.15□□□□□ -1.11
PTPRB-209ENST00000550857 MASP1P48740 699 aa8.15□□□□□ -1.11
PTPRB-209ENST00000550857 PDX1P52945 283 aa8.15□□□□□ -1.11
PTPRB-209ENST00000550857 ACAP2Q15057 778 aa8.15□□□□□ -1.11
PTPRB-209ENST00000550857 CARD16Q5EG05 197 aa8.15□□□□□ -1.11
PTPRB-209ENST00000550857 FAM45BPQ6NSW5 357 aa8.15□□□□□ -1.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41 ms