RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533099.5

RNPC3-208, Transcript of RNA binding region (RNP1, RRM) containing 3, humanhuman

APPRIS P2 TSL 5 BASIC

Gene RNPC3, Length 3,641 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNPC3-208ENST00000533099 SUN2Q9UH99 717 aa8.33□□□□□ -1.08
RNPC3-208ENST00000533099 ZNF180Q9UJW8 692 aa8.33□□□□□ -1.08
RNPC3-208ENST00000533099 GSTA4O15217 222 aa8.33□□□□□ -1.08
RNPC3-208ENST00000533099 OR4Q2P0C623 313 aa8.33□□□□□ -1.08
RNPC3-208ENST00000533099 PTPN3P26045 913 aa8.33□□□□□ -1.08
RNPC3-208ENST00000533099 CD151P48509 253 aa8.33□□□□□ -1.08
RNPC3-208ENST00000533099 RAP1GDS1P52306 607 aa8.33□□□□□ -1.08
RNPC3-208ENST00000533099 TAS2R39P59534 338 aa8.33□□□□□ -1.08
RNPC3-208ENST00000533099 TLR1Q15399 786 aa8.33□□□□□ -1.08
RNPC3-208ENST00000533099 SV2CQ496J9 727 aa8.33□□□□□ -1.08
RNPC3-208ENST00000533099 ZNF484Q5JVG2 852 aa8.33□□□□□ -1.08
RNPC3-208ENST00000533099 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
RNPC3-208ENST00000533099 TSPAN14Q8NG11 270 aa8.33□□□□□ -1.08
RNPC3-208ENST00000533099 MAGEE2Q8TD90 523 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
RNPC3-208ENST00000533099 SENP8Q96LD8 212 aa8.33□□□□□ -1.08
RNPC3-208ENST00000533099 RBBP8Q99708 897 aa8.33□□□□□ -1.08
RNPC3-208ENST00000533099 HAUS8Q9BT25 410 aa8.33□□□□□ -1.08
RNPC3-208ENST00000533099 FAM192AQ9GZU8 254 aa8.33□□□□□ -1.08
RNPC3-208ENST00000533099 ABCG8Q9H221 673 aa8.33□□□□□ -1.08
RNPC3-208ENST00000533099 COQ10BQ9H8M1 238 aa8.33□□□□□ -1.08
RNPC3-208ENST00000533099 GMPR2Q9P2T1 348 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
RNPC3-208ENST00000533099 PSMD13Q9UNM6 376 aa8.33□□□□□ -1.08
RNPC3-208ENST00000533099 RPL26L1Q9UNX3 145 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
RNPC3-208ENST00000533099 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa8.33□□□□□ -1.08
RNPC3-208ENST00000533099 MAN1A2O60476 641 aa8.33□□□□□ -1.08
RNPC3-208ENST00000533099 KATNA1O75449 491 aa8.33□□□□□ -1.08
RNPC3-208ENST00000533099 TADA2AO75478 443 aa8.33□□□□□ -1.08
RNPC3-208ENST00000533099 GCATO75600 419 aa8.33□□□□□ -1.08
RNPC3-208ENST00000533099 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
RNPC3-208ENST00000533099 C22orf31O95567 290 aa8.33□□□□□ -1.08
RNPC3-208ENST00000533099 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
RNPC3-208ENST00000533099 DHRS4L1P0CG22 281 aa8.33□□□□□ -1.08
RNPC3-208ENST00000533099 NPR3P17342 541 aa8.33□□□□□ -1.08
RNPC3-208ENST00000533099 IL10P22301 178 aa8.33□□□□□ -1.08
RNPC3-208ENST00000533099 MAP4P27816 1152 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
RNPC3-208ENST00000533099 EEF1DP29692 281 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
RNPC3-208ENST00000533099 NOS2P35228 1153 aa8.33□□□□□ -1.08
RNPC3-208ENST00000533099 ADRA1BP35368 520 aa8.33□□□□□ -1.08
RNPC3-208ENST00000533099 RPL5P46777 297 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
RNPC3-208ENST00000533099 SCNN1GP51170 649 aa8.33□□□□□ -1.08
RNPC3-208ENST00000533099 KPNA2P52292 529 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
RNPC3-208ENST00000533099 ADARP55265 1226 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
RNPC3-208ENST00000533099 CLDN10P78369 228 aa8.33□□□□□ -1.08
RNPC3-208ENST00000533099 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
RNPC3-208ENST00000533099 C9orf57Q5W0N0 161 aa8.33□□□□□ -1.08
RNPC3-208ENST00000533099 NEPROQ6NW34 567 aa8.33□□□□□ -1.08
RNPC3-208ENST00000533099 TAS2R42Q7RTR8 314 aa8.33□□□□□ -1.08
RNPC3-208ENST00000533099 SAPCD2Q86UD0 394 aa8.33□□□□□ -1.08
RNPC3-208ENST00000533099 RMND5BQ96G75 393 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
RNPC3-208ENST00000533099 OCEL1Q9H607 264 aa8.33□□□□□ -1.08
RNPC3-208ENST00000533099 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
RNPC3-208ENST00000533099 MORF4L1Q9UBU8 362 aa8.33□□□□□ -1.08
RNPC3-208ENST00000533099 TIMM22Q9Y584 194 aa8.33□□□□□ -1.08
RNPC3-208ENST00000533099 PTGDR2Q9Y5Y4 395 aa8.33□□□□□ -1.08
RNPC3-208ENST00000533099 PHLPP1O60346 1717 aa8.32□□□□□ -1.08
RNPC3-208ENST00000533099 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa8.32□□□□□ -1.08
RNPC3-208ENST00000533099 HMX2A2RU54 273 aa8.32□□□□□ -1.08
RNPC3-208ENST00000533099 LRIG2O94898 1065 aa8.32□□□□□ -1.08
RNPC3-208ENST00000533099 CD4P01730 458 aa8.32□□□□□ -1.08
RNPC3-208ENST00000533099 NCK1P16333 377 aa8.32□□□□□ -1.08
RNPC3-208ENST00000533099 BRCC3P46736 316 aa8.32□□□□□ -1.08
RNPC3-208ENST00000533099 LIMK2P53671 638 aa8.32□□□□□ -1.08
RNPC3-208ENST00000533099 ZBTB17Q13105 803 aa8.32□□□□□ -1.08
RNPC3-208ENST00000533099 STX5Q13190 355 aa8.32□□□□□ -1.08
RNPC3-208ENST00000533099 PTPRCAPQ14761 206 aa8.32□□□□□ -1.08
RNPC3-208ENST00000533099 CYP51A1Q16850 503 aa8.32□□□□□ -1.08
RNPC3-208ENST00000533099 UGP2Q16851 508 aa8.32□□□□□ -1.08
RNPC3-208ENST00000533099 LIPMQ5VYY2 423 aa8.32□□□□□ -1.08
RNPC3-208ENST00000533099 GRAMD4Q6IC98 578 aa8.32□□□□□ -1.08
RNPC3-208ENST00000533099 B3GNT6Q6ZMB0 384 aa8.32□□□□□ -1.08
RNPC3-208ENST00000533099 MILR1Q7Z6M3 343 aa8.32□□□□□ -1.08
RNPC3-208ENST00000533099 PDSS2Q86YH6 399 aa8.32□□□□□ -1.08
RNPC3-208ENST00000533099 SPPL2CQ8IUH8 684 aa8.32□□□□□ -1.08
RNPC3-208ENST00000533099 TTC39CQ8N584 583 aa8.32□□□□□ -1.08
RNPC3-208ENST00000533099 TRPC4APQ8TEL6 797 aa8.32□□□□□ -1.08
RNPC3-208ENST00000533099 BCO2Q9BYV7 579 aa8.32□□□□□ -1.08
RNPC3-208ENST00000533099 IPO11Q9UI26 975 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
RNPC3-208ENST00000533099 EMCNQ9ULC0 261 aa8.32□□□□□ -1.08
RNPC3-208ENST00000533099 RAP2CQ9Y3L5 183 aa8.32□□□□□ -1.08
RNPC3-208ENST00000533099 ANGPTL3Q9Y5C1 460 aa8.32□□□□□ -1.08
RNPC3-208ENST00000533099 A0A1B0GTW7 788 aa8.32□□□□□ -1.08
RNPC3-208ENST00000533099 A8MX80 341 aa8.32□□□□□ -1.08
RNPC3-208ENST00000533099 MAGEB3O15480 346 aa8.32□□□□□ -1.08
RNPC3-208ENST00000533099 USP2O75604 605 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
RNPC3-208ENST00000533099 SIX3O95343 332 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
RNPC3-208ENST00000533099 ZBTB11O95625 1053 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
RNPC3-208ENST00000533099 TFPTP0C1Z6 253 aa8.32□□□□□ -1.08
RNPC3-208ENST00000533099 LINC00032P0C843 101 aa8.32□□□□□ -1.08
RNPC3-208ENST00000533099 SPATA31D3P0C874 917 aa8.32□□□□□ -1.08
RNPC3-208ENST00000533099 TPSB2P20231 275 aa8.32□□□□□ -1.08
RNPC3-208ENST00000533099 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
RNPC3-208ENST00000533099 EPHX2P34913 555 aa8.32□□□□□ -1.08
RNPC3-208ENST00000533099 LSM3P62310 102 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
RNPC3-208ENST00000533099 EFEMP1Q12805 493 aa8.32□□□□□ -1.08
RNPC3-208ENST00000533099 TPSAB1Q15661 275 aa8.32□□□□□ -1.08
RNPC3-208ENST00000533099 SLC25A52Q3SY17 297 aa8.32□□□□□ -1.08
RNPC3-208ENST00000533099 VPS26BQ4G0F5 336 aa8.32□□□□□ -1.08
RNPC3-208ENST00000533099 GPR107Q5VW38 600 aa8.32□□□□□ -1.08
RNPC3-208ENST00000533099 CNSTQ6PJW8 725 aa8.32□□□□□ -1.08
RNPC3-208ENST00000533099 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa8.32□□□□□ -1.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26 ms