RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000532751.1

PTPRK-222, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 4

Gene PTPRK, Length 563 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-222ENST00000532751 GNSP15586 552 aa22.34■■□□□ 1.17
PTPRK-222ENST00000532751 HADHBP55084 474 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
PTPRK-222ENST00000532751 ARHGAP8P85298 464 aa22.34■■□□□ 1.17
PTPRK-222ENST00000532751 RAD51Q06609 339 aa22.34■■□□□ 1.17
PTPRK-222ENST00000532751 DUOXA1Q1HG43 343 aa22.34■■□□□ 1.17
PTPRK-222ENST00000532751 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa22.34■■□□□ 1.17
PTPRK-222ENST00000532751 RAB11FIP1Q6WKZ4 1283 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
PTPRK-222ENST00000532751 ARHGAP12Q8IWW6 846 aa22.34■■□□□ 1.17
PTPRK-222ENST00000532751 NPWQ8N729 165 aa22.34■■□□□ 1.17
PTPRK-222ENST00000532751 OR2AP1Q8NGE2 309 aa22.34■■□□□ 1.17
PTPRK-222ENST00000532751 OR14C36Q8NHC7 312 aa22.34■■□□□ 1.17
PTPRK-222ENST00000532751 GRIN3AQ8TCU5 1115 aa22.34■■□□□ 1.17
PTPRK-222ENST00000532751 TSC1Q92574 1164 aa22.34■■□□□ 1.17
PTPRK-222ENST00000532751 ZNF670Q9BS34 389 aa22.34■■□□□ 1.17
PTPRK-222ENST00000532751 SMOC1Q9H4F8 434 aa22.34■■□□□ 1.17
PTPRK-222ENST00000532751 TMEM74BQ9NUR3 256 aa22.34■■□□□ 1.17
PTPRK-222ENST00000532751 FAM47DPA6NHR8 397 aa22.33■■□□□ 1.17
PTPRK-222ENST00000532751 LEFTY1O75610 366 aa22.33■■□□□ 1.17
PTPRK-222ENST00000532751 IGSF6O95976 241 aa22.33■■□□□ 1.17
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PTPRK-222ENST00000532751 DPYSL3Q14195 570 aa22.33■■□□□ 1.17
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PTPRK-222ENST00000532751 ARSIQ5FYB1 569 aa22.33■■□□□ 1.17
PTPRK-222ENST00000532751 RAD9BQ6WBX8 426 aa22.33■■□□□ 1.17
PTPRK-222ENST00000532751 OR2T34Q8NGX1 318 aa22.33■■□□□ 1.17
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PTPRK-222ENST00000532751 SNX19Q92543 992 aa22.33■■□□□ 1.17
PTPRK-222ENST00000532751 LRIG1Q96JA1 1093 aa22.33■■□□□ 1.17
PTPRK-222ENST00000532751 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa22.33■■□□□ 1.17
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PTPRK-222ENST00000532751 ETNK2Q9NVF9 386 aa22.33■■□□□ 1.17
PTPRK-222ENST00000532751 EVLQ9UI08 416 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.17
PTPRK-222ENST00000532751 WASF2Q9Y6W5 498 aa22.33■■□□□ 1.17
PTPRK-222ENST00000532751 SHROOM3Q8TF72 1996 aa22.32■■□□□ 1.16
PTPRK-222ENST00000532751 ZNF292O60281 2723 aa22.32■■□□□ 1.16
PTPRK-222ENST00000532751 J3KR12 359 aa22.32■■□□□ 1.16
PTPRK-222ENST00000532751 SPOPO43791 374 aa22.32■■□□□ 1.16
PTPRK-222ENST00000532751 FSBPO95073 299 aa22.32■■□□□ 1.16
PTPRK-222ENST00000532751 POP4O95707 220 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
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PTPRK-222ENST00000532751 METAP1P53582 386 aa22.32■■□□□ 1.16
PTPRK-222ENST00000532751 ADPRHP54922 357 aa22.32■■□□□ 1.16
PTPRK-222ENST00000532751 GSDMDP57764 484 aa22.32■■□□□ 1.16
PTPRK-222ENST00000532751 IL10RBQ08334 325 aa22.32■■□□□ 1.16
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PTPRK-222ENST00000532751 NCEH1Q6PIU2 408 aa22.32■■□□□ 1.16
PTPRK-222ENST00000532751 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
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PTPRK-222ENST00000532751 PLK4O00444 970 aa22.31■■□□□ 1.16
PTPRK-222ENST00000532751 CFIP05156 583 aa22.31■■□□□ 1.16
PTPRK-222ENST00000532751 KDELR1P24390 212 aa22.31■■□□□ 1.16
PTPRK-222ENST00000532751 IL4RP24394 825 aa22.31■■□□□ 1.16
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PTPRK-222ENST00000532751 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa22.31■■□□□ 1.16
PTPRK-222ENST00000532751 LRRC38Q5VT99 294 aa22.31■■□□□ 1.16
PTPRK-222ENST00000532751 SLC23A3Q6PIS1 610 aa22.31■■□□□ 1.16
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PTPRK-222ENST00000532751 TXLNBQ8N3L3 684 aa22.31■■□□□ 1.16
PTPRK-222ENST00000532751 NETO2Q8NC67 525 aa22.31■■□□□ 1.16
PTPRK-222ENST00000532751 FAM131CQ96AQ9 280 aa22.31■■□□□ 1.16
PTPRK-222ENST00000532751 ARRDC3Q96B67 414 aa22.31■■□□□ 1.16
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PTPRK-222ENST00000532751 SLC6A14Q9UN76 642 aa22.31■■□□□ 1.16
PTPRK-222ENST00000532751 ZBTB32Q9Y2Y4 487 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
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PTPRK-222ENST00000532751 TBC1D3IA0A087WXS9 549 aa22.3■■□□□ 1.16
PTPRK-222ENST00000532751 TBC1D3EA0A087X179 549 aa22.3■■□□□ 1.16
PTPRK-222ENST00000532751 TBC1D3KA0A087X1G2 549 aa22.3■■□□□ 1.16
PTPRK-222ENST00000532751 TBC1D3FA6NER0 549 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
PTPRK-222ENST00000532751 TBC1D3LB9A6J9 549 aa22.3■■□□□ 1.16
PTPRK-222ENST00000532751 KRIT1O00522 736 aa22.3■■□□□ 1.16
PTPRK-222ENST00000532751 PLRG1O43660 514 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
PTPRK-222ENST00000532751 PALMO75781 387 aa22.3■■□□□ 1.16
PTPRK-222ENST00000532751 TBC1D3HP0C7X1 549 aa22.3■■□□□ 1.16
PTPRK-222ENST00000532751 COMTP21964 271 aa22.3■■□□□ 1.16
PTPRK-222ENST00000532751 CYTH1Q15438 398 aa22.3■■□□□ 1.16
PTPRK-222ENST00000532751 MYLK3Q32MK0 819 aa22.3■■□□□ 1.16
PTPRK-222ENST00000532751 AGBL4Q5VU57 503 aa22.3■■□□□ 1.16
PTPRK-222ENST00000532751 TBC1D3GQ6DHY5 549 aa22.3■■□□□ 1.16
PTPRK-222ENST00000532751 TBC1D3CQ6IPX1 549 aa22.3■■□□□ 1.16
PTPRK-222ENST00000532751 TCEAL6Q6IPX3 200 aa22.3■■□□□ 1.16
PTPRK-222ENST00000532751 ERN2Q76MJ5 926 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
PTPRK-222ENST00000532751 KIAA1328Q86T90 577 aa22.3■■□□□ 1.16
PTPRK-222ENST00000532751 TMEM139Q8IV31 216 aa22.3■■□□□ 1.16
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