RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522907.5

MSRA-208, Transcript of methionine sulfoxide reductase A, humanhuman

TSL 5

Gene MSRA, Length 871 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSRA-208ENST00000522907 PIGHQ14442 188 aaPredicted RBP5.56□□□□□ -1.52
MSRA-208ENST00000522907 PON2Q15165 354 aa5.56□□□□□ -1.52
MSRA-208ENST00000522907 DPYSL2Q16555 572 aa5.56□□□□□ -1.52
MSRA-208ENST00000522907 FUT11Q495W5 492 aa5.56□□□□□ -1.52
MSRA-208ENST00000522907 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP5.56□□□□□ -1.52
MSRA-208ENST00000522907 AFMIDQ63HM1 303 aa5.56□□□□□ -1.52
MSRA-208ENST00000522907 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP5.56□□□□□ -1.52
MSRA-208ENST00000522907 PKN3Q6P5Z2 889 aa5.56□□□□□ -1.52
MSRA-208ENST00000522907 TPRG1Q6ZUI0 275 aa5.56□□□□□ -1.52
MSRA-208ENST00000522907 CHST9Q7L1S5 443 aa5.56□□□□□ -1.52
MSRA-208ENST00000522907 POLNQ7Z5Q5 900 aa5.56□□□□□ -1.52
MSRA-208ENST00000522907 ADIPOR2Q86V24 386 aa5.56□□□□□ -1.52
MSRA-208ENST00000522907 CIR1Q86X95 450 aaPredicted RBP5.56□□□□□ -1.52
MSRA-208ENST00000522907 PSTKQ8IV42 348 aaKnown RBP5.56□□□□□ -1.52
MSRA-208ENST00000522907 RHOT2Q8IXI1 618 aa5.56□□□□□ -1.52
MSRA-208ENST00000522907 YAF2Q8IY57 180 aa5.56□□□□□ -1.52
MSRA-208ENST00000522907 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP5.56□□□□□ -1.52
MSRA-208ENST00000522907 CFAP52Q8N1V2 620 aa5.56□□□□□ -1.52
MSRA-208ENST00000522907 ATP6V0D2Q8N8Y2 350 aa5.56□□□□□ -1.52
MSRA-208ENST00000522907 HJURPQ8NCD3 748 aaPredicted RBP5.56□□□□□ -1.52
MSRA-208ENST00000522907 PJA1Q8NG27 643 aa5.56□□□□□ -1.52
MSRA-208ENST00000522907 FIBINQ8TAL6 211 aa5.56□□□□□ -1.52
MSRA-208ENST00000522907 TEKT4Q8WW24 435 aa5.56□□□□□ -1.52
MSRA-208ENST00000522907 ALG3Q92685 438 aa5.56□□□□□ -1.52
MSRA-208ENST00000522907 FAF2Q96CS3 445 aa5.56□□□□□ -1.52
MSRA-208ENST00000522907 TMA16Q96EY4 203 aaKnown RBP5.56□□□□□ -1.52
MSRA-208ENST00000522907 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP5.56□□□□□ -1.52
MSRA-208ENST00000522907 PSMB7Q99436 277 aa5.56□□□□□ -1.52
MSRA-208ENST00000522907 HERPUD2Q9BSE4 406 aa5.56□□□□□ -1.52
MSRA-208ENST00000522907 BBS2Q9BXC9 721 aa5.56□□□□□ -1.52
MSRA-208ENST00000522907 SLC2A11Q9BYW1 496 aa5.56□□□□□ -1.52
MSRA-208ENST00000522907 OSBPL6Q9BZF3 934 aa5.56□□□□□ -1.52
MSRA-208ENST00000522907 WDCPQ9H6R7 721 aa5.56□□□□□ -1.52
MSRA-208ENST00000522907 LTB4R2Q9NPC1 389 aa5.56□□□□□ -1.52
MSRA-208ENST00000522907 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP5.56□□□□□ -1.52
MSRA-208ENST00000522907 ETNK2Q9NVF9 386 aa5.56□□□□□ -1.52
MSRA-208ENST00000522907 MPP6Q9NZW5 540 aa5.56□□□□□ -1.52
MSRA-208ENST00000522907 CWC15Q9P013 229 aaKnown RBP5.56□□□□□ -1.52
MSRA-208ENST00000522907 CTTNBP2NLQ9P2B4 639 aa5.56□□□□□ -1.52
MSRA-208ENST00000522907 PPARGC1AQ9UBK2 798 aaKnown RBP5.56□□□□□ -1.52
MSRA-208ENST00000522907 OR12D3Q9UGF7 316 aa5.56□□□□□ -1.52
MSRA-208ENST00000522907 IP6K2Q9UHH9 426 aa5.56□□□□□ -1.52
MSRA-208ENST00000522907 PYCARDQ9ULZ3 195 aa5.56□□□□□ -1.52
MSRA-208ENST00000522907 USP18Q9UMW8 372 aa5.56□□□□□ -1.52
MSRA-208ENST00000522907 TBC1D30Q9Y2I9 924 aa5.56□□□□□ -1.52
MSRA-208ENST00000522907 MFHAS1Q9Y4C4 1052 aa5.56□□□□□ -1.52
MSRA-208ENST00000522907 HYOU1Q9Y4L1 999 aa5.56□□□□□ -1.52
MSRA-208ENST00000522907 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa5.56□□□□□ -1.52
MSRA-208ENST00000522907 SHROOM3Q8TF72 1996 aa5.56□□□□□ -1.52
MSRA-208ENST00000522907 NUMA1Q14980 2115 aa5.56□□□□□ -1.52
MSRA-208ENST00000522907 SPAG17Q6Q759 2223 aa5.55□□□□□ -1.52
MSRA-208ENST00000522907 A0A1B0GVM2 712 aa5.55□□□□□ -1.52
MSRA-208ENST00000522907 TCAF2A6NFQ2 919 aa5.55□□□□□ -1.52
MSRA-208ENST00000522907 USP27XA6NNY8 438 aa5.55□□□□□ -1.52
MSRA-208ENST00000522907 ZNF487B1APH4 448 aa5.55□□□□□ -1.52
MSRA-208ENST00000522907 MYO1FO00160 1098 aa5.55□□□□□ -1.52
MSRA-208ENST00000522907 DCLK1O15075 740 aa5.55□□□□□ -1.52
MSRA-208ENST00000522907 FANCGO15287 622 aa5.55□□□□□ -1.52
MSRA-208ENST00000522907 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
MSRA-208ENST00000522907 TBL1XO60907 577 aa5.55□□□□□ -1.52
MSRA-208ENST00000522907 ZMPSTE24O75844 475 aa5.55□□□□□ -1.52
MSRA-208ENST00000522907 LUC7L3O95232 432 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
MSRA-208ENST00000522907 KAT7O95251 611 aa5.55□□□□□ -1.52
MSRA-208ENST00000522907 DLGAP3O95886 979 aa5.55□□□□□ -1.52
MSRA-208ENST00000522907 CD160O95971 181 aa5.55□□□□□ -1.52
MSRA-208ENST00000522907 B3GALT4O96024 378 aa5.55□□□□□ -1.52
MSRA-208ENST00000522907 EGFP01133 1207 aa5.55□□□□□ -1.52
MSRA-208ENST00000522907 CD48P09326 243 aa5.55□□□□□ -1.52
MSRA-208ENST00000522907 TDGF1P13385 188 aa5.55□□□□□ -1.52
MSRA-208ENST00000522907 ALADP13716 330 aa5.55□□□□□ -1.52
MSRA-208ENST00000522907 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP5.55□□□□□ -1.52
MSRA-208ENST00000522907 COMTP21964 271 aa5.55□□□□□ -1.52
MSRA-208ENST00000522907 GRIA2P42262 883 aa5.55□□□□□ -1.52
MSRA-208ENST00000522907 RPS9P46781 194 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
MSRA-208ENST00000522907 PEX5P50542 639 aa5.55□□□□□ -1.52
MSRA-208ENST00000522907 PLK1P53350 603 aa5.55□□□□□ -1.52
MSRA-208ENST00000522907 GAD2Q05329 585 aa5.55□□□□□ -1.52
MSRA-208ENST00000522907 KDSRQ06136 332 aa5.55□□□□□ -1.52
MSRA-208ENST00000522907 LMAN2Q12907 356 aa5.55□□□□□ -1.52
MSRA-208ENST00000522907 MTA1Q13330 715 aa5.55□□□□□ -1.52
MSRA-208ENST00000522907 DPYSL3Q14195 570 aa5.55□□□□□ -1.52
MSRA-208ENST00000522907 SPA17Q15506 151 aa5.55□□□□□ -1.52
MSRA-208ENST00000522907 GEN1Q17RS7 908 aa5.55□□□□□ -1.52
MSRA-208ENST00000522907 SMTNL2Q2TAL5 461 aa5.55□□□□□ -1.52
MSRA-208ENST00000522907 MPPE1Q53F39 396 aa5.55□□□□□ -1.52
MSRA-208ENST00000522907 KCNT1Q5JUK3 1230 aa5.55□□□□□ -1.52
MSRA-208ENST00000522907 ERMARDQ5T6L9 678 aa5.55□□□□□ -1.52
MSRA-208ENST00000522907 ACBD5Q5T8D3 534 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
MSRA-208ENST00000522907 EMC10Q5UCC4 262 aa5.55□□□□□ -1.52
MSRA-208ENST00000522907 LRRC38Q5VT99 294 aa5.55□□□□□ -1.52
MSRA-208ENST00000522907 DCAF12L1Q5VU92 463 aa5.55□□□□□ -1.52
MSRA-208ENST00000522907 Q6ZS52 159 aa5.55□□□□□ -1.52
MSRA-208ENST00000522907 NT5DC3Q86UY8 548 aa5.55□□□□□ -1.52
MSRA-208ENST00000522907 CHSY1Q86X52 802 aa5.55□□□□□ -1.52
MSRA-208ENST00000522907 ARHGAP12Q8IWW6 846 aa5.55□□□□□ -1.52
MSRA-208ENST00000522907 TP53INP2Q8IXH6 220 aa5.55□□□□□ -1.52
MSRA-208ENST00000522907 MAML2Q8IZL2 1156 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
MSRA-208ENST00000522907 NPWQ8N729 165 aa5.55□□□□□ -1.52
MSRA-208ENST00000522907 PQLC3Q8N755 202 aa5.55□□□□□ -1.52
MSRA-208ENST00000522907 NAT16Q8N8M0 369 aa5.55□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.4 ms