RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522702.5

FAM49B-222, Transcript of family with sequence similarity 49 member B, human

TSL 4

Gene FAM49B, Length 544 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FAM49B-222	ENST00000522702	CAMK2D	Q13557	499 aa		4.21	□□□□□ -1.74
FAM49B-222	ENST00000522702	IRF3	Q14653	427 aa		4.21	□□□□□ -1.74
FAM49B-222	ENST00000522702	NTRK2	Q16620	822 aa		4.21	□□□□□ -1.74
FAM49B-222	ENST00000522702	SRSF7	Q16629	238 aa	Known RBP eCLIP	4.21	□□□□□ -1.74
FAM49B-222	ENST00000522702	MMEL1	Q495T6	779 aa		4.21	□□□□□ -1.74
FAM49B-222	ENST00000522702	GARNL3	Q5VVW2	1013 aa		4.21	□□□□□ -1.74
FAM49B-222	ENST00000522702	ZNF425	Q6IV72	752 aa		4.21	□□□□□ -1.74
FAM49B-222	ENST00000522702	CDC73	Q6P1J9	531 aa		4.21	□□□□□ -1.74
FAM49B-222	ENST00000522702	DENND5B	Q6ZUT9	1274 aa		4.21	□□□□□ -1.74
FAM49B-222	ENST00000522702	RTL10	Q7L3V2	364 aa		4.21	□□□□□ -1.74
FAM49B-222	ENST00000522702	DNAAF5	Q86Y56	855 aa		4.21	□□□□□ -1.74
FAM49B-222	ENST00000522702	TMCO5A	Q8N6Q1	288 aa		4.21	□□□□□ -1.74
FAM49B-222	ENST00000522702		Q8NFD4	153 aa		4.21	□□□□□ -1.74
FAM49B-222	ENST00000522702	MAFA	Q8NHW3	353 aa	Predicted RBP	4.21	□□□□□ -1.74
FAM49B-222	ENST00000522702	CLEC4C	Q8WTT0	213 aa		4.21	□□□□□ -1.74
FAM49B-222	ENST00000522702	NPIPB3	Q92617	1050 aa		4.21	□□□□□ -1.74
FAM49B-222	ENST00000522702	CCDC47	Q96A33	483 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
FAM49B-222	ENST00000522702	SIPA1	Q96FS4	1042 aa		4.21	□□□□□ -1.74
FAM49B-222	ENST00000522702	HIC2	Q96JB3	615 aa		4.21	□□□□□ -1.74
FAM49B-222	ENST00000522702	HNRNPUL1	Q9BUJ2	856 aa	Known RBP eCLIP	4.21	□□□□□ -1.74
FAM49B-222	ENST00000522702	DPCD	Q9BVM2	203 aa	Predicted RBP	4.21	□□□□□ -1.74
FAM49B-222	ENST00000522702	TEX12	Q9BXU0	123 aa		4.21	□□□□□ -1.74
FAM49B-222	ENST00000522702	C2orf40	Q9H1Z8	148 aa		4.21	□□□□□ -1.74
FAM49B-222	ENST00000522702	GLOD4	Q9HC38	313 aa		4.21	□□□□□ -1.74
FAM49B-222	ENST00000522702	TRIM36	Q9NQ86	728 aa		4.21	□□□□□ -1.74
FAM49B-222	ENST00000522702	MKLN1	Q9UL63	735 aa		4.21	□□□□□ -1.74
FAM49B-222	ENST00000522702	GABRQ	Q9UN88	632 aa		4.21	□□□□□ -1.74
FAM49B-222	ENST00000522702	CFTR	P13569	1480 aa		4.21	□□□□□ -1.74
FAM49B-222	ENST00000522702	ABCC8	Q09428	1581 aa		4.2	□□□□□ -1.74
FAM49B-222	ENST00000522702		A1L4Q6	167 aa		4.2	□□□□□ -1.74
FAM49B-222	ENST00000522702	EIF3CL	B5ME19	914 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
FAM49B-222	ENST00000522702	CTDSP2	O14595	271 aa		4.2	□□□□□ -1.74
FAM49B-222	ENST00000522702	TP73	O15350	636 aa		4.2	□□□□□ -1.74
FAM49B-222	ENST00000522702	NKX2-8	O15522	239 aa		4.2	□□□□□ -1.74
FAM49B-222	ENST00000522702	DIAPH2	O60879	1101 aa		4.2	□□□□□ -1.74
FAM49B-222	ENST00000522702	TBX10	O75333	385 aa		4.2	□□□□□ -1.74
FAM49B-222	ENST00000522702	IL6R	P08887	468 aa	Predicted RBP	4.2	□□□□□ -1.74
FAM49B-222	ENST00000522702	THEGL	P0DJG4	465 aa		4.2	□□□□□ -1.74
FAM49B-222	ENST00000522702	MYBL1	P10243	752 aa		4.2	□□□□□ -1.74
FAM49B-222	ENST00000522702	CD19	P15391	556 aa		4.2	□□□□□ -1.74
FAM49B-222	ENST00000522702	GPD1	P21695	349 aa		4.2	□□□□□ -1.74
FAM49B-222	ENST00000522702	FOLR3	P41439	243 aa		4.2	□□□□□ -1.74
FAM49B-222	ENST00000522702	CLCN2	P51788	898 aa		4.2	□□□□□ -1.74
FAM49B-222	ENST00000522702	ZNF41	P51814	821 aa	Predicted RBP	4.2	□□□□□ -1.74
FAM49B-222	ENST00000522702	PRAME	P78395	509 aa		4.2	□□□□□ -1.74
FAM49B-222	ENST00000522702	CDK18	Q07002	472 aa		4.2	□□□□□ -1.74
FAM49B-222	ENST00000522702	TFCP2	Q12800	502 aa		4.2	□□□□□ -1.74
FAM49B-222	ENST00000522702	TNFAIP1	Q13829	316 aa		4.2	□□□□□ -1.74
FAM49B-222	ENST00000522702	PTPRR	Q15256	657 aa		4.2	□□□□□ -1.74
FAM49B-222	ENST00000522702	TXNRD1	Q16881	649 aa		4.2	□□□□□ -1.74
FAM49B-222	ENST00000522702	ZNF674	Q2M3X9	581 aa		4.2	□□□□□ -1.74
FAM49B-222	ENST00000522702	TCP11X2	Q5H9J9	407 aa		4.2	□□□□□ -1.74
FAM49B-222	ENST00000522702	RAB41	Q5JT25	222 aa		4.2	□□□□□ -1.74
FAM49B-222	ENST00000522702	KRBOX4	Q5JUW0	171 aa		4.2	□□□□□ -1.74
FAM49B-222	ENST00000522702	ADAL	Q6DHV7	355 aa		4.2	□□□□□ -1.74
FAM49B-222	ENST00000522702	MTFR2	Q6P444	385 aa		4.2	□□□□□ -1.74
FAM49B-222	ENST00000522702	DCLRE1A	Q6PJP8	1040 aa		4.2	□□□□□ -1.74
FAM49B-222	ENST00000522702	C16orf89	Q6UX73	402 aa		4.2	□□□□□ -1.74
FAM49B-222	ENST00000522702	SCN4B	Q8IWT1	228 aa		4.2	□□□□□ -1.74
FAM49B-222	ENST00000522702	KIAA2013	Q8IYS2	634 aa		4.2	□□□□□ -1.74
FAM49B-222	ENST00000522702	NAT8L	Q8N9F0	302 aa		4.2	□□□□□ -1.74
FAM49B-222	ENST00000522702	POC5	Q8NA72	575 aa		4.2	□□□□□ -1.74
FAM49B-222	ENST00000522702	POGLUT1	Q8NBL1	392 aa		4.2	□□□□□ -1.74
FAM49B-222	ENST00000522702	TMEM116	Q8NCL8	245 aa		4.2	□□□□□ -1.74
FAM49B-222	ENST00000522702	APPL2	Q8NEU8	664 aa		4.2	□□□□□ -1.74
FAM49B-222	ENST00000522702	CADM4	Q8NFZ8	388 aa		4.2	□□□□□ -1.74
FAM49B-222	ENST00000522702	GDAP1	Q8TB36	358 aa		4.2	□□□□□ -1.74
FAM49B-222	ENST00000522702	OVCA2	Q8WZ82	227 aa		4.2	□□□□□ -1.74
FAM49B-222	ENST00000522702	CNOT9	Q92600	299 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
FAM49B-222	ENST00000522702	RFK	Q969G6	155 aa		4.2	□□□□□ -1.74
FAM49B-222	ENST00000522702	FKBP10	Q96AY3	582 aa		4.2	□□□□□ -1.74
FAM49B-222	ENST00000522702	CTHRC1	Q96CG8	243 aa		4.2	□□□□□ -1.74
FAM49B-222	ENST00000522702	SAT2	Q96F10	170 aa	Predicted RBP	4.2	□□□□□ -1.74
FAM49B-222	ENST00000522702	PGAP3	Q96FM1	320 aa	Predicted RBP	4.2	□□□□□ -1.74
FAM49B-222	ENST00000522702	WDYHV1	Q96HA8	205 aa		4.2	□□□□□ -1.74
FAM49B-222	ENST00000522702	PGBD1	Q96JS3	809 aa		4.2	□□□□□ -1.74
FAM49B-222	ENST00000522702	TIMP4	Q99727	224 aa		4.2	□□□□□ -1.74
FAM49B-222	ENST00000522702	ALG8	Q9BVK2	526 aa		4.2	□□□□□ -1.74
FAM49B-222	ENST00000522702	XPO4	Q9C0E2	1151 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
FAM49B-222	ENST00000522702	SLC32A1	Q9H598	525 aa		4.2	□□□□□ -1.74
FAM49B-222	ENST00000522702	EPHX3	Q9H6B9	360 aa		4.2	□□□□□ -1.74
FAM49B-222	ENST00000522702	CPNE5	Q9HCH3	593 aa		4.2	□□□□□ -1.74
FAM49B-222	ENST00000522702	KLC4	Q9NSK0	619 aa		4.2	□□□□□ -1.74
FAM49B-222	ENST00000522702	RRP7BP	Q9NSQ0	103 aa		4.2	□□□□□ -1.74
FAM49B-222	ENST00000522702	DECR2	Q9NUI1	292 aa		4.2	□□□□□ -1.74
FAM49B-222	ENST00000522702	COQ3	Q9NZJ6	369 aa		4.2	□□□□□ -1.74
FAM49B-222	ENST00000522702	IL1RAPL1	Q9NZN1	696 aa		4.2	□□□□□ -1.74
FAM49B-222	ENST00000522702	C5AR2	Q9P296	337 aa		4.2	□□□□□ -1.74
FAM49B-222	ENST00000522702	SUCLA2	Q9P2R7	463 aa	Predicted RBP	4.2	□□□□□ -1.74
FAM49B-222	ENST00000522702	DKK3	Q9UBP4	350 aa		4.2	□□□□□ -1.74
FAM49B-222	ENST00000522702	SLCO3A1	Q9UIG8	710 aa		4.2	□□□□□ -1.74
FAM49B-222	ENST00000522702	SH2B3	Q9UQQ2	575 aa		4.2	□□□□□ -1.74
FAM49B-222	ENST00000522702	hCG_1809904	A0A1W2PP81	198 aa		4.19	□□□□□ -1.74
FAM49B-222	ENST00000522702		A0A1W2PPE2	198 aa		4.19	□□□□□ -1.74
FAM49B-222	ENST00000522702		A0A1W2PR64	198 aa		4.19	□□□□□ -1.74
FAM49B-222	ENST00000522702	FRMD3	A2A2Y4	597 aa		4.19	□□□□□ -1.74
FAM49B-222	ENST00000522702	CCDC151	A5D8V7	595 aa		4.19	□□□□□ -1.74
FAM49B-222	ENST00000522702		A8MXE2	369 aa		4.19	□□□□□ -1.74
FAM49B-222	ENST00000522702	BTBD18	B2RXH4	712 aa		4.19	□□□□□ -1.74
FAM49B-222	ENST00000522702	TEX22	C9J3V5	150 aa		4.19	□□□□□ -1.74

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