RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519076.5

TRPS1-208, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene TRPS1, Length 3,329 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-208ENST00000519076 ARFIP2P53365 341 aa7.98□□□□□ -1.13
TRPS1-208ENST00000519076 SLC12A2P55011 1212 aa7.98□□□□□ -1.13
TRPS1-208ENST00000519076 SLC10A2Q12908 348 aaPredicted RBP7.98□□□□□ -1.13
TRPS1-208ENST00000519076 CYTH1Q15438 398 aa7.98□□□□□ -1.13
TRPS1-208ENST00000519076 CTC1Q2NKJ3 1217 aa7.98□□□□□ -1.13
TRPS1-208ENST00000519076 LIN52Q52LA3 116 aa7.98□□□□□ -1.13
TRPS1-208ENST00000519076 KIAA0319Q5VV43 1072 aa7.98□□□□□ -1.13
TRPS1-208ENST00000519076 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa7.98□□□□□ -1.13
TRPS1-208ENST00000519076 C4orf22Q6V702 233 aa7.98□□□□□ -1.13
TRPS1-208ENST00000519076 TRABD2AQ86V40 505 aa7.98□□□□□ -1.13
TRPS1-208ENST00000519076 SPATA24Q86W54 205 aa7.98□□□□□ -1.13
TRPS1-208ENST00000519076 RASSF3Q86WH2 238 aa7.98□□□□□ -1.13
TRPS1-208ENST00000519076 OR7G1Q8NGA0 311 aa7.98□□□□□ -1.13
TRPS1-208ENST00000519076 OR52K1Q8NGK4 314 aa7.98□□□□□ -1.13
TRPS1-208ENST00000519076 OR10T2Q8NGX3 314 aa7.98□□□□□ -1.13
TRPS1-208ENST00000519076 OSCP1Q8WVF1 389 aa7.98□□□□□ -1.13
TRPS1-208ENST00000519076 MAML1Q92585 1016 aa7.98□□□□□ -1.13
TRPS1-208ENST00000519076 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP7.98□□□□□ -1.137e-7■■■■□ 21.5
TRPS1-208ENST00000519076 NPY6RQ99463 290 aa7.98□□□□□ -1.13
TRPS1-208ENST00000519076 HEPHQ9BQS7 1158 aa7.98□□□□□ -1.13
TRPS1-208ENST00000519076 TMEM109Q9BVC6 243 aa7.98□□□□□ -1.13
TRPS1-208ENST00000519076 ABCC13Q9NSE7 274 aa7.98□□□□□ -1.13
TRPS1-208ENST00000519076 RRN3Q9NYV6 651 aa7.98□□□□□ -1.13
TRPS1-208ENST00000519076 HBS1LQ9Y450 684 aaKnown RBP7.98□□□□□ -1.13
TRPS1-208ENST00000519076 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP7.98□□□□□ -1.13
TRPS1-208ENST00000519076 ZBBXA8MT70 800 aa7.97□□□□□ -1.13
TRPS1-208ENST00000519076 FAM72CH0Y354 149 aa7.97□□□□□ -1.13
TRPS1-208ENST00000519076 CDK2AP1O14519 115 aa7.97□□□□□ -1.13
TRPS1-208ENST00000519076 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP7.97□□□□□ -1.13
TRPS1-208ENST00000519076 SPATA31D3P0C874 917 aa7.97□□□□□ -1.13
TRPS1-208ENST00000519076 SELPP16109 830 aa7.97□□□□□ -1.13
TRPS1-208ENST00000519076 GARSP41250 739 aaKnown RBP7.97□□□□□ -1.13
TRPS1-208ENST00000519076 ABCG1P45844 678 aa7.97□□□□□ -1.13
TRPS1-208ENST00000519076 GATMP50440 423 aa7.97□□□□□ -1.13
TRPS1-208ENST00000519076 GALK1P51570 392 aa7.97□□□□□ -1.13
TRPS1-208ENST00000519076 THOP1P52888 689 aa7.97□□□□□ -1.13
TRPS1-208ENST00000519076 DSTNP60981 165 aa7.97□□□□□ -1.13
TRPS1-208ENST00000519076 DUSP4Q13115 394 aa7.97□□□□□ -1.13
TRPS1-208ENST00000519076 FAM72AQ5TYM5 149 aa7.97□□□□□ -1.13
TRPS1-208ENST00000519076 FAM72DQ6L9T8 149 aa7.97□□□□□ -1.13
TRPS1-208ENST00000519076 LRRC8BQ6P9F7 803 aa7.97□□□□□ -1.13
TRPS1-208ENST00000519076 TRIM67Q6ZTA4 783 aa7.97□□□□□ -1.13
TRPS1-208ENST00000519076 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa7.97□□□□□ -1.13
TRPS1-208ENST00000519076 PAQR9Q6ZVX9 377 aa7.97□□□□□ -1.13
TRPS1-208ENST00000519076 FAM72BQ86X60 149 aa7.97□□□□□ -1.13
TRPS1-208ENST00000519076 RELL1Q8IUW5 271 aa7.97□□□□□ -1.13
TRPS1-208ENST00000519076 TP53INP2Q8IXH6 220 aa7.97□□□□□ -1.13
TRPS1-208ENST00000519076 FRS2Q8WU20 508 aa7.97□□□□□ -1.13
TRPS1-208ENST00000519076 KLHL29Q96CT2 875 aa7.97□□□□□ -1.13
TRPS1-208ENST00000519076 FCRL2Q96LA5 508 aaPredicted RBP7.97□□□□□ -1.13
TRPS1-208ENST00000519076 PPCSQ9HAB8 311 aa7.97□□□□□ -1.13
TRPS1-208ENST00000519076 NPHS2Q9NP85 383 aa7.97□□□□□ -1.13
TRPS1-208ENST00000519076 SLCO1B3Q9NPD5 702 aa7.97□□□□□ -1.13
TRPS1-208ENST00000519076 CCDC177Q9NQR7 707 aaPredicted RBP7.97□□□□□ -1.13
TRPS1-208ENST00000519076 MARCOQ9UEW3 520 aaPredicted RBP7.97□□□□□ -1.13
TRPS1-208ENST00000519076 A0A1W2PQH9 124 aa7.97□□□□□ -1.13
TRPS1-208ENST00000519076 GABRDO14764 452 aa7.97□□□□□ -1.13
TRPS1-208ENST00000519076 TMCC2O75069 709 aa7.97□□□□□ -1.13
TRPS1-208ENST00000519076 CHRNB1P11230 501 aa7.97□□□□□ -1.13
TRPS1-208ENST00000519076 YWHAQP27348 245 aa7.97□□□□□ -1.13
TRPS1-208ENST00000519076 MZF1P28698 734 aaPredicted RBP7.97□□□□□ -1.13
TRPS1-208ENST00000519076 HSPA14Q0VDF9 509 aa7.97□□□□□ -1.13
TRPS1-208ENST00000519076 ITIH4Q14624 930 aa7.97□□□□□ -1.13
TRPS1-208ENST00000519076 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP7.97□□□□□ -1.13
TRPS1-208ENST00000519076 TTC39BQ5VTQ0 682 aaPredicted RBP7.97□□□□□ -1.13
TRPS1-208ENST00000519076 SLC9A4Q6AI14 798 aa7.97□□□□□ -1.13
TRPS1-208ENST00000519076 LRRTM3Q86VH5 581 aa7.97□□□□□ -1.13
TRPS1-208ENST00000519076 SLC25A41Q8N5S1 370 aa7.97□□□□□ -1.13
TRPS1-208ENST00000519076 BRSK1Q8TDC3 778 aa7.97□□□□□ -1.13
TRPS1-208ENST00000519076 FTHL17Q9BXU8 183 aa7.97□□□□□ -1.13
TRPS1-208ENST00000519076 NUF2Q9BZD4 464 aa7.97□□□□□ -1.13
TRPS1-208ENST00000519076 RNPEPL1Q9HAU8 725 aa7.97□□□□□ -1.13
TRPS1-208ENST00000519076 USP29Q9HBJ7 922 aa7.97□□□□□ -1.13
TRPS1-208ENST00000519076 TMLHEQ9NVH6 421 aa7.97□□□□□ -1.13
TRPS1-208ENST00000519076 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP7.97□□□□□ -1.13
TRPS1-208ENST00000519076 GIMAP1-GIMAP5A0A087WTJ2 511 aa7.96□□□□□ -1.13
TRPS1-208ENST00000519076 HACD1B0YJ81 288 aa7.96□□□□□ -1.13
TRPS1-208ENST00000519076 MTSS1O43312 755 aa7.96□□□□□ -1.13
TRPS1-208ENST00000519076 PAGE1O75459 146 aa7.96□□□□□ -1.13
TRPS1-208ENST00000519076 DDHD2O94830 711 aa7.96□□□□□ -1.13
TRPS1-208ENST00000519076 STAMBPO95630 424 aa7.96□□□□□ -1.13
TRPS1-208ENST00000519076 IRF1P10914 325 aa7.96□□□□□ -1.13
TRPS1-208ENST00000519076 VAV1P15498 845 aa7.96□□□□□ -1.13
TRPS1-208ENST00000519076 HMOX2P30519 316 aa7.96□□□□□ -1.13
TRPS1-208ENST00000519076 TBX4P57082 545 aa7.96□□□□□ -1.13
TRPS1-208ENST00000519076 GPX6P59796 221 aa7.96□□□□□ -1.13
TRPS1-208ENST00000519076 MYLK3Q32MK0 819 aa7.96□□□□□ -1.13
TRPS1-208ENST00000519076 TTC23LQ6PF05 361 aa7.96□□□□□ -1.13
TRPS1-208ENST00000519076 VASH1Q7L8A9 365 aaPredicted RBP7.96□□□□□ -1.13
TRPS1-208ENST00000519076 NUDCD3Q8IVD9 361 aa7.96□□□□□ -1.13
TRPS1-208ENST00000519076 CROCCP3Q8IVE0 287 aa7.96□□□□□ -1.13
TRPS1-208ENST00000519076 IGDCC3Q8IVU1 814 aa7.96□□□□□ -1.13
TRPS1-208ENST00000519076 NUP93Q8N1F7 819 aa7.96□□□□□ -1.13
TRPS1-208ENST00000519076 ARL6IP6Q8N6S5 226 aa7.96□□□□□ -1.13
TRPS1-208ENST00000519076 ZMIZ2Q8NF64 920 aa7.96□□□□□ -1.13
TRPS1-208ENST00000519076 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP7.96□□□□□ -1.13
TRPS1-208ENST00000519076 UCMAQ8WVF2 138 aa7.96□□□□□ -1.13
TRPS1-208ENST00000519076 KCTD13Q8WZ19 329 aa7.96□□□□□ -1.13
TRPS1-208ENST00000519076 SPOCK2Q92563 424 aa7.96□□□□□ -1.13
TRPS1-208ENST00000519076 ALKBH8Q96BT7 664 aaKnown RBP7.96□□□□□ -1.13
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