RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000518059.5

UBXN8-204, Transcript of UBX domain protein 8, humanhuman

TSL 3

Gene UBXN8, Length 493 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN8-204ENST00000518059 MFSD3Q96ES6 412 aa7.55□□□□□ -1.2
UBXN8-204ENST00000518059 HMCESQ96FZ2 354 aa7.55□□□□□ -1.2
UBXN8-204ENST00000518059 NSL1Q96IY1 281 aa7.55□□□□□ -1.2
UBXN8-204ENST00000518059 VPS39Q96JC1 886 aa7.55□□□□□ -1.2
UBXN8-204ENST00000518059 RPRD1AQ96P16 312 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
UBXN8-204ENST00000518059 GPR22Q99680 433 aa7.55□□□□□ -1.2
UBXN8-204ENST00000518059 NT5MQ9NPB1 228 aa7.55□□□□□ -1.2
UBXN8-204ENST00000518059 CHRAC1Q9NRG0 131 aa7.55□□□□□ -1.2
UBXN8-204ENST00000518059 SDAD1Q9NVU7 687 aaKnown RBP eCLIP7.55□□□□□ -1.2
UBXN8-204ENST00000518059 SAGE1Q9NXZ1 904 aa7.55□□□□□ -1.2
UBXN8-204ENST00000518059 BAIAP2L1Q9UHR4 511 aa7.55□□□□□ -1.2
UBXN8-204ENST00000518059 LNPEPQ9UIQ6 1025 aa7.55□□□□□ -1.2
UBXN8-204ENST00000518059 DNMT3LQ9UJW3 386 aa7.55□□□□□ -1.2
UBXN8-204ENST00000518059 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
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UBXN8-204ENST00000518059 STK38LQ9Y2H1 464 aa7.55□□□□□ -1.2
UBXN8-204ENST00000518059 BACE2Q9Y5Z0 518 aa7.55□□□□□ -1.2
UBXN8-204ENST00000518059 VWA8A3KMH1 1905 aa7.54□□□□□ -1.2
UBXN8-204ENST00000518059 NUP205Q92621 2012 aa7.54□□□□□ -1.2
UBXN8-204ENST00000518059 DRGXA6NNA5 263 aa7.54□□□□□ -1.2
UBXN8-204ENST00000518059 TMEM114B3SHH9 223 aa7.54□□□□□ -1.2
UBXN8-204ENST00000518059 FCHO1O14526 889 aa7.54□□□□□ -1.2
UBXN8-204ENST00000518059 TRAFD1O14545 582 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
UBXN8-204ENST00000518059 TBC1D4O60343 1298 aa7.54□□□□□ -1.2
UBXN8-204ENST00000518059 PAPSS2O95340 614 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
UBXN8-204ENST00000518059 MT-CYBP00156 380 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
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UBXN8-204ENST00000518059 HMBSP08397 361 aa7.54□□□□□ -1.2
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UBXN8-204ENST00000518059 RALBP11234 206 aa7.54□□□□□ -1.2
UBXN8-204ENST00000518059 ESRRAP11474 423 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
UBXN8-204ENST00000518059 COL6A2P12110 1019 aa7.54□□□□□ -1.2
UBXN8-204ENST00000518059 TACR2P21452 398 aa7.54□□□□□ -1.2
UBXN8-204ENST00000518059 CALB2P22676 271 aa7.54□□□□□ -1.2
UBXN8-204ENST00000518059 PTPN4P29074 926 aa7.54□□□□□ -1.2
UBXN8-204ENST00000518059 CRABP2P29373 138 aa7.54□□□□□ -1.2
UBXN8-204ENST00000518059 SERPINB3P29508 390 aa7.54□□□□□ -1.2
UBXN8-204ENST00000518059 ADRA1AP35348 466 aa7.54□□□□□ -1.2
UBXN8-204ENST00000518059 CD151P48509 253 aa7.54□□□□□ -1.2
UBXN8-204ENST00000518059 SLC1A6P48664 564 aa7.54□□□□□ -1.2
UBXN8-204ENST00000518059 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
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UBXN8-204ENST00000518059 KCNJ2P63252 427 aa7.54□□□□□ -1.2
UBXN8-204ENST00000518059 TNK2Q07912 1038 aa7.54□□□□□ -1.2
UBXN8-204ENST00000518059 IL10RBQ08334 325 aa7.54□□□□□ -1.2
UBXN8-204ENST00000518059 DUSP4Q13115 394 aa7.54□□□□□ -1.2
UBXN8-204ENST00000518059 SLC12A1Q13621 1099 aa7.54□□□□□ -1.2
UBXN8-204ENST00000518059 ZNF235Q14590 738 aa7.54□□□□□ -1.2
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UBXN8-204ENST00000518059 VEPH1Q14D04 833 aa7.54□□□□□ -1.2
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UBXN8-204ENST00000518059 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa7.54□□□□□ -1.2
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UBXN8-204ENST00000518059 CNTN4Q8IWV2 1026 aa7.54□□□□□ -1.2
UBXN8-204ENST00000518059 ZNF683Q8IZ20 524 aa7.54□□□□□ -1.2
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UBXN8-204ENST00000518059 ANKLE1Q8NAG6 615 aa7.54□□□□□ -1.2
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UBXN8-204ENST00000518059 SH3TC2Q8TF17 1288 aa7.54□□□□□ -1.2
UBXN8-204ENST00000518059 GIPC2Q8TF65 315 aa7.54□□□□□ -1.2
UBXN8-204ENST00000518059 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
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UBXN8-204ENST00000518059 RILPQ96NA2 401 aa7.54□□□□□ -1.2
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UBXN8-204ENST00000518059 RANBP9Q96S59 729 aa7.54□□□□□ -1.2
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UBXN8-204ENST00000518059 TTLL2Q9BWV7 592 aa7.54□□□□□ -1.2
UBXN8-204ENST00000518059 HIPK3Q9H422 1215 aa7.54□□□□□ -1.2
UBXN8-204ENST00000518059 IL1RAPL1Q9NZN1 696 aa7.54□□□□□ -1.2
UBXN8-204ENST00000518059 COPG2Q9UBF2 871 aa7.54□□□□□ -1.2
UBXN8-204ENST00000518059 MTRRQ9UBK8 725 aa7.54□□□□□ -1.2
UBXN8-204ENST00000518059 AFF4Q9UHB7 1163 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
UBXN8-204ENST00000518059 HAO1Q9UJM8 370 aa7.54□□□□□ -1.2
UBXN8-204ENST00000518059 EMCNQ9ULC0 261 aa7.54□□□□□ -1.2
UBXN8-204ENST00000518059 SLC39A10Q9ULF5 831 aa7.54□□□□□ -1.2
UBXN8-204ENST00000518059 SORCS3Q9UPU3 1222 aa7.54□□□□□ -1.2
UBXN8-204ENST00000518059 APOBEC2Q9Y235 224 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
UBXN8-204ENST00000518059 DNAJC16Q9Y2G8 782 aa7.54□□□□□ -1.2
UBXN8-204ENST00000518059 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa7.54□□□□□ -1.2
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