RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517346.1

AC008708.1-201, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene AC008708.1, Length 474 nt, Biotype sense intronic.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AC008708.1-201ENST00000517346 KLK13Q9UKR3 277 aa6.91□□□□□ -1.3
AC008708.1-201ENST00000517346 ERVW-1Q9UQF0 538 aa6.91□□□□□ -1.3
AC008708.1-201ENST00000517346 ZBTB32Q9Y2Y4 487 aaPredicted RBP6.91□□□□□ -1.3
AC008708.1-201ENST00000517346 CEP83Q9Y592 693 aa6.91□□□□□ -1.3
AC008708.1-201ENST00000517346 CFAP47Q6ZTR5 3102 aa6.91□□□□□ -1.3
AC008708.1-201ENST00000517346 CABIN1Q9Y6J0 2220 aa6.91□□□□□ -1.3
AC008708.1-201ENST00000517346 ZFYVE26Q68DK2 2539 aa6.9□□□□□ -1.3
AC008708.1-201ENST00000517346 SYNJ2BP-COX16A0A087WUM0 186 aa6.9□□□□□ -1.3
AC008708.1-201ENST00000517346 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
AC008708.1-201ENST00000517346 FAM47DPA6NHR8 397 aa6.9□□□□□ -1.3
AC008708.1-201ENST00000517346 KCNU1A8MYU2 1149 aa6.9□□□□□ -1.3
AC008708.1-201ENST00000517346 F5H5T6 163 aa6.9□□□□□ -1.3
AC008708.1-201ENST00000517346 H0Y626 953 aa6.9□□□□□ -1.3
AC008708.1-201ENST00000517346 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
AC008708.1-201ENST00000517346 RNASEH1O60930 286 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
AC008708.1-201ENST00000517346 GRAP2O75791 330 aa6.9□□□□□ -1.3
AC008708.1-201ENST00000517346 TRIM16O95361 564 aa6.9□□□□□ -1.3
AC008708.1-201ENST00000517346 MOCS3O95396 460 aa6.9□□□□□ -1.3
AC008708.1-201ENST00000517346 CER1O95813 267 aa6.9□□□□□ -1.3
AC008708.1-201ENST00000517346 BPNT1O95861 308 aa6.9□□□□□ -1.3
AC008708.1-201ENST00000517346 IGLV3-25P01717 112 aa6.9□□□□□ -1.3
AC008708.1-201ENST00000517346 ERBB2P04626 1255 aa6.9□□□□□ -1.3
AC008708.1-201ENST00000517346 SRPRAP08240 638 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
AC008708.1-201ENST00000517346 FTH1P19P0C7X4 201 aa6.9□□□□□ -1.3
AC008708.1-201ENST00000517346 PNMA6AP0CW24 399 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
AC008708.1-201ENST00000517346 SLC2A3P11169 496 aa6.9□□□□□ -1.3
AC008708.1-201ENST00000517346 ABCB4P21439 1286 aa6.9□□□□□ -1.3
AC008708.1-201ENST00000517346 KRT9P35527 623 aa6.9□□□□□ -1.3
AC008708.1-201ENST00000517346 MATKP42679 507 aa6.9□□□□□ -1.3
AC008708.1-201ENST00000517346 AFF3P51826 1226 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
AC008708.1-201ENST00000517346 SEPT6Q14141 434 aa6.9□□□□□ -1.3
AC008708.1-201ENST00000517346 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
AC008708.1-201ENST00000517346 KIF19Q2TAC6 998 aa6.9□□□□□ -1.3
AC008708.1-201ENST00000517346 KCNT1Q5JUK3 1230 aa6.9□□□□□ -1.3
AC008708.1-201ENST00000517346 EFHC1Q5JVL4 640 aa6.9□□□□□ -1.3
AC008708.1-201ENST00000517346 EXOSC6Q5RKV6 272 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
AC008708.1-201ENST00000517346 C9orf64Q5T6V5 341 aa6.9□□□□□ -1.3
AC008708.1-201ENST00000517346 RNF219Q5W0B1 726 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
AC008708.1-201ENST00000517346 OR6B2Q6IFH4 312 aa6.9□□□□□ -1.3
AC008708.1-201ENST00000517346 FBXL19Q6PCT2 694 aa6.9□□□□□ -1.3
AC008708.1-201ENST00000517346 LAYNQ6UX15 382 aa6.9□□□□□ -1.3
AC008708.1-201ENST00000517346 CIR1Q86X95 450 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
AC008708.1-201ENST00000517346 MMAAQ8IVH4 418 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
AC008708.1-201ENST00000517346 DEFB106AQ8N104 65 aa6.9□□□□□ -1.3
AC008708.1-201ENST00000517346 STK40Q8N2I9 435 aa6.9□□□□□ -1.3
AC008708.1-201ENST00000517346 PNPLA1Q8N8W4 532 aa6.9□□□□□ -1.3
AC008708.1-201ENST00000517346 ATP6V0D2Q8N8Y2 350 aa6.9□□□□□ -1.3
AC008708.1-201ENST00000517346 C1orf131Q8NDD1 294 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
AC008708.1-201ENST00000517346 UBASH3BQ8TF42 649 aa6.9□□□□□ -1.3
AC008708.1-201ENST00000517346 SETD7Q8WTS6 366 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
AC008708.1-201ENST00000517346 GATA6Q92908 595 aa6.9□□□□□ -1.3
AC008708.1-201ENST00000517346 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa6.9□□□□□ -1.3
AC008708.1-201ENST00000517346 RPL10LQ96L21 214 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
AC008708.1-201ENST00000517346 FAM81BQ96LP2 452 aa6.9□□□□□ -1.3
AC008708.1-201ENST00000517346 PRMT1Q99873 361 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
AC008708.1-201ENST00000517346 NRSN2Q9GZP1 204 aa6.9□□□□□ -1.3
AC008708.1-201ENST00000517346 NEUROG2Q9H2A3 272 aa6.9□□□□□ -1.3
AC008708.1-201ENST00000517346 CCDC86Q9H6F5 360 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
AC008708.1-201ENST00000517346 SGK2Q9HBY8 427 aa6.9□□□□□ -1.3
AC008708.1-201ENST00000517346 TM9SF3Q9HD45 589 aa6.9□□□□□ -1.3
AC008708.1-201ENST00000517346 SIX2Q9NPC8 291 aa6.9□□□□□ -1.3
AC008708.1-201ENST00000517346 DDIT4Q9NX09 232 aa6.9□□□□□ -1.3
AC008708.1-201ENST00000517346 FBXL12Q9NXK8 326 aa6.9□□□□□ -1.3
AC008708.1-201ENST00000517346 COX16Q9P0S2 106 aa6.9□□□□□ -1.3
AC008708.1-201ENST00000517346 APEX2Q9UBZ4 518 aa6.9□□□□□ -1.3
AC008708.1-201ENST00000517346 SERGEFQ9UGK8 458 aa6.9□□□□□ -1.3
AC008708.1-201ENST00000517346 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa6.9□□□□□ -1.3
AC008708.1-201ENST00000517346 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa6.9□□□□□ -1.3
AC008708.1-201ENST00000517346 DNAJC12Q9UKB3 198 aa6.9□□□□□ -1.3
AC008708.1-201ENST00000517346 AJAP1Q9UKB5 411 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
AC008708.1-201ENST00000517346 NCKAP1Q9Y2A7 1128 aa6.9□□□□□ -1.3
AC008708.1-201ENST00000517346 ANKRD6Q9Y2G4 727 aa6.9□□□□□ -1.3
AC008708.1-201ENST00000517346 MSRB2Q9Y3D2 182 aa6.9□□□□□ -1.3
AC008708.1-201ENST00000517346 NEUROG3Q9Y4Z2 214 aa6.9□□□□□ -1.3
AC008708.1-201ENST00000517346 SNX11Q9Y5W9 270 aa6.9□□□□□ -1.3
AC008708.1-201ENST00000517346 MUC22E2RYF6 1773 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.31
AC008708.1-201ENST00000517346 PKD1L2Q7Z442 2459 aa6.89□□□□□ -1.31
AC008708.1-201ENST00000517346 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
AC008708.1-201ENST00000517346 DSPP15924 2871 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
AC008708.1-201ENST00000517346 EDDM13A0A1B0GTR0 161 aa6.89□□□□□ -1.31
AC008708.1-201ENST00000517346 FAM170AA1A519 330 aa6.89□□□□□ -1.31
AC008708.1-201ENST00000517346 TARSL2A2RTX5 802 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
AC008708.1-201ENST00000517346 KCNK3O14649 394 aa6.89□□□□□ -1.31
AC008708.1-201ENST00000517346 MID1O15344 667 aa6.89□□□□□ -1.31
AC008708.1-201ENST00000517346 HSF2BPO75031 334 aa6.89□□□□□ -1.31
AC008708.1-201ENST00000517346 CBFA2T3O75081 653 aa6.89□□□□□ -1.31
AC008708.1-201ENST00000517346 RNASEH2AO75792 299 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
AC008708.1-201ENST00000517346 IGHV4-34P06331 123 aa6.89□□□□□ -1.31
AC008708.1-201ENST00000517346 GLI1P08151 1106 aa6.89□□□□□ -1.31
AC008708.1-201ENST00000517346 ZNF883P0CG24 379 aa6.89□□□□□ -1.31
AC008708.1-201ENST00000517346 VAV1P15498 845 aa6.89□□□□□ -1.31
AC008708.1-201ENST00000517346 PDGFRAP16234 1089 aa6.89□□□□□ -1.31
AC008708.1-201ENST00000517346 CD27P26842 260 aa6.89□□□□□ -1.31
AC008708.1-201ENST00000517346 CCR1P32246 355 aa6.89□□□□□ -1.31
AC008708.1-201ENST00000517346 SLC8A1P32418 973 aa6.89□□□□□ -1.31
AC008708.1-201ENST00000517346 PSMD8P48556 350 aa6.89□□□□□ -1.31
AC008708.1-201ENST00000517346 STK19P49842 368 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
AC008708.1-201ENST00000517346 IRAK1P51617 712 aa6.89□□□□□ -1.31
AC008708.1-201ENST00000517346 GALCP54803 685 aa6.89□□□□□ -1.31
AC008708.1-201ENST00000517346 NME3Q13232 169 aa6.89□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.7 ms