RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516876.1

RNU6-928P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 928, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-928P, Length 104 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-928P-201ENST00000516876 MBD3L2BA0A1B0GVZ6 204 aaPredicted RBP3.2□□□□□ -1.9
RNU6-928P-201ENST00000516876 OR2A25A4D2G3 310 aa3.2□□□□□ -1.9
RNU6-928P-201ENST00000516876 CAPN14A8MX76 684 aa3.2□□□□□ -1.9
RNU6-928P-201ENST00000516876 C19orf81C9J6K1 198 aa3.2□□□□□ -1.9
RNU6-928P-201ENST00000516876 LEFTY2O00292 366 aa3.2□□□□□ -1.9
RNU6-928P-201ENST00000516876 CA12O43570 354 aa3.2□□□□□ -1.9
RNU6-928P-201ENST00000516876 PRICKLE3O43900 615 aaPredicted RBP3.2□□□□□ -1.9
RNU6-928P-201ENST00000516876 FMO6PO60774 539 aa3.2□□□□□ -1.9
RNU6-928P-201ENST00000516876 MITFO75030 526 aaPredicted RBP3.2□□□□□ -1.9
RNU6-928P-201ENST00000516876 GPC4O75487 556 aa3.2□□□□□ -1.9
RNU6-928P-201ENST00000516876 DAB1O75553 588 aa3.2□□□□□ -1.9
RNU6-928P-201ENST00000516876 TJP3O95049 919 aa3.2□□□□□ -1.9
RNU6-928P-201ENST00000516876 PNPP00491 289 aa3.2□□□□□ -1.9
RNU6-928P-201ENST00000516876 SERPINC1P01008 464 aa3.2□□□□□ -1.9
RNU6-928P-201ENST00000516876 MT-ND3P03897 115 aa3.2□□□□□ -1.9
RNU6-928P-201ENST00000516876 HEXAP06865 529 aa3.2□□□□□ -1.9
RNU6-928P-201ENST00000516876 FESP07332 822 aa3.2□□□□□ -1.9
RNU6-928P-201ENST00000516876 IL6RP08887 468 aaPredicted RBP3.2□□□□□ -1.9
RNU6-928P-201ENST00000516876 ALDOCP09972 364 aaKnown RBP3.2□□□□□ -1.9
RNU6-928P-201ENST00000516876 FAM200BP0CF97 657 aa3.2□□□□□ -1.9
RNU6-928P-201ENST00000516876 PCNAP12004 261 aa3.2□□□□□ -1.9
RNU6-928P-201ENST00000516876 PTPN2P17706 415 aa3.2□□□□□ -1.9
RNU6-928P-201ENST00000516876 LAG3P18627 525 aa3.2□□□□□ -1.9
RNU6-928P-201ENST00000516876 PI3P19957 117 aa3.2□□□□□ -1.9
RNU6-928P-201ENST00000516876 CASTP20810 708 aaKnown RBP3.2□□□□□ -1.9
RNU6-928P-201ENST00000516876 TGM2P21980 687 aa3.2□□□□□ -1.9
RNU6-928P-201ENST00000516876 HOXC8P31273 242 aa3.2□□□□□ -1.9
RNU6-928P-201ENST00000516876 CDAP32320 146 aa3.2□□□□□ -1.9
RNU6-928P-201ENST00000516876 KIF5BP33176 963 aa3.2□□□□□ -1.9
RNU6-928P-201ENST00000516876 CYP2C18P33260 490 aa3.2□□□□□ -1.9
RNU6-928P-201ENST00000516876 MCM5P33992 734 aa3.2□□□□□ -1.9
RNU6-928P-201ENST00000516876 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP3.2□□□□□ -1.9
RNU6-928P-201ENST00000516876 AGTR2P50052 363 aa3.2□□□□□ -1.9
RNU6-928P-201ENST00000516876 RAB28P51157 221 aa3.2□□□□□ -1.9
RNU6-928P-201ENST00000516876 PMS2P54278 862 aa3.2□□□□□ -1.9
RNU6-928P-201ENST00000516876 ADPRHP54922 357 aa3.2□□□□□ -1.9
RNU6-928P-201ENST00000516876 SLC37A1P57057 533 aa3.2□□□□□ -1.9
RNU6-928P-201ENST00000516876 CAMK2DQ13557 499 aa3.2□□□□□ -1.9
RNU6-928P-201ENST00000516876 PPP2R5BQ15173 497 aa3.2□□□□□ -1.9
RNU6-928P-201ENST00000516876 SHBQ15464 509 aa3.2□□□□□ -1.9
RNU6-928P-201ENST00000516876 MLANAQ16655 118 aa3.2□□□□□ -1.9
RNU6-928P-201ENST00000516876 GEN1Q17RS7 908 aa3.2□□□□□ -1.9
RNU6-928P-201ENST00000516876 KRT24Q2M2I5 525 aa3.2□□□□□ -1.9
RNU6-928P-201ENST00000516876 MMEL1Q495T6 779 aa3.2□□□□□ -1.9
RNU6-928P-201ENST00000516876 PDCD4Q53EL6 469 aaKnown RBP3.2□□□□□ -1.9
RNU6-928P-201ENST00000516876 ZNF667Q5HYK9 610 aa3.2□□□□□ -1.9
RNU6-928P-201ENST00000516876 SPDYAQ5MJ70 313 aa3.2□□□□□ -1.9
RNU6-928P-201ENST00000516876 TREML2Q5T2D2 321 aa3.2□□□□□ -1.9
RNU6-928P-201ENST00000516876 ARMC4Q5T2S8 1044 aa3.2□□□□□ -1.9
RNU6-928P-201ENST00000516876 VWA5B1Q5TIE3 1220 aa3.2□□□□□ -1.9
RNU6-928P-201ENST00000516876 TMEM268Q5VZI3 342 aa3.2□□□□□ -1.9
RNU6-928P-201ENST00000516876 TATDN1Q6P1N9 297 aa3.2□□□□□ -1.9
RNU6-928P-201ENST00000516876 MTFR2Q6P444 385 aa3.2□□□□□ -1.9
RNU6-928P-201ENST00000516876 SHQ1Q6PI26 577 aaKnown RBP3.2□□□□□ -1.9
RNU6-928P-201ENST00000516876 CATSPER4Q7RTX7 472 aa3.2□□□□□ -1.9
RNU6-928P-201ENST00000516876 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa3.2□□□□□ -1.9
RNU6-928P-201ENST00000516876 NEK8Q86SG6 692 aa3.2□□□□□ -1.9
RNU6-928P-201ENST00000516876 GPR149Q86SP6 731 aa3.2□□□□□ -1.9
RNU6-928P-201ENST00000516876 GPAT4Q86UL3 456 aa3.2□□□□□ -1.9
RNU6-928P-201ENST00000516876 LCA5Q86VQ0 697 aa3.2□□□□□ -1.9
RNU6-928P-201ENST00000516876 LINC00346Q8IVM7 164 aa3.2□□□□□ -1.9
RNU6-928P-201ENST00000516876 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP3.2□□□□□ -1.9
RNU6-928P-201ENST00000516876 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP3.2□□□□□ -1.9
RNU6-928P-201ENST00000516876 LINC01356Q8N9X3 169 aa3.2□□□□□ -1.9
RNU6-928P-201ENST00000516876 IL17RCQ8NAC3 791 aa3.2□□□□□ -1.9
RNU6-928P-201ENST00000516876 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP3.2□□□□□ -1.9
RNU6-928P-201ENST00000516876 EXOC4Q96A65 974 aa3.2□□□□□ -1.9
RNU6-928P-201ENST00000516876 ARHGEF26Q96DR7 871 aa3.2□□□□□ -1.9
RNU6-928P-201ENST00000516876 MMABQ96EY8 250 aaPredicted RBP3.2□□□□□ -1.9
RNU6-928P-201ENST00000516876 HARBI1Q96MB7 349 aa3.2□□□□□ -1.9
RNU6-928P-201ENST00000516876 DGAT2Q96PD7 388 aa3.2□□□□□ -1.9
RNU6-928P-201ENST00000516876 TEFMQ96QE5 360 aaKnown RBP3.2□□□□□ -1.9
RNU6-928P-201ENST00000516876 SNX18Q96RF0 628 aa3.2□□□□□ -1.9
RNU6-928P-201ENST00000516876 NEU1Q99519 415 aa3.2□□□□□ -1.9
RNU6-928P-201ENST00000516876 IFT27Q9BW83 186 aa3.2□□□□□ -1.9
RNU6-928P-201ENST00000516876 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP3.2□□□□□ -1.9
RNU6-928P-201ENST00000516876 XYLT2Q9H1B5 865 aa3.2□□□□□ -1.9
RNU6-928P-201ENST00000516876 POLR1BQ9H9Y6 1135 aa3.2□□□□□ -1.9
RNU6-928P-201ENST00000516876 SAP30LQ9HAJ7 183 aa3.2□□□□□ -1.9
RNU6-928P-201ENST00000516876 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP3.2□□□□□ -1.9
RNU6-928P-201ENST00000516876 PAPOLBQ9NRJ5 636 aaKnown RBP3.2□□□□□ -1.9
RNU6-928P-201ENST00000516876 KLC4Q9NSK0 619 aa3.2□□□□□ -1.9
RNU6-928P-201ENST00000516876 SNTG1Q9NSN8 517 aa3.2□□□□□ -1.9
RNU6-928P-201ENST00000516876 TBCCD1Q9NVR7 557 aa3.2□□□□□ -1.9
RNU6-928P-201ENST00000516876 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP3.2□□□□□ -1.9
RNU6-928P-201ENST00000516876 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa3.2□□□□□ -1.9
RNU6-928P-201ENST00000516876 MKLN1Q9UL63 735 aa3.2□□□□□ -1.9
RNU6-928P-201ENST00000516876 MAFFQ9ULX9 164 aa3.2□□□□□ -1.9
RNU6-928P-201ENST00000516876 VPS4AQ9UN37 437 aa3.2□□□□□ -1.9
RNU6-928P-201ENST00000516876 FAM96BQ9Y3D0 163 aa3.2□□□□□ -1.9
RNU6-928P-201ENST00000516876 PTRH2Q9Y3E5 179 aaKnown RBP3.2□□□□□ -1.9
RNU6-928P-201ENST00000516876 PKP3Q9Y446 797 aa3.2□□□□□ -1.9
RNU6-928P-201ENST00000516876 KCTD3Q9Y597 815 aa3.2□□□□□ -1.9
RNU6-928P-201ENST00000516876 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP3.2□□□□□ -1.9
RNU6-928P-201ENST00000516876 TRAV34A0A0B4J273 112 aa3.19□□□□□ -1.9
RNU6-928P-201ENST00000516876 A0A0U1RQK1 487 aa3.19□□□□□ -1.9
RNU6-928P-201ENST00000516876 C11orf97A0A1B0GVM6 126 aaPredicted RBP3.19□□□□□ -1.9
RNU6-928P-201ENST00000516876 A0A1W2PQF6 199 aa3.19□□□□□ -1.9
RNU6-928P-201ENST00000516876 ZNF320A2RRD8 509 aa3.19□□□□□ -1.9
RNU6-928P-201ENST00000516876 LRRD1A4D1F6 860 aa3.19□□□□□ -1.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.8 ms