RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516552.1

RNU6-118P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 118, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-118P, Length 102 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-118P-201ENST00000516552 SGMS2Q8NHU3 365 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-118P-201ENST00000516552 FAM71BQ8TC56 605 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-118P-201ENST00000516552 TMEM158Q8WZ71 300 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-118P-201ENST00000516552 LPIN2Q92539 896 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-118P-201ENST00000516552 PROX1Q92786 737 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-118P-201ENST00000516552 FAF2Q96CS3 445 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-118P-201ENST00000516552 RMI2Q96E14 147 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-118P-201ENST00000516552 TVP23CQ96ET8 276 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-118P-201ENST00000516552 MARS2Q96GW9 593 aaKnown RBP-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-118P-201ENST00000516552 RCC1LQ96I51 464 aaKnown RBP-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-118P-201ENST00000516552 FAM218AQ96MZ4 157 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-118P-201ENST00000516552 RAB3IPQ96QF0 476 aaPredicted RBP-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-118P-201ENST00000516552 SPAG5Q96R06 1193 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-118P-201ENST00000516552 FNBP1Q96RU3 617 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-118P-201ENST00000516552 CDRT15Q96T59 188 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-118P-201ENST00000516552 CDC6Q99741 560 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-118P-201ENST00000516552 MXRA8Q9BRK3 442 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-118P-201ENST00000516552 SLC25A33Q9BSK2 321 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-118P-201ENST00000516552 DCUN1D5Q9BTE7 237 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-118P-201ENST00000516552 RAB11FIP5Q9BXF6 653 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-118P-201ENST00000516552 FAM126AQ9BYI3 521 aaPredicted RBP-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-118P-201ENST00000516552 TRIM55Q9BYV6 548 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-118P-201ENST00000516552 FAM192AQ9GZU8 254 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-118P-201ENST00000516552 AP5M1Q9H0R1 490 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-118P-201ENST00000516552 RETREG1Q9H6L5 497 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-118P-201ENST00000516552 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-118P-201ENST00000516552 FOXD4L1Q9NU39 408 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-118P-201ENST00000516552 ASB6Q9NWX5 421 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-118P-201ENST00000516552 SPASTQ9UBP0 616 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-118P-201ENST00000516552 CACNG5Q9UF02 275 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-118P-201ENST00000516552 ZNF107Q9UII5 783 aaPredicted RBP-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-118P-201ENST00000516552 ZDHHC2Q9UIJ5 367 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-118P-201ENST00000516552 AGO1Q9UL18 857 aaKnown RBP-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-118P-201ENST00000516552 PHTF1Q9UMS5 762 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-118P-201ENST00000516552 SAMD4AQ9UPU9 718 aaKnown RBP-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-118P-201ENST00000516552 KIAA1024Q9UPX6 916 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-118P-201ENST00000516552 VSIG4Q9Y279 399 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-118P-201ENST00000516552 RCL1Q9Y2P8 373 aaKnown RBP-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-118P-201ENST00000516552 L3MBTL1Q9Y468 752 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-118P-201ENST00000516552 NR2E3Q9Y5X4 410 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-118P-201ENST00000516552 USP3Q9Y6I4 520 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-118P-201ENST00000516552 USH1CQ9Y6N9 552 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-118P-201ENST00000516552 U3KQ87 197 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-118P-201ENST00000516552 MED14O60244 1454 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-118P-201ENST00000516552 GREB1Q4ZG55 1949 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-118P-201ENST00000516552 PTPN23Q9H3S7 1636 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-118P-201ENST00000516552 SCN1AP35498 2009 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-118P-201ENST00000516552 MEIKINA0A087WXM9 373 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-118P-201ENST00000516552 CENPVL1A0A0U1RR11 272 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-118P-201ENST00000516552 LOC390937A0A1W2PQ73 354 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-118P-201ENST00000516552 A0A1W2PRG6 482 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-118P-201ENST00000516552 ZNF320A2RRD8 509 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-118P-201ENST00000516552 GRIFINA4D1Z8 144 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-118P-201ENST00000516552 FITM1A5D6W6 292 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-118P-201ENST00000516552 FAM83GA6ND36 823 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-118P-201ENST00000516552 RCCD1A6NED2 376 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-118P-201ENST00000516552 FAM90A22PA8MWA6 464 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-118P-201ENST00000516552 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-118P-201ENST00000516552 DLGAP1O14490 977 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-118P-201ENST00000516552 PDPK1O15530 556 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-118P-201ENST00000516552 ARHGEF9O43307 516 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-118P-201ENST00000516552 MGEA5O60502 916 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-118P-201ENST00000516552 SORBS3O60504 671 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-118P-201ENST00000516552 B4GALT4O60513 344 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-118P-201ENST00000516552 KHDRBS3O75525 346 aaKnown RBP-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-118P-201ENST00000516552 RBBP9O75884 186 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-118P-201ENST00000516552 PGM3O95394 542 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-118P-201ENST00000516552 NAPSAO96009 420 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-118P-201ENST00000516552 SFTPBP07988 381 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-118P-201ENST00000516552 STSP08842 583 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-118P-201ENST00000516552 CD63P08962 238 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-118P-201ENST00000516552 HOXB5P09067 269 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-118P-201ENST00000516552 SNRPCP09234 159 aaKnown RBP-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-118P-201ENST00000516552 CISD3P0C7P0 127 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-118P-201ENST00000516552 DANCRP0C864 163 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-118P-201ENST00000516552 ESRRAP11474 423 aaPredicted RBP-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-118P-201ENST00000516552 MTHFD1P11586 935 aaKnown RBP-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-118P-201ENST00000516552 FDPSP14324 419 aaKnown RBP-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-118P-201ENST00000516552 CAPN2P17655 700 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-118P-201ENST00000516552 PTPN2P17706 415 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-118P-201ENST00000516552 PTPRAP18433 802 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-118P-201ENST00000516552 PDE6GP18545 87 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-118P-201ENST00000516552 ENPP1P22413 925 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-118P-201ENST00000516552 CYP7A1P22680 504 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-118P-201ENST00000516552 LHCGRP22888 699 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-118P-201ENST00000516552 PAX3P23760 479 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-118P-201ENST00000516552 MAOBP27338 520 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-118P-201ENST00000516552 RBMS1P29558 406 aaKnown RBP-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-118P-201ENST00000516552 IDUAP35475 653 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-118P-201ENST00000516552 GJC1P36383 396 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-118P-201ENST00000516552 ETV5P41161 510 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-118P-201ENST00000516552 GRIA1P42261 906 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-118P-201ENST00000516552 YAP1P46937 504 aaKnown RBP-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-118P-201ENST00000516552 GZMMP51124 257 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-118P-201ENST00000516552 LIMK1P53667 647 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-118P-201ENST00000516552 KCNK10P57789 538 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-118P-201ENST00000516552 CCNA1P78396 465 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-118P-201ENST00000516552 RAE1P78406 368 aaKnown RBP-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-118P-201ENST00000516552 IL13RA1P78552 427 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-118P-201ENST00000516552 EEF1A2Q05639 463 aaKnown RBP-1.65□□□□□ -2.67
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.5 ms