RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513325.5

HERC3-211, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 5

Gene HERC3, Length 582 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-211ENST00000513325 OR12D3Q9UGF7 316 aa17.25■□□□□ 0.35
HERC3-211ENST00000513325 CLCA2Q9UQC9 943 aa17.25■□□□□ 0.35
HERC3-211ENST00000513325 LAMA5O15230 3695 aa17.25■□□□□ 0.35
HERC3-211ENST00000513325 DOCK4Q8N1I0 1966 aa17.25■□□□□ 0.35
HERC3-211ENST00000513325 ATRXP46100 2492 aa17.25■□□□□ 0.35
HERC3-211ENST00000513325 CYP1A1P04798 512 aaPredicted RBP17.24■□□□□ 0.35
HERC3-211ENST00000513325 ADRB3P13945 408 aa17.24■□□□□ 0.35
HERC3-211ENST00000513325 CHRNB2P17787 502 aa17.24■□□□□ 0.35
HERC3-211ENST00000513325 MMP8P22894 467 aa17.24■□□□□ 0.35
HERC3-211ENST00000513325 L1CAMP32004 1257 aa17.24■□□□□ 0.35
HERC3-211ENST00000513325 ADRA1BP35368 520 aa17.24■□□□□ 0.35
HERC3-211ENST00000513325 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP17.24■□□□□ 0.35
HERC3-211ENST00000513325 RPS21P63220 83 aaKnown RBP17.24■□□□□ 0.35
HERC3-211ENST00000513325 DAB2P98082 770 aa17.24■□□□□ 0.35
HERC3-211ENST00000513325 INSM1Q01101 510 aaPredicted RBP17.24■□□□□ 0.35
HERC3-211ENST00000513325 RTP5Q14D33 572 aa17.24■□□□□ 0.35
HERC3-211ENST00000513325 ARL13BQ3SXY8 428 aa17.24■□□□□ 0.35
HERC3-211ENST00000513325 CCDC14Q49A88 953 aa17.24■□□□□ 0.35
HERC3-211ENST00000513325 HS1BP3Q53T59 392 aa17.24■□□□□ 0.35
HERC3-211ENST00000513325 ZNF542PQ5EBM4 170 aa17.24■□□□□ 0.35
HERC3-211ENST00000513325 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP17.24■□□□□ 0.35
HERC3-211ENST00000513325 RWDD4Q6NW29 188 aaKnown RBP17.24■□□□□ 0.35
HERC3-211ENST00000513325 Q6ZSR6 202 aa17.24■□□□□ 0.35
HERC3-211ENST00000513325 OR4C6Q8NH72 309 aa17.24■□□□□ 0.35
HERC3-211ENST00000513325 JOSD2Q8TAC2 188 aa17.24■□□□□ 0.35
HERC3-211ENST00000513325 SLC30A5Q8TAD4 765 aa17.24■□□□□ 0.35
HERC3-211ENST00000513325 RFFLQ8WZ73 363 aa17.24■□□□□ 0.35
HERC3-211ENST00000513325 FEM1CQ96JP0 617 aa17.24■□□□□ 0.35
HERC3-211ENST00000513325 BMFQ96LC9 184 aa17.24■□□□□ 0.35
HERC3-211ENST00000513325 SLC17A9Q9BYT1 436 aa17.24■□□□□ 0.35
HERC3-211ENST00000513325 MAGEB5Q9BZ81 275 aa17.24■□□□□ 0.35
HERC3-211ENST00000513325 TM6SF2Q9BZW4 377 aa17.24■□□□□ 0.35
HERC3-211ENST00000513325 NRSN2Q9GZP1 204 aa17.24■□□□□ 0.35
HERC3-211ENST00000513325 ZDHHC6Q9H6R6 413 aa17.24■□□□□ 0.35
HERC3-211ENST00000513325 NDFIP2Q9NV92 336 aa17.24■□□□□ 0.35
HERC3-211ENST00000513325 HECAQ9UBI9 543 aaPredicted RBP17.24■□□□□ 0.35
HERC3-211ENST00000513325 FADS3Q9Y5Q0 445 aa17.24■□□□□ 0.35
HERC3-211ENST00000513325 HS3ST3A1Q9Y663 406 aa17.24■□□□□ 0.35
HERC3-211ENST00000513325 A6NNZ2 444 aa17.23■□□□□ 0.35
HERC3-211ENST00000513325 FAM72CH0Y354 149 aa17.23■□□□□ 0.35
HERC3-211ENST00000513325 TLX3O43711 291 aaPredicted RBP17.23■□□□□ 0.35
HERC3-211ENST00000513325 PIAS2O75928 621 aa17.23■□□□□ 0.35
HERC3-211ENST00000513325 GJB6O95452 261 aa17.23■□□□□ 0.35
HERC3-211ENST00000513325 PAK4O96013 591 aaPredicted RBP17.23■□□□□ 0.35
HERC3-211ENST00000513325 GIMD1P0DJR0 217 aa17.23■□□□□ 0.35
HERC3-211ENST00000513325 SDC4P31431 198 aa17.23■□□□□ 0.35
HERC3-211ENST00000513325 ABCG1P45844 678 aa17.23■□□□□ 0.35
HERC3-211ENST00000513325 E2F1Q01094 437 aa17.23■□□□□ 0.35
HERC3-211ENST00000513325 FMO1Q01740 532 aa17.23■□□□□ 0.35
HERC3-211ENST00000513325 FGL2Q14314 439 aa17.23■□□□□ 0.35
HERC3-211ENST00000513325 ACAP1Q15027 740 aa17.23■□□□□ 0.35
HERC3-211ENST00000513325 FAM72AQ5TYM5 149 aa17.23■□□□□ 0.35
HERC3-211ENST00000513325 MANEALQ5VSG8 457 aa17.23■□□□□ 0.35
HERC3-211ENST00000513325 FAM72DQ6L9T8 149 aa17.23■□□□□ 0.35
HERC3-211ENST00000513325 KIAA1161Q6NSJ0 714 aa17.23■□□□□ 0.35
HERC3-211ENST00000513325 PARS2Q7L3T8 475 aaKnown RBP17.23■□□□□ 0.35
HERC3-211ENST00000513325 PTAR1Q7Z6K3 402 aaPredicted RBP17.23■□□□□ 0.35
HERC3-211ENST00000513325 FAM72BQ86X60 149 aa17.23■□□□□ 0.35
HERC3-211ENST00000513325 RYBPQ8N488 228 aaPredicted RBP17.23■□□□□ 0.35
HERC3-211ENST00000513325 GPT2Q8TD30 523 aa17.23■□□□□ 0.35
HERC3-211ENST00000513325 C11orf70Q9BRQ4 267 aa17.23■□□□□ 0.35
HERC3-211ENST00000513325 NLRC4Q9NPP4 1024 aa17.23■□□□□ 0.35
HERC3-211ENST00000513325 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP17.23■□□□□ 0.35
HERC3-211ENST00000513325 DNAJC28Q9NX36 388 aa17.23■□□□□ 0.35
HERC3-211ENST00000513325 DNAI1Q9UI46 699 aa17.23■□□□□ 0.35
HERC3-211ENST00000513325 MYLKQ15746 1914 aa17.22■□□□□ 0.35
HERC3-211ENST00000513325 POM121BA6NF01 834 aa17.22■□□□□ 0.35
HERC3-211ENST00000513325 C2CD4BA6NLJ0 364 aa17.22■□□□□ 0.35
HERC3-211ENST00000513325 EPHB6O15197 1021 aa17.22■□□□□ 0.35
HERC3-211ENST00000513325 RAD51BO15315 384 aa17.22■□□□□ 0.35
HERC3-211ENST00000513325 RHOQP17081 205 aa17.22■□□□□ 0.35
HERC3-211ENST00000513325 ITPKBP27987 946 aa17.22■□□□□ 0.35
HERC3-211ENST00000513325 GKP32189 559 aa17.22■□□□□ 0.35
HERC3-211ENST00000513325 SOX5P35711 763 aa17.22■□□□□ 0.35
HERC3-211ENST00000513325 ETFBP38117 255 aa17.22■□□□□ 0.35
HERC3-211ENST00000513325 MAPKAPK2P49137 400 aa17.22■□□□□ 0.35
HERC3-211ENST00000513325 JAM2P57087 298 aa17.22■□□□□ 0.35
HERC3-211ENST00000513325 NRG1Q02297 640 aaPredicted RBP17.22■□□□□ 0.35
HERC3-211ENST00000513325 KRT31Q15323 416 aa17.22■□□□□ 0.35
HERC3-211ENST00000513325 TMC6Q7Z403 805 aa17.22■□□□□ 0.35
HERC3-211ENST00000513325 NLRP14Q86W24 1093 aa17.22■□□□□ 0.35
HERC3-211ENST00000513325 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa17.22■□□□□ 0.35
HERC3-211ENST00000513325 DCBLD1Q8N8Z6 715 aa17.22■□□□□ 0.35
HERC3-211ENST00000513325 OR6K2Q8NGY2 324 aa17.22■□□□□ 0.35
HERC3-211ENST00000513325 FAM174AQ8TBP5 190 aa17.22■□□□□ 0.35
HERC3-211ENST00000513325 ENOX1Q8TC92 643 aaKnown RBP17.22■□□□□ 0.35
HERC3-211ENST00000513325 ARHGEF2Q92974 986 aaKnown RBP17.22■□□□□ 0.35
HERC3-211ENST00000513325 ISG20Q96AZ6 181 aaKnown RBP17.22■□□□□ 0.35
HERC3-211ENST00000513325 IFT43Q96FT9 208 aa17.22■□□□□ 0.35
HERC3-211ENST00000513325 BBC3Q96PG8 261 aaPredicted RBP17.22■□□□□ 0.35
HERC3-211ENST00000513325 PCDHB18PQ96TA0 734 aa17.22■□□□□ 0.35
HERC3-211ENST00000513325 OSBPL2Q9H1P3 480 aa17.22■□□□□ 0.35
HERC3-211ENST00000513325 AP1G1O43747 822 aa17.21■□□□□ 0.35
HERC3-211ENST00000513325 LRIG2O94898 1065 aa17.21■□□□□ 0.35
HERC3-211ENST00000513325 MT-CO3P00414 261 aa17.21■□□□□ 0.35
HERC3-211ENST00000513325 UNGP13051 313 aaPredicted RBP17.21■□□□□ 0.35
HERC3-211ENST00000513325 MYF5P13349 255 aa17.21■□□□□ 0.35
HERC3-211ENST00000513325 EIF2S3P41091 472 aaKnown RBP17.21■□□□□ 0.35
HERC3-211ENST00000513325 PTPN9P43378 593 aa17.21■□□□□ 0.35
HERC3-211ENST00000513325 FZD2Q14332 565 aa17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.9 ms