RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512014.5

SH3BP2-222, Transcript of SH3 domain binding protein 2, human

TSL 3

Gene SH3BP2, Length 688 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SH3BP2-222	ENST00000512014	PRNP	P04156	253 aa		12.94	□□□□□ -0.34
SH3BP2-222	ENST00000512014	FAM228B	P0C875	321 aa		12.94	□□□□□ -0.34
SH3BP2-222	ENST00000512014	TCF4	P15884	667 aa		12.94	□□□□□ -0.34
SH3BP2-222	ENST00000512014	SPINK2	P20155	84 aa		12.94	□□□□□ -0.34
SH3BP2-222	ENST00000512014	IL1R2	P27930	398 aa		12.94	□□□□□ -0.34
SH3BP2-222	ENST00000512014	MIP	P30301	263 aa		12.94	□□□□□ -0.34
SH3BP2-222	ENST00000512014	MAT2A	P31153	395 aa	Known RBP	12.94	□□□□□ -0.34
SH3BP2-222	ENST00000512014	ETFB	P38117	255 aa		12.94	□□□□□ -0.34
SH3BP2-222	ENST00000512014	TPM4	P67936	248 aa		12.94	□□□□□ -0.34
SH3BP2-222	ENST00000512014	ZBED6	P86452	979 aa		12.94	□□□□□ -0.34
SH3BP2-222	ENST00000512014	TEAD4	Q15561	434 aa		12.94	□□□□□ -0.34
SH3BP2-222	ENST00000512014	UMODL1-AS1	Q8N2C9	162 aa		12.94	□□□□□ -0.34
SH3BP2-222	ENST00000512014	NETO2	Q8NC67	525 aa		12.94	□□□□□ -0.34
SH3BP2-222	ENST00000512014	ZNF653	Q96CK0	615 aa		12.94	□□□□□ -0.34
SH3BP2-222	ENST00000512014	SERAC1	Q96JX3	654 aa		12.94	□□□□□ -0.34
SH3BP2-222	ENST00000512014	CCDC114	Q96M63	670 aa		12.94	□□□□□ -0.34
SH3BP2-222	ENST00000512014	EPAS1	Q99814	870 aa		12.94	□□□□□ -0.34
SH3BP2-222	ENST00000512014	HEPH	Q9BQS7	1158 aa		12.94	□□□□□ -0.34
SH3BP2-222	ENST00000512014	TM6SF2	Q9BZW4	377 aa		12.94	□□□□□ -0.34
SH3BP2-222	ENST00000512014	XPO4	Q9C0E2	1151 aa	Known RBP	12.94	□□□□□ -0.34
SH3BP2-222	ENST00000512014	LRRC19	Q9H756	370 aa		12.94	□□□□□ -0.34
SH3BP2-222	ENST00000512014	PREB	Q9HCU5	417 aa		12.94	□□□□□ -0.34
SH3BP2-222	ENST00000512014	PCSK1N	Q9UHG2	260 aa		12.94	□□□□□ -0.34
SH3BP2-222	ENST00000512014	ANGPTL2	Q9UKU9	493 aa		12.94	□□□□□ -0.34
SH3BP2-222	ENST00000512014	AP4E1	Q9UPM8	1137 aa		12.94	□□□□□ -0.34
SH3BP2-222	ENST00000512014	PCDHGB2	Q9Y5G2	931 aa		12.94	□□□□□ -0.34
SH3BP2-222	ENST00000512014	KMT2B	Q9UMN6	2715 aa	Predicted RBP	12.94	□□□□□ -0.34
SH3BP2-222	ENST00000512014	FREM2	Q5SZK8	3169 aa		12.93	□□□□□ -0.34
SH3BP2-222	ENST00000512014	USP24	Q9UPU5	2620 aa		12.93	□□□□□ -0.34
SH3BP2-222	ENST00000512014	RASA4B	C9J798	803 aa		12.93	□□□□□ -0.34
SH3BP2-222	ENST00000512014	GOLGA6L19	H0YKK7	550 aa		12.93	□□□□□ -0.34
SH3BP2-222	ENST00000512014	SPINT1	O43278	529 aa		12.93	□□□□□ -0.34
SH3BP2-222	ENST00000512014	RASA4	O43374	803 aa		12.93	□□□□□ -0.34
SH3BP2-222	ENST00000512014	TMCC1	O94876	653 aa		12.93	□□□□□ -0.34
SH3BP2-222	ENST00000512014	SERPING1	P05155	500 aa		12.93	□□□□□ -0.34
SH3BP2-222	ENST00000512014	ITGB7	P26010	798 aa		12.93	□□□□□ -0.34
SH3BP2-222	ENST00000512014	CD38	P28907	300 aa		12.93	□□□□□ -0.34
SH3BP2-222	ENST00000512014	YBEY	P58557	167 aa	Predicted RBP	12.93	□□□□□ -0.34
SH3BP2-222	ENST00000512014	SIM1	P81133	766 aa	Predicted RBP	12.93	□□□□□ -0.34
SH3BP2-222	ENST00000512014	SERINC3	Q13530	473 aa		12.93	□□□□□ -0.34
SH3BP2-222	ENST00000512014	FGL2	Q14314	439 aa		12.93	□□□□□ -0.34
SH3BP2-222	ENST00000512014	SKOR2	Q2VWA4	1001 aa	Predicted RBP	12.93	□□□□□ -0.34
SH3BP2-222	ENST00000512014	ZNF284	Q2VY69	593 aa		12.93	□□□□□ -0.34
SH3BP2-222	ENST00000512014	TDRD12	Q587J7	1177 aa	Known RBP	12.93	□□□□□ -0.34
SH3BP2-222	ENST00000512014	PRAMEF14	Q5SWL7	426 aa		12.93	□□□□□ -0.34
SH3BP2-222	ENST00000512014	ERMARD	Q5T6L9	678 aa		12.93	□□□□□ -0.34
SH3BP2-222	ENST00000512014	AFMID	Q63HM1	303 aa		12.93	□□□□□ -0.34
SH3BP2-222	ENST00000512014	NAPEPLD	Q6IQ20	393 aa		12.93	□□□□□ -0.34
SH3BP2-222	ENST00000512014	ERN2	Q76MJ5	926 aa	Known RBP	12.93	□□□□□ -0.34
SH3BP2-222	ENST00000512014	PARS2	Q7L3T8	475 aa	Known RBP	12.93	□□□□□ -0.34
SH3BP2-222	ENST00000512014	SPATS2	Q86XZ4	545 aa	Known RBP	12.93	□□□□□ -0.34
SH3BP2-222	ENST00000512014	ARHGAP12	Q8IWW6	846 aa		12.93	□□□□□ -0.34
SH3BP2-222	ENST00000512014	TMEM145	Q8NBT3	493 aa		12.93	□□□□□ -0.34
SH3BP2-222	ENST00000512014	OR6K2	Q8NGY2	324 aa		12.93	□□□□□ -0.34
SH3BP2-222	ENST00000512014	CPLX3	Q8WVH0	158 aa		12.93	□□□□□ -0.34
SH3BP2-222	ENST00000512014	ARHGEF26	Q96DR7	871 aa		12.93	□□□□□ -0.34
SH3BP2-222	ENST00000512014	TMEM121B	Q9BXQ6	578 aa	Predicted RBP	12.93	□□□□□ -0.34
SH3BP2-222	ENST00000512014	PDF	Q9HBH1	243 aa		12.93	□□□□□ -0.34
SH3BP2-222	ENST00000512014	TOR4A	Q9NXH8	423 aa		12.93	□□□□□ -0.34
SH3BP2-222	ENST00000512014	MYO1A	Q9UBC5	1043 aa		12.93	□□□□□ -0.34
SH3BP2-222	ENST00000512014	HECA	Q9UBI9	543 aa	Predicted RBP	12.93	□□□□□ -0.34
SH3BP2-222	ENST00000512014	TPX2	Q9ULW0	747 aa	Known RBP	12.93	□□□□□ -0.34
SH3BP2-222	ENST00000512014	CA5B	Q9Y2D0	317 aa		12.93	□□□□□ -0.34
SH3BP2-222	ENST00000512014	FARP1	Q9Y4F1	1045 aa	Predicted RBP	12.93	□□□□□ -0.34
SH3BP2-222	ENST00000512014	ARID1B	Q8NFD5	2236 aa	Predicted RBP	12.93	□□□□□ -0.34
SH3BP2-222	ENST00000512014	LAMA5	O15230	3695 aa		12.93	□□□□□ -0.34
SH3BP2-222	ENST00000512014	TRPM6	Q9BX84	2022 aa		12.93	□□□□□ -0.34
SH3BP2-222	ENST00000512014		A0A1B0GTQ1	180 aa		12.92	□□□□□ -0.34
SH3BP2-222	ENST00000512014		A0A1W2PQU0	124 aa		12.92	□□□□□ -0.34
SH3BP2-222	ENST00000512014	FGF10	O15520	208 aa	Predicted RBP	12.92	□□□□□ -0.34
SH3BP2-222	ENST00000512014	PCDHGA12	O60330	932 aa		12.92	□□□□□ -0.34
SH3BP2-222	ENST00000512014	RNGTT	O60942	597 aa	Known RBP	12.92	□□□□□ -0.34
SH3BP2-222	ENST00000512014	GSR	P00390	522 aa		12.92	□□□□□ -0.34
SH3BP2-222	ENST00000512014	MYBL1	P10243	752 aa		12.92	□□□□□ -0.34
SH3BP2-222	ENST00000512014	ADRB3	P13945	408 aa		12.92	□□□□□ -0.34
SH3BP2-222	ENST00000512014	HNRNPH3	P31942	346 aa	Known RBP	12.92	□□□□□ -0.34
SH3BP2-222	ENST00000512014	CASP14	P31944	242 aa		12.92	□□□□□ -0.34
SH3BP2-222	ENST00000512014	HTR7	P34969	479 aa		12.92	□□□□□ -0.34
SH3BP2-222	ENST00000512014	ABL2	P42684	1182 aa		12.92	□□□□□ -0.34
SH3BP2-222	ENST00000512014	RECQL	P46063	649 aa	Predicted RBP	12.92	□□□□□ -0.34
SH3BP2-222	ENST00000512014	DNA2	P51530	1060 aa		12.92	□□□□□ -0.34
SH3BP2-222	ENST00000512014	NXPH1	P58417	271 aa		12.92	□□□□□ -0.34
SH3BP2-222	ENST00000512014	TPI1	P60174	286 aa		12.92	□□□□□ -0.34
SH3BP2-222	ENST00000512014	IL9R	Q01113	521 aa		12.92	□□□□□ -0.34
SH3BP2-222	ENST00000512014	FOXC1	Q12948	553 aa		12.92	□□□□□ -0.34
SH3BP2-222	ENST00000512014	CYTH1	Q15438	398 aa		12.92	□□□□□ -0.34
SH3BP2-222	ENST00000512014	TRIP6	Q15654	476 aa	Known RBP	12.92	□□□□□ -0.34
SH3BP2-222	ENST00000512014	PARP15	Q460N3	678 aa		12.92	□□□□□ -0.34
SH3BP2-222	ENST00000512014	TMEM259	Q4ZIN3	620 aa		12.92	□□□□□ -0.34
SH3BP2-222	ENST00000512014	ATXN7L2	Q5T6C5	722 aa	Predicted RBP	12.92	□□□□□ -0.34
SH3BP2-222	ENST00000512014	SEL1L3	Q68CR1	1132 aa		12.92	□□□□□ -0.34
SH3BP2-222	ENST00000512014	TXNRD3NB	Q6F5E7	133 aa		12.92	□□□□□ -0.34
SH3BP2-222	ENST00000512014	NEK5	Q6P3R8	708 aa		12.92	□□□□□ -0.34
SH3BP2-222	ENST00000512014	GLRX5	Q86SX6	157 aa		12.92	□□□□□ -0.34
SH3BP2-222	ENST00000512014	PRPF39	Q86UA1	669 aa	Known RBP	12.92	□□□□□ -0.34
SH3BP2-222	ENST00000512014	SLCO6A1	Q86UG4	719 aa		12.92	□□□□□ -0.34
SH3BP2-222	ENST00000512014	NPW	Q8N729	165 aa		12.92	□□□□□ -0.34
SH3BP2-222	ENST00000512014	OR2AP1	Q8NGE2	309 aa		12.92	□□□□□ -0.34
SH3BP2-222	ENST00000512014	KLK6	Q92876	244 aa		12.92	□□□□□ -0.34
SH3BP2-222	ENST00000512014	BTBD6	Q96KE9	485 aa		12.92	□□□□□ -0.34

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