RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511807.1

UBE2B-208, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 B, humanhuman

TSL 3

Gene UBE2B, Length 818 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2B-208ENST00000511807 TPI1P60174 286 aa11.6□□□□□ -0.55
UBE2B-208ENST00000511807 CAMK2GQ13555 558 aaPredicted RBP11.6□□□□□ -0.55
UBE2B-208ENST00000511807 AUHQ13825 339 aaKnown RBP11.6□□□□□ -0.55
UBE2B-208ENST00000511807 CA9Q16790 459 aa11.6□□□□□ -0.55
UBE2B-208ENST00000511807 TFDP3Q5H9I0 405 aa11.6□□□□□ -0.55
UBE2B-208ENST00000511807 RABGAP1LQ5R372 815 aa11.6□□□□□ -0.55
UBE2B-208ENST00000511807 MBLAC2Q68D91 279 aa11.6□□□□□ -0.55
UBE2B-208ENST00000511807 RFWD3Q6PCD5 774 aa11.6□□□□□ -0.55
UBE2B-208ENST00000511807 SPOCD1Q6ZMY3 1216 aa11.6□□□□□ -0.55
UBE2B-208ENST00000511807 RAB44Q7Z6P3 723 aaPredicted RBP11.6□□□□□ -0.55
UBE2B-208ENST00000511807 CHSY1Q86X52 802 aa11.6□□□□□ -0.55
UBE2B-208ENST00000511807 AHI1Q8N157 1196 aa11.6□□□□□ -0.55
UBE2B-208ENST00000511807 PYROXD2Q8N2H3 581 aa11.6□□□□□ -0.55
UBE2B-208ENST00000511807 FAM71BQ8TC56 605 aa11.6□□□□□ -0.55
UBE2B-208ENST00000511807 WFIKKN2Q8TEU8 576 aa11.6□□□□□ -0.55
UBE2B-208ENST00000511807 RAPGEF5Q92565 580 aa11.6□□□□□ -0.55
UBE2B-208ENST00000511807 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP11.6□□□□□ -0.55
UBE2B-208ENST00000511807 OSBPL9Q96SU4 736 aa11.6□□□□□ -0.55
UBE2B-208ENST00000511807 ZNF670Q9BS34 389 aa11.6□□□□□ -0.55
UBE2B-208ENST00000511807 RETREG1Q9H6L5 497 aa11.6□□□□□ -0.55
UBE2B-208ENST00000511807 CATSPERBQ9H7T0 1116 aa11.6□□□□□ -0.55
UBE2B-208ENST00000511807 PCDH18Q9HCL0 1135 aa11.6□□□□□ -0.55
UBE2B-208ENST00000511807 ANLNQ9NQW6 1124 aa11.6□□□□□ -0.55
UBE2B-208ENST00000511807 TMPRSS4Q9NRS4 437 aa11.6□□□□□ -0.55
UBE2B-208ENST00000511807 RNF14Q9UBS8 474 aa11.6□□□□□ -0.55
UBE2B-208ENST00000511807 GGA2Q9UJY4 613 aa11.6□□□□□ -0.55
UBE2B-208ENST00000511807 EFR3BQ9Y2G0 817 aa11.6□□□□□ -0.55
UBE2B-208ENST00000511807 PLXND1Q9Y4D7 1925 aa11.6□□□□□ -0.55
UBE2B-208ENST00000511807 GOLGA6L7A0A1B0GV03 622 aa11.59□□□□□ -0.55
UBE2B-208ENST00000511807 E9PAM4 449 aa11.59□□□□□ -0.55
UBE2B-208ENST00000511807 I6L893 689 aaPredicted RBP11.59□□□□□ -0.55
UBE2B-208ENST00000511807 FGF10O15520 208 aaPredicted RBP11.59□□□□□ -0.55
UBE2B-208ENST00000511807 CEP104O60308 925 aa11.59□□□□□ -0.55
UBE2B-208ENST00000511807 TBL1XO60907 577 aa11.59□□□□□ -0.55
UBE2B-208ENST00000511807 SRGAP2O75044 1071 aa11.59□□□□□ -0.55
UBE2B-208ENST00000511807 URI1O94763 535 aaPredicted RBP11.59□□□□□ -0.55
UBE2B-208ENST00000511807 CER1O95813 267 aa11.59□□□□□ -0.55
UBE2B-208ENST00000511807 DNTTP04053 509 aa11.59□□□□□ -0.55
UBE2B-208ENST00000511807 PYGMP11217 842 aa11.59□□□□□ -0.55
UBE2B-208ENST00000511807 ZFXP17010 805 aaPredicted RBP11.59□□□□□ -0.55
UBE2B-208ENST00000511807 POLR2EP19388 210 aaKnown RBP11.59□□□□□ -0.55
UBE2B-208ENST00000511807 CXCR5P32302 372 aa11.59□□□□□ -0.55
UBE2B-208ENST00000511807 ACSL1P33121 698 aa11.59□□□□□ -0.55
UBE2B-208ENST00000511807 PTPN7P35236 360 aa11.59□□□□□ -0.55
UBE2B-208ENST00000511807 CSNK1EP49674 416 aaKnown RBP11.59□□□□□ -0.55
UBE2B-208ENST00000511807 BNC1Q01954 994 aa11.59□□□□□ -0.55
UBE2B-208ENST00000511807 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP11.59□□□□□ -0.55
UBE2B-208ENST00000511807 TFDP2Q14188 446 aa11.59□□□□□ -0.55
UBE2B-208ENST00000511807 DPYSL3Q14195 570 aa11.59□□□□□ -0.55
UBE2B-208ENST00000511807 PPP2R5EQ16537 467 aa11.59□□□□□ -0.55
UBE2B-208ENST00000511807 HLA-BQ31612 363 aa11.59□□□□□ -0.55
UBE2B-208ENST00000511807 PIK3R6Q5UE93 754 aa11.59□□□□□ -0.55
UBE2B-208ENST00000511807 RAP1GAP2Q684P5 730 aa11.59□□□□□ -0.55
UBE2B-208ENST00000511807 IL27RAQ6UWB1 636 aa11.59□□□□□ -0.55
UBE2B-208ENST00000511807 MFSD7Q6UXD7 560 aa11.59□□□□□ -0.55
UBE2B-208ENST00000511807 ADIPOR2Q86V24 386 aa11.59□□□□□ -0.55
UBE2B-208ENST00000511807 LGI2Q8N0V4 545 aa11.59□□□□□ -0.55
UBE2B-208ENST00000511807 TRAF3IP1Q8TDR0 691 aaPredicted RBP11.59□□□□□ -0.55
UBE2B-208ENST00000511807 MAIP1Q8WWC4 291 aa11.59□□□□□ -0.55
UBE2B-208ENST00000511807 TBC1D31Q96DN5 1066 aa11.59□□□□□ -0.55
UBE2B-208ENST00000511807 PSMB7Q99436 277 aa11.59□□□□□ -0.55
UBE2B-208ENST00000511807 NAP1L3Q99457 506 aaPredicted RBP11.59□□□□□ -0.55
UBE2B-208ENST00000511807 PRMT1Q99873 361 aaKnown RBP11.59□□□□□ -0.55
UBE2B-208ENST00000511807 OSBPL8Q9BZF1 889 aa11.59□□□□□ -0.55
UBE2B-208ENST00000511807 TMEM245Q9H330 911 aa11.59□□□□□ -0.55
UBE2B-208ENST00000511807 C6orf106Q9H6K1 298 aaPredicted RBP11.59□□□□□ -0.55
UBE2B-208ENST00000511807 TM7SF3Q9NS93 570 aa11.59□□□□□ -0.55
UBE2B-208ENST00000511807 KLHL11Q9NVR0 708 aa11.59□□□□□ -0.55
UBE2B-208ENST00000511807 CWC15Q9P013 229 aaKnown RBP11.59□□□□□ -0.55
UBE2B-208ENST00000511807 PPARGC1AQ9UBK2 798 aaKnown RBP11.59□□□□□ -0.55
UBE2B-208ENST00000511807 XPO7Q9UIA9 1087 aaKnown RBP11.59□□□□□ -0.55
UBE2B-208ENST00000511807 APOBEC2Q9Y235 224 aaKnown RBP11.59□□□□□ -0.55
UBE2B-208ENST00000511807 FNDC3AQ9Y2H6 1198 aaKnown RBP11.59□□□□□ -0.55
UBE2B-208ENST00000511807 PCDH15Q96QU1 1955 aa11.59□□□□□ -0.55
UBE2B-208ENST00000511807 LAMA1P25391 3075 aa11.58□□□□□ -0.55
UBE2B-208ENST00000511807 A0A1B0GVT2 93 aa11.58□□□□□ -0.56
UBE2B-208ENST00000511807 C3orf70A6NLC5 250 aaPredicted RBP11.58□□□□□ -0.56
UBE2B-208ENST00000511807 DRGXA6NNA5 263 aa11.58□□□□□ -0.56
UBE2B-208ENST00000511807 FAM72CH0Y354 149 aa11.58□□□□□ -0.56
UBE2B-208ENST00000511807 LRIG2O94898 1065 aa11.58□□□□□ -0.56
UBE2B-208ENST00000511807 TJP3O95049 919 aa11.58□□□□□ -0.56
UBE2B-208ENST00000511807 FSBPO95073 299 aa11.58□□□□□ -0.56
UBE2B-208ENST00000511807 ATP5BP06576 529 aaKnown RBP11.58□□□□□ -0.56
UBE2B-208ENST00000511807 DLDP09622 509 aaKnown RBP11.58□□□□□ -0.56
UBE2B-208ENST00000511807 GOT1P17174 413 aa11.58□□□□□ -0.56
UBE2B-208ENST00000511807 EPHB2P29323 1055 aa11.58□□□□□ -0.56
UBE2B-208ENST00000511807 CD70P32970 193 aa11.58□□□□□ -0.56
UBE2B-208ENST00000511807 CDKN2BP42772 138 aa11.58□□□□□ -0.56
UBE2B-208ENST00000511807 PAFAH1B1P43034 410 aa11.58□□□□□ -0.56
UBE2B-208ENST00000511807 RPS14P62263 151 aaKnown RBP11.58□□□□□ -0.56
UBE2B-208ENST00000511807 PTPRNQ16849 979 aa11.58□□□□□ -0.56
UBE2B-208ENST00000511807 C5orf22Q49AR2 442 aa11.58□□□□□ -0.56
UBE2B-208ENST00000511807 FAM133BQ5BKY9 247 aaKnown RBP11.58□□□□□ -0.56
UBE2B-208ENST00000511807 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa11.58□□□□□ -0.56
UBE2B-208ENST00000511807 CCDC181Q5TID7 509 aa11.58□□□□□ -0.56
UBE2B-208ENST00000511807 FAM72AQ5TYM5 149 aa11.58□□□□□ -0.56
UBE2B-208ENST00000511807 TTC39BQ5VTQ0 682 aaPredicted RBP11.58□□□□□ -0.56
UBE2B-208ENST00000511807 NADSYN1Q6IA69 706 aa11.58□□□□□ -0.56
UBE2B-208ENST00000511807 FAM72DQ6L9T8 149 aa11.58□□□□□ -0.56
UBE2B-208ENST00000511807 RWDD4Q6NW29 188 aaKnown RBP11.58□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.4 ms