RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000499624.3

GABPB1-AS1-202, GABPB1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene GABPB1-AS1, Length 16,182 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 MINDY2Q8NBR6 621 aa4.58□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 SLC29A3Q9BZD2 475 aa4.58□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 PIGVQ9NUD9 493 aa4.58□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 TBX20Q9UMR3 447 aa4.58□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 V9GYQ6 96 aa4.58□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 LY86O95711 162 aa4.58□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 OTCP00480 354 aa4.58□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 TWF1Q12792 350 aa4.58□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 ATP1A4Q13733 1029 aa4.58□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 SYT16Q17RD7 645 aa4.58□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 FAM209AQ5JX71 171 aa4.58□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 TYW1BQ6NUM6 668 aa4.58□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 LCTLQ6UWM7 567 aa4.58□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 DEFB132Q7Z7B7 95 aa4.58□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 ACTRT1Q8TDG2 376 aa4.58□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 FOXJ1Q92949 421 aa4.58□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 C8orf33Q9H7E9 229 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 PRORSD1PA6NEY8 169 aa4.58□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 CLDN4O14493 209 aa4.58□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 SNAP91O60641 907 aa4.58□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 WDR47O94967 919 aa4.58□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 YWHAQP27348 245 aa4.58□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 TNFRSF8P28908 595 aa4.58□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 EIF2S3LQ2VIR3 472 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 SHQ1Q6PI26 577 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 FSTL5Q8N475 847 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 KCNS3Q9BQ31 491 aa4.58□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 ILKAPQ9H0C8 392 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 GREM2Q9H772 168 aa4.58□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 PFDN2Q9UHV9 154 aa4.58□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 CACNB4O00305 520 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 TRAFD1O14545 582 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 CPA1P15085 419 aa4.58□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 PTGS1P23219 599 aa4.58□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 HOXC13P31276 330 aa4.58□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 ACSL1P33121 698 aa4.58□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 MLLT3P42568 568 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 FGFBP1Q14512 234 aa4.58□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 MPZL3Q6UWV2 235 aa4.58□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 FAM220AQ7Z4H9 259 aa4.58□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 ELMO1Q92556 727 aa4.58□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 KIAA1143Q96AT1 154 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 KLHL29Q96CT2 875 aa4.58□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 NMD3Q96D46 503 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 MYO19Q96H55 970 aa4.58□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 FAM83CQ9BQN1 747 aa4.58□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 AXIN2Q9Y2T1 843 aa4.58□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 MYL3P08590 195 aa4.58□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 POLR2EP19388 210 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 GPD1P21695 349 aa4.58□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 GMFBP60983 142 aa4.58□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 FAM98BQ52LJ0 330 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 G2E3Q7L622 706 aa4.58□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 RRP15Q9Y3B9 282 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 MAPK3P27361 379 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 OXTRP30559 389 aa4.58□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 VIPR1P32241 457 aa4.58□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 PRKCIP41743 596 aa4.58□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 ERVK-9P63128 1117 aa4.58□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 ERVK-24P63145 666 aa4.58□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 EOGTQ5NDL2 527 aa4.58□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 PPM1LQ5SGD2 360 aa4.58□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 SYTL1Q8IYJ3 562 aa4.58□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 ASCC1Q8N9N2 400 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 DUSP23Q9BVJ7 150 aa4.58□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 NMRAL1Q9HBL8 299 aa4.58□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 PAQR5Q9NXK6 330 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 CKLFQ9UBR5 152 aa4.58□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 SIX4Q9UIU6 781 aa4.58□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 CLCA2Q9UQC9 943 aa4.58□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 ICE1Q9Y2F5 2266 aa4.58□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 ADAMTS3O15072 1205 aa4.58□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 CLDN11O75508 207 aa4.58□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 RARAP10276 462 aa4.58□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 ASB18Q6ZVZ8 466 aa4.58□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 MON1AQ86VX9 555 aa4.58□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 SLAMF9Q96A28 289 aa4.58□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 AGXT2Q9BYV1 514 aa4.58□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 PHPT1Q9NRX4 125 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 GGA3Q9NZ52 723 aa4.58□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 TCP10L2B9ZVM9 353 aa4.58□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 TYK2P29597 1187 aa4.58□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 CDH5P33151 784 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 C21orf59P57076 290 aa4.58□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 NFKB2Q00653 900 aa4.58□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 MRPL49Q13405 166 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 PCED1AQ9H1Q7 454 aa4.58□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 FASTKD2Q9NYY8 710 aaKnown RBP eCLIP4.58□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 CCDC154A6NI56 674 aa4.58□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 GJE1A6NN92 205 aa4.58□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 ABHD2P08910 425 aa4.58□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 UMPSP11172 480 aa4.58□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 62.7 ms