RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498007.1

HLA-B-255, Transcript of major histocompatibility complex, class I, B, humanhuman

Gene HLA-B, Length 1,087 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-B-255ENST00000498007 OR2AP1Q8NGE2 309 aa20.13■□□□□ 0.81
HLA-B-255ENST00000498007 TOE1Q96GM8 510 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
HLA-B-255ENST00000498007 RBM41Q96IZ5 413 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
HLA-B-255ENST00000498007 OMDQ99983 421 aa20.13■□□□□ 0.81
HLA-B-255ENST00000498007 DUSP15Q9H1R2 295 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
HLA-B-255ENST00000498007 KCNF1Q9H3M0 494 aa20.13■□□□□ 0.81
HLA-B-255ENST00000498007 FBXL12Q9NXK8 326 aa20.13■□□□□ 0.81
HLA-B-255ENST00000498007 HECAQ9UBI9 543 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
HLA-B-255ENST00000498007 SERGEFQ9UGK8 458 aa20.13■□□□□ 0.81
HLA-B-255ENST00000498007 AMFRQ9UKV5 643 aa20.13■□□□□ 0.81
HLA-B-255ENST00000498007 SCML1Q9UN30 329 aa20.13■□□□□ 0.81
HLA-B-255ENST00000498007 PACSIN2Q9UNF0 486 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
HLA-B-255ENST00000498007 PPP2R2CQ9Y2T4 447 aa20.13■□□□□ 0.81
HLA-B-255ENST00000498007 HEY1Q9Y5J3 304 aa20.13■□□□□ 0.81
HLA-B-255ENST00000498007 MSANTD3-TMEFF1A0A0A6YYJ0 341 aa20.12■□□□□ 0.81
HLA-B-255ENST00000498007 CCDC66A2RUB6 948 aa20.12■□□□□ 0.81
HLA-B-255ENST00000498007 PRR23AA6NEV1 266 aa20.12■□□□□ 0.81
HLA-B-255ENST00000498007 KPNA3O00505 521 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
HLA-B-255ENST00000498007 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP20.12■□□□□ 0.81
HLA-B-255ENST00000498007 IGSF6O95976 241 aa20.12■□□□□ 0.81
HLA-B-255ENST00000498007 GSRP00390 522 aa20.12■□□□□ 0.81
HLA-B-255ENST00000498007 KRT10P13645 584 aa20.12■□□□□ 0.81
HLA-B-255ENST00000498007 C5AR1P21730 350 aa20.12■□□□□ 0.81
HLA-B-255ENST00000498007 CTNNA2P26232 953 aa20.12■□□□□ 0.81
HLA-B-255ENST00000498007 OXTRP30559 389 aa20.12■□□□□ 0.81
HLA-B-255ENST00000498007 GKP32189 559 aa20.12■□□□□ 0.81
HLA-B-255ENST00000498007 PLA2G5P39877 138 aa20.12■□□□□ 0.81
HLA-B-255ENST00000498007 GALNT2Q10471 571 aa20.12■□□□□ 0.81
HLA-B-255ENST00000498007 CYTH1Q15438 398 aa20.12■□□□□ 0.81
HLA-B-255ENST00000498007 ARSIQ5FYB1 569 aa20.12■□□□□ 0.81
HLA-B-255ENST00000498007 FAM46CQ5VWP2 391 aa20.12■□□□□ 0.81
HLA-B-255ENST00000498007 PMS2CLQ68D20 193 aa20.12■□□□□ 0.81
HLA-B-255ENST00000498007 SLC9A4Q6AI14 798 aa20.12■□□□□ 0.81
HLA-B-255ENST00000498007 LPCAT2Q7L5N7 544 aa20.12■□□□□ 0.81
HLA-B-255ENST00000498007 ASCL5Q7RTU5 278 aa20.12■□□□□ 0.81
HLA-B-255ENST00000498007 TMEFF1Q8IYR6 380 aa20.12■□□□□ 0.81
HLA-B-255ENST00000498007 HDDC3Q8N4P3 179 aa20.12■□□□□ 0.81
HLA-B-255ENST00000498007 AADATQ8N5Z0 425 aa20.12■□□□□ 0.81
HLA-B-255ENST00000498007 PLD5Q8N7P1 536 aa20.12■□□□□ 0.81
HLA-B-255ENST00000498007 EXD1Q8NHP7 514 aa20.12■□□□□ 0.81
HLA-B-255ENST00000498007 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa20.12■□□□□ 0.81
HLA-B-255ENST00000498007 CINPQ9BW66 212 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
HLA-B-255ENST00000498007 LHX3Q9UBR4 397 aa20.12■□□□□ 0.81
HLA-B-255ENST00000498007 PPM1HQ9ULR3 514 aa20.12■□□□□ 0.81
HLA-B-255ENST00000498007 NCKAP1Q9Y2A7 1128 aa20.12■□□□□ 0.81
HLA-B-255ENST00000498007 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa20.12■□□□□ 0.81
HLA-B-255ENST00000498007 THADAQ6YHU6 1953 aa20.12■□□□□ 0.81
HLA-B-255ENST00000498007 PLK4O00444 970 aa20.11■□□□□ 0.81
HLA-B-255ENST00000498007 KRIT1O00522 736 aa20.11■□□□□ 0.81
HLA-B-255ENST00000498007 MAFKO60675 156 aa20.11■□□□□ 0.81
HLA-B-255ENST00000498007 LEFTY1O75610 366 aa20.11■□□□□ 0.81
HLA-B-255ENST00000498007 RHOBTB1O94844 696 aa20.11■□□□□ 0.81
HLA-B-255ENST00000498007 IGLV3-19P01714 112 aa20.11■□□□□ 0.81
HLA-B-255ENST00000498007 PRNPP04156 253 aa20.11■□□□□ 0.81
HLA-B-255ENST00000498007 C7P10643 843 aa20.11■□□□□ 0.81
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HLA-B-255ENST00000498007 SFSWAPQ12872 951 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
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HLA-B-255ENST00000498007 LAIR1Q6GTX8 287 aa20.11■□□□□ 0.81
HLA-B-255ENST00000498007 NPNTQ6UXI9 565 aa20.11■□□□□ 0.81
HLA-B-255ENST00000498007 RCOR2Q8IZ40 523 aa20.11■□□□□ 0.81
HLA-B-255ENST00000498007 LRRN4Q8WUT4 740 aa20.11■□□□□ 0.81
HLA-B-255ENST00000498007 NSMCE1Q8WV22 266 aa20.11■□□□□ 0.81
HLA-B-255ENST00000498007 ZC3H10Q96K80 434 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
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HLA-B-255ENST00000498007 HEPHQ9BQS7 1158 aa20.11■□□□□ 0.81
HLA-B-255ENST00000498007 GPR174Q9BXC1 333 aa20.11■□□□□ 0.81
HLA-B-255ENST00000498007 WSB2Q9NYS7 404 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
HLA-B-255ENST00000498007 DTLQ9NZJ0 730 aa20.11■□□□□ 0.81
HLA-B-255ENST00000498007 NCDNQ9UBB6 729 aa20.11■□□□□ 0.81
HLA-B-255ENST00000498007 GMEB2Q9UKD1 530 aa20.11■□□□□ 0.81
HLA-B-255ENST00000498007 WASF2Q9Y6W5 498 aa20.11■□□□□ 0.81
HLA-B-255ENST00000498007 CEP192Q8TEP8 1941 aa20.11■□□□□ 0.81
HLA-B-255ENST00000498007 SPAG17Q6Q759 2223 aa20.11■□□□□ 0.81
HLA-B-255ENST00000498007 hCG_1818297A0A087WSY0 165 aa20.1■□□□□ 0.81
HLA-B-255ENST00000498007 RNF103O00237 685 aa20.1■□□□□ 0.81
HLA-B-255ENST00000498007 ZFXP17010 805 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
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HLA-B-255ENST00000498007 ZNF235Q14590 738 aa20.1■□□□□ 0.81
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HLA-B-255ENST00000498007 DYRK4Q9NR20 520 aa20.1■□□□□ 0.81
HLA-B-255ENST00000498007 EVLQ9UI08 416 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
HLA-B-255ENST00000498007 GFRA3O60609 400 aa20.09■□□□□ 0.81
HLA-B-255ENST00000498007 CST8O60676 142 aa20.09■□□□□ 0.81
HLA-B-255ENST00000498007 MX2P20592 715 aa20.09■□□□□ 0.81
HLA-B-255ENST00000498007 DRD3P35462 400 aa20.09■□□□□ 0.81
HLA-B-255ENST00000498007 SLC10A7Q0GE19 358 aa20.09■□□□□ 0.81
HLA-B-255ENST00000498007 SLC10A2Q12908 348 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
HLA-B-255ENST00000498007 TFDP2Q14188 446 aa20.09■□□□□ 0.81
HLA-B-255ENST00000498007 TAZQ16635 292 aa20.09■□□□□ 0.81
HLA-B-255ENST00000498007 MYLK3Q32MK0 819 aa20.09■□□□□ 0.81
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