RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496567.5

C9orf3-222, Transcript of chromosome 9 open reading frame 3, humanhuman

TSL 5

Gene C9orf3, Length 1,575 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf3-222ENST00000496567 CCDC188H7C350 402 aa22.11■■□□□ 1.13
C9orf3-222ENST00000496567 SYNCRIPO60506 623 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
C9orf3-222ENST00000496567 PHF2O75151 1096 aa22.11■■□□□ 1.13
C9orf3-222ENST00000496567 PDGFBP01127 241 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
C9orf3-222ENST00000496567 HLA-EP13747 358 aa22.11■■□□□ 1.13
C9orf3-222ENST00000496567 PRKCHP24723 683 aa22.11■■□□□ 1.13
C9orf3-222ENST00000496567 WASP42768 502 aa22.11■■□□□ 1.13
C9orf3-222ENST00000496567 RECQLP46063 649 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
C9orf3-222ENST00000496567 SNRPD1P62314 119 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
C9orf3-222ENST00000496567 LMNB2Q03252 620 aa22.11■■□□□ 1.13
C9orf3-222ENST00000496567 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP22.11■■□□□ 1.13
C9orf3-222ENST00000496567 STARD3Q14849 445 aa22.11■■□□□ 1.13
C9orf3-222ENST00000496567 CWF19L1Q69YN2 538 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
C9orf3-222ENST00000496567 Q6ZS52 159 aa22.11■■□□□ 1.13
C9orf3-222ENST00000496567 PLPP6Q8IY26 295 aa22.11■■□□□ 1.13
C9orf3-222ENST00000496567 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
C9orf3-222ENST00000496567 PTPRN2Q92932 1015 aa22.11■■□□□ 1.13
C9orf3-222ENST00000496567 CHRDQ9H2X0 955 aa22.11■■□□□ 1.13
C9orf3-222ENST00000496567 FEZ2Q9UHY8 353 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
C9orf3-222ENST00000496567 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
C9orf3-222ENST00000496567 TECTAO75443 2155 aa22.1■■□□□ 1.13
C9orf3-222ENST00000496567 A0A0C4DFX4 3053 aa22.1■■□□□ 1.13
C9orf3-222ENST00000496567 RNF103O00237 685 aa22.1■■□□□ 1.13
C9orf3-222ENST00000496567 ZNF821O75541 412 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
C9orf3-222ENST00000496567 GSRP00390 522 aa22.1■■□□□ 1.13
C9orf3-222ENST00000496567 AOC1P19801 751 aa22.1■■□□□ 1.13
C9orf3-222ENST00000496567 PTPN3P26045 913 aa22.1■■□□□ 1.13
C9orf3-222ENST00000496567 CHRNA3P32297 505 aa22.1■■□□□ 1.13
C9orf3-222ENST00000496567 FNTAP49354 379 aa22.1■■□□□ 1.13
C9orf3-222ENST00000496567 CLCN5P51795 746 aa22.1■■□□□ 1.13
C9orf3-222ENST00000496567 WASHC5Q12768 1159 aa22.1■■□□□ 1.13
C9orf3-222ENST00000496567 ZBTB17Q13105 803 aa22.1■■□□□ 1.13
C9orf3-222ENST00000496567 CARD16Q5EG05 197 aa22.1■■□□□ 1.13
C9orf3-222ENST00000496567 Q6ZVU0 165 aa22.1■■□□□ 1.13
C9orf3-222ENST00000496567 ZNF366Q8N895 744 aa22.1■■□□□ 1.13
C9orf3-222ENST00000496567 OR2AP1Q8NGE2 309 aa22.1■■□□□ 1.13
C9orf3-222ENST00000496567 ATL2Q8NHH9 583 aa22.1■■□□□ 1.13
C9orf3-222ENST00000496567 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa22.1■■□□□ 1.13
C9orf3-222ENST00000496567 TNKS2Q9H2K2 1166 aa22.1■■□□□ 1.13
C9orf3-222ENST00000496567 NT5MQ9NPB1 228 aa22.1■■□□□ 1.13
C9orf3-222ENST00000496567 LHX3Q9UBR4 397 aa22.1■■□□□ 1.13
C9orf3-222ENST00000496567 TRHDEQ9UKU6 1024 aa22.1■■□□□ 1.13
C9orf3-222ENST00000496567 ATG2BQ96BY7 2078 aa22.1■■□□□ 1.13
C9orf3-222ENST00000496567 SGK1O00141 431 aa22.09■■□□□ 1.13
C9orf3-222ENST00000496567 ADAM23O75077 832 aa22.09■■□□□ 1.13
C9orf3-222ENST00000496567 IGSF6O95976 241 aa22.09■■□□□ 1.13
C9orf3-222ENST00000496567 DCNP07585 359 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
C9orf3-222ENST00000496567 HOXB2P14652 356 aa22.09■■□□□ 1.13
C9orf3-222ENST00000496567 COILP38432 576 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
C9orf3-222ENST00000496567 CCDC137Q6PK04 289 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
C9orf3-222ENST00000496567 FAM71DQ8N9W8 422 aa22.09■■□□□ 1.13
C9orf3-222ENST00000496567 TEKT5Q96M29 485 aa22.09■■□□□ 1.13
C9orf3-222ENST00000496567 MGME1Q9BQP7 344 aa22.09■■□□□ 1.13
C9orf3-222ENST00000496567 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
C9orf3-222ENST00000496567 TM6SF2Q9BZW4 377 aa22.09■■□□□ 1.13
C9orf3-222ENST00000496567 POLR1EQ9GZS1 481 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
C9orf3-222ENST00000496567 KLHL8Q9P2G9 620 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
C9orf3-222ENST00000496567 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa22.09■■□□□ 1.13
C9orf3-222ENST00000496567 BNIP3LO60238 219 aa22.08■■□□□ 1.13
C9orf3-222ENST00000496567 CES1P23141 567 aa22.08■■□□□ 1.13
C9orf3-222ENST00000496567 KCNJ1P48048 391 aa22.08■■□□□ 1.13
C9orf3-222ENST00000496567 CSNK1DP48730 415 aa22.08■■□□□ 1.13
C9orf3-222ENST00000496567 ITKQ08881 620 aa22.08■■□□□ 1.13
C9orf3-222ENST00000496567 C9orf64Q5T6V5 341 aa22.08■■□□□ 1.13
C9orf3-222ENST00000496567 SYT13Q7L8C5 426 aa22.08■■□□□ 1.13
C9orf3-222ENST00000496567 GSTA5Q7RTV2 222 aa22.08■■□□□ 1.13
C9orf3-222ENST00000496567 ZNF572Q7Z3I7 529 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
C9orf3-222ENST00000496567 SPEM1Q8N4L4 309 aa22.08■■□□□ 1.13
C9orf3-222ENST00000496567 SPATA4Q8NEY3 305 aa22.08■■□□□ 1.13
C9orf3-222ENST00000496567 OR2A12Q8NGT7 310 aa22.08■■□□□ 1.13
C9orf3-222ENST00000496567 GRK7Q8WTQ7 553 aa22.08■■□□□ 1.13
C9orf3-222ENST00000496567 PBXIP1Q96AQ6 731 aa22.08■■□□□ 1.13
C9orf3-222ENST00000496567 RTP4Q96DX8 246 aa22.08■■□□□ 1.13
C9orf3-222ENST00000496567 RUNDC3BQ96NL0 473 aa22.08■■□□□ 1.13
C9orf3-222ENST00000496567 AGAP3Q96P47 875 aa22.08■■□□□ 1.13
C9orf3-222ENST00000496567 CEP41Q9BYV8 373 aa22.08■■□□□ 1.13
C9orf3-222ENST00000496567 TTLL3Q9Y4R7 772 aa22.08■■□□□ 1.13
C9orf3-222ENST00000496567 C5orf60A6NFR6 353 aa22.08■■□□□ 1.12
C9orf3-222ENST00000496567 SIN3BO75182 1162 aa22.08■■□□□ 1.12
C9orf3-222ENST00000496567 HLA-DQB2P05538 268 aa22.08■■□□□ 1.12
C9orf3-222ENST00000496567 ACTN2P35609 894 aa22.08■■□□□ 1.12
C9orf3-222ENST00000496567 RAD51Q06609 339 aa22.08■■□□□ 1.12
C9orf3-222ENST00000496567 CAMK2GQ13555 558 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.12
C9orf3-222ENST00000496567 GAS6Q14393 721 aa22.08■■□□□ 1.12
C9orf3-222ENST00000496567 RALGPS1Q5JS13 557 aa22.08■■□□□ 1.12
C9orf3-222ENST00000496567 PKN3Q6P5Z2 889 aa22.08■■□□□ 1.12
C9orf3-222ENST00000496567 PID1Q7Z2X4 250 aa22.08■■□□□ 1.12
C9orf3-222ENST00000496567 BMP8AQ7Z5Y6 402 aa22.08■■□□□ 1.12
C9orf3-222ENST00000496567 ZNF567Q8N184 647 aa22.08■■□□□ 1.12
C9orf3-222ENST00000496567 PGBD5Q8N414 524 aa22.08■■□□□ 1.12
C9orf3-222ENST00000496567 CNTD1Q8N815 330 aa22.08■■□□□ 1.12
C9orf3-222ENST00000496567 ZNF419Q96HQ0 510 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.12
C9orf3-222ENST00000496567 MTG2Q9H4K7 406 aa22.08■■□□□ 1.12
C9orf3-222ENST00000496567 FBRSQ9HAH7 460 aa22.08■■□□□ 1.12
C9orf3-222ENST00000496567 PRSS16Q9NQE7 514 aa22.08■■□□□ 1.12
C9orf3-222ENST00000496567 MUSKO15146 869 aa22.07■■□□□ 1.12
C9orf3-222ENST00000496567 OPHN1O60890 802 aa22.07■■□□□ 1.12
C9orf3-222ENST00000496567 POP4O95707 220 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
C9orf3-222ENST00000496567 MAPK8P45983 427 aa22.07■■□□□ 1.12
C9orf3-222ENST00000496567 SCNN1BP51168 640 aa22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34 ms