RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489554.1

SCAMP4-208, Transcript of secretory carrier membrane protein 4, human

TSL 3

Gene SCAMP4, Length 573 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SCAMP4-208	ENST00000489554	BCAT2	O15382	392 aa	Predicted RBP	10.79	□□□□□ -0.68
SCAMP4-208	ENST00000489554	OPHN1	O60890	802 aa		10.79	□□□□□ -0.68
SCAMP4-208	ENST00000489554	SRGAP2	O75044	1071 aa		10.79	□□□□□ -0.68
SCAMP4-208	ENST00000489554	ADH1B	P00325	375 aa		10.79	□□□□□ -0.68
SCAMP4-208	ENST00000489554	RHOC	P08134	193 aa		10.79	□□□□□ -0.68
SCAMP4-208	ENST00000489554	KRT7	P08729	469 aa		10.79	□□□□□ -0.68
SCAMP4-208	ENST00000489554	PRLR	P16471	622 aa		10.79	□□□□□ -0.68
SCAMP4-208	ENST00000489554	MAOB	P27338	520 aa		10.79	□□□□□ -0.68
SCAMP4-208	ENST00000489554	CXCR5	P32302	372 aa		10.79	□□□□□ -0.68
SCAMP4-208	ENST00000489554	ACSL1	P33121	698 aa		10.79	□□□□□ -0.68
SCAMP4-208	ENST00000489554	GGCX	P38435	758 aa		10.79	□□□□□ -0.68
SCAMP4-208	ENST00000489554	STK19	P49842	368 aa	Predicted RBP	10.79	□□□□□ -0.68
SCAMP4-208	ENST00000489554	NOVA1	P51513	510 aa	Known RBP	10.79	□□□□□ -0.68
SCAMP4-208	ENST00000489554	DNA2	P51530	1060 aa		10.79	□□□□□ -0.68
SCAMP4-208	ENST00000489554	IRAK1	P51617	712 aa		10.79	□□□□□ -0.68
SCAMP4-208	ENST00000489554	ADCY2	Q08462	1091 aa		10.79	□□□□□ -0.68
SCAMP4-208	ENST00000489554	ZNF211	Q13398	564 aa	Predicted RBP	10.79	□□□□□ -0.68
SCAMP4-208	ENST00000489554	DPYSL3	Q14195	570 aa		10.79	□□□□□ -0.68
SCAMP4-208	ENST00000489554	UAP1L1	Q3KQV9	507 aa		10.79	□□□□□ -0.68
SCAMP4-208	ENST00000489554	ARL13B	Q3SXY8	428 aa		10.79	□□□□□ -0.68
SCAMP4-208	ENST00000489554	BOLA3	Q53S33	107 aa		10.79	□□□□□ -0.68
SCAMP4-208	ENST00000489554	MFSD7	Q6UXD7	560 aa		10.79	□□□□□ -0.68
SCAMP4-208	ENST00000489554	DSG4	Q86SJ6	1040 aa		10.79	□□□□□ -0.68
SCAMP4-208	ENST00000489554	SETD3	Q86TU7	594 aa	Predicted RBP	10.79	□□□□□ -0.68
SCAMP4-208	ENST00000489554	PSTK	Q8IV42	348 aa	Known RBP	10.79	□□□□□ -0.68
SCAMP4-208	ENST00000489554	MMAA	Q8IVH4	418 aa	Known RBP	10.79	□□□□□ -0.68
SCAMP4-208	ENST00000489554	RASGEF1C	Q8N431	466 aa		10.79	□□□□□ -0.68
SCAMP4-208	ENST00000489554	HDDC3	Q8N4P3	179 aa		10.79	□□□□□ -0.68
SCAMP4-208	ENST00000489554	CEP112	Q8N8E3	955 aa		10.79	□□□□□ -0.68
SCAMP4-208	ENST00000489554	MNS1	Q8NEH6	495 aa		10.79	□□□□□ -0.68
SCAMP4-208	ENST00000489554	EXD1	Q8NHP7	514 aa		10.79	□□□□□ -0.68
SCAMP4-208	ENST00000489554	GANC	Q8TET4	914 aa		10.79	□□□□□ -0.68
SCAMP4-208	ENST00000489554	HSPH1	Q92598	858 aa		10.79	□□□□□ -0.68
SCAMP4-208	ENST00000489554	PTPRN2	Q92932	1015 aa		10.79	□□□□□ -0.68
SCAMP4-208	ENST00000489554	FAF2	Q96CS3	445 aa		10.79	□□□□□ -0.68
SCAMP4-208	ENST00000489554	ALG14	Q96F25	216 aa		10.79	□□□□□ -0.68
SCAMP4-208	ENST00000489554	OSBPL9	Q96SU4	736 aa		10.79	□□□□□ -0.68
SCAMP4-208	ENST00000489554	PSMB7	Q99436	277 aa		10.79	□□□□□ -0.68
SCAMP4-208	ENST00000489554	C2orf49	Q9BVC5	232 aa	Predicted RBP	10.79	□□□□□ -0.68
SCAMP4-208	ENST00000489554	GTPBP2	Q9BX10	602 aa	Known RBP	10.79	□□□□□ -0.68
SCAMP4-208	ENST00000489554	MUC3B	Q9H195	1237 aa		10.79	□□□□□ -0.68
SCAMP4-208	ENST00000489554	MIR1-1HG	Q9H1L0	117 aa		10.79	□□□□□ -0.68
SCAMP4-208	ENST00000489554	CARD9	Q9H257	536 aa		10.79	□□□□□ -0.68
SCAMP4-208	ENST00000489554	STAU2	Q9NUL3	570 aa	Known RBP eCLIP	10.79	□□□□□ -0.68
SCAMP4-208	ENST00000489554	FBXL12	Q9NXK8	326 aa		10.79	□□□□□ -0.68
SCAMP4-208	ENST00000489554	EIF2B4	Q9UI10	523 aa	Known RBP	10.79	□□□□□ -0.68
SCAMP4-208	ENST00000489554	VPS28	Q9UK41	221 aa		10.79	□□□□□ -0.68
SCAMP4-208	ENST00000489554	FZD4	Q9ULV1	537 aa		10.79	□□□□□ -0.68
SCAMP4-208	ENST00000489554	AP4E1	Q9UPM8	1137 aa		10.79	□□□□□ -0.68
SCAMP4-208	ENST00000489554	OR51B4	Q9Y5P0	310 aa		10.79	□□□□□ -0.68
SCAMP4-208	ENST00000489554	DOCK4	Q8N1I0	1966 aa		10.79	□□□□□ -0.68
SCAMP4-208	ENST00000489554		E9PAM4	449 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SCAMP4-208	ENST00000489554	KCNK3	O14649	394 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SCAMP4-208	ENST00000489554	ZNF185	O15231	689 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SCAMP4-208	ENST00000489554	ATP9B	O43861	1147 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SCAMP4-208	ENST00000489554	URI1	O94763	535 aa	Predicted RBP	10.78	□□□□□ -0.68
SCAMP4-208	ENST00000489554	CNTN5	O94779	1100 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SCAMP4-208	ENST00000489554	KRT1	P04264	644 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SCAMP4-208	ENST00000489554	CEACAM1	P13688	526 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SCAMP4-208	ENST00000489554	C5AR1	P21730	350 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SCAMP4-208	ENST00000489554	KDELR1	P24390	212 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SCAMP4-208	ENST00000489554	SLC8A1	P32418	973 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SCAMP4-208	ENST00000489554	PTPN7	P35236	360 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SCAMP4-208	ENST00000489554	CDKN2B	P42772	138 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SCAMP4-208	ENST00000489554	SSR1	P43307	286 aa	Known RBP	10.78	□□□□□ -0.68
SCAMP4-208	ENST00000489554	AIF1	P55008	147 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SCAMP4-208	ENST00000489554	RWDD2B	P57060	319 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SCAMP4-208	ENST00000489554	NRG1	Q02297	640 aa	Predicted RBP	10.78	□□□□□ -0.68
SCAMP4-208	ENST00000489554	MMRN1	Q13201	1228 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SCAMP4-208	ENST00000489554	HADH	Q16836	314 aa	Known RBP	10.78	□□□□□ -0.68
SCAMP4-208	ENST00000489554	ALF	Q53S48	1182 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SCAMP4-208	ENST00000489554	C6orf118	Q5T5N4	469 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SCAMP4-208	ENST00000489554	PSAPL1	Q6NUJ1	521 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SCAMP4-208	ENST00000489554	ZNF783	Q6ZMS7	281 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SCAMP4-208	ENST00000489554	CREG2	Q8IUH2	290 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SCAMP4-208	ENST00000489554	STK40	Q8N2I9	435 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SCAMP4-208	ENST00000489554	ZCCHC9	Q8N567	271 aa	Known RBP	10.78	□□□□□ -0.68
SCAMP4-208	ENST00000489554	MINDY1	Q8N5J2	469 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SCAMP4-208	ENST00000489554	OR52K2	Q8NGK3	314 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SCAMP4-208	ENST00000489554	FRS2	Q8WU20	508 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SCAMP4-208	ENST00000489554	SNX19	Q92543	992 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SCAMP4-208	ENST00000489554	FAM129B	Q96TA1	746 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SCAMP4-208	ENST00000489554	OMD	Q99983	421 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SCAMP4-208	ENST00000489554	OSBPL2	Q9H1P3	480 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SCAMP4-208	ENST00000489554	SLC32A1	Q9H598	525 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SCAMP4-208	ENST00000489554	C6orf106	Q9H6K1	298 aa	Predicted RBP	10.78	□□□□□ -0.68
SCAMP4-208	ENST00000489554	FSCN3	Q9NQT6	498 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SCAMP4-208	ENST00000489554	DNAAF2	Q9NVR5	837 aa	Known RBP	10.78	□□□□□ -0.68
SCAMP4-208	ENST00000489554	DDX56	Q9NY93	547 aa	Known RBP	10.78	□□□□□ -0.68
SCAMP4-208	ENST00000489554	SMARCAL1	Q9NZC9	954 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SCAMP4-208	ENST00000489554	TPX2	Q9ULW0	747 aa	Known RBP	10.78	□□□□□ -0.68
SCAMP4-208	ENST00000489554	ZBTB32	Q9Y2Y4	487 aa	Predicted RBP	10.78	□□□□□ -0.68
SCAMP4-208	ENST00000489554	GON4L	Q3T8J9	2241 aa		10.77	□□□□□ -0.68
SCAMP4-208	ENST00000489554	hCG_1818297	A0A087WSY0	165 aa		10.77	□□□□□ -0.69
SCAMP4-208	ENST00000489554		A0A1W2PP55	124 aa		10.77	□□□□□ -0.69
SCAMP4-208	ENST00000489554	TCRBV7S2A1N4T	A0A589	114 aa		10.77	□□□□□ -0.69
SCAMP4-208	ENST00000489554	LRRC72	A6NJI9	287 aa		10.77	□□□□□ -0.69
SCAMP4-208	ENST00000489554	ZNF487	B1APH4	448 aa		10.77	□□□□□ -0.69
SCAMP4-208	ENST00000489554	PDE2A	O00408	941 aa	Predicted RBP	10.77	□□□□□ -0.69
SCAMP4-208	ENST00000489554	CES2	O00748	559 aa		10.77	□□□□□ -0.69

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