RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000447061.2

GAPDHP25-201, Transcript of glyceraldehyde 3 phosphate dehydrogenase pseudogene 25, humanhuman

BASIC

Gene GAPDHP25, Length 1,001 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPDHP25-201ENST00000447061 RBP3P10745 1247 aa5.49□□□□□ -1.53
GAPDHP25-201ENST00000447061 KRT10P13645 584 aa5.49□□□□□ -1.53
GAPDHP25-201ENST00000447061 JUNDP17535 347 aa5.49□□□□□ -1.53
GAPDHP25-201ENST00000447061 AOC1P19801 751 aa5.49□□□□□ -1.53
GAPDHP25-201ENST00000447061 CA4P22748 312 aa5.49□□□□□ -1.53
GAPDHP25-201ENST00000447061 TARSP26639 723 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
GAPDHP25-201ENST00000447061 NTSR1P30989 418 aa5.49□□□□□ -1.53
GAPDHP25-201ENST00000447061 HOXA6P31267 233 aa5.49□□□□□ -1.53
GAPDHP25-201ENST00000447061 ACVRL1P37023 503 aa5.49□□□□□ -1.53
GAPDHP25-201ENST00000447061 RECQLP46063 649 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
GAPDHP25-201ENST00000447061 FNTAP49354 379 aa5.49□□□□□ -1.53
GAPDHP25-201ENST00000447061 DNA2P51530 1060 aa5.49□□□□□ -1.53
GAPDHP25-201ENST00000447061 CCR3P51677 355 aa5.49□□□□□ -1.53
GAPDHP25-201ENST00000447061 DGKEP52429 567 aa5.49□□□□□ -1.53
GAPDHP25-201ENST00000447061 EIF3EP60228 445 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
GAPDHP25-201ENST00000447061 SNRPD1P62314 119 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
GAPDHP25-201ENST00000447061 ARF5P84085 180 aa5.49□□□□□ -1.53
GAPDHP25-201ENST00000447061 OTUD4Q01804 1114 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
GAPDHP25-201ENST00000447061 ZBTB16Q05516 673 aa5.49□□□□□ -1.53
GAPDHP25-201ENST00000447061 KDSRQ06136 332 aa5.49□□□□□ -1.53
GAPDHP25-201ENST00000447061 RAD51Q06609 339 aa5.49□□□□□ -1.53
GAPDHP25-201ENST00000447061 CCDC15Q0P6D6 951 aa5.49□□□□□ -1.53
GAPDHP25-201ENST00000447061 SLC10A2Q12908 348 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
GAPDHP25-201ENST00000447061 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
GAPDHP25-201ENST00000447061 ELAVL3Q14576 367 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
GAPDHP25-201ENST00000447061 ZNF234Q14588 700 aa5.49□□□□□ -1.53
GAPDHP25-201ENST00000447061 STARD3Q14849 445 aa5.49□□□□□ -1.53
GAPDHP25-201ENST00000447061 CYP1B1Q16678 543 aa5.49□□□□□ -1.53
GAPDHP25-201ENST00000447061 PTPRNQ16849 979 aa5.49□□□□□ -1.53
GAPDHP25-201ENST00000447061 WHAMMP3Q1A5X7 153 aa5.49□□□□□ -1.53
GAPDHP25-201ENST00000447061 LONRF2Q1L5Z9 754 aa5.49□□□□□ -1.53
GAPDHP25-201ENST00000447061 FNDC3BQ53EP0 1204 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
GAPDHP25-201ENST00000447061 SLC45A4Q5BKX6 768 aa5.49□□□□□ -1.53
GAPDHP25-201ENST00000447061 MARC1Q5VT66 337 aa5.49□□□□□ -1.53
GAPDHP25-201ENST00000447061 TMEM215Q68D42 235 aa5.49□□□□□ -1.53
GAPDHP25-201ENST00000447061 HEATR6Q6AI08 1181 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
GAPDHP25-201ENST00000447061 ALG1LQ6GMV1 187 aa5.49□□□□□ -1.53
GAPDHP25-201ENST00000447061 SYT10Q6XYQ8 523 aa5.49□□□□□ -1.53
GAPDHP25-201ENST00000447061 SYT13Q7L8C5 426 aa5.49□□□□□ -1.53
GAPDHP25-201ENST00000447061 DSG4Q86SJ6 1040 aa5.49□□□□□ -1.53
GAPDHP25-201ENST00000447061 RETREG3Q86VR2 466 aa5.49□□□□□ -1.53
GAPDHP25-201ENST00000447061 ZNF354CQ86Y25 554 aa5.49□□□□□ -1.53
GAPDHP25-201ENST00000447061 CHPFQ8IZ52 775 aa5.49□□□□□ -1.53
GAPDHP25-201ENST00000447061 ABCA7Q8IZY2 2146 aa5.49□□□□□ -1.53
GAPDHP25-201ENST00000447061 APCDD1Q8J025 514 aa5.49□□□□□ -1.53
GAPDHP25-201ENST00000447061 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
GAPDHP25-201ENST00000447061 SPEM1Q8N4L4 309 aa5.49□□□□□ -1.53
GAPDHP25-201ENST00000447061 ZNF513Q8N8E2 541 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
GAPDHP25-201ENST00000447061 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
GAPDHP25-201ENST00000447061 MNS1Q8NEH6 495 aa5.49□□□□□ -1.53
GAPDHP25-201ENST00000447061 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
GAPDHP25-201ENST00000447061 OR7D4Q8NG98 312 aa5.49□□□□□ -1.53
GAPDHP25-201ENST00000447061 OR52K2Q8NGK3 314 aa5.49□□□□□ -1.53
GAPDHP25-201ENST00000447061 TTC8Q8TAM2 541 aa5.49□□□□□ -1.53
GAPDHP25-201ENST00000447061 ACTL9Q8TC94 416 aa5.49□□□□□ -1.53
GAPDHP25-201ENST00000447061 CCHCR1Q8TD31 782 aa5.49□□□□□ -1.53
GAPDHP25-201ENST00000447061 HCAR2Q8TDS4 363 aa5.49□□□□□ -1.53
GAPDHP25-201ENST00000447061 GRK7Q8WTQ7 553 aa5.49□□□□□ -1.53
GAPDHP25-201ENST00000447061 FRS2Q8WU20 508 aa5.49□□□□□ -1.53
GAPDHP25-201ENST00000447061 RTP4Q96DX8 246 aa5.49□□□□□ -1.53
GAPDHP25-201ENST00000447061 MYO19Q96H55 970 aa5.49□□□□□ -1.53
GAPDHP25-201ENST00000447061 CELF6Q96J87 481 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
GAPDHP25-201ENST00000447061 MRGPRX3Q96LB0 322 aa5.49□□□□□ -1.53
GAPDHP25-201ENST00000447061 NECAB3Q96P71 396 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
GAPDHP25-201ENST00000447061 PSKH2Q96QS6 385 aa5.49□□□□□ -1.53
GAPDHP25-201ENST00000447061 IL12RB2Q99665 862 aa5.49□□□□□ -1.53
GAPDHP25-201ENST00000447061 MGME1Q9BQP7 344 aa5.49□□□□□ -1.53
GAPDHP25-201ENST00000447061 CINPQ9BW66 212 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
GAPDHP25-201ENST00000447061 HEMGNQ9BXL5 484 aa5.49□□□□□ -1.53
GAPDHP25-201ENST00000447061 CPEB1Q9BZB8 566 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
GAPDHP25-201ENST00000447061 CIPCQ9C0C6 399 aa5.49□□□□□ -1.53
GAPDHP25-201ENST00000447061 MFSD1Q9H3U5 465 aa5.49□□□□□ -1.53
GAPDHP25-201ENST00000447061 CDC23Q9UJX2 597 aa5.49□□□□□ -1.53
GAPDHP25-201ENST00000447061 TRHDEQ9UKU6 1024 aa5.49□□□□□ -1.53
GAPDHP25-201ENST00000447061 MMP17Q9ULZ9 603 aa5.49□□□□□ -1.53
GAPDHP25-201ENST00000447061 SCML1Q9UN30 329 aa5.49□□□□□ -1.53
GAPDHP25-201ENST00000447061 SIT1Q9Y3P8 196 aa5.49□□□□□ -1.53
GAPDHP25-201ENST00000447061 MFHAS1Q9Y4C4 1052 aa5.49□□□□□ -1.53
GAPDHP25-201ENST00000447061 HEY1Q9Y5J3 304 aa5.49□□□□□ -1.53
GAPDHP25-201ENST00000447061 FAM186AA6NE01 2351 aa5.49□□□□□ -1.53
GAPDHP25-201ENST00000447061 CEP192Q8TEP8 1941 aa5.48□□□□□ -1.53
GAPDHP25-201ENST00000447061 A0A0C4DFX4 3053 aa5.48□□□□□ -1.53
GAPDHP25-201ENST00000447061 CCDC163A0A0D9SF12 145 aa5.48□□□□□ -1.53
GAPDHP25-201ENST00000447061 LOC107983988A0A1B0GUW6 1196 aaPredicted RBP5.48□□□□□ -1.53
GAPDHP25-201ENST00000447061 C5orf60A6NFR6 353 aa5.48□□□□□ -1.53
GAPDHP25-201ENST00000447061 H7C0C1 242 aa5.48□□□□□ -1.53
GAPDHP25-201ENST00000447061 KRIT1O00522 736 aa5.48□□□□□ -1.53
GAPDHP25-201ENST00000447061 NDC80O14777 642 aa5.48□□□□□ -1.53
GAPDHP25-201ENST00000447061 TRIM24O15164 1050 aa5.48□□□□□ -1.53
GAPDHP25-201ENST00000447061 ST8SIA5O15466 376 aa5.48□□□□□ -1.53
GAPDHP25-201ENST00000447061 LIASO43766 372 aa5.48□□□□□ -1.53
GAPDHP25-201ENST00000447061 SYNCRIPO60506 623 aaKnown RBP5.48□□□□□ -1.53
GAPDHP25-201ENST00000447061 SNAP91O60641 907 aa5.48□□□□□ -1.53
GAPDHP25-201ENST00000447061 GPR37L1O60883 481 aa5.48□□□□□ -1.53
GAPDHP25-201ENST00000447061 OPHN1O60890 802 aa5.48□□□□□ -1.53
GAPDHP25-201ENST00000447061 RNASEH1O60930 286 aaKnown RBP5.48□□□□□ -1.53
GAPDHP25-201ENST00000447061 NEBLO76041 1014 aa5.48□□□□□ -1.53
GAPDHP25-201ENST00000447061 ALDH1A2O94788 518 aa5.48□□□□□ -1.53
GAPDHP25-201ENST00000447061 TMCC1O94876 653 aa5.48□□□□□ -1.53
GAPDHP25-201ENST00000447061 POP4O95707 220 aaKnown RBP5.48□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 65.4 ms