RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428482.5

HDLBP-216, Transcript of high density lipoprotein binding protein, human

TSL 5

Gene HDLBP, Length 1,096 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HDLBP-216	ENST00000428482	ZSCAN12	O43309	604 aa		10.43	□□□□□ -0.74
HDLBP-216	ENST00000428482	RASA4	O43374	803 aa		10.43	□□□□□ -0.74
HDLBP-216	ENST00000428482	PLRG1	O43660	514 aa	Known RBP	10.43	□□□□□ -0.74
HDLBP-216	ENST00000428482	LEFTY1	O75610	366 aa		10.43	□□□□□ -0.74
HDLBP-216	ENST00000428482	NDUFA10	O95299	355 aa		10.43	□□□□□ -0.74
HDLBP-216	ENST00000428482	PIGN	O95427	931 aa		10.43	□□□□□ -0.74
HDLBP-216	ENST00000428482	CD48	P09326	243 aa		10.43	□□□□□ -0.74
HDLBP-216	ENST00000428482	PRLR	P16471	622 aa		10.43	□□□□□ -0.74
HDLBP-216	ENST00000428482	SPINK2	P20155	84 aa		10.43	□□□□□ -0.74
HDLBP-216	ENST00000428482	CYLC1	P35663	651 aa	Predicted RBP	10.43	□□□□□ -0.74
HDLBP-216	ENST00000428482	NOVA1	P51513	510 aa	Known RBP	10.43	□□□□□ -0.74
HDLBP-216	ENST00000428482	GALC	P54803	685 aa		10.43	□□□□□ -0.74
HDLBP-216	ENST00000428482	SULT2A1	Q06520	285 aa		10.43	□□□□□ -0.74
HDLBP-216	ENST00000428482	DUOXA1	Q1HG43	343 aa		10.43	□□□□□ -0.74
HDLBP-216	ENST00000428482	ARL13B	Q3SXY8	428 aa		10.43	□□□□□ -0.74
HDLBP-216	ENST00000428482	SEL1L3	Q68CR1	1132 aa		10.43	□□□□□ -0.74
HDLBP-216	ENST00000428482	ZNF354C	Q86Y25	554 aa		10.43	□□□□□ -0.74
HDLBP-216	ENST00000428482	OR14C36	Q8NHC7	312 aa		10.43	□□□□□ -0.74
HDLBP-216	ENST00000428482	UBE2Q2	Q8WVN8	375 aa		10.43	□□□□□ -0.74
HDLBP-216	ENST00000428482	DNASE2B	Q8WZ79	361 aa		10.43	□□□□□ -0.74
HDLBP-216	ENST00000428482	HSPH1	Q92598	858 aa		10.43	□□□□□ -0.74
HDLBP-216	ENST00000428482	CCDC42	Q96M95	316 aa		10.43	□□□□□ -0.74
HDLBP-216	ENST00000428482	EPAS1	Q99814	870 aa		10.43	□□□□□ -0.74
HDLBP-216	ENST00000428482	OMD	Q99983	421 aa		10.43	□□□□□ -0.74
HDLBP-216	ENST00000428482	ZWILCH	Q9H900	591 aa		10.43	□□□□□ -0.74
HDLBP-216	ENST00000428482	PDF	Q9HBH1	243 aa		10.43	□□□□□ -0.74
HDLBP-216	ENST00000428482	OSGEP	Q9NPF4	335 aa		10.43	□□□□□ -0.74
HDLBP-216	ENST00000428482	PARVA	Q9NVD7	372 aa		10.43	□□□□□ -0.74
HDLBP-216	ENST00000428482	LHX3	Q9UBR4	397 aa		10.43	□□□□□ -0.74
HDLBP-216	ENST00000428482	SUN2	Q9UH99	717 aa		10.43	□□□□□ -0.74
HDLBP-216	ENST00000428482	ADGRG1	Q9Y653	693 aa		10.43	□□□□□ -0.74
HDLBP-216	ENST00000428482	CHD8	Q9HCK8	2581 aa		10.42	□□□□□ -0.74
HDLBP-216	ENST00000428482	TDRD6	O60522	2096 aa	Known RBP	10.42	□□□□□ -0.74
HDLBP-216	ENST00000428482	SPAAR	A0A1B0GVQ0	90 aa		10.42	□□□□□ -0.74
HDLBP-216	ENST00000428482		H0Y8X5	98 aa		10.42	□□□□□ -0.74
HDLBP-216	ENST00000428482		J3KR12	359 aa		10.42	□□□□□ -0.74
HDLBP-216	ENST00000428482	EEF2K	O00418	725 aa	Known RBP	10.42	□□□□□ -0.74
HDLBP-216	ENST00000428482	KCNK3	O14649	394 aa		10.42	□□□□□ -0.74
HDLBP-216	ENST00000428482	MUSK	O15146	869 aa		10.42	□□□□□ -0.74
HDLBP-216	ENST00000428482	MFSD11	O43934	449 aa		10.42	□□□□□ -0.74
HDLBP-216	ENST00000428482	MAP3K6	O95382	1288 aa		10.42	□□□□□ -0.74
HDLBP-216	ENST00000428482	ADH1B	P00325	375 aa		10.42	□□□□□ -0.74
HDLBP-216	ENST00000428482	PRKCG	P05129	697 aa		10.42	□□□□□ -0.74
HDLBP-216	ENST00000428482	SERPINF2	P08697	491 aa		10.42	□□□□□ -0.74
HDLBP-216	ENST00000428482	GZMA	P12544	262 aa		10.42	□□□□□ -0.74
HDLBP-216	ENST00000428482	MSN	P26038	577 aa	Known RBP	10.42	□□□□□ -0.74
HDLBP-216	ENST00000428482	L1CAM	P32004	1257 aa		10.42	□□□□□ -0.74
HDLBP-216	ENST00000428482	CHRNA3	P32297	505 aa		10.42	□□□□□ -0.74
HDLBP-216	ENST00000428482	CSNK1E	P49674	416 aa	Known RBP	10.42	□□□□□ -0.74
HDLBP-216	ENST00000428482	DNA2	P51530	1060 aa		10.42	□□□□□ -0.74
HDLBP-216	ENST00000428482	OXCT1	P55809	520 aa		10.42	□□□□□ -0.74
HDLBP-216	ENST00000428482	TAS2R40	P59535	323 aa		10.42	□□□□□ -0.74
HDLBP-216	ENST00000428482	MMRN1	Q13201	1228 aa		10.42	□□□□□ -0.74
HDLBP-216	ENST00000428482	DPYS	Q14117	519 aa		10.42	□□□□□ -0.74
HDLBP-216	ENST00000428482	FGL2	Q14314	439 aa		10.42	□□□□□ -0.74
HDLBP-216	ENST00000428482	SLC18A3	Q16572	532 aa		10.42	□□□□□ -0.74
HDLBP-216	ENST00000428482	PPP6R3	Q5H9R7	873 aa	Predicted RBP	10.42	□□□□□ -0.74
HDLBP-216	ENST00000428482	SPDYC	Q5MJ68	293 aa		10.42	□□□□□ -0.74
HDLBP-216	ENST00000428482	RAD9B	Q6WBX8	426 aa		10.42	□□□□□ -0.74
HDLBP-216	ENST00000428482	RAB11FIP1	Q6WKZ4	1283 aa	Predicted RBP	10.42	□□□□□ -0.74
HDLBP-216	ENST00000428482	USP30	Q70CQ3	517 aa		10.42	□□□□□ -0.74
HDLBP-216	ENST00000428482	ZSWIM9	Q86XI8	627 aa		10.42	□□□□□ -0.74
HDLBP-216	ENST00000428482	TXLNB	Q8N3L3	684 aa		10.42	□□□□□ -0.74
HDLBP-216	ENST00000428482	ZNF564	Q8TBZ8	553 aa	Predicted RBP	10.42	□□□□□ -0.74
HDLBP-216	ENST00000428482	LRRN4	Q8WUT4	740 aa		10.42	□□□□□ -0.74
HDLBP-216	ENST00000428482	NSMCE3	Q96MG7	304 aa		10.42	□□□□□ -0.74
HDLBP-216	ENST00000428482	LRRC19	Q9H756	370 aa		10.42	□□□□□ -0.74
HDLBP-216	ENST00000428482	STAU2	Q9NUL3	570 aa	Known RBP eCLIP	10.42	□□□□□ -0.74
HDLBP-216	ENST00000428482	IL36A	Q9UHA7	158 aa		10.42	□□□□□ -0.74
HDLBP-216	ENST00000428482	INTU	Q9ULD6	942 aa		10.42	□□□□□ -0.74
HDLBP-216	ENST00000428482	PPM1H	Q9ULR3	514 aa		10.42	□□□□□ -0.74
HDLBP-216	ENST00000428482	FZD4	Q9ULV1	537 aa		10.42	□□□□□ -0.74
HDLBP-216	ENST00000428482	PYCARD	Q9ULZ3	195 aa		10.42	□□□□□ -0.74
HDLBP-216	ENST00000428482	SLC6A14	Q9UN76	642 aa		10.42	□□□□□ -0.74
HDLBP-216	ENST00000428482	BTBD3	Q9Y2F9	522 aa		10.42	□□□□□ -0.74
HDLBP-216	ENST00000428482	SNX11	Q9Y5W9	270 aa		10.42	□□□□□ -0.74
HDLBP-216	ENST00000428482	SCIN	Q9Y6U3	715 aa		10.42	□□□□□ -0.74
HDLBP-216	ENST00000428482	KNL1	Q8NG31	2342 aa		10.42	□□□□□ -0.74
HDLBP-216	ENST00000428482	MYLK	Q15746	1914 aa		10.42	□□□□□ -0.74
HDLBP-216	ENST00000428482	MAP1B	P46821	2468 aa	Known RBP	10.41	□□□□□ -0.74
HDLBP-216	ENST00000428482		A0A1B0GTW7	788 aa		10.41	□□□□□ -0.74
HDLBP-216	ENST00000428482	TTC24	A2A3L6	582 aa	Predicted RBP	10.41	□□□□□ -0.74
HDLBP-216	ENST00000428482	ANKRD62	A6NC57	917 aa		10.41	□□□□□ -0.74
HDLBP-216	ENST00000428482	TMEM110-MUSTN1	A8MSY1	372 aa		10.41	□□□□□ -0.74
HDLBP-216	ENST00000428482	C1QTNF3-AMACR	E9PGA6	284 aa		10.41	□□□□□ -0.74
HDLBP-216	ENST00000428482	ARHGAP33	O14559	1287 aa		10.41	□□□□□ -0.74
HDLBP-216	ENST00000428482	MCF2L	O15068	1137 aa		10.41	□□□□□ -0.74
HDLBP-216	ENST00000428482	BCAT2	O15382	392 aa	Predicted RBP	10.41	□□□□□ -0.74
HDLBP-216	ENST00000428482	PJA2	O43164	708 aa		10.41	□□□□□ -0.74
HDLBP-216	ENST00000428482	KCNK5	O95279	499 aa		10.41	□□□□□ -0.74
HDLBP-216	ENST00000428482	CYP1A2	P05177	515 aa		10.41	□□□□□ -0.74
HDLBP-216	ENST00000428482	UGT2B4	P06133	528 aa		10.41	□□□□□ -0.74
HDLBP-216	ENST00000428482	CCDC175	P0C221	793 aa		10.41	□□□□□ -0.74
HDLBP-216	ENST00000428482	CD59	P13987	128 aa		10.41	□□□□□ -0.74
HDLBP-216	ENST00000428482	ITIH2	P19823	946 aa		10.41	□□□□□ -0.74
HDLBP-216	ENST00000428482	C5AR1	P21730	350 aa		10.41	□□□□□ -0.74
HDLBP-216	ENST00000428482	OXTR	P30559	389 aa		10.41	□□□□□ -0.74
HDLBP-216	ENST00000428482	HOXD12	P35452	270 aa		10.41	□□□□□ -0.74
HDLBP-216	ENST00000428482	VASP	P50552	380 aa	Predicted RBP	10.41	□□□□□ -0.74
HDLBP-216	ENST00000428482	SEMG2	Q02383	582 aa		10.41	□□□□□ -0.74

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