RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428120.5

FAAP20-209, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene FAAP20, Length 2,313 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-209ENST00000428120 CA8P35219 290 aa23.53■■□□□ 1.36
FAAP20-209ENST00000428120 SPRP35270 261 aaPredicted RBP23.53■■□□□ 1.36
FAAP20-209ENST00000428120 SLC11A2P49281 568 aa23.53■■□□□ 1.36
FAAP20-209ENST00000428120 LIMK2P53671 638 aa23.53■■□□□ 1.36
FAAP20-209ENST00000428120 FRG1Q14331 258 aaKnown RBP23.53■■□□□ 1.36
FAAP20-209ENST00000428120 DLG2Q15700 870 aa23.53■■□□□ 1.36
FAAP20-209ENST00000428120 N4BP2L1Q5TBK1 243 aaPredicted RBP23.53■■□□□ 1.36
FAAP20-209ENST00000428120 FYB2Q5VWT5 728 aa23.53■■□□□ 1.36
FAAP20-209ENST00000428120 CES4AQ5XG92 561 aa23.53■■□□□ 1.36
FAAP20-209ENST00000428120 RNF43Q68DV7 783 aa23.53■■□□□ 1.36
FAAP20-209ENST00000428120 ANKLE1Q8NAG6 615 aa23.53■■□□□ 1.36
FAAP20-209ENST00000428120 YME1L1Q96TA2 773 aa23.53■■□□□ 1.36
FAAP20-209ENST00000428120 SNX15Q9NRS6 342 aa23.53■■□□□ 1.36
FAAP20-209ENST00000428120 SMPD4Q9NXE4 827 aa23.53■■□□□ 1.36
FAAP20-209ENST00000428120 EMCNQ9ULC0 261 aa23.53■■□□□ 1.36
FAAP20-209ENST00000428120 MIA3Q5JRA6 1907 aa23.53■■□□□ 1.36
FAAP20-209ENST00000428120 RAG1P15918 1043 aa23.52■■□□□ 1.36
FAAP20-209ENST00000428120 MAPKAPK2P49137 400 aa23.52■■□□□ 1.36
FAAP20-209ENST00000428120 SGSHP51688 502 aa23.52■■□□□ 1.36
FAAP20-209ENST00000428120 CHI3L2Q15782 390 aa23.52■■□□□ 1.36
FAAP20-209ENST00000428120 NUDCD3Q8IVD9 361 aa23.52■■□□□ 1.36
FAAP20-209ENST00000428120 RFWD2Q8NHY2 731 aa23.52■■□□□ 1.36
FAAP20-209ENST00000428120 ACMSDQ8TDX5 336 aa23.52■■□□□ 1.36
FAAP20-209ENST00000428120 C10orf82Q8WW14 230 aa23.52■■□□□ 1.36
FAAP20-209ENST00000428120 OVCA2Q8WZ82 227 aa23.52■■□□□ 1.36
FAAP20-209ENST00000428120 CEP295NLQ96MC4 621 aa23.52■■□□□ 1.36
FAAP20-209ENST00000428120 PRICKLE1Q96MT3 831 aaPredicted RBP23.52■■□□□ 1.36
FAAP20-209ENST00000428120 PLCD4Q9BRC7 762 aa23.52■■□□□ 1.36
FAAP20-209ENST00000428120 ACTR5Q9H9F9 607 aaPredicted RBP23.52■■□□□ 1.36
FAAP20-209ENST00000428120 H0YHG0 523 aa23.51■■□□□ 1.35
FAAP20-209ENST00000428120 STC2O76061 302 aa23.51■■□□□ 1.35
FAAP20-209ENST00000428120 GJA8P48165 433 aa23.51■■□□□ 1.35
FAAP20-209ENST00000428120 IL10RBQ08334 325 aa23.51■■□□□ 1.35
FAAP20-209ENST00000428120 LBRQ14739 615 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
FAAP20-209ENST00000428120 OR7D4Q8NG98 312 aa23.51■■□□□ 1.35
FAAP20-209ENST00000428120 MYRFLQ96LU7 910 aa23.51■■□□□ 1.35
FAAP20-209ENST00000428120 PPP1R2P1Q96PQ5 205 aa23.51■■□□□ 1.35
FAAP20-209ENST00000428120 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa23.51■■□□□ 1.35
FAAP20-209ENST00000428120 ZNF395Q9H8N7 513 aaPredicted RBP23.51■■□□□ 1.35
FAAP20-209ENST00000428120 ZNF358Q9NW07 568 aa23.51■■□□□ 1.35
FAAP20-209ENST00000428120 TCAF1Q9Y4C2 921 aa23.51■■□□□ 1.35
FAAP20-209ENST00000428120 LAG3P18627 525 aa23.51■■□□□ 1.35
FAAP20-209ENST00000428120 PGGT1BP53609 377 aa23.51■■□□□ 1.35
FAAP20-209ENST00000428120 TMPRSS15P98073 1019 aa23.51■■□□□ 1.35
FAAP20-209ENST00000428120 CNGA3Q16281 694 aa23.51■■□□□ 1.35
FAAP20-209ENST00000428120 PDPK2PQ6A1A2 396 aa23.51■■□□□ 1.35
FAAP20-209ENST00000428120 ZCCHC23Q6ZST2 131 aa23.51■■□□□ 1.35
FAAP20-209ENST00000428120 DNAJB7Q7Z6W7 309 aaPredicted RBP23.51■■□□□ 1.35
FAAP20-209ENST00000428120 TTC16Q8NEE8 873 aa23.51■■□□□ 1.35
FAAP20-209ENST00000428120 PPM1EQ8WY54 764 aa23.51■■□□□ 1.35
FAAP20-209ENST00000428120 CYP2S1Q96SQ9 504 aa23.51■■□□□ 1.35
FAAP20-209ENST00000428120 RXFP1Q9HBX9 757 aa23.51■■□□□ 1.35
FAAP20-209ENST00000428120 SLC12A4Q9UP95 1085 aa23.51■■□□□ 1.35
FAAP20-209ENST00000428120 MUSKO15146 869 aa23.5■■□□□ 1.35
FAAP20-209ENST00000428120 TSPAN3O60637 253 aa23.5■■□□□ 1.35
FAAP20-209ENST00000428120 ARNTP27540 789 aa23.5■■□□□ 1.35
FAAP20-209ENST00000428120 ELF1P32519 619 aa23.5■■□□□ 1.35
FAAP20-209ENST00000428120 BST1Q10588 318 aa23.5■■□□□ 1.35
FAAP20-209ENST00000428120 VEPH1Q14D04 833 aa23.5■■□□□ 1.35
FAAP20-209ENST00000428120 POTEHQ6S545 545 aa23.5■■□□□ 1.35
FAAP20-209ENST00000428120 DENND6AQ8IWF6 608 aa23.5■■□□□ 1.35
FAAP20-209ENST00000428120 TEX26Q8N6G2 289 aa23.5■■□□□ 1.35
FAAP20-209ENST00000428120 FATE1Q969F0 183 aa23.5■■□□□ 1.35
FAAP20-209ENST00000428120 SIRPGQ9P1W8 387 aa23.5■■□□□ 1.35
FAAP20-209ENST00000428120 USH1CQ9Y6N9 552 aa23.5■■□□□ 1.35
FAAP20-209ENST00000428120 GLRA3O75311 464 aa23.5■■□□□ 1.35
FAAP20-209ENST00000428120 SAT1P21673 171 aa23.5■■□□□ 1.35
FAAP20-209ENST00000428120 CTBP1Q13363 440 aa23.5■■□□□ 1.35
FAAP20-209ENST00000428120 RAB33AQ14088 237 aa23.5■■□□□ 1.35
FAAP20-209ENST00000428120 ACBD5Q5T8D3 534 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
FAAP20-209ENST00000428120 KLHDC10Q6PID8 442 aa23.5■■□□□ 1.35
FAAP20-209ENST00000428120 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
FAAP20-209ENST00000428120 E2F7Q96AV8 911 aa23.5■■□□□ 1.35
FAAP20-209ENST00000428120 VPS39Q96JC1 886 aa23.5■■□□□ 1.35
FAAP20-209ENST00000428120 SPON2Q9BUD6 331 aa23.5■■□□□ 1.35
FAAP20-209ENST00000428120 TRPC7Q9HCX4 862 aa23.5■■□□□ 1.35
FAAP20-209ENST00000428120 HAUS2Q9NVX0 235 aa23.5■■□□□ 1.35
FAAP20-209ENST00000428120 UXTQ9UBK9 157 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
FAAP20-209ENST00000428120 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa23.5■■□□□ 1.35
FAAP20-209ENST00000428120 A0A0G2JND7 137 aa23.49■■□□□ 1.35
FAAP20-209ENST00000428120 PRAMEF11O60813 436 aa23.49■■□□□ 1.35
FAAP20-209ENST00000428120 CSPG5O95196 566 aa23.49■■□□□ 1.35
FAAP20-209ENST00000428120 BPGMP07738 259 aa23.49■■□□□ 1.35
FAAP20-209ENST00000428120 TROVE2P10155 538 aaKnown RBP eCLIP23.49■■□□□ 1.35
FAAP20-209ENST00000428120 GLDCP23378 1020 aa23.49■■□□□ 1.35
FAAP20-209ENST00000428120 SERPINB8P50452 374 aa23.49■■□□□ 1.35
FAAP20-209ENST00000428120 YBEYP58557 167 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
FAAP20-209ENST00000428120 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
FAAP20-209ENST00000428120 ARRDC2Q8TBH0 407 aa23.49■■□□□ 1.35
FAAP20-209ENST00000428120 SEMA3CQ99985 751 aa23.49■■□□□ 1.35
FAAP20-209ENST00000428120 RASSF4Q9H2L5 321 aa23.49■■□□□ 1.35
FAAP20-209ENST00000428120 CHKBQ9Y259 395 aa23.49■■□□□ 1.35
FAAP20-209ENST00000428120 TEX28O15482 410 aa23.49■■□□□ 1.35
FAAP20-209ENST00000428120 GSRP00390 522 aa23.49■■□□□ 1.35
FAAP20-209ENST00000428120 IRF9Q00978 393 aa23.49■■□□□ 1.35
FAAP20-209ENST00000428120 GNA12Q03113 381 aa23.49■■□□□ 1.35
FAAP20-209ENST00000428120 IL31Q6EBC2 164 aa23.49■■□□□ 1.35
FAAP20-209ENST00000428120 KYAT3Q6YP21 454 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
FAAP20-209ENST00000428120 TMEM150AQ86TG1 271 aa23.49■■□□□ 1.35
FAAP20-209ENST00000428120 PLD6Q8N2A8 252 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.7 ms